EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000012060 (Gene tree)
Gene ID: 103362358
Gene Symbol: rab25b
Alias: zgc:112037
Full Name: ras-related protein Rab-25-like
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14508 bases
Position: chrKK580641.1:274108-288615
Accession: 103362358
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000015992	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-07	1	1
ENSSPAP00000016004	MMR_HSR1	PF01926.23	3.7e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000016263	-	603	-	ENSSPAP00000016004	200 (aa)	-	-
ENSSPAT00000016249	-	1333	XM_008288685	ENSSPAP00000015992	208 (aa)	XP_008286907	UPI000497D101

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000012060	rab25b	97	48.454	ENSSPAG00000022927	rab14	87	48.223
ENSSPAG00000012060	rab25b	97	46.907	ENSSPAG00000005141	-	89	46.040
ENSSPAG00000012060	rab25b	85	47.674	ENSSPAG00000010771	RAB39B	83	46.023
ENSSPAG00000012060	rab25b	96	33.838	ENSSPAG00000001423	-	95	35.025
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	32.821	ENSSPAG00000017366	rab6ba	94	32.821
ENSSPAG00000012060	rab25b	96	33.333	ENSSPAG00000023345	RAB7A	95	34.518
ENSSPAG00000012060	rab25b	89	35.028	ENSSPAG00000009276	rab6bb	93	35.028
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	45.408	ENSSPAG00000022676	rab1ba	98	45.226
ENSSPAG00000012060	rab25b	86	42.197	ENSSPAG00000016167	rab42a	83	41.111
ENSSPAG00000012060	rab25b	97	35.000	ENSSPAG00000018203	rab36	78	35.821
ENSSPAG00000012060	rab25b	80	30.682	ENSSPAG00000014922	rasl11b	70	30.508
ENSSPAG00000012060	rab25b	81	74.556	ENSSPAG00000019393	RAB11A	83	74.556
ENSSPAG00000012060	rab25b	83	43.529	ENSSPAG00000022440	-	86	44.186
ENSSPAG00000012060	rab25b	83	38.462	ENSSPAG00000023185	RAB15	81	38.012
ENSSPAG00000012060	rab25b	81	35.294	ENSSPAG00000007900	rab9a	81	36.471
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	81.429	ENSSPAG00000015817	rab25a	99	81.429
ENSSPAG00000012060	rab25b	85	46.512	ENSSPAG00000010919	-	83	44.886
ENSSPAG00000012060	rab25b	76	34.868	ENSSPAG00000009928	kras	90	36.628
ENSSPAG00000012060	rab25b	81	37.059	ENSSPAG00000011224	-	76	38.235
ENSSPAG00000012060	rab25b	94	33.333	ENSSPAG00000001067	-	94	33.333
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	43.434	ENSSPAG00000015678	rab5aa	90	43.434
ENSSPAG00000012060	rab25b	81	32.716	ENSSPAG00000005867	rheb	88	33.129
ENSSPAG00000012060	rab25b	82	41.104	ENSSPAG00000015211	rab15	77	41.104
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	62.745	ENSSPAG00000012044	rab11al	97	62.381
ENSSPAG00000012060	rab25b	86	38.919	ENSSPAG00000004801	rab33ba	76	38.919
ENSSPAG00000012060	rab25b	59	31.356	ENSSPAG00000005746	arl8ba	61	31.356
ENSSPAG00000012060	rab25b	85	46.154	ENSSPAG00000006436	rab5c	89	42.289
ENSSPAG00000012060	rab25b	87	49.425	ENSSPAG00000015564	rab1ab	78	49.153
ENSSPAG00000012060	rab25b	83	51.205	ENSSPAG00000012564	-	84	50.888
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	43.719	ENSSPAG00000008400	rab35b	98	43.564
ENSSPAG00000012060	rab25b	85	36.782	ENSSPAG00000012955	si:dkey-34d22.5	80	35.955
ENSSPAG00000012060	rab25b	82	39.181	ENSSPAG00000010224	-	77	40.351
ENSSPAG00000012060	rab25b	86	44.944	ENSSPAG00000013422	rab30	88	44.944
ENSSPAG00000012060	rab25b	78	48.387	ENSSPAG00000006302	si:dkey-16l2.16	75	48.734
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	38.000	ENSSPAG00000010822	rab12	84	39.320
ENSSPAG00000012060	rab25b	87	72.376	ENSSPAG00000014559	-	83	72.376
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	43.478	ENSSPAG00000013533	zgc:171927	98	43.333
ENSSPAG00000012060	rab25b	82	32.927	ENSSPAG00000004878	rras	83	32.927
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	61.927	ENSSPAG00000017313	rab11ba	100	61.927
ENSSPAG00000012060	rab25b	81	46.914	ENSSPAG00000020875	rab18b	79	46.914
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	33.168	ENSSPAG00000009806	rab9b	90	34.483
ENSSPAG00000012060	rab25b	78	41.250	ENSSPAG00000005785	rab33a	70	41.250
ENSSPAG00000012060	rab25b	81	32.961	ENSSPAG00000023440	rasl11a	69	32.961
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	31.754	ENSSPAG00000017348	rab34a	78	31.754
ENSSPAG00000012060	rab25b	78	41.875	ENSSPAG00000006404	zgc:101559	71	40.964
ENSSPAG00000012060	rab25b	60	31.707	ENSSPAG00000020792	arl8bb	70	31.707
ENSSPAG00000012060	rab25b	76	31.579	ENSSPAG00000015015	rras2	81	32.927
ENSSPAG00000012060	rab25b	97	40.722	ENSSPAG00000021333	rab22a	97	41.327
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	32.821	ENSSPAG00000006001	rab41	92	32.821
ENSSPAG00000012060	rab25b	88	30.939	ENSSPAG00000002062	RAB29	87	32.597
ENSSPAG00000012060	rab25b	81	31.481	ENSSPAG00000012674	rhebl1	88	31.902
ENSSPAG00000012060	rab25b	80	35.185	ENSSPAG00000010373	rab23	88	35.359
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	62.844	ENSSPAG00000011419	rab11bb	100	62.844
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	30.288	ENSSPAG00000002801	rab34b	81	30.769
ENSSPAG00000012060	rab25b	76	32.895	ENSSPAG00000007357	hrasb	86	34.146
ENSSPAG00000012060	rab25b	82	45.455	ENSSPAG00000022624	-	72	45.783

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.014	ENSG00000132698	RAB25	97	71.014	Homo_sapiens
