EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000014955 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: pop1
Alias: -
Full Name: POP1 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11424 bases
Position: chrKK580089.1:1395114-1406537
Accession: 103364871
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000019846	POP1	PF06978.11	3.7e-37	1	2
ENSSPAP00000019846	POP1	PF06978.11	3.7e-37	2	2
ENSSPAP00000019846	POPLD	PF08170.12	8.5e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000020144	-	2748	XM_008292154	ENSSPAP00000019846	915 (aa)	XP_008290376	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000014955	pop1	100	47.241	ENSG00000104356	POP1	100	47.144	Homo_sapiens
ENSSPAG00000014955	pop1	100	81.344	ENSAPOG00000008198	pop1	100	81.846	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.432	ENSAMEG00000000556	POP1	90	50.108	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000014955	pop1	100	76.259	ENSACIG00000004169	POP1	100	76.259	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	81.846	ENSAOCG00000010991	pop1	100	82.447	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000014955	pop1	100	81.593	ENSAPEG00000007607	pop1	100	81.593	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000014955	pop1	100	72.700	ENSATEG00000024814	POP1	100	74.018	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	51.313	ENSAPLG00000014418	POP1	97	50.875	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.189	ENSACAG00000016083	POP1	90	49.132	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000014955	pop1	86	53.067	ENSANAG00000026360	POP1	99	53.067	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000014955	pop1	100	73.731	ENSACLG00000010951	pop1	100	74.229	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000014955	pop1	100	62.222	ENSAMXG00000014483	POP1	94	62.222	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.000	ENSBTAG00000012596	POP1	90	50.758	Bos_taurus
ENSSPAG00000014955	pop1	85	33.333	WBGene00015486	C05D11.9	96	33.333	Caenorhabditis_elegans
ENSSPAG00000014955	pop1	100	47.271	ENSCJAG00000015567	POP1	100	47.512	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.333	ENSCAFG00000000469	POP1	90	50.000	Canis_familiaris
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.138	ENSCAFG00020026765	POP1	90	48.815	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000014955	pop1	87	56.501	ENSCHIG00000017066	POP1	90	49.837	Capra_hircus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.731	ENSTSYG00000003097	POP1	100	47.144	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000014955	pop1	100	45.508	ENSCAPG00000007251	POP1	100	45.552	Cavia_aperea
ENSSPAG00000014955	pop1	100	47.209	ENSCPOG00000002901	POP1	100	47.255	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	47.301	ENSCCAG00000018939	POP1	100	47.937	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	46.860	ENSCATG00000040916	POP1	100	47.053	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.054	ENSCLAG00000007208	POP1	87	49.946	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.678	ENSCSAG00000012340	POP1	99	50.375	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	47.583	ENSCHOG00000011432	POP1	94	47.634	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000014955	pop1	94	51.795	ENSCPBG00000006373	POP1	89	52.131	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000014955	pop1	89	32.509	ENSCING00000008323	-	92	32.509	Ciona_intestinalis
ENSSPAG00000014955	pop1	100	46.622	ENSCANG00000001647	POP1	100	46.957	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000014955	pop1	93	48.845	ENSCGRG00001017308	Pop1	90	49.075	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000014955	pop1	100	43.900	ENSCGRG00000010824	Pop1	100	44.221	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000014955	pop1	100	67.100	ENSCSEG00000008737	POP1	100	67.568	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000014955	pop1	100	69.889	ENSCVAG00000022248	pop1	100	70.493	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000014955	pop1	52	53.279	ENSDARG00000102087	pop1	99	53.074	Danio_rerio
ENSSPAG00000014955	pop1	94	46.793	ENSDNOG00000019974	POP1	90	46.891	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	42.270	ENSDORG00000015384	Pop1	100	42.689	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000014955	pop1	66	33.704	FBgn0026702	l(1)G0045	67	33.387	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000014955	pop1	87	45.754	ENSETEG00000007839	POP1	88	45.927	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000014955	pop1	51	45.492	ENSEBUG00000009897	pop1	96	44.877	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.378	ENSEASG00005003189	POP1	88	50.649	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.378	ENSECAG00000024236	POP1	90	50.649	Equus_caballus
ENSSPAG00000014955	pop1	52	75.325	ENSEEUG00000003050	-	54	75.325	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	60.040	ENSELUG00000003526	pop1	100	60.843	Esox_lucius
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.678	ENSFCAG00000002168	POP1	90	49.623	Felis_catus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.130	ENSFALG00000005711	POP1	100	46.523	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000014955	pop1	94	48.870	ENSFDAG00000017068	POP1	90	48.927	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000014955	pop1	100	70.517	ENSFHEG00000019518	pop1	100	70.821	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	61.634	ENSGMOG00000000659	POP1	100	61.737	Gadus_morhua
