EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000014364 (Gene tree)
Gene ID: 103372425
Gene Symbol: pop4
Alias: zgc:110597
Full Name: POP4 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7857 bases
Position: chrKK581825.1:10045-17901
Accession: 103372425
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000019025	UPF0086	PF01868.16	6.4e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000019315	-	3628	XM_008302065	ENSSPAP00000019025	224 (aa)	XP_008300287	UPI000495508C

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.725	ENSG00000105171	POP4	99	76.842	Homo_sapiens
ENSSPAG00000014364	pop4	93	55.238	ENSAMEG00000003172	-	94	55.238	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000014364	pop4	93	61.058	ENSAMEG00000018329	-	94	61.538	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000014364	pop4	99	80.543	ENSACIG00000008358	pop4	99	80.543	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000014364	pop4	90	92.537	ENSAOCG00000010116	pop4	98	92.537	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000014364	pop4	100	91.071	ENSAPEG00000002829	pop4	94	91.071	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000014364	pop4	99	85.973	ENSATEG00000013028	pop4	99	85.973	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000014364	pop4	91	61.275	ENSAPLG00000014051	POP4	98	62.255	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000014364	pop4	91	64.216	ENSANAG00000020295	POP4	92	64.878	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000014364	pop4	99	81.448	ENSACLG00000000526	pop4	99	81.448	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000014364	pop4	96	69.907	ENSAMXG00000002899	pop4	97	69.907	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000014364	pop4	93	63.462	ENSBTAG00000002223	POP4	94	64.423	Bos_taurus
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.725	ENSCJAG00000046750	POP4	95	72.093	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000014364	pop4	77	67.442	ENSCAFG00000007630	POP4	93	68.605	Canis_familiaris
ENSSPAG00000014364	pop4	93	62.500	ENSCHIG00000016743	POP4	94	63.462	Capra_hircus
ENSSPAG00000014364	pop4	92	62.136	ENSTSYG00000003488	POP4	93	63.285	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000014364	pop4	96	43.836	ENSCAPG00000011105	POP4	100	44.292	Cavia_aperea
ENSSPAG00000014364	pop4	97	59.459	ENSCPOG00000002992	POP4	100	59.910	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000014364	pop4	97	51.364	ENSCCAG00000034244	-	100	51.364	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.235	ENSCCAG00000020285	-	100	59.910	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000014364	pop4	91	64.390	ENSCATG00000036022	POP4	99	77.895	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.235	ENSCLAG00000013162	POP4	99	60.455	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.725	ENSCSAG00000004868	POP4	93	64.216	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000014364	pop4	93	44.712	ENSCHOG00000002071	POP4	95	45.192	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000014364	pop4	99	58.824	ENSCPBG00000016132	POP4	99	59.276	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000014364	pop4	85	31.959	ENSCING00000023871	-	95	31.959	Ciona_intestinalis
ENSSPAG00000014364	pop4	88	65.482	ENSCANG00000005924	POP4	97	65.990	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000014364	pop4	98	61.086	ENSCGRG00001017185	Pop4	99	61.086	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000014364	pop4	98	61.086	ENSCGRG00000008155	Pop4	99	61.086	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000014364	pop4	98	72.727	ENSCSEG00000002946	pop4	99	72.727	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000014364	pop4	99	59.910	ENSCVAG00000018602	POP4	96	59.910	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	67.873	ENSDARG00000101472	pop4	99	68.326	Danio_rerio
ENSSPAG00000014364	pop4	88	64.975	ENSDNOG00000047663	POP4	78	65.482	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000014364	pop4	71	56.604	ENSDORG00000008577	Pop4	91	57.233	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000014364	pop4	73	31.765	FBgn0035831	CG8038	83	31.765	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000014364	pop4	93	51.442	ENSETEG00000003607	POP4	95	51.923	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000014364	pop4	89	46.262	ENSEBUG00000010447	pop4	82	45.972	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000014364	pop4	92	41.748	ENSEBUG00000008575	pop4	92	41.748	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000014364	pop4	97	39.655	ENSEBUG00000004305	pop4	100	39.301	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000014364	pop4	93	71.154	ENSECAG00000020206	POP4	77	71.154	Equus_caballus
ENSSPAG00000014364	pop4	89	46.535	ENSEEUG00000013109	POP4	100	47.030	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	69.683	ENSELUG00000019812	pop4	99	70.588	Esox_lucius
ENSSPAG00000014364	pop4	93	61.538	ENSFCAG00000001619	POP4	94	62.019	Felis_catus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	60.811	ENSFALG00000000206	POP4	98	61.712	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.235	ENSFDAG00000017859	POP4	92	63.725	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000014364	pop4	96	71.759	ENSFHEG00000012745	pop4	96	71.759	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000014364	pop4	88	70.408	ENSGMOG00000000335	pop4	97	70.408	Gadus_morhua
ENSSPAG00000014364	pop4	99	57.919	ENSGALG00000041972	POP4	92	58.824	Gallus_gallus
