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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000020091 (Gene tree)
Gene ID: 103358121
Gene Symbol: -
Alias: wu:fa56c07|wu:fi27f11|zgc:66238
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 82860 bases
Position: chrKK580362.1:2994-85853
Accession: 103358121
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000026751	ResIII	PF04851.15	1.5e-07	1	1
ENSSPAP00000026711	ResIII	PF04851.15	1.7e-07	1	1
ENSSPAP00000026711	BRK	PF07533.16	1.9e-17	1	1
ENSSPAP00000026751	BRK	PF07533.16	6.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000027189	-	4455	-	ENSSPAP00000026751	1484 (aa)	-	-
ENSSPAT00000027149	-	8380	XM_008282956	ENSSPAP00000026711	1587 (aa)	XP_008281178	UPI0004982612

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPAG00000020091	-	95	70.904	ENSSPAG00000012533	-	97	71.276
ENSSPAG00000020091	-	93	73.743	ENSSPAG00000004248	smarca4a	99	73.026

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000020091	-	97	80.077	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSSPAG00000020091	-	100	97.543	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	100	97.543	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000020091	-	90	75.485	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	99	85.848	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000020091	-	100	90.762	ENSACIG00000015607	SMARCA2	100	90.551	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000020091	-	100	97.292	ENSAOCG00000009647	-	100	97.292	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000020091	-	100	97.480	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	100	97.480	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000020091	-	99	94.388	ENSATEG00000006916	SMARCA2	98	94.133	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000020091	-	89	77.263	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	77.593	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000020091	-	97	79.589	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	79.599	Anolis_carolinensis
ENSSPAG00000020091	-	97	79.949	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	80.451	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000020091	-	100	92.385	ENSACLG00000004248	SMARCA2	100	92.385	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000020091	-	99	86.852	ENSAMXG00000012404	smarca2	100	86.115	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000020091	-	97	79.962	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	80.326	Bos_taurus
ENSSPAG00000020091	-	97	80.181	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	80.000	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000020091	-	97	80.141	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	80.263	Canis_familiaris
ENSSPAG00000020091	-	76	87.850	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	87.850	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000020091	-	97	80.090	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	80.326	Capra_hircus
ENSSPAG00000020091	-	97	77.121	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	80.328	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000020091	-	97	78.303	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	99	78.435	Cavia_aperea
ENSSPAG00000020091	-	97	80.777	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	100	80.827	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000020091	-	97	79.949	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	80.576	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000020091	-	97	78.640	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	80.288	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000020091	-	97	80.647	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	80.702	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000020091	-	94	80.569	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	81.459	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000020091	-	87	81.714	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	81.714	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000020091	-	97	80.821	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	83.236	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000020091	-	97	80.206	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	80.639	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000020091	-	95	74.795	ENSCGRG00001002323	Smarca2	100	75.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000020091	-	98	87.525	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	98	86.535	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000020091	-	87	90.083	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	98	90.371	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000020091	-	100	85.616	ENSDARG00000008904	smarca2	100	85.303	Danio_rerio
ENSSPAG00000020091	-	97	79.579	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	79.801	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000020091	-	97	79.884	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	80.451	Dipodomys_ordii
ENSSPAG00000020091	-	79	62.386	FBgn0000212	brm	93	53.733	Drosophila_melanogaster
ENSSPAG00000020091	-	88	60.650	ENSEBUG00000002449	-	95	62.518	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000020091	-	97	69.939	ENSEBUG00000011442	-	97	69.589	Eptatretus_burgeri
ENSSPAG00000020091	-	97	79.681	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	80.075	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000020091	-	63	88.235	ENSEEUG00000015540	-	64	88.235	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000020091	-	99	82.780	ENSELUG00000010318	smarca2	98	83.452	Esox_lucius
ENSSPAG00000020091	-	97	79.910	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	80.326	Felis_catus
ENSSPAG00000020091	-	97	80.180	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	82.278	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000020091	-	95	79.336	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	78.510	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000020091	-	100	92.250	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	100	92.683	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000020091	-	99	83.481	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	99	83.038	Gadus_morhua
ENSSPAG00000020091	-	97	80.372	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	80.675	Gallus_gallus
