EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPAG00000021240 (Gene tree)
Gene ID: 103354870
Gene Symbol: polr1e
Alias: zgc:112501
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Stegastes_partitus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 7209 bases
Position: chrKK580194.1:700775-707983
Accession: 103354870
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPAP00000028215	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	2.3e-115	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPAT00000028673	-	4893	XM_008278439	ENSSPAP00000028215	415 (aa)	XP_008276661	UPI000496D2CA

Gene Model

Click here to download ENSSPAG00000021240's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPAG00000021240's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.394	ENSG00000137054	POLR1E	98	46.860	Homo_sapiens
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	83.654	ENSAPOG00000012452	polr1e	100	83.654	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	41.739	ENSAMEG00000010193	POLR1E	95	41.739	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	69.856	ENSACIG00000009884	polr1e	99	74.490	Amphilophus_citrinellus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	91.346	ENSAOCG00000005665	polr1e	100	91.346	Amphiprion_ocellaris
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	91.827	ENSAPEG00000020581	polr1e	100	91.827	Amphiprion_percula
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	81.490	ENSATEG00000020609	polr1e	100	81.490	Anabas_testudineus
ENSSPAG00000021240	polr1e	81	41.192	ENSAPLG00000010340	POLR1E	100	41.192	Anas_platyrhynchos
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.377	ENSANAG00000038046	POLR1E	98	46.377	Aotus_nancymaae
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	80.048	ENSACLG00000013685	polr1e	99	80.048	Astatotilapia_calliptera
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	60.386	ENSAMXG00000018181	polr1e	99	60.386	Astyanax_mexicanus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	47.101	ENSBTAG00000012243	POLR1E	98	47.101	Bos_taurus
ENSSPAG00000021240	polr1e	94	44.332	ENSCJAG00000010512	POLR1E	93	48.118	Callithrix_jacchus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	45.411	ENSCAFG00000002377	POLR1E	98	45.411	Canis_familiaris
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	45.652	ENSCAFG00020017851	POLR1E	98	45.652	Canis_lupus_dingo
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.860	ENSCHIG00000019479	POLR1E	98	46.860	Capra_hircus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.635	ENSTSYG00000002075	POLR1E	98	46.635	Carlito_syrichta
ENSSPAG00000021240	polr1e	70	43.643	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	43.643	Cavia_aperea
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.135	ENSCPOG00000009965	POLR1E	98	46.135	Cavia_porcellus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	42.233	ENSCCAG00000029460	POLR1E	98	42.233	Cebus_capucinus
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.860	ENSCATG00000031732	POLR1E	98	46.860	Cercocebus_atys
ENSSPAG00000021240	polr1e	87	48.619	ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	48.619	Chinchilla_lanigera
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.860	ENSCSAG00000010782	POLR1E	98	46.860	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPAG00000021240	polr1e	95	38.889	ENSCHOG00000013024	POLR1E	82	38.889	Choloepus_hoffmanni
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.301	ENSCPBG00000006923	POLR1E	99	46.539	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.875	ENSCANG00000036112	POLR1E	97	52.727	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	43.855	ENSCGRG00001006197	Polr1e	95	43.855	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	43.373	ENSCGRG00000006430	Polr1e	95	43.373	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	71.981	ENSCSEG00000005121	polr1e	99	71.981	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	77.349	ENSCVAG00000019759	polr1e	100	77.349	Cyprinodon_variegatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	97	61.634	ENSDARG00000006434	polr1e	100	61.298	Danio_rerio
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	41.365	ENSDNOG00000010257	POLR1E	99	41.365	Dasypus_novemcinctus
ENSSPAG00000021240	polr1e	76	46.541	ENSETEG00000018204	POLR1E	89	46.541	Echinops_telfairi
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.875	ENSEASG00005000675	POLR1E	98	46.875	Equus_asinus_asinus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.875	ENSECAG00000014669	POLR1E	98	46.875	Equus_caballus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	38.221	ENSEEUG00000011928	POLR1E	86	38.221	Erinaceus_europaeus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	67.633	ENSELUG00000008150	polr1e	99	67.633	Esox_lucius
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.265	ENSFCAG00000013081	POLR1E	98	46.265	Felis_catus
ENSSPAG00000021240	polr1e	95	47.000	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	47.000	Ficedula_albicollis
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	47.343	ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	47.343	Fukomys_damarensis
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	77.885	ENSFHEG00000009801	polr1e	100	77.885	Fundulus_heteroclitus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	57.108	ENSGMOG00000003336	POLR1E	98	57.108	Gadus_morhua