ENSSPAG00000014364	pop4	79	72.881	ENSGAFG00000003571	pop4	98	72.881	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000014364	pop4	99	79.186	ENSGACG00000014510	pop4	100	83.152	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	59.729	ENSGAGG00000024544	POP4	79	60.181	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.235	ENSGGOG00000038346	POP4	92	63.725	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000014364	pop4	99	80.995	ENSHBUG00000021821	pop4	99	80.995	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000014364	pop4	96	60.455	ENSHGLG00000015798	POP4	99	60.909	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.235	ENSHGLG00100009737	POP4	92	63.725	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000014364	pop4	100	75.446	ENSHCOG00000020937	pop4	100	75.446	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000014364	pop4	99	64.414	ENSIPUG00000013652	pop4	99	64.414	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000014364	pop4	93	63.462	ENSSTOG00000011016	POP4	94	63.942	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000014364	pop4	91	62.745	ENSJJAG00000013376	Pop4	92	63.725	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000014364	pop4	100	84.375	ENSKMAG00000012250	pop4	100	84.375	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	74.661	ENSLBEG00000014139	pop4	99	74.661	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000014364	pop4	99	74.208	ENSLBEG00000018846	-	99	74.208	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000014364	pop4	100	55.357	ENSLACG00000008581	POP4	100	56.696	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000014364	pop4	99	63.801	ENSLOCG00000005597	pop4	99	64.253	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000014364	pop4	93	62.981	ENSLAFG00000000084	POP4	94	63.462	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.725	ENSMFAG00000029606	POP4	92	64.216	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000014364	pop4	91	62.745	ENSMMUG00000017424	POP4	92	64.390	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000014364	pop4	91	62.745	ENSMNEG00000031374	POP4	92	64.390	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000014364	pop4	91	64.216	ENSMLEG00000043454	POP4	92	65.366	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	87.838	ENSMAMG00000011716	pop4	99	88.235	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	81.448	ENSMZEG00005002360	pop4	99	81.448	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000014364	pop4	98	57.727	ENSMGAG00000005337	POP4	95	60.280	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000014364	pop4	98	60.633	ENSMAUG00000020110	Pop4	99	60.181	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000014364	pop4	93	60.577	ENSMICG00000035730	POP4	92	61.244	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	82.353	ENSMMOG00000015321	pop4	99	82.805	Mola_mola
ENSSPAG00000014364	pop4	93	63.462	ENSMODG00000029406	POP4	89	64.423	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000014364	pop4	100	84.821	ENSMALG00000012571	pop4	100	85.268	Monopterus_albus
ENSSPAG00000014364	pop4	98	60.909	MGP_CAROLIEiJ_G0029600	Pop4	99	61.538	Mus_caroli
ENSSPAG00000014364	pop4	99	61.261	ENSMUSG00000030423	Pop4	99	61.261	Mus_musculus
ENSSPAG00000014364	pop4	98	60.455	MGP_SPRETEiJ_G0030699	Pop4	99	61.712	Mus_spretus
ENSSPAG00000014364	pop4	93	62.019	ENSMPUG00000008041	-	94	62.981	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000014364	pop4	93	54.545	ENSMPUG00000008063	-	89	57.576	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000014364	pop4	93	47.368	ENSMLUG00000010774	POP4	94	47.847	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000014364	pop4	56	70.400	ENSMEUG00000003636	-	100	70.400	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000014364	pop4	88	64.975	ENSOPRG00000004736	POP4	98	66.667	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000014364	pop4	98	59.821	ENSODEG00000013025	POP4	99	60.444	Octodon_degus
ENSSPAG00000014364	pop4	100	80.357	ENSONIG00000003458	pop4	99	80.357	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000014364	pop4	97	60.360	ENSOCUG00000015974	POP4	100	60.811	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	78.281	ENSORLG00000020317	pop4	99	78.281	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000014364	pop4	99	78.281	ENSORLG00015011624	pop4	99	78.281	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000014364	pop4	99	77.828	ENSOMEG00000002538	pop4	99	77.828	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000014364	pop4	93	63.942	ENSOGAG00000011168	POP4	94	65.072	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000014364	pop4	88	64.975	ENSOARG00000004041	POP4	88	65.990	Ovis_aries
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.235	ENSPPAG00000040372	POP4	92	63.902	Pan_paniscus
ENSSPAG00000014364	pop4	93	61.538	ENSPPRG00000010502	POP4	94	62.019	Panthera_pardus
ENSSPAG00000014364	pop4	93	61.538	ENSPTIG00000016598	POP4	94	62.019	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.235	ENSPTRG00000010779	POP4	92	63.902	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.725	ENSPANG00000008546	POP4	92	64.216	Papio_anubis
ENSSPAG00000014364	pop4	91	66.502	ENSPKIG00000004468	pop4	89	66.502	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000014364	pop4	98	59.545	ENSPSIG00000015690	POP4	100	64.216	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.942	ENSPMGG00000008608	pop4	99	64.904	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000014364	pop4	98	60.714	ENSPEMG00000014034	-	97	60.714	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000014364	pop4	98	50.909	ENSPEMG00000019982	-	100	50.909	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000014364	pop4	65	66.207	ENSPMAG00000006265	pop4	73	66.207	Petromyzon_marinus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	60.181	ENSPCIG00000024738	POP4	95	60.181	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	74.661	ENSPFOG00000000925	pop4	99	74.661	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000014364	pop4	99	75.113	ENSPLAG00000003161	pop4	99	75.113	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000014364	pop4	99	74.661	ENSPMEG00000002475	pop4	99	74.661	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000014364	pop4	100	72.768	ENSPREG00000022403	pop4	94	72.768	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.725	ENSPPYG00000009805	POP4	92	64.390	Pongo_abelii
ENSSPAG00000014364	pop4	91	61.084	ENSPCAG00000007737	POP4	91	61.576	Procavia_capensis
ENSSPAG00000014364	pop4	93	61.538	ENSPCOG00000018055	POP4	94	62.019	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000014364	pop4	97	60.268	ENSPVAG00000006069	POP4	100	60.268	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000014364	pop4	99	80.995	ENSPNYG00000020038	pop4	99	80.995	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000014364	pop4	99	65.158	ENSPNAG00000005591	pop4	99	65.158	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000014364	pop4	98	60.455	ENSRNOG00000027646	Pop4	99	61.086	Rattus_norvegicus
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ENSSPAG00000014364	pop4	91	63.725	ENSRROG00000028903	POP4	92	64.216	Rhinopithecus_roxellana
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