EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000016244 (Gene tree)
Gene ID: 103369784
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22358 bases
Position: chrKK581401.1:121383-143740
Accession: 103369784
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000021662	ResIII	PF04851.15	4.8e-07	1	1
ENSSPAP00000021751	ResIII	PF04851.15	1.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000022002	-	7122	XM_008298588	ENSSPAP00000021662	1407 (aa)	XP_008296810	UPI0004959F60
ENSSPAT00000022095	-	4056	-	ENSSPAP00000021751	1351 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000016244's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000016244's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000016244	sbno1	82	54.641	ENSSPAG00000017717	si:ch73-63e15.2	63	63.492

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.895	ENSG00000139697	SBNO1	99	74.825	Homo_sapiens
ENSSPAG00000016244	sbno1	82	97.652	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	97.652	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.174	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	74.965	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	88.646	ENSACIG00000008088	sbno1	99	88.858	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	96.020	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	96.020	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	95.949	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	95.949	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	94.243	ENSATEG00000006667	sbno1	100	94.243	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	75.678	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	75.879	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	75.107	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	74.175	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	83.303	ENSANAG00000029958	-	99	82.914	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	87.420	ENSACLG00000024913	sbno1	100	87.278	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	82.236	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	82.519	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	75.332	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	75.262	Bos_taurus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.895	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	74.755	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.157	ENSCAFG00000007503	SBNO1	99	77.102	Canis_familiaris
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	80.969	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	80.969	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.975	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	82.975	Capra_hircus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.035	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	76.396	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000016244	sbno1	91	83.124	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	83.124	Cavia_aperea
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	83.124	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	83.124	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	70.790	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	71.685	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.191	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	83.124	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	83.124	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	83.124	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000016244	sbno1	82	81.399	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	80.887	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000016244	sbno1	96	72.356	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	72.940	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	75.143	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	75.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	71.538	ENSCANG00000042688	-	99	71.329	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.079	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	82.079	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.079	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	82.079	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	90.618	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	90.618	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	91.684	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	91.471	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	81.432	ENSDARG00000099080	sbno1	100	82.069	Danio_rerio
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	77.714	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	77.714	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	68.772	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	79.929	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000016244	sbno1	93	71.384	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	71.384	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000016244	sbno1	75	61.418	ENSEBUG00000013823	sbno1	92	61.941	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000016244	sbno1	51	72.702	ENSEASG00005012595	-	92	73.023	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.245	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	75.613	Equus_caballus
ENSSPAG00000016244	sbno1	81	77.596	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	77.596	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	84.017	ENSELUG00000002886	sbno1	99	83.876	Esox_lucius
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.297	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	75.087	Felis_catus
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	75.606	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	75.809	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	80.978	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	80.322	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	91.400	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	91.187	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000016244	sbno1	94	85.543	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	85.543	Gadus_morhua
ENSSPAG00000016244	sbno1	88	75.355	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	75.774	Gallus_gallus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	91.400	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	91.187	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000016244	sbno1	94	90.105	ENSGACG00000015633	sbno1	99	89.955	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	74.643	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	83.633	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.796	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	82.796	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	81.064	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	80.426	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	83.848	ENSHGLG00000014165	-	99	83.453	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000016244	sbno1	91	93.861	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	93.861	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	82.345	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	83.091	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	83.124	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	83.124	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	79.713	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	79.354	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	93.319	ENSKMAG00000009696	sbno1	100	93.319	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	91.489	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	91.702	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	71.469	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.821	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	81.518	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.518	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.476	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.545	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	79.751	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	79.751	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	79.751	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	79.751	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.944	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	82.944	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	93.177	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	92.964	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	75.786	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	75.845	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000016244	sbno1	50	73.487	ENSMAUG00000004834	-	99	73.343	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	80.581	ENSMICG00000006573	-	99	80.216	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.437	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	82.437	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	85.572	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	85.795	Mola_mola
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.000	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	74.930	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	92.964	ENSMALG00000001056	sbno1	100	92.751	Monopterus_albus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.738	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	90.351	Mus_caroli
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.140	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	90.351	Mus_musculus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.035	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	90.351	Mus_pahari
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.387	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	90.351	Mus_spretus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.332	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	75.122	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.755	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	74.685	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000016244	sbno1	92	84.180	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	84.180	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	88.486	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	87.846	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	72.028	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	75.045	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000016244	sbno1	62	71.069	ENSMEUG00000008768	-	93	74.214	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.613	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	74.613	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	83.303	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	83.303	Octodon_degus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	93.258	ENSONIG00000015348	sbno1	100	92.548	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	74.200	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	73.916	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	90.638	ENSORLG00000001593	sbno1	100	90.071	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	90.703	ENSORLG00020015216	sbno1	100	90.206	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	90.845	ENSORLG00015002726	sbno1	100	90.348	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	90.812	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	90.741	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000016244	sbno1	50	72.767	ENSOGAG00000010781	-	99	73.094	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	75.087	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	75.017	Ovis_aries
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.796	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	82.796	Pan_paniscus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.297	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	75.087	Panthera_pardus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.245	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	75.035	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.796	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	82.796	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.944	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	82.944	Papio_anubis
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	80.902	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.775	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	74.751	ENSPSIG00000009572	-	99	74.614	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000016244	sbno1	92	71.634	ENSPSIG00000009256	-	99	72.015	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.258	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	82.258	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.808	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	75.017	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	92.182	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	92.182	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	92.182	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	92.182	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	92.188	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	92.188	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	91.406	ENSPREG00000017746	sbno1	100	91.406	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	74.948	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	75.227	Pongo_abelii
ENSSPAG00000016244	sbno1	88	68.874	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	68.526	Procavia_capensis
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	83.242	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	83.242	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000016244	sbno1	87	83.698	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	83.698	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	92.832	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	92.619	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	82.345	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	81.992	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.437	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	82.585	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	82.944	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	82.944	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000016244	sbno1	97	72.371	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	71.936	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	81.325	ENSSFOG00015019025	sbno1	100	82.241	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	93.461	ENSSMAG00000013640	sbno1	100	93.461	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	95.096	ENSSDUG00000023480	sbno1	100	95.096	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	94.883	ENSSLDG00000007928	sbno1	100	94.883	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000016244	sbno1	89	80.645	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	80.968	Sorex_araneus
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	74.749	ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	74.682	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.105	ENSSSCG00000009776	SBNO1	99	75.035	Sus_scrofa
ENSSPAG00000016244	sbno1	98	75.464	ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	75.668	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	87.943	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	88.582	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000016244	sbno1	57	86.070	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	86.483	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.297	ENSUAMG00000019671	SBNO1	99	75.087	Ursus_americanus
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.297	ENSUMAG00000004002	SBNO1	99	75.087	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000016244	sbno1	95	71.111	ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	71.111	Vicugna_pacos
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	75.262	ENSVVUG00000027807	SBNO1	99	75.052	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000016244	sbno1	99	73.034	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	72.683	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000016244	sbno1	89	88.489	ENSXCOG00000011607	sbno1	99	86.885	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000016244	sbno1	100	91.690	ENSXMAG00000002140	sbno1	100	91.690	Xiphophorus_maculatus