ENSSPAG00000020091	-	98	86.286	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	95	86.073	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000020091	-	99	89.727	ENSGACG00000014488	SMARCA2	99	88.966	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000020091	-	97	80.629	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	80.425	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000020091	-	88	86.215	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	81.075	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000020091	-	100	94.210	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	100	94.210	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000020091	-	97	79.600	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	98	80.152	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000020091	-	97	79.884	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	80.326	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000020091	-	92	83.066	ENSHCOG00000015348	-	95	88.075	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000020091	-	99	84.703	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	85.830	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000020091	-	97	80.141	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	80.451	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000020091	-	97	79.820	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	80.062	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000020091	-	100	92.634	ENSKMAG00000015844	-	100	92.567	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000020091	-	97	83.806	ENSLOCG00000011499	smarca2	99	83.406	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000020091	-	97	79.872	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	80.249	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000020091	-	95	79.459	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	80.013	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000020091	-	97	80.206	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	80.639	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000020091	-	95	80.424	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	80.288	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000020091	-	91	86.100	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	79.323	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000020091	-	100	92.902	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	100	92.847	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000020091	-	100	94.336	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	100	94.336	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000020091	-	74	68.560	ENSMGAG00000005160	-	100	68.032	Meleagris_gallopavo
ENSSPAG00000020091	-	97	80.077	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	80.702	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000020091	-	97	80.039	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	80.163	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000020091	-	98	87.995	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	99	86.060	Mola_mola
ENSSPAG00000020091	-	96	80.767	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	80.788	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000020091	-	98	94.399	ENSMALG00000009611	SMARCA2	99	90.701	Monopterus_albus
ENSSPAG00000020091	-	95	79.635	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	79.551	Mus_caroli
ENSSPAG00000020091	-	95	79.824	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSSPAG00000020091	-	97	80.051	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	79.639	Mus_pahari
ENSSPAG00000020091	-	95	79.635	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	90.909	Mus_spretus
ENSSPAG00000020091	-	79	85.335	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	85.569	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000020091	-	97	76.291	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	76.677	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000020091	-	97	78.426	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	78.678	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000020091	-	95	79.643	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	89.426	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000020091	-	95	79.835	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	100	79.399	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000020091	-	94	74.844	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	73.234	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000020091	-	79	81.181	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	75.826	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000020091	-	95	79.851	ENSODEG00000005452	SMARCA2	98	80.316	Octodon_degus
ENSSPAG00000020091	-	99	93.865	ENSONIG00000014163	SMARCA2	99	93.991	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000020091	-	79	86.472	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	79.652	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000020091	-	100	92.772	ENSORLG00000020820	SMARCA2	100	92.893	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000020091	-	100	92.830	ENSORLG00015006289	SMARCA2	100	93.082	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000020091	-	100	92.506	ENSOMEG00000009736	-	100	92.569	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000020091	-	79	86.010	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	79.258	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000020091	-	95	79.809	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	79.562	Ovis_aries
ENSSPAG00000020091	-	97	79.586	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	100	78.094	Pan_paniscus
ENSSPAG00000020091	-	97	79.974	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	80.388	Panthera_pardus
ENSSPAG00000020091	-	97	79.872	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	80.363	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000020091	-	97	75.397	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	75.828	Papio_anubis
ENSSPAG00000020091	-	100	84.789	ENSPKIG00000018469	-	100	84.349	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000020091	-	96	80.687	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	80.337	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000020091	-	99	84.066	ENSPMGG00000013696	-	98	83.875	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000020091	-	97	79.397	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	79.487	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000020091	-	95	70.794	ENSPMAG00000005337	-	97	69.987	Petromyzon_marinus
ENSSPAG00000020091	-	97	80.552	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	80.788	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000020091	-	100	92.216	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	100	92.530	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000020091	-	99	91.719	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	96	91.841	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000020091	-	99	91.588	ENSPMEG00000001815	-	99	91.703	Poecilia_mexicana
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ENSSPAG00000020091	-	97	78.984	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	80.138	Pongo_abelii
ENSSPAG00000020091	-	71	92.754	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	71	92.754	Procavia_capensis
ENSSPAG00000020091	-	97	78.199	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	78.509	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000020091	-	87	92.391	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	89	92.391	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000020091	-	100	90.818	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	100	90.881	Pundamilia_nyererei
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