EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000019077 (Gene tree)
Gene ID: 103354796
Gene Symbol: esf1
Alias: fe06g12|im:7138472|wu:fe06g12|zgc:66241
Full Name: ESF1 nucleolar pre-rRNA processing protein homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11427 bases
Position: chrKK580191.1:730363-741789
Accession: 103354796
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000025236	NUC153	PF08159.12	1.2e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000025652	-	2487	XM_008278340	ENSSPAP00000025236	772 (aa)	XP_008276562	UPI000496EBAA

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000019077	esf1	89	66.667	ENSG00000089048	ESF1	75	71.795	Homo_sapiens
ENSSPAG00000019077	esf1	70	78.976	ENSAPOG00000003004	esf1	100	77.879	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000019077	esf1	98	73.611	ENSAMEG00000008830	ESF1	75	73.077	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000019077	esf1	100	74.131	ENSACIG00000018305	esf1	100	74.517	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000019077	esf1	100	77.332	ENSAOCG00000006033	esf1	100	79.380	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000019077	esf1	100	82.262	ENSAPEG00000022385	esf1	100	82.134	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000019077	esf1	100	73.783	ENSATEG00000016321	esf1	100	75.000	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000019077	esf1	89	65.882	ENSAPLG00000012113	ESF1	77	66.250	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000019077	esf1	89	71.795	ENSACAG00000000963	ESF1	76	72.727	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000019077	esf1	89	73.077	ENSANAG00000036778	ESF1	75	73.077	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000019077	esf1	100	73.032	ENSACLG00000002972	esf1	100	71.613	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000019077	esf1	78	62.417	ENSAMXG00000001172	esf1	99	60.875	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	70.833	ENSBTAG00000007130	ESF1	75	70.513	Bos_taurus
ENSSPAG00000019077	esf1	95	62.857	ENSCJAG00000004640	ESF1	75	73.077	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSCAFG00000005587	ESF1	75	71.795	Canis_familiaris
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSCAFG00020027530	ESF1	75	71.795	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000019077	esf1	91	72.222	ENSCHIG00000021188	ESF1	77	71.795	Capra_hircus
ENSSPAG00000019077	esf1	95	73.611	ENSTSYG00000009956	ESF1	76	73.077	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000019077	esf1	78	52.483	ENSCAPG00000010333	-	99	50.320	Cavia_aperea
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSCAPG00000010466	-	53	71.795	Cavia_aperea
ENSSPAG00000019077	esf1	87	70.833	ENSCPOG00000014027	-	77	70.513	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000019077	esf1	88	73.077	ENSCCAG00000024521	ESF1	75	73.077	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSCATG00000042792	ESF1	75	73.077	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSCLAG00000013266	-	77	73.077	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSCSAG00000011777	ESF1	75	73.077	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000019077	esf1	89	38.604	ENSCING00000020446	-	73	39.250	Ciona_intestinalis
ENSSPAG00000019077	esf1	77	45.631	ENSCSAVG00000009015	-	79	37.258	Ciona_savignyi
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSCANG00000030674	ESF1	75	73.077	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	70.833	ENSCGRG00001018257	Esf1	76	70.513	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000019077	esf1	78	72.973	ENSCSEG00000001159	esf1	99	66.914	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000019077	esf1	99	68.509	ENSCVAG00000007894	esf1	99	67.613	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000019077	esf1	81	63.166	ENSDARG00000008740	esf1	99	57.494	Danio_rerio
ENSSPAG00000019077	esf1	91	59.048	ENSDNOG00000019409	ESF1	76	70.513	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSDORG00000016313	Esf1	76	73.077	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000019077	esf1	90	39.148	FBgn0024364	CG11417	71	39.858	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000019077	esf1	91	53.846	ENSEBUG00000015161	esf1	79	71.642	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000019077	esf1	90	64.211	ENSEASG00005001777	ESF1	75	71.795	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000019077	esf1	90	64.211	ENSECAG00000019188	ESF1	75	71.795	Equus_caballus
ENSSPAG00000019077	esf1	69	50.472	ENSEEUG00000015837	-	78	49.772	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000019077	esf1	78	68.412	ENSELUG00000000408	esf1	100	62.455	Esox_lucius
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.239	ENSFCAG00000000919	ESF1	75	73.077	Felis_catus
ENSSPAG00000019077	esf1	88	68.354	ENSFALG00000010914	ESF1	76	68.831	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSFDAG00000014777	ESF1	77	73.077	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000019077	esf1	70	72.928	ENSFHEG00000014984	esf1	99	70.290	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000019077	esf1	89	63.529	ENSGALG00000034768	ESF1	76	66.250	Gallus_gallus
