EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000012904 (Gene tree)
Gene ID: 103356822
Gene Symbol: skiv2l
Alias: fb70b07|wu:fb70b07
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 21983 bases
Position: chrKK580295.1:9757-31739
Accession: 103356822
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000017109	rRNA_proc-arch	PF13234.6	5.8e-29	1	1
ENSSPAP00000017109	DEAD	PF00270.29	2.4e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000017374	-	5050	XM_008281120	ENSSPAP00000017109	1188 (aa)	XP_008279342	-

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000012904's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000012904's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000012904	skiv2l	74	34.922	ENSSPAG00000011319	mtrex	85	34.257

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.069	ENSG00000204351	SKIV2L	98	57.542	Homo_sapiens
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	92.706	ENSAPOG00000008257	skiv2l	95	92.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.441	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	94	61.590	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	89.136	ENSACIG00000016719	skiv2l	95	89.050	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	93.554	ENSAOCG00000017352	skiv2l	95	93.554	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	93.469	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	93.238	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	91.892	ENSATEG00000007601	skiv2l	98	91.892	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	62.026	ENSACAG00000011746	SKIV2L	95	62.222	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.949	ENSANAG00000037992	SKIV2L	94	61.738	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	90.932	ENSACLG00000006886	skiv2l	95	90.932	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	81.352	ENSAMXG00000011517	skiv2l	95	81.113	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.899	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	94	60.953	Bos_taurus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	95	38.929	WBGene00008502	skih-2	95	39.159	Caenorhabditis_elegans
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	62.034	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	94	61.821	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.729	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	94	61.139	Canis_familiaris
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.729	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	94	61.139	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.238	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	94	61.288	Capra_hircus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.102	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	94	61.069	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.699	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	94	60.404	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.780	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	94	61.571	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.984	ENSCATG00000036901	SKIV2L	94	61.120	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.984	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	94	60.720	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.493	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	94	61.288	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	88	59.047	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	94	59.013	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000012904	skiv2l	91	50.227	ENSCING00000005576	-	93	50.227	Ciona_intestinalis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.441	ENSCANG00000039709	SKIV2L	95	60.888	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.362	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	94	61.158	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	87.436	ENSCSEG00000011326	skiv2l	94	87.521	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	90.339	ENSCVAG00000003072	skiv2l	95	90.505	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	83.642	ENSDARG00000062206	skiv2l	95	83.390	Danio_rerio
ENSSPAG00000012904	skiv2l	91	64.955	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	88	65.327	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	91	44.554	FBgn0039117	tst	91	44.215	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000012904	skiv2l	66	74.684	ENSETEG00000009522	SKIV2L	64	74.684	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000012904	skiv2l	96	54.855	ENSEBUG00000013680	-	99	53.958	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000012904	skiv2l	91	62.013	ENSEASG00005015534	SKIV2L	94	62.943	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.102	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	61.674	Equus_caballus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	53	74.308	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	56	74.308	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	84.557	ENSELUG00000000181	skiv2l	95	84.557	Esox_lucius
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.238	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	94	61.558	Felis_catus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	59.695	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	94	59.683	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	89.492	ENSFHEG00000008853	skiv2l	95	89.492	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	80.944	ENSGMOG00000005926	skiv2l	95	80.944	Gadus_morhua
ENSSPAG00000012904	skiv2l	75	56.138	ENSGALG00000035499	SKIV2L	91	55.863	Gallus_gallus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	90.593	ENSGAFG00000002382	skiv2l	95	90.593	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	89.731	ENSGACG00000002927	skiv2l	95	89.731	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	50	68.040	ENSGAGG00000015556	SKIV2L	76	69.723	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.238	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	94	61.037	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	91.102	ENSHBUG00000000726	skiv2l	95	91.102	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.050	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	94	61.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	59.475	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	94	59.450	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	81.277	ENSHCOG00000007191	skiv2l	94	81.277	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	81.334	ENSIPUG00000016263	skiv2l	95	81.529	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	61.236	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	94	61.487	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	53	60.526	ENSLACG00000002986	-	54	60.526	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.271	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	94	61.204	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.238	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	94	61.371	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.238	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	94	61.371	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.238	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	94	61.371	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.984	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	94	61.120	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	91.441	ENSMAMG00000002927	skiv2l	95	91.441	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	91.017	ENSMZEG00005026415	skiv2l	95	91.017	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000012904	skiv2l	72	49.130	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	96	48.069	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.054	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	94	60.837	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.271	ENSMICG00000046331	SKIV2L	94	61.487	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.357	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	94	60.167	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	86.650	ENSMMOG00000014547	skiv2l	94	86.650	Mola_mola
