EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000012044 (Gene tree)
Gene ID: 103362356
Gene Symbol: rab11al
Alias: fc54g10|wu:fc54g10|zgc:63565
Full Name: ras-related protein Rab-11A-like
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15372 bases
Position: chrKK580641.1:253870-269241
Accession: 103362356
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000015971	MMR_HSR1	PF01926.23	3.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000016229	-	2498	XM_008288684	ENSSPAP00000015971	216 (aa)	XP_008286906	UPI0004977E22

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000012044's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000012044's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000012044	rab11al	75	36.025	ENSSPAG00000006001	rab41	76	36.025
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	81.567	ENSSPAG00000011419	rab11bb	99	81.567
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	82.488	ENSSPAG00000017313	rab11ba	99	82.488
ENSSPAG00000012044	rab11al	84	41.530	ENSSPAG00000016167	rab42a	98	38.140
ENSSPAG00000012044	rab11al	97	62.381	ENSSPAG00000012060	rab25b	99	62.745
ENSSPAG00000012044	rab11al	66	33.333	ENSSPAG00000018992	si:cabz01085950.1	71	33.333
ENSSPAG00000012044	rab11al	72	39.752	ENSSPAG00000009806	rab9b	73	39.752
ENSSPAG00000012044	rab11al	94	34.450	ENSSPAG00000007900	rab9a	95	34.450
ENSSPAG00000012044	rab11al	82	31.915	ENSSPAG00000017348	rab34a	68	31.915
ENSSPAG00000012044	rab11al	70	42.405	ENSSPAG00000010224	-	71	42.405
ENSSPAG00000012044	rab11al	76	45.562	ENSSPAG00000006302	si:dkey-16l2.16	98	39.904
ENSSPAG00000012044	rab11al	69	33.333	ENSSPAG00000009928	kras	85	34.568
ENSSPAG00000012044	rab11al	55	30.645	ENSSPAG00000004205	-	60	30.645
ENSSPAG00000012044	rab11al	69	34.000	ENSSPAG00000007357	hrasb	85	35.185
ENSSPAG00000012044	rab11al	74	47.500	ENSSPAG00000013422	rab30	79	47.500
ENSSPAG00000012044	rab11al	98	63.679	ENSSPAG00000015817	rab25a	99	63.679
ENSSPAG00000012044	rab11al	75	46.296	ENSSPAG00000020875	rab18b	79	46.296
ENSSPAG00000012044	rab11al	81	40.805	ENSSPAG00000021333	rab22a	90	40.805
ENSSPAG00000012044	rab11al	72	41.250	ENSSPAG00000005785	rab33a	70	41.250
ENSSPAG00000012044	rab11al	96	47.343	ENSSPAG00000012564	-	99	47.343
ENSSPAG00000012044	rab11al	73	49.682	ENSSPAG00000006436	rab5c	71	49.682
ENSSPAG00000012044	rab11al	74	34.161	ENSSPAG00000005867	rheb	87	34.161
ENSSPAG00000012044	rab11al	79	39.766	ENSSPAG00000010822	rab12	69	39.766
ENSSPAG00000012044	rab11al	78	30.857	ENSSPAG00000002062	RAB29	84	30.857
ENSSPAG00000012044	rab11al	74	42.767	ENSSPAG00000023185	RAB15	75	42.767
ENSSPAG00000012044	rab11al	75	33.333	ENSSPAG00000004878	rras	82	33.333
ENSSPAG00000012044	rab11al	77	53.012	ENSSPAG00000022927	rab14	77	53.012
ENSSPAG00000012044	rab11al	91	42.857	ENSSPAG00000010919	-	94	42.857
ENSSPAG00000012044	rab11al	96	45.327	ENSSPAG00000013533	zgc:171927	99	45.327
ENSSPAG00000012044	rab11al	79	37.572	ENSSPAG00000006404	zgc:101559	74	37.572
ENSSPAG00000012044	rab11al	78	33.728	ENSSPAG00000010373	rab23	90	33.511
ENSSPAG00000012044	rab11al	94	41.748	ENSSPAG00000010771	RAB39B	96	41.748
ENSSPAG00000012044	rab11al	78	42.604	ENSSPAG00000022624	-	75	42.604
ENSSPAG00000012044	rab11al	79	35.912	ENSSPAG00000004801	rab33ba	75	35.912
ENSSPAG00000012044	rab11al	78	39.306	ENSSPAG00000023345	RAB7A	82	39.306
ENSSPAG00000012044	rab11al	72	39.130	ENSSPAG00000011224	-	74	39.130
ENSSPAG00000012044	rab11al	74	44.654	ENSSPAG00000015211	rab15	75	44.654
ENSSPAG00000012044	rab11al	78	39.306	ENSSPAG00000001423	-	82	39.306
ENSSPAG00000012044	rab11al	93	42.786	ENSSPAG00000022440	-	96	42.786
ENSSPAG00000012044	rab11al	96	42.180	ENSSPAG00000008400	rab35b	99	42.180
ENSSPAG00000012044	rab11al	80	51.445	ENSSPAG00000005141	-	80	51.445
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	44.131	ENSSPAG00000022676	rab1ba	99	45.894
ENSSPAG00000012044	rab11al	73	48.408	ENSSPAG00000015678	rab5aa	73	48.408
ENSSPAG00000012044	rab11al	79	36.111	ENSSPAG00000018203	rab36	68	36.111
ENSSPAG00000012044	rab11al	77	51.807	ENSSPAG00000015564	rab1ab	86	45.408
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	82.488	ENSSPAG00000014559	-	99	82.488
ENSSPAG00000012044	rab11al	79	35.088	ENSSPAG00000017366	rab6ba	82	35.088
ENSSPAG00000012044	rab11al	81	90.341	ENSSPAG00000019393	RAB11A	87	90.341
ENSSPAG00000012044	rab11al	95	31.944	ENSSPAG00000012955	si:dkey-34d22.5	97	31.944
ENSSPAG00000012044	rab11al	79	35.795	ENSSPAG00000002801	rab34b	69	35.795
ENSSPAG00000012044	rab11al	66	32.468	ENSSPAG00000023440	rasl11a	59	32.468
ENSSPAG00000012044	rab11al	94	32.353	ENSSPAG00000001067	-	94	32.353
ENSSPAG00000012044	rab11al	86	33.862	ENSSPAG00000009276	rab6bb	91	33.862

