EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000018810 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: si:dkey-89b17.4
Alias: fj14g06|fj60g01|fk87f09|wu:fj14g06|wu:fj60g01|wu:fk87f09
Full Name: si:dkey-89b17.4
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18456 bases
Position: chrKK580579.1:240908-259363
Accession: ZDB-GENE-030131-8215
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000024877	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-54	1	6
ENSSPAP00000024877	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-54	2	6
ENSSPAP00000024877	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-54	3	6
ENSSPAP00000024877	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-54	4	6
ENSSPAP00000024877	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-54	5	6
ENSSPAP00000024877	zf-C2H2	PF00096.26	1.3e-54	6	6
ENSSPAP00000024877	zf-met	PF12874.7	2.2e-09	1	2
ENSSPAP00000024877	zf-met	PF12874.7	2.2e-09	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000025286	-	7098	-	ENSSPAP00000024877	1256 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	42.052	ENSSPAG00000016701	znf646	98	60.714
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	75	30.000	ENSSPAG00000008958	-	75	32.031
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	63	36.364	ENSSPAG00000021978	-	99	36.364
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	99	33.083	ENSSPAG00000022865	-	93	33.051
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	86	32.061	ENSSPAG00000015016	-	76	38.158
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	64	34.821	ENSSPAG00000006749	-	90	34.821
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	95	30.112	ENSSPAG00000020165	-	79	37.895
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	70	30.833	ENSSPAG00000014129	-	99	30.833
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	54	31.818	ENSSPAG00000006539	-	91	31.818
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	90	30.288	ENSSPAG00000008865	-	74	37.963
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	86	43.421	ENSSPAG00000007403	-	91	31.884
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	85	44.643	ENSSPAG00000022041	-	80	38.961
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	85	38.158	ENSSPAG00000006148	-	92	35.385
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	69	33.645	ENSSPAG00000004429	-	93	33.645
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	72	37.963	ENSSPAG00000015796	-	67	37.963
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	61	32.773	ENSSPAG00000004470	-	77	32.773
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	76	33.077	ENSSPAG00000007454	-	89	33.898
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	54	30.078	ENSSPAG00000006832	-	58	32.773
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	64	36.937	ENSSPAG00000009653	-	76	36.937
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	32.903	ENSSPAG00000007231	-	98	36.000
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	63	33.036	ENSSPAG00000011524	-	62	33.036
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	81	30.078	ENSSPAG00000014689	-	86	32.203
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	61	30.038	ENSSPAG00000021008	-	87	41.558
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	70	36.752	ENSSPAG00000014607	-	92	36.522
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	70	30.841	ENSSPAG00000023136	znf526	67	33.750
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	68	30.973	ENSSPAG00000020960	-	99	30.973
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	71	30.216	ENSSPAG00000002850	-	96	31.897
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	59	36.250	ENSSPAG00000013118	-	55	41.270

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	98.965	ENSAPOG00000018015	si:dkey-89b17.4	100	98.965	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	41.032	ENSAPOG00000020151	znf646	98	50.943	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	93.312	ENSACIG00000001025	si:dkey-89b17.4	100	93.073	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	90	54.067	ENSACIG00000023049	znf646	94	54.028	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	99.124	ENSAOCG00000018684	si:dkey-89b17.4	100	99.124	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	41.066	ENSAOCG00000012062	znf646	98	41.647	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	40.416	ENSAPEG00000006427	znf646	98	41.113	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	99.124	ENSAPEG00000007719	si:dkey-89b17.4	100	99.124	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	41.041	ENSATEG00000015206	znf646	98	41.176	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	96.178	ENSATEG00000016814	si:dkey-89b17.4	100	96.178	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	95.310	ENSACLG00000016017	si:dkey-89b17.4	100	95.310	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	41.673	ENSACLG00000012712	znf646	98	41.570	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	41.480	ENSAMXG00000035525	znf646	98	39.385	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	99	67.811	ENSAMXG00000001155	si:dkey-89b17.4	99	66.920	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	84.890	ENSCSEG00000010769	si:dkey-89b17.4	99	84.647	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	39.663	ENSCSEG00000012389	znf646	98	51.786	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	91.342	ENSCVAG00000012420	si:dkey-89b17.4	100	91.501	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	99	66.413	ENSDARG00000075545	si:dkey-89b17.4	99	65.732	Danio_rerio