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	61.558	ENSMODG00000015052	SKIV2L	94	61.558	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	84.635	ENSMALG00000010535	skiv2l	94	84.277	Monopterus_albus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.257	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	94	61.158	Mus_caroli
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.003	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	94	61.158	Mus_musculus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.257	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	94	61.493	Mus_pahari
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.833	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	94	60.990	Mus_spretus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.729	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	94	61.037	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.186	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	94	60.902	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	87.660	ENSNBRG00000018650	skiv2l	94	87.404	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.340	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	95	60.101	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000012904	skiv2l	77	63.830	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	73	63.830	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.729	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	94	60.786	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.238	ENSODEG00000017516	SKIV2L	94	60.972	Octodon_degus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	90.847	ENSONIG00000013500	skiv2l	95	90.847	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.662	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	94	61.706	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	88.409	ENSORLG00000002021	skiv2l	95	88.409	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	88.409	ENSORLG00020009462	skiv2l	95	88.409	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	88.240	ENSORLG00015016750	skiv2l	95	88.240	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	89.162	ENSOMEG00000008531	skiv2l	95	89.162	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.525	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	94	61.390	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	57.581	ENSOARG00000002411	-	94	57.680	Ovis_aries
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.455	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	95	60.300	Pan_paniscus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.154	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	94	61.371	Panthera_pardus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.814	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	94	61.037	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.069	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	94	60.870	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.084	ENSPANG00000011501	SKIV2L	95	60.267	Papio_anubis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	78.956	ENSPKIG00000011876	skiv2l	95	78.841	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	85.872	ENSPMGG00000019707	skiv2l	94	86.043	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.003	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	94	61.074	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	61.153	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	94	61.339	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	89.915	ENSPFOG00000002424	skiv2l	95	89.915	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	89.746	ENSPLAG00000018304	skiv2l	95	89.746	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	89.915	ENSPMEG00000006997	skiv2l	95	89.915	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	83.234	ENSPREG00000002277	skiv2l	94	84.170	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.645	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	94	60.452	Pongo_abelii
ENSSPAG00000012904	skiv2l	75	64.286	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	71	64.286	Procavia_capensis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.441	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	94	61.571	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.342	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	94	61.223	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	84.269	ENSPNYG00000017853	skiv2l	94	84.269	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	83.619	ENSPNAG00000011823	skiv2l	95	83.164	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.427	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	94	61.326	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.067	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	94	60.250	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.238	ENSRROG00000036429	SKIV2L	94	61.371	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000012904	skiv2l	89	38.342	YLR398C	-	85	38.535	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.949	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	94	61.841	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	61.307	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	94	60.302	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	81.129	ENSSFOG00015016930	skiv2l	95	81.129	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	91.102	ENSSMAG00000020185	skiv2l	95	91.275	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	92.027	ENSSDUG00000019977	skiv2l	95	92.027	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	84.354	ENSSLDG00000024382	skiv2l	94	84.354	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	95	61.172	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	93	61.257	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	61.204	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	93	62.795	Sus_scrofa
ENSSPAG00000012904	skiv2l	68	80.842	ENSTRUG00000000966	skiv2l	93	68.731	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	85.232	ENSTNIG00000004382	skiv2l	95	85.232	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	92	63.017	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	89	63.017	Tupaia_belangeri
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	56.743	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	94	56.940	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.610	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	95	61.686	Ursus_americanus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	91	62.591	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	94	63.067	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	60.899	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	94	61.176	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	57.895	ENSXETG00000010932	skiv2l	94	57.728	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	88.946	ENSXCOG00000019517	skiv2l	92	88.946	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	90.000	ENSXMAG00000014079	skiv2l	95	89.915	Xiphophorus_maculatus