ENSSPAG00000014955	pop1	100	69.756	ENSGAFG00000019770	POP1	100	70.714	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000014955	pop1	100	65.670	ENSGACG00000003499	pop1	100	66.345	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	51.313	ENSGAGG00000011737	POP1	91	50.158	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.677	ENSGGOG00000003176	POP1	90	49.946	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000014955	pop1	100	74.129	ENSHBUG00000021583	pop1	100	74.129	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000014955	pop1	93	49.349	ENSHGLG00000006029	POP1	90	49.409	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000014955	pop1	93	49.349	ENSHGLG00100016879	POP1	90	49.409	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000014955	pop1	100	67.795	ENSHCOG00000013888	pop1	100	67.179	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000014955	pop1	100	53.301	ENSIPUG00000018336	pop1	100	53.158	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	47.328	ENSSTOG00000011455	POP1	97	47.287	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	48.625	ENSJJAG00000013325	Pop1	89	48.732	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	72.811	ENSKMAG00000001346	POP1	100	73.727	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	69.055	ENSLBEG00000024457	POP1	100	69.886	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000014955	pop1	94	52.128	ENSLACG00000012498	POP1	96	51.592	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000014955	pop1	100	54.286	ENSLOCG00000009817	POP1	100	54.187	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.970	ENSLAFG00000010770	POP1	90	51.025	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000014955	pop1	100	46.763	ENSMFAG00000000347	POP1	100	47.150	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000014955	pop1	100	46.866	ENSMNEG00000036870	POP1	100	47.201	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000014955	pop1	100	46.860	ENSMLEG00000034986	POP1	100	47.246	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	73.547	ENSMAMG00000004040	pop1	100	74.048	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	74.129	ENSMZEG00005025448	pop1	100	74.129	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000014955	pop1	94	48.732	ENSMGAG00000012167	POP1	100	46.731	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.182	ENSMAUG00000017537	Pop1	90	49.125	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.194	ENSMICG00000004361	POP1	100	46.109	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	48.751	ENSMOCG00000006356	Pop1	90	49.239	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000014955	pop1	100	70.242	ENSMMOG00000018242	pop1	100	70.347	Mola_mola
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.302	ENSMODG00000006561	POP1	89	49.136	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000014955	pop1	100	71.414	ENSMALG00000012621	POP1	100	71.615	Monopterus_albus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	47.147	MGP_CAROLIEiJ_G0019726	Pop1	90	47.078	Mus_caroli
ENSSPAG00000014955	pop1	100	44.477	ENSMUSG00000022325	Pop1	90	47.078	Mus_musculus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	44.791	MGP_PahariEiJ_G0019735	Pop1	100	44.727	Mus_pahari
ENSSPAG00000014955	pop1	94	47.454	MGP_SPRETEiJ_G0020622	Pop1	90	47.454	Mus_spretus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.592	ENSMPUG00000015250	POP1	90	50.377	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000014955	pop1	94	47.747	ENSMLUG00000010204	POP1	90	47.691	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000014955	pop1	99	47.808	ENSNGAG00000001582	Pop1	100	46.563	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000014955	pop1	100	75.971	ENSNBRG00000002356	pop1	100	75.971	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.000	ENSNLEG00000002541	POP1	90	50.108	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000014955	pop1	94	43.811	ENSMEUG00000003118	POP1	94	43.918	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.383	ENSOPRG00000007667	POP1	90	50.219	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000014955	pop1	93	48.850	ENSODEG00000003984	POP1	90	49.079	Octodon_degus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	74.229	ENSONIG00000016445	pop1	100	74.428	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000014955	pop1	61	46.123	ENSOANG00000001278	-	94	45.726	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.946	ENSOCUG00000017400	POP1	90	50.268	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	70.859	ENSORLG00000002839	pop1	100	71.692	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000014955	pop1	100	70.661	ENSORLG00020022450	POP1	100	71.206	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000014955	pop1	100	70.842	ENSORLG00015012746	POP1	100	71.253	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000014955	pop1	100	69.543	ENSOMEG00000006915	pop1	99	70.699	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000014955	pop1	100	46.951	ENSOGAG00000001466	POP1	100	46.951	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000014955	pop1	100	47.338	ENSPPAG00000018410	POP1	100	47.241	Pan_paniscus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.514	ENSPPRG00000005002	POP1	90	49.138	Panthera_pardus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.249	ENSPTIG00000016527	POP1	90	49.193	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000014955	pop1	100	47.435	ENSPTRG00000020458	POP1	100	47.338	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000014955	pop1	100	46.860	ENSPANG00000009704	POP1	100	47.246	Papio_anubis
ENSSPAG00000014955	pop1	100	56.137	ENSPKIG00000016325	POP1	100	56.740	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000014955	pop1	94	50.976	ENSPSIG00000012343	POP1	92	49.739	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000014955	pop1	100	65.773	ENSPMGG00000022253	POP1	100	65.773	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000014955	pop1	99	45.229	ENSPEMG00000023633	Pop1	100	45.359	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000014955	pop1	94	42.255	ENSPMAG00000003209	POP1	100	42.466	Petromyzon_marinus
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.241	ENSPCIG00000012216	POP1	89	49.132	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000014955	pop1	100	69.827	ENSPFOG00000012490	POP1	100	70.438	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000014955	pop1	100	69.623	ENSPLAG00000004646	POP1	100	70.234	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000014955	pop1	100	69.623	ENSPMEG00000019592	POP1	100	70.642	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000014955	pop1	100	69.929	ENSPREG00000020951	POP1	100	70.438	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000014955	pop1	94	49.839	ENSPPYG00000018777	POP1	90	49.839	Pongo_abelii
ENSSPAG00000014955	pop1	94	47.676	ENSPCAG00000016662	POP1	90	47.568	Procavia_capensis
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ENSSPAG00000014955	pop1	94	48.862	ENSPVAG00000014468	POP1	90	49.512	Pteropus_vampyrus
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