EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000009626 (Gene tree)
Gene ID: 103359041
Gene Symbol: syf2
Alias: hm:zeh0031|zeh0031|zgc:113871|zgc:92835
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 8242 bases
Position: chrKK580422.1:702272-710513
Accession: 103359041
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000012702	SYF2	PF08231.12	2.5e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000012917	-	1171	XM_008284223	ENSSPAP00000012702	238 (aa)	XP_008282445	UPI0004955875

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000009626's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000009626's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	ENSG00000117614	SYF2	96	78.151	Homo_sapiens
ENSSPAG00000009626	syf2	100	94.958	ENSAPOG00000001174	syf2	100	94.958	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000009626	syf2	82	83.590	ENSAMEG00000010134	-	100	83.590	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000009626	syf2	92	82.192	ENSAMEG00000010115	-	90	82.192	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000009626	syf2	99	91.064	ENSACIG00000023688	syf2	94	91.064	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000009626	syf2	93	94.570	ENSAOCG00000010912	syf2	69	94.570	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000009626	syf2	100	94.958	ENSAOCG00000022046	syf2	100	93.697	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000009626	syf2	100	94.958	ENSAPEG00000018858	syf2	92	94.958	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000009626	syf2	100	92.017	ENSATEG00000007745	syf2	100	92.017	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000009626	syf2	84	83.000	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	83.000	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000009626	syf2	70	69.461	ENSACAG00000026777	-	100	69.461	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000009626	syf2	86	83.824	ENSACAG00000013653	-	100	83.824	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.796	ENSANAG00000032473	SYF2	90	83.562	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000009626	syf2	100	90.336	ENSACLG00000019916	syf2	100	90.336	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000009626	syf2	100	84.034	ENSAMXG00000004051	syf2	100	84.034	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.571	ENSBTAG00000001651	SYF2	99	78.571	Bos_taurus
ENSSPAG00000009626	syf2	87	52.857	WBGene00019402	syf-2	90	52.133	Caenorhabditis_elegans
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.796	ENSCJAG00000046570	SYF2	96	78.571	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000009626	syf2	88	79.426	ENSCAFG00000030331	-	92	79.426	Canis_familiaris
ENSSPAG00000009626	syf2	91	82.407	ENSCAFG00000012895	-	89	82.192	Canis_familiaris
ENSSPAG00000009626	syf2	76	74.725	ENSCAFG00020021094	-	95	74.725	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000009626	syf2	91	82.407	ENSCAFG00020021091	-	89	82.192	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000009626	syf2	100	77.366	ENSCHIG00000020874	SYF2	99	78.661	Capra_hircus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.723	ENSTSYG00000005114	SYF2	95	78.723	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000009626	syf2	83	82.828	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	82.828	Cavia_aperea
ENSSPAG00000009626	syf2	100	77.459	ENSCPOG00000005326	SYF2	95	78.571	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.796	ENSCCAG00000022459	SYF2	96	78.571	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	ENSCATG00000026917	SYF2	95	79.237	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.149	ENSCLAG00000008474	SYF2	95	79.149	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	ENSCSAG00000000948	SYF2	95	79.237	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000009626	syf2	70	65.060	ENSCHOG00000005273	-	91	65.060	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000009626	syf2	93	82.883	ENSCPBG00000025073	SYF2	94	80.591	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000009626	syf2	95	52.863	ENSCING00000003017	-	95	53.304	Ciona_intestinalis
ENSSPAG00000009626	syf2	89	49.765	ENSCSAVG00000006627	-	97	49.765	Ciona_savignyi
ENSSPAG00000009626	syf2	99	69.492	ENSCANG00000037322	SYF2	94	69.492	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.099	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	78.099	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000009626	syf2	82	83.163	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	83.333	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000009626	syf2	92	89.450	ENSCSEG00000000117	syf2	99	86.076	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.540	ENSCVAG00000019543	syf2	100	89.540	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	83.613	ENSDARG00000004706	syf2	100	83.613	Danio_rerio
ENSSPAG00000009626	syf2	99	77.686	ENSDNOG00000047605	SYF2	99	77.686	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.903	ENSDORG00000001274	Syf2	95	78.903	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000009626	syf2	94	55.752	FBgn0033556	CG12343	99	55.752	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000009626	syf2	92	67.123	ENSETEG00000015729	SYF2	94	67.123	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000009626	syf2	83	59.391	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.391	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.992	ENSEASG00005004224	-	95	78.992	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	70.464	ENSEASG00005004232	-	96	70.464	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000009626	syf2	92	84.018	ENSECAG00000010440	-	92	84.018	Equus_caballus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.992	ENSECAG00000012023	-	96	78.992	Equus_caballus