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	45.714	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	45.714	Gallus_gallus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	75.904	ENSGAFG00000004850	polr1e	100	75.904	Gambusia_affinis
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	71.122	ENSGACG00000016087	polr1e	100	71.122	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	97	42.752	ENSGAGG00000001659	POLR1E	99	42.446	Gopherus_agassizii
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.763	ENSGGOG00000001882	POLR1E	98	48.062	Gorilla_gorilla
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	80.288	ENSHBUG00000002559	polr1e	99	80.288	Haplochromis_burtoni
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	47.837	ENSHGLG00000002036	POLR1E	98	47.837	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	48.077	ENSHGLG00100012784	POLR1E	98	48.077	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	74.458	ENSHCOG00000002774	polr1e	100	74.699	Hippocampus_comes
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	57.349	ENSIPUG00000003019	polr1e	99	57.349	Ictalurus_punctatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.394	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	46.394	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.472	ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	46.472	Jaculus_jaculus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	78.125	ENSKMAG00000000046	polr1e	100	78.125	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	78.554	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	78.554	Labrus_bergylta
ENSSPAG00000021240	polr1e	86	50.964	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	50.964	Latimeria_chalumnae
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	55.156	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	55.156	Lepisosteus_oculatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.618	ENSLAFG00000012831	POLR1E	98	46.618	Loxodonta_africana
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.860	ENSMFAG00000045465	POLR1E	97	47.619	Macaca_fascicularis
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.860	ENSMMUG00000017892	POLR1E	98	46.860	Macaca_mulatta
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	43.026	ENSMNEG00000040283	POLR1E	98	43.026	Macaca_nemestrina
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.860	ENSMLEG00000031135	POLR1E	98	46.860	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	77.590	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	77.590	Mastacembelus_armatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	80.288	ENSMZEG00005021536	polr1e	99	80.288	Maylandia_zebra
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	44.444	ENSMAUG00000021044	Polr1e	95	44.444	Mesocricetus_auratus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	47.356	ENSMICG00000003673	POLR1E	98	47.356	Microcebus_murinus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	43.932	ENSMOCG00000012920	Polr1e	94	43.932	Microtus_ochrogaster
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	78.897	ENSMMOG00000007391	polr1e	100	78.897	Mola_mola
ENSSPAG00000021240	polr1e	96	47.160	ENSMODG00000002884	POLR1E	98	47.160	Monodelphis_domestica
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	81.010	ENSMALG00000002665	polr1e	99	81.010	Monopterus_albus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	44.686	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	98	44.472	Mus_caroli
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	44.578	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	44.361	Mus_musculus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.024	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	98	45.865	Mus_pahari
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	55.556	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	98	44.612	Mus_spretus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	40.948	ENSMPUG00000006040	POLR1E	98	38.495	Mustela_putorius_furo
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	47.343	ENSMLUG00000012688	POLR1E	95	47.343	Myotis_lucifugus
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	45.985	ENSNGAG00000002520	Polr1e	94	45.985	Nannospalax_galili
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	80.529	ENSNBRG00000016822	polr1e	99	80.529	Neolamprologus_brichardi
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.394	ENSNLEG00000003616	POLR1E	97	48.413	Nomascus_leucogenys
ENSSPAG00000021240	polr1e	73	52.889	ENSMEUG00000015372	-	80	52.889	Notamacropus_eugenii
ENSSPAG00000021240	polr1e	86	40.055	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	40.055	Ochotona_princeps
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	47.059	ENSODEG00000014565	POLR1E	94	47.059	Octodon_degus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	80.769	ENSONIG00000008921	polr1e	99	80.769	Oreochromis_niloticus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.377	ENSOCUG00000024773	POLR1E	98	46.377	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	72.837	ENSORLG00000005143	polr1e	100	72.837	Oryzias_latipes
ENSSPAG00000021240	polr1e	93	70.130	ENSORLG00020007271	polr1e	99	70.130	Oryzias_latipes_hni
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	72.837	ENSORLG00015000137	polr1e	100	72.837	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	71.875	ENSOMEG00000013264	polr1e	98	71.875	Oryzias_melastigma