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	94.231	ENSAPOG00000008216	rab25b	100	94.231	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	81.429	ENSAPOG00000021268	rab25a	99	81.429	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	70.874	ENSAMEG00000014249	RAB25	97	70.874	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	89.904	ENSACIG00000017414	rab25b	100	89.904	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	80.476	ENSACIG00000019803	rab25a	99	80.476	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	80.769	ENSAOCG00000003528	rab25a	99	80.769	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	96.154	ENSAOCG00000015713	rab25b	100	96.154	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	80.769	ENSAPEG00000013500	rab25a	99	80.769	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	96.154	ENSAPEG00000022106	rab25b	100	96.154	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	83.333	ENSATEG00000014851	rab25a	99	83.333	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	94.712	ENSATEG00000006124	rab25b	100	94.712	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.014	ENSANAG00000036045	RAB25	97	71.014	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	90.865	ENSACLG00000010251	rab25b	100	90.865	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	80.952	ENSACLG00000018262	rab25a	100	80.952	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	85.782	ENSAMXG00000029712	rab25b	100	85.782	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	79.621	ENSAMXG00000040879	rab25a	99	79.621	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.845	ENSBTAG00000018914	RAB25	97	71.845	Bos_taurus
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	70.335	ENSCJAG00000007715	RAB25	97	70.335	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.359	ENSCAFG00000016866	RAB25	97	71.359	Canis_familiaris
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.359	ENSCAFG00020006179	RAB25	97	71.359	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.359	ENSCHIG00000018911	RAB25	97	71.359	Capra_hircus
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.014	ENSTSYG00000013028	RAB25	97	71.014	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000012060	rab25b	80	79.641	ENSCAPG00000006181	RAB25	97	79.641	Cavia_aperea
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	70.048	ENSCPOG00000002472	RAB25	97	70.048	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000012060	rab25b	70	84.211	ENSCCAG00000021873	RAB25	96	84.211	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	50.481	ENSCATG00000029662	RAB25	97	50.718	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	70.874	ENSCLAG00000003784	RAB25	97	70.874	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.014	ENSCSAG00000002096	RAB25	97	71.014	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	70.952	ENSCPBG00000025817	RAB25	99	70.952	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000012060	rab25b	97	70.558	ENSCANG00000040397	RAB25	89	70.558	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	70.952	ENSCGRG00001017341	Rab25	99	70.952	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	70.952	ENSCGRG00000012173	Rab25	99	70.952	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	89.100	ENSCSEG00000011982	rab25b	97	89.100	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	82.857	ENSCSEG00000017026	rab25a	99	82.857	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	83.333	ENSCVAG00000008126	-	99	83.333	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	91.827	ENSCVAG00000020003	rab25b	100	91.827	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	81.818	ENSDARG00000058800	rab25a	99	81.818	Danio_rerio
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	85.714	ENSDARG00000052954	rab25b	100	85.714	Danio_rerio
ENSSPAG00000012060	rab25b	96	70.500	ENSDNOG00000039155	RAB25	79	70.500	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	69.856	ENSDORG00000002922	Rab25	97	69.856	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.014	ENSEASG00005019133	RAB25	97	71.014	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.014	ENSECAG00000023191	RAB25	97	71.014	Equus_caballus
ENSSPAG00000012060	rab25b	96	72.000	ENSEEUG00000014804	RAB25	85	72.000	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	83.254	ENSELUG00000006604	rab25a	98	83.254	Esox_lucius
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	89.100	ENSELUG00000012060	rab25b	100	89.100	Esox_lucius
ENSSPAG00000012060	rab25b	98	70.673	ENSFCAG00000011775	RAB25	97	70.673	Felis_catus
ENSSPAG00000012060	rab25b	97	67.677	ENSFALG00000002597	RAB25	78	68.528	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	70.952	ENSFDAG00000006897	RAB25	99	70.952	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	93.269	ENSFHEG00000003018	rab25b	100	93.269	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	82.381	ENSFHEG00000014186	rab25a	99	82.381	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000012060	rab25b	81	78.698	ENSGMOG00000006444	rab25b	100	78.698	Gadus_morhua
ENSSPAG00000012060	rab25b	92	84.896	ENSGMOG00000003577	-	96	84.896	Gadus_morhua
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	71.429	ENSGALG00000029812	RAB25	98	71.429	Gallus_gallus
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	91.827	ENSGAFG00000021724	rab25b	100	91.827	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	82.857	ENSGAFG00000011713	rab25a	94	93.590	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000012060	rab25b	100	89.904	ENSGACG00000013249	rab25b	99	89.904	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000012060	rab25b	99	78.947	ENSGACG00000004965	rab25a	99	78.947	Gasterosteus_aculeatus
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ENSSPAG00000012060	rab25b	98	71.014	ENSGGOG00000006821	RAB25	97	71.014	Gorilla_gorilla
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