ENSSPAG00000009626	syf2	74	67.598	ENSEEUG00000015084	SYF2	98	67.598	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	83.613	ENSELUG00000003465	syf2	100	83.613	Esox_lucius
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.325	ENSFCAG00000010324	-	81	79.325	Felis_catus
ENSSPAG00000009626	syf2	95	79.913	ENSFCAG00000043095	-	93	79.310	Felis_catus
ENSSPAG00000009626	syf2	86	79.902	ENSFALG00000000460	SYF2	89	78.899	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000009626	syf2	100	77.366	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	77.366	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000009626	syf2	95	76.991	ENSFHEG00000007238	syf2	100	76.991	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000009626	syf2	90	90.698	ENSGMOG00000019138	syf2	96	90.698	Gadus_morhua
ENSSPAG00000009626	syf2	93	81.532	ENSGALG00000013639	SYF2	93	78.059	Gallus_gallus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	88.235	ENSGAFG00000019435	syf2	100	88.235	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000009626	syf2	94	89.732	ENSGACG00000007305	syf2	100	89.121	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000009626	syf2	93	82.883	ENSGAGG00000010670	SYF2	94	80.169	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	ENSGGOG00000012796	SYF2	96	78.151	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.916	ENSHBUG00000020477	syf2	100	89.916	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000009626	syf2	93	72.072	ENSHGLG00000004304	-	93	72.523	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000009626	syf2	93	82.432	ENSHGLG00000014393	SYF2	91	82.432	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000009626	syf2	93	82.432	ENSHGLG00100014722	SYF2	91	82.432	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000009626	syf2	100	88.655	ENSHCOG00000012904	syf2	78	88.655	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000009626	syf2	100	83.264	ENSIPUG00000019859	syf2	100	83.264	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000009626	syf2	61	78.082	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	78.082	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000009626	syf2	84	83.417	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	83.417	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	91.597	ENSKMAG00000013856	syf2	100	91.597	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	92.017	ENSLBEG00000014425	syf2	100	92.017	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000009626	syf2	93	81.448	ENSLACG00000012064	SYF2	93	81.448	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000009626	syf2	100	82.353	ENSLOCG00000002728	syf2	95	82.353	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000009626	syf2	93	83.333	ENSLAFG00000023150	-	91	83.333	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000009626	syf2	77	54.891	ENSLAFG00000030814	-	100	54.891	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	ENSMFAG00000041831	SYF2	95	79.237	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000009626	syf2	91	82.870	ENSMMUG00000002968	SYF2	95	78.814	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	ENSMNEG00000030180	SYF2	95	79.237	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	ENSMLEG00000030248	SYF2	95	79.237	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	92.857	ENSMAMG00000010403	syf2	98	92.857	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.916	ENSMZEG00005006429	syf2	100	89.916	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000009626	syf2	84	82.915	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	82.915	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.926	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	78.926	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000009626	syf2	84	83.417	ENSMICG00000016191	SYF2	100	83.417	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.099	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	78.099	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000009626	syf2	95	91.556	ENSMMOG00000002396	syf2	94	91.556	Mola_mola
ENSSPAG00000009626	syf2	93	77.679	ENSMODG00000013951	-	98	77.679	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000009626	syf2	100	90.871	ENSMALG00000010706	syf2	100	91.286	Monopterus_albus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.926	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	78.926	Mus_caroli
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.926	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	78.926	Mus_musculus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.926	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	78.926	Mus_pahari
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.926	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	78.926	Mus_spretus
ENSSPAG00000009626	syf2	92	82.727	ENSMPUG00000015801	-	89	82.727	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000009626	syf2	91	82.407	ENSMPUG00000015802	-	89	82.192	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000009626	syf2	99	77.917	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	77.917	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.325	ENSNGAG00000007912	Syf2	96	79.325	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000009626	syf2	100	80.165	ENSNBRG00000010720	syf2	99	80.165	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	ENSNLEG00000035185	SYF2	96	78.151	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000009626	syf2	100	75.720	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	75.720	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000009626	syf2	98	78.205	ENSODEG00000017664	-	97	78.205	Octodon_degus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	70.042	ENSODEG00000014338	-	98	70.042	Octodon_degus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	91.597	ENSONIG00000008213	syf2	100	91.597	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000009626	syf2	85	82.178	ENSOANG00000009552	SYF2	100	82.178	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.796	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	80.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000009626	syf2	98	89.700	ENSORLG00000028820	syf2	100	89.700	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.076	ENSORLG00020018333	syf2	100	89.076	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000009626	syf2	100	88.235	ENSORLG00015014665	syf2	100	88.235	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000009626	syf2	100	90.336	ENSOMEG00000013911	syf2	100	90.336	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000009626	syf2	99	80.000	ENSOGAG00000009962	SYF2	95	80.000	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000009626	syf2	82	57.436	ENSOARG00000006269	-	100	57.436	Ovis_aries