ENSSPAG00000019077	esf1	79	70.880	ENSGAFG00000000540	esf1	99	66.282	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000019077	esf1	91	60.000	ENSGGOG00000006692	ESF1	75	71.795	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000019077	esf1	100	73.840	ENSHBUG00000001890	esf1	100	72.938	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSHGLG00000011505	ESF1	78	71.795	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSHGLG00100015045	ESF1	78	71.795	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000019077	esf1	99	59.630	ENSIPUG00000006507	esf1	99	59.601	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000019077	esf1	91	73.611	ENSSTOG00000009846	ESF1	76	73.077	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000019077	esf1	92	58.036	ENSJJAG00000012570	Esf1	75	74.026	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000019077	esf1	88	77.333	ENSLACG00000016439	ESF1	75	77.333	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000019077	esf1	78	63.531	ENSLOCG00000015979	esf1	74	63.226	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000019077	esf1	92	69.444	ENSLAFG00000005479	ESF1	76	70.130	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSMFAG00000036841	ESF1	75	73.077	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSMNEG00000044042	ESF1	75	73.077	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSMLEG00000037121	ESF1	75	71.795	Mandrillus_leucophaeus
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ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSMAUG00000015975	Esf1	76	71.795	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSMICG00000010711	ESF1	75	74.026	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSMOCG00000005902	Esf1	77	71.795	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000019077	esf1	70	74.773	ENSMMOG00000018693	esf1	99	72.958	Mola_mola
ENSSPAG00000019077	esf1	88	70.513	ENSMODG00000005066	ESF1	78	70.513	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000019077	esf1	94	68.108	ENSMALG00000007338	esf1	93	67.534	Monopterus_albus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	MGP_CAROLIEiJ_G0024365	Esf1	76	71.795	Mus_caroli
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSMUSG00000045624	Esf1	75	74.026	Mus_musculus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	MGP_PahariEiJ_G0025810	Esf1	80	72.727	Mus_pahari
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	MGP_SPRETEiJ_G0025285	Esf1	76	74.026	Mus_spretus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSMPUG00000001450	ESF1	75	73.077	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSMLUG00000013080	ESF1	76	71.795	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSNLEG00000014563	ESF1	75	71.795	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000019077	esf1	72	54.513	ENSOPRG00000004862	ESF1	99	53.526	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000019077	esf1	93	70.833	ENSODEG00000006824	ESF1	78	70.513	Octodon_degus
ENSSPAG00000019077	esf1	100	74.069	ENSONIG00000006804	esf1	100	73.171	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000019077	esf1	91	62.857	ENSOANG00000008432	-	76	75.641	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPAG00000019077	esf1	95	73.611	ENSOCUG00000005414	ESF1	77	73.077	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000019077	esf1	70	67.395	ENSORLG00000018625	esf1	99	65.996	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000019077	esf1	78	71.429	ENSORLG00015022826	esf1	99	65.674	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000019077	esf1	70	68.864	ENSOMEG00000009311	esf1	100	67.949	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000019077	esf1	91	59.048	ENSOGAG00000016912	ESF1	77	70.513	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSOARG00000011158	ESF1	73	71.795	Ovis_aries
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSPPAG00000024379	ESF1	76	71.795	Pan_paniscus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.239	ENSPPRG00000012007	ESF1	75	73.077	Panthera_pardus
ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.239	ENSPTIG00000020063	ESF1	75	73.077	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000019077	esf1	87	72.222	ENSPTRG00000013258	ESF1	75	71.795	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000019077	esf1	86	54.074	ENSPMGG00000016911	esf1	73	57.096	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000019077	esf1	94	73.611	ENSPCIG00000019331	ESF1	78	73.077	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000019077	esf1	99	64.578	ENSPFOG00000010101	esf1	80	70.195	Poecilia_formosa
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ENSSPAG00000019077	esf1	66	58.095	ENSPCAG00000006881	ESF1	50	68.831	Procavia_capensis
ENSSPAG00000019077	esf1	87	69.444	ENSPVAG00000001295	ESF1	68	67.949	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000019077	esf1	100	73.196	ENSPNYG00000015735	esf1	100	72.294	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000019077	esf1	99	60.994	ENSPNAG00000014721	esf1	99	62.192	Pygocentrus_nattereri
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ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSRBIG00000035763	ESF1	75	73.077	Rhinopithecus_bieti
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ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSSHAG00000000449	ESF1	80	73.077	Sarcophilus_harrisii
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ENSSPAG00000019077	esf1	87	73.611	ENSSSCG00000007077	ESF1	74	74.026	Sus_scrofa
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ENSSPAG00000019077	esf1	87	70.833	ENSTTRG00000005335	ESF1	75	70.513	Tursiops_truncatus
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