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	97	41.456	ENSDARG00000061424	znf646	98	48.214	Danio_rerio
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	42.378	ENSELUG00000010423	znf646	98	50.943	Esox_lucius
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	75.078	ENSELUG00000015516	si:dkey-89b17.4	98	74.980	Esox_lucius
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	91.435	ENSFHEG00000019457	si:dkey-89b17.4	100	91.990	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	94	48.276	ENSFHEG00000000561	znf646	98	46.774	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	99	49.004	ENSGMOG00000016554	znf646	99	62.264	Gadus_morhua
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	77	55.556	ENSGAFG00000016353	-	85	55.556	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	92.994	ENSGAFG00000000345	si:dkey-89b17.4	100	92.994	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	62.264	ENSGACG00000008733	znf646	98	62.264	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	76.400	ENSGACG00000014714	si:dkey-89b17.4	99	83.053	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	41.888	ENSHBUG00000004840	znf646	92	63.636	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	95.390	ENSHBUG00000013093	si:dkey-89b17.4	100	95.390	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	88.792	ENSHCOG00000001901	si:dkey-89b17.4	100	88.712	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	97	40.354	ENSHCOG00000014890	znf646	100	40.402	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	41.339	ENSIPUG00000018102	znf646	98	51.786	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	67.011	ENSIPUG00000012845	si:dkey-89b17.4	98	66.216	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	92.607	ENSKMAG00000014037	si:dkey-89b17.4	100	92.846	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	95	40.549	ENSKMAG00000011982	znf646	98	40.613	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	40.522	ENSLBEG00000016562	znf646	99	39.740	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	95.462	ENSLBEG00000020291	si:dkey-89b17.4	100	95.701	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	46.774	ENSLOCG00000003238	si:dkey-89b17.4	99	46.774	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	42.517	ENSMAMG00000009313	znf646	98	41.968	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	96.738	ENSMAMG00000009604	si:dkey-89b17.4	100	96.738	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	95.310	ENSMZEG00005003901	si:dkey-89b17.4	100	95.310	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	41.953	ENSMZEG00005011264	znf646	98	41.570	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	93.392	ENSMMOG00000012741	si:dkey-89b17.4	100	93.392	Mola_mola
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	97	41.943	ENSMMOG00000002311	znf646	100	41.654	Mola_mola
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	96.669	ENSMALG00000019558	si:dkey-89b17.4	100	96.669	Monopterus_albus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	97	40.000	ENSMALG00000002274	-	99	40.345	Monopterus_albus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	41.628	ENSNBRG00000022534	znf646	98	41.835	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	95.134	ENSNBRG00000020314	si:dkey-89b17.4	99	95.134	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	63.436	ENSONIG00000009324	si:dkey-89b17.4	99	63.436	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	41.860	ENSONIG00000019947	-	99	43.284	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	90.294	ENSORLG00000024255	si:dkey-89b17.4	100	90.215	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	38.674	ENSORLG00000007885	znf646	99	38.238	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	38.697	ENSORLG00020010285	znf646	99	38.293	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	38.638	ENSORLG00015008733	znf646	99	38.273	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	100	90.620	ENSOMEG00000020587	si:dkey-89b17.4	100	90.541	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	96	39.387	ENSOMEG00000015658	znf646	99	39.120	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	98	34.531	ENSPMGG00000004639	znf646	99	34.011	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	97	68.976	ENSPMGG00000015931	-	100	67.947	Periophthalmus_magnuspinnatus
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ENSSPAG00000018810	si:dkey-89b17.4	95	37.647	ENSPFOG00000004826	-	99	38.679	Poecilia_formosa
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