EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000012564 (Gene tree)
Gene ID: 103375385
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: ras-related protein ORAB-1
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7418 bases
Position: chrKK582645.1:20512-27929
Accession: 103375385
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000016660	MMR_HSR1	PF01926.23	2.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000016923	-	1093	XM_008305649	ENSSPAP00000016660	202 (aa)	XP_008303871	UPI0004976394

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000012564's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000012564's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000012564	-	81	46.626	ENSSPAG00000023185	RAB15	77	46.626
ENSSPAG00000012564	-	81	31.548	ENSSPAG00000018992	si:cabz01085950.1	82	31.548
ENSSPAG00000012564	-	97	36.816	ENSSPAG00000007900	rab9a	95	36.816
ENSSPAG00000012564	-	96	38.660	ENSSPAG00000021333	rab22a	97	38.660
ENSSPAG00000012564	-	59	31.667	ENSSPAG00000005746	arl8ba	62	31.667
ENSSPAG00000012564	-	96	37.313	ENSSPAG00000018203	rab36	78	37.313
ENSSPAG00000012564	-	84	45.614	ENSSPAG00000010919	-	80	45.614
ENSSPAG00000012564	-	79	39.877	ENSSPAG00000023345	RAB7A	79	39.877
ENSSPAG00000012564	-	58	32.231	ENSSPAG00000017321	arl2	61	32.231
ENSSPAG00000012564	-	75	32.237	ENSSPAG00000015015	rras2	81	32.927
ENSSPAG00000012564	-	58	33.898	ENSSPAG00000015869	arl8a	61	33.898
ENSSPAG00000012564	-	84	50.888	ENSSPAG00000012060	rab25b	83	51.205
ENSSPAG00000012564	-	98	75.635	ENSSPAG00000013533	zgc:171927	92	75.635
ENSSPAG00000012564	-	99	46.890	ENSSPAG00000011419	rab11bb	96	46.890
ENSSPAG00000012564	-	96	44.615	ENSSPAG00000020875	rab18b	95	44.615
ENSSPAG00000012564	-	78	37.888	ENSSPAG00000002801	rab34b	63	37.888
ENSSPAG00000012564	-	82	51.205	ENSSPAG00000013422	rab30	82	51.205
ENSSPAG00000012564	-	58	30.328	ENSSPAG00000022062	-	60	30.328
ENSSPAG00000012564	-	80	54.938	ENSSPAG00000019393	RAB11A	80	54.938
ENSSPAG00000012564	-	80	38.554	ENSSPAG00000009806	rab9b	76	38.554
ENSSPAG00000012564	-	98	43.627	ENSSPAG00000015817	rab25a	96	43.627
ENSSPAG00000012564	-	81	44.643	ENSSPAG00000005785	rab33a	73	44.643
ENSSPAG00000012564	-	81	37.576	ENSSPAG00000009928	kras	95	35.912
ENSSPAG00000012564	-	94	96.825	ENSSPAG00000015564	rab1ab	83	96.825
ENSSPAG00000012564	-	83	50.296	ENSSPAG00000010822	rab12	78	46.561
ENSSPAG00000012564	-	79	39.877	ENSSPAG00000001423	-	79	39.877
ENSSPAG00000012564	-	78	38.037	ENSSPAG00000017348	rab34a	61	38.037
ENSSPAG00000012564	-	55	37.500	ENSSPAG00000002659	RAP2B	91	37.903
ENSSPAG00000012564	-	58	32.203	ENSSPAG00000020792	arl8bb	69	32.203
ENSSPAG00000012564	-	97	45.128	ENSSPAG00000005141	-	90	45.128
ENSSPAG00000012564	-	58	33.333	ENSSPAG00000008565	arl4aa	61	33.333
ENSSPAG00000012564	-	57	32.787	ENSSPAG00000017484	-	65	33.051
ENSSPAG00000012564	-	83	52.381	ENSSPAG00000017313	rab11ba	77	52.381
ENSSPAG00000012564	-	96	43.367	ENSSPAG00000015678	rab5aa	89	43.367
ENSSPAG00000012564	-	99	46.411	ENSSPAG00000014559	-	96	46.411
ENSSPAG00000012564	-	84	33.714	ENSSPAG00000005867	rheb	94	33.714
ENSSPAG00000012564	-	98	54.500	ENSSPAG00000022440	-	98	54.500
ENSSPAG00000012564	-	90	32.418	ENSSPAG00000010373	rab23	98	31.188
ENSSPAG00000012564	-	84	45.977	ENSSPAG00000006404	zgc:101559	74	45.977
ENSSPAG00000012564	-	89	41.919	ENSSPAG00000004801	rab33ba	83	41.919
ENSSPAG00000012564	-	84	49.112	ENSSPAG00000015211	rab15	79	49.112
ENSSPAG00000012564	-	85	36.158	ENSSPAG00000007357	hrasb	93	36.158
ENSSPAG00000012564	-	96	38.265	ENSSPAG00000017366	rab6ba	93	38.265
ENSSPAG00000012564	-	100	93.069	ENSSPAG00000022676	rab1ba	100	93.069
ENSSPAG00000012564	-	96	38.191	ENSSPAG00000006001	rab41	91	38.191
ENSSPAG00000012564	-	58	31.092	ENSSPAG00000010587	arl4cb	59	31.092
ENSSPAG00000012564	-	81	35.294	ENSSPAG00000002062	RAB29	82	35.294
ENSSPAG00000012564	-	96	44.615	ENSSPAG00000006436	rab5c	89	45.128
ENSSPAG00000012564	-	81	35.758	ENSSPAG00000004878	rras	83	34.756
ENSSPAG00000012564	-	77	40.252	ENSSPAG00000011224	-	73	40.252
ENSSPAG00000012564	-	84	46.199	ENSSPAG00000010771	RAB39B	80	46.199
ENSSPAG00000012564	-	96	38.889	ENSSPAG00000001067	-	94	38.889
ENSSPAG00000012564	-	97	45.641	ENSSPAG00000022927	rab14	90	45.641
ENSSPAG00000012564	-	86	33.143	ENSSPAG00000012674	rhebl1	92	33.143
ENSSPAG00000012564	-	80	66.049	ENSSPAG00000008400	rab35b	80	66.049
ENSSPAG00000012564	-	61	31.496	ENSSPAG00000004205	-	62	31.496
ENSSPAG00000012564	-	96	35.714	ENSSPAG00000022624	-	87	35.714
ENSSPAG00000012564	-	69	30.496	ENSSPAG00000009787	arl3	77	30.496
ENSSPAG00000012564	-	89	40.437	ENSSPAG00000012955	si:dkey-34d22.5	81	40.437
ENSSPAG00000012564	-	96	37.879	ENSSPAG00000009276	rab6bb	93	37.879
ENSSPAG00000012564	-	99	47.343	ENSSPAG00000012044	rab11al	96	47.343
ENSSPAG00000012564	-	83	43.429	ENSSPAG00000010224	-	78	43.429
ENSSPAG00000012564	-	58	30.081	ENSSPAG00000011431	-	63	30.081
