EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000018800 (Gene tree)
Gene ID: 103357465
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC103357465
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13870 bases
Position: chrKK580326.1:340274-354143
Accession: 103357465
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000024866	MMR_HSR1	PF01926.23	5.6e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000025275	-	3241	XM_008282041	ENSSPAP00000024866	448 (aa)	XP_008280263	UPI000497B403

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSSPAG00000010697	si:ch211-11k18.4	99	60.222

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	96.429	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	96.429	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	58.315	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	58.315	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	93.527	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	93.527	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.222	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	96.652	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	96.652	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	96.652	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	96.652	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	91.964	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	91.964	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	99	58.482	ENSACAG00000028632	-	99	58.929	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	81.960	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	81.960	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.793	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.793	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	81	61.308	ENSCING00000020807	-	97	61.308	Ciona_intestinalis
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	98	55.909	ENSCSAVG00000009987	-	98	56.591	Ciona_savignyi
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	90.179	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	87.736	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	59.111	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	98	84.091	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	84.091	Danio_rerio
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	74.490	Danio_rerio
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	79	56.497	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	56.497	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	99	82.287	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	82.287	Esox_lucius
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	59.867	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.867	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	89	55.362	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	55.362	Gadus_morhua
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.667	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	60.667	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	90.402	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	58	95.349	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	95.349	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	81	66.667	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.692	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	59.735	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	59.735	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	92.857	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	92.857	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	99	86.486	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	86.486	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	59.333	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.333	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	79.065	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	79.065	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	96	60.508	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	60.508	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	81	59.452	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	81	59.452	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.000	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	60.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	62.361	ENSLACG00000004899	-	99	62.361	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	99	69.144	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.144	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	99	62.247	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	62.247	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	99	75.391	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	75.391	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	92.188	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	92.188	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	96	60.739	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	60.739	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	59.292	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	59.292	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	92.634	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	92.634	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	57.650	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.650	Mola_mola
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.444	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	60.444	Monopterus_albus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	98	90.433	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	90.433	Monopterus_albus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	92.411	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	92.411	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	96	60.277	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	60.277	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	59.513	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.513	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	93.973	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	93.973	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	87.500	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	87.500	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	61.556	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.889	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	60.889	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	90.402	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	90.402	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	90.625	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	90.625	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	61.556	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	61.111	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	91.741	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	91.741	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	61.778	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	61.333	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	58.952	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	60.222	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	58.575	ENSPKIG00000023918	-	98	58.575	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	76.837	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	76.837	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	60.398	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	60.398	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	86.607	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	86.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	89.800	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	89.800	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	100	61.778	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	61.778	Poecilia_formosa
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