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.135	ENSOGAG00000012981	POLR1E	96	46.135	Otolemur_garnettii
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	47.101	ENSOARG00000011465	POLR1E	95	47.101	Ovis_aries
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.394	ENSPPAG00000034566	POLR1E	97	48.413	Pan_paniscus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.265	ENSPPRG00000005649	POLR1E	98	46.265	Panthera_pardus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.265	ENSPTIG00000009774	POLR1E	98	46.265	Panthera_tigris_altaica
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.394	ENSPTRG00000020944	POLR1E	97	48.413	Pan_troglodytes
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.860	ENSPANG00000025563	POLR1E	98	46.860	Papio_anubis
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	58.195	ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.195	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	45.146	ENSPSIG00000003274	POLR1E	95	45.631	Pelodiscus_sinensis
ENSSPAG00000021240	polr1e	95	67.595	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	67.595	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	45.169	ENSPEMG00000019151	-	95	45.169	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	38.443	ENSPEMG00000022300	-	94	38.443	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	47.722	ENSPCIG00000014798	POLR1E	99	47.722	Phascolarctos_cinereus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	72.562	ENSPFOG00000019627	polr1e	99	72.562	Poecilia_formosa
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	76.867	ENSPLAG00000022679	polr1e	100	76.867	Poecilia_latipinna
ENSSPAG00000021240	polr1e	87	77.437	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	77.437	Poecilia_mexicana
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	75.181	ENSPREG00000009470	polr1e	100	75.181	Poecilia_reticulata
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.377	ENSPPYG00000019061	POLR1E	98	46.377	Pongo_abelii
ENSSPAG00000021240	polr1e	50	41.627	ENSPCAG00000004891	POLR1E	68	41.627	Procavia_capensis
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	47.837	ENSPCOG00000027448	POLR1E	98	47.837	Propithecus_coquereli
ENSSPAG00000021240	polr1e	96	46.633	ENSPVAG00000007940	POLR1E	84	46.384	Pteropus_vampyrus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	80.288	ENSPNYG00000001032	polr1e	99	80.288	Pundamilia_nyererei
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	59.277	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	59.277	Pygocentrus_nattereri
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	44.444	ENSRNOG00000012664	Polr1e	95	44.444	Rattus_norvegicus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.394	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	48.294	Rhinopithecus_bieti
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	46.860	ENSRROG00000031986	POLR1E	98	46.860	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPAG00000021240	polr1e	97	46.341	ENSSBOG00000021415	POLR1E	97	46.341	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPAG00000021240	polr1e	82	47.536	ENSSHAG00000016084	POLR1E	95	47.536	Sarcophilus_harrisii
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	59.233	ENSSFOG00015002293	polr1e	99	59.233	Scleropages_formosus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	79.227	ENSSMAG00000011672	polr1e	93	79.227	Scophthalmus_maximus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	81.250	ENSSDUG00000022279	polr1e	99	81.250	Seriola_dumerili
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	81.490	ENSSLDG00000024918	polr1e	99	81.490	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPAG00000021240	polr1e	56	42.241	ENSSARG00000009810	-	58	42.241	Sorex_araneus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	46.081	ENSSPUG00000009499	POLR1E	100	46.081	Sphenodon_punctatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	44.686	ENSSSCG00000005347	POLR1E	98	44.686	Sus_scrofa
ENSSPAG00000021240	polr1e	95	40.179	ENSTGUG00000007169	POLR1E	100	40.179	Taeniopygia_guttata
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	74.163	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	74.163	Takifugu_rubripes
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	75.962	ENSTNIG00000017812	polr1e	99	75.962	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPAG00000021240	polr1e	95	47.487	ENSTBEG00000013786	POLR1E	84	47.487	Tupaia_belangeri
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	44.258	ENSTTRG00000008294	POLR1E	87	44.258	Tursiops_truncatus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.618	ENSUAMG00000012474	POLR1E	98	48.753	Ursus_americanus
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	46.618	ENSUMAG00000011496	POLR1E	98	46.618	Ursus_maritimus
ENSSPAG00000021240	polr1e	82	42.857	ENSVPAG00000009048	POLR1E	81	42.857	Vicugna_pacos
ENSSPAG00000021240	polr1e	98	45.742	ENSVVUG00000019954	POLR1E	97	45.742	Vulpes_vulpes
ENSSPAG00000021240	polr1e	99	42.619	ENSXETG00000006533	polr1e	99	42.619	Xenopus_tropicalis
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	71.566	ENSXCOG00000013706	polr1e	100	71.566	Xiphophorus_couchianus
ENSSPAG00000021240	polr1e	100	77.590	ENSXMAG00000012484	polr1e	100	77.590	Xiphophorus_maculatus