ENSSPAG00000012564	-	87	42.135	ENSSPAG00000016167	rab42a	82	42.135
ENSSPAG00000012564	-	79	61.875	ENSSPAG00000006302	si:dkey-16l2.16	92	53.886

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSG00000138069	RAB1A	98	100.000	Homo_sapiens
ENSSPAG00000012564	-	100	100.000	ENSAPOG00000008143	-	100	100.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSAMEG00000001127	RAB1A	99	95.545	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000012564	-	100	100.000	ENSAOCG00000020606	-	100	100.000	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000012564	-	100	100.000	ENSAPEG00000022488	-	100	100.000	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSANAG00000020929	RAB1A	99	95.545	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000012564	-	100	99.505	ENSACLG00000003326	-	100	99.505	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000012564	-	100	92.574	ENSAMXG00000034850	-	100	92.574	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSBTAG00000016720	RAB1A	99	95.545	Bos_taurus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSCJAG00000046275	RAB1A	99	95.545	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSCAFG00000003187	RAB1A	99	95.545	Canis_familiaris
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSCAFG00020026971	RAB1A	99	95.545	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000012564	-	98	95.431	ENSCHIG00000014060	RAB1A	100	92.683	Capra_hircus
ENSSPAG00000012564	-	100	94.059	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	95.431	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSCPOG00000015437	RAB1A	99	95.545	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSCCAG00000021869	RAB1A	99	95.545	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSCATG00000030853	RAB1A	99	95.545	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSCLAG00000014766	RAB1A	99	95.545	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000012564	-	100	96.040	ENSCPBG00000013243	RAB1A	99	96.040	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000012564	-	100	93.069	ENSCANG00000035916	RAB1A	99	93.069	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSCGRG00001012691	-	99	95.545	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSCGRG00000008456	-	99	95.545	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSDNOG00000018236	RAB1A	99	95.545	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSDORG00000028628	-	99	95.545	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000012564	-	100	85.222	FBgn0285937	Rab1	99	85.222	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	95.545	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSEASG00005007298	RAB1A	99	95.545	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSECAG00000009926	RAB1A	99	95.545	Equus_caballus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	95.545	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000012564	-	100	96.569	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	96.569	Esox_lucius
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSFCAG00000002536	RAB1A	99	95.545	Felis_catus
ENSSPAG00000012564	-	100	94.059	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	94.059	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSFDAG00000019505	-	99	95.545	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000012564	-	100	99.010	ENSFHEG00000014414	-	100	99.010	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000012564	-	100	96.040	ENSGALG00000031582	RAB1A	99	96.040	Gallus_gallus
ENSSPAG00000012564	-	100	97.525	ENSGAFG00000000918	-	100	97.525	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000012564	-	100	96.040	ENSGAGG00000006802	RAB1A	99	96.040	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSGGOG00000026603	RAB1A	99	95.545	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSHGLG00000013585	RAB1A	99	95.545	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000012564	-	100	94.059	ENSHGLG00100007994	RAB1A	99	94.059	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSSTOG00000020693	-	99	95.545	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000012564	-	98	95.431	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	95.431	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000012564	-	98	99.492	ENSKMAG00000014038	-	93	99.492	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000012564	-	100	99.010	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	99.010	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000012564	-	100	96.535	ENSLACG00000012869	RAB1A	99	96.535	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	95.545	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSMFAG00000046246	RAB1A	99	95.545	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000012564	-	98	95.431	ENSMMUG00000021721	RAB1A	91	95.431	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000012564	-	95	96.859	ENSMNEG00000028414	-	96	96.859	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSMLEG00000042535	RAB1A	99	95.545	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000012564	-	100	99.505	ENSMZEG00005013959	-	100	99.505	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000012564	-	98	95.939	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	95.939	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000012564	-	100	95.050	ENSMAUG00000012156	Rab1a	99	95.050	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSMICG00000012587	RAB1A	99	95.545	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.050	ENSMOCG00000017022	Rab1a	99	95.050	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000012564	-	100	97.030	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	97.030	Mola_mola