ENSSPAG00000009626	syf2	99	77.049	ENSOARG00000006348	-	99	77.049	Ovis_aries
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	ENSPPAG00000036579	SYF2	96	78.151	Pan_paniscus
ENSSPAG00000009626	syf2	95	79.913	ENSPPRG00000001651	-	93	79.310	Panthera_pardus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.574	ENSPPRG00000001638	-	95	79.574	Panthera_pardus
ENSSPAG00000009626	syf2	97	79.310	ENSPTIG00000007036	-	93	79.310	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000009626	syf2	91	84.259	ENSPTIG00000005711	-	80	83.945	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	ENSPTRG00000000352	SYF2	96	78.151	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	ENSPANG00000008139	SYF2	95	79.237	Papio_anubis
ENSSPAG00000009626	syf2	100	83.193	ENSPKIG00000008130	syf2	100	83.193	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.481	ENSPSIG00000011816	SYF2	91	78.481	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000009626	syf2	93	91.855	ENSPMGG00000008755	syf2	86	91.855	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.099	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	78.099	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000009626	syf2	93	81.982	ENSPCIG00000014235	SYF2	89	81.982	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	87.448	ENSPFOG00000004116	syf2	99	87.448	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000009626	syf2	98	88.841	ENSPLAG00000006691	syf2	100	88.841	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000009626	syf2	100	85.714	ENSPMEG00000011684	syf2	100	85.714	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000009626	syf2	100	88.655	ENSPREG00000003009	syf2	100	88.655	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	ENSPPYG00000001713	SYF2	95	79.237	Pongo_abelii
ENSSPAG00000009626	syf2	99	53.112	ENSPCOG00000027011	SYF2	99	53.112	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000009626	syf2	100	67.901	ENSPVAG00000005841	SYF2	99	67.901	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.916	ENSPNYG00000004979	syf2	100	89.916	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000009626	syf2	100	83.613	ENSPNAG00000015570	syf2	100	83.613	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000009626	syf2	100	78.926	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	78.926	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	77.119	ENSRBIG00000042970	SYF2	95	77.119	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000009626	syf2	99	79.237	ENSRROG00000001347	SYF2	95	79.237	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	ENSSBOG00000020184	SYF2	96	78.992	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000009626	syf2	86	82.039	ENSSHAG00000007152	-	100	82.039	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000009626	syf2	93	80.631	ENSSHAG00000015630	-	89	80.631	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000009626	syf2	93	86.425	ENSSFOG00015023647	syf2	93	86.425	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	91.597	ENSSMAG00000009867	syf2	100	91.597	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	93.697	ENSSDUG00000013072	syf2	100	93.697	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000009626	syf2	100	93.697	ENSSLDG00000012677	syf2	100	93.697	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000009626	syf2	100	60.084	ENSSARG00000012889	SYF2	96	60.084	Sorex_araneus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.099	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	78.099	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.481	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	77.686	Sus_scrofa
ENSSPAG00000009626	syf2	63	52.980	ENSTGUG00000001126	SYF2	81	53.939	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000009626	syf2	100	86.250	ENSTRUG00000001499	syf2	95	85.232	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000009626	syf2	93	87.387	ENSTNIG00000016912	syf2	99	87.387	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000009626	syf2	100	56.790	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	56.790	Tupaia_belangeri
ENSSPAG00000009626	syf2	91	83.333	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	76.639	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000009626	syf2	92	82.192	ENSUAMG00000002897	SYF2	89	82.192	Ursus_americanus
ENSSPAG00000009626	syf2	91	81.944	ENSUMAG00000013108	SYF2	89	81.735	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000009626	syf2	100	76.230	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	76.230	Vicugna_pacos
ENSSPAG00000009626	syf2	91	82.407	ENSVVUG00000027175	-	89	82.192	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000009626	syf2	86	82.927	ENSVVUG00000027181	-	100	75.806	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000009626	syf2	99	75.949	ENSXETG00000022797	syf2	94	75.949	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000009626	syf2	100	89.496	ENSXMAG00000022698	syf2	100	89.496	Xiphophorus_maculatus