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	95.370	ENSAPOG00000008251	rab11al	100	95.370	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	97.222	ENSACIG00000017403	rab11al	100	97.222	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	98.148	ENSAOCG00000015678	rab11al	100	98.148	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	98.148	ENSAPEG00000022135	rab11al	100	98.148	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	95.833	ENSATEG00000006156	rab11al	100	95.833	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	98.148	ENSACLG00000010268	rab11al	100	98.148	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000012044	rab11al	94	86.207	ENSAMXG00000024632	rab11al	93	86.207	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000012044	rab11al	94	79.703	ENSCPBG00000025819	-	99	79.703	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	95.833	ENSCSEG00000011996	rab11al	100	95.833	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	93.056	ENSCVAG00000020016	rab11al	100	93.056	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	90.741	ENSDARG00000014340	rab11al	100	90.741	Danio_rerio
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	92.593	ENSELUG00000012035	rab11al	100	92.593	Esox_lucius
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	79.535	ENSFALG00000002594	-	91	79.535	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000012044	rab11al	96	94.231	ENSFHEG00000000832	rab11al	99	94.231	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000012044	rab11al	94	88.614	ENSGMOG00000006450	rab11al	100	88.614	Gadus_morhua
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	78.140	ENSGALG00000037802	-	50	78.140	Gallus_gallus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	93.056	ENSGAFG00000021725	rab11al	100	93.056	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	97.685	ENSGACG00000013259	rab11al	100	97.685	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	80.000	ENSGAGG00000020702	-	99	80.000	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	98.148	ENSHBUG00000009333	rab11al	100	98.148	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	95.370	ENSHCOG00000000232	rab11al	100	95.370	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	91.667	ENSIPUG00000006091	RAB11A	100	91.667	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	90.741	ENSKMAG00000015516	rab11al	100	90.741	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	94.907	ENSLBEG00000016417	rab11al	100	94.907	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	79.070	ENSLACG00000011380	rab11al	99	79.070	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	93.056	ENSLOCG00000008865	rab11al	100	93.056	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	96.296	ENSMAMG00000010278	rab11al	100	96.296	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	98.148	ENSMZEG00005017514	rab11al	100	98.148	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000012044	rab11al	75	88.820	ENSMGAG00000004720	-	95	88.820	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000012044	rab11al	79	97.076	ENSMMOG00000017117	rab11al	84	97.076	Mola_mola
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	95.370	ENSMALG00000004093	rab11al	100	95.370	Monopterus_albus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	97.685	ENSNBRG00000005116	rab11al	100	97.685	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	97.685	ENSONIG00000002281	rab11al	100	97.685	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	95.833	ENSORLG00000016126	rab11al	100	95.833	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	95.833	ENSORLG00020013747	rab11al	100	95.833	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	95.833	ENSORLG00015019591	rab11al	100	95.833	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	95.833	ENSOMEG00000020271	rab11al	100	95.833	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	89.352	ENSPKIG00000020893	rab11al	100	89.352	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	78.605	ENSPSIG00000013143	-	99	78.605	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	90.741	ENSPMGG00000004220	rab11al	100	90.741	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	93.056	ENSPFOG00000011316	rab11al	100	93.056	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	93.056	ENSPLAG00000007986	rab11al	100	93.056	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	93.056	ENSPMEG00000000804	rab11al	100	93.056	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	93.056	ENSPREG00000017324	rab11al	100	93.056	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	98.148	ENSPNYG00000018244	rab11al	100	98.148	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	92.593	ENSPNAG00000029085	rab11al	100	92.593	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	90.741	ENSSFOG00015008618	rab11al	100	90.741	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	96.759	ENSSMAG00000016206	rab11al	100	96.759	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	97.685	ENSSDUG00000006278	rab11al	100	97.685	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	97.685	ENSSLDG00000012116	rab11al	100	97.685	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000012044	rab11al	98	78.774	ENSSPUG00000002526	-	98	78.774	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000012044	rab11al	94	82.178	ENSTGUG00000003680	-	99	82.178	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000012044	rab11al	99	95.327	ENSTRUG00000007556	rab11al	99	95.327	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	92.130	ENSXCOG00000004226	rab11al	100	92.130	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000012044	rab11al	100	92.130	ENSXMAG00000027071	rab11al	100	92.130	Xiphophorus_maculatus