ENSSPAG00000012564	-	100	96.040	ENSMODG00000003340	RAB1A	99	96.040	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	99	95.545	Mus_caroli
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	95.545	Mus_musculus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	99	95.545	Mus_pahari
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	95.545	Mus_spretus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSMPUG00000006139	RAB1A	80	95.545	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSMLUG00000009489	RAB1A	99	95.545	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSNGAG00000005838	Rab1a	99	95.545	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000012564	-	100	99.505	ENSNBRG00000020492	-	100	99.505	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000012564	-	98	95.431	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	95.431	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000012564	-	94	95.238	ENSODEG00000011248	-	96	95.312	Octodon_degus
ENSSPAG00000012564	-	100	97.525	ENSONIG00000006819	-	99	97.525	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000012564	-	100	96.040	ENSOANG00000012438	RAB1A	99	96.040	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSOCUG00000017003	RAB1A	99	95.545	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSOGAG00000026181	RAB1A	99	95.545	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000012564	-	98	95.431	ENSOARG00000019997	RAB1A	97	95.431	Ovis_aries
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	95.545	Pan_paniscus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSPPRG00000025077	RAB1A	99	95.545	Panthera_pardus
ENSSPAG00000012564	-	98	95.431	ENSPTIG00000013471	RAB1A	97	95.431	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSPTRG00000011989	RAB1A	99	95.545	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSPANG00000010485	RAB1A	99	95.545	Papio_anubis
ENSSPAG00000012564	-	100	93.564	ENSPSIG00000008028	RAB1A	99	93.564	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000012564	-	100	99.010	ENSPMGG00000021015	-	99	99.010	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSPEMG00000009340	Rab1a	99	95.545	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000012564	-	100	96.040	ENSPCIG00000023212	RAB1A	99	96.040	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000012564	-	100	97.030	ENSPFOG00000000498	-	98	97.030	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000012564	-	100	97.030	ENSPLAG00000015592	-	100	97.030	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000012564	-	100	97.030	ENSPMEG00000005288	-	100	97.030	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSPPYG00000012360	RAB1A	99	95.545	Pongo_abelii
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSPCOG00000017244	RAB1A	99	95.545	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000012564	-	100	99.505	ENSPNYG00000015841	-	100	99.505	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSRNOG00000004992	Rab1a	99	95.545	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSSBOG00000023732	RAB1A	99	95.545	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000012564	-	98	95.939	ENSSHAG00000003597	RAB1A	98	94.527	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000012564	-	100	99.505	ENSSMAG00000021049	-	100	99.505	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000012564	-	100	99.505	ENSSDUG00000022535	RAB1A	100	99.505	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000012564	-	100	96.040	ENSSPUG00000012822	RAB1A	99	96.040	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSSSCG00000008359	RAB1A	100	95.431	Sus_scrofa
ENSSPAG00000012564	-	100	94.059	ENSTGUG00000002328	RAB1A	99	94.059	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000012564	-	100	99.505	ENSTRUG00000024994	RAB1A	100	99.505	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000012564	-	98	95.431	ENSUMAG00000021038	RAB1A	99	95.431	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000012564	-	98	94.949	ENSVPAG00000005640	RAB1A	99	94.949	Vicugna_pacos
ENSSPAG00000012564	-	100	95.545	ENSVVUG00000027588	RAB1A	99	95.545	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000012564	-	100	97.525	ENSXMAG00000015776	-	100	97.525	Xiphophorus_maculatus