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Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000000149 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 145663 bases
Position: chrQEPC01000724.1:492490-638152
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000000115	IBN_N	PF03810.19	9.2e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000000129	TNPO1-201	2779	-	ENSSPUP00000000115	890 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	86.547	ENSSPUG00000000736	TNPO2	99	86.547

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSG00000083312	TNPO1	100	97.927	Homo_sapiens
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.820	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	95.768	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	95.768	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000000149	TNPO1	87	93.282	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	93.282	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.933	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.933	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.708	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.708	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	93.123	ENSAPLG00000009619	-	99	93.123	Anas_platyrhynchos
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	97.753	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	97.753	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	85.955	ENSANAG00000025351	-	99	85.955	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.180	ENSANAG00000022453	-	99	96.180	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	63.029	ENSANAG00000027118	-	99	63.252	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	91.685	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.685	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	92.825	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.489	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	96.517	Bos_taurus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.292	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	96.292	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	96	96.499	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	96.499	Canis_familiaris
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	94.045	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	94.045	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.404	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	96.404	Capra_hircus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	92.768	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	95.205	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.180	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	96.180	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	96.629	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.404	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	96.404	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	96.629	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	94	84.148	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	84.148	Choloepus_hoffmanni
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	98.652	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	98.652	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	75.421	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.196	Ciona_savignyi
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	96.629	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	96.517	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000000149	TNPO1	96	96.608	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	96.608	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	92.697	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.697	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.483	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.483	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	92.929	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	Danio_rerio
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	90.594	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	90.594	Dasypus_novemcinctus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	93	96.506	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	96.502	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	57.449	FBgn0035693	CG8219	99	57.449	Drosophila_melanogaster
ENSSPUG00000000149	TNPO1	86	98.876	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	98.876	Echinops_telfairi
ENSSPUG00000000149	TNPO1	94	84.881	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.000	Eptatretus_burgeri
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	96.629	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	96.517	Equus_caballus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	86.492	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	85.948	Esox_lucius
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	96.629	Felis_catus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	98.764	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	98.764	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	96.517	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.827	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.827	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	90.929	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.929	Gadus_morhua
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	97.865	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	97.865	Gallus_gallus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	92.713	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.713	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.034	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.034	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	98.652	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	98.652	Gopherus_agassizii
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	96.629	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	80.605	ENSGGOG00000022535	-	98	80.605	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.371	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.371	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.180	ENSHGLG00000000970	-	99	96.180	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000000149	TNPO1	96	96.145	ENSHGLG00100017090	-	99	96.145	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000000149	TNPO1	97	75.465	ENSHGLG00100000963	-	99	75.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.742	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	96.742	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.596	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	91	90.752	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.752	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000000149	TNPO1	96	89.070	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	Latimeria_chalumnae
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	95.730	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.730	Lepisosteus_oculatus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	97	96.189	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	96.189	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	96.629	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	96.517	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	96.629	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	96.629	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.708	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.708	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.034	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	93.034	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	97.191	Mesocricetus_auratus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	92.921	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	92.921	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	96.517	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000000149	TNPO1	87	93.041	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	93.041	Mola_mola
ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	92.472	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.472	Monopterus_albus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.292	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	97.191	Mus_caroli
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	97.191	Mus_musculus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.404	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	97.191	Mus_pahari
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.292	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	97.191	Mus_spretus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.742	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	96.742	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000000149	TNPO1	96	96.042	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	96.042	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	96.517	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000000149	TNPO1	87	93.152	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	93.152	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	96.629	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000000149	TNPO1	90	90.184	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	90.184	Ochotona_princeps
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.180	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	96.180	Octodon_degus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	92.634	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.634	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	92	97.927	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	96	90.187	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	90.187	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	87	92.866	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.866	Oryzias_latipes
ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	92.897	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	92.897	Oryzias_latipes_hni
ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	93.123	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPUG00000000149	TNPO1	99	93.010	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	Oryzias_melastigma
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	96.629	Otolemur_garnettii
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	96.517	Ovis_aries
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	96.629	Pan_paniscus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	96.629	Panthera_pardus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	96.629	Panthera_tigris_altaica
ENSSPUG00000000149	TNPO1	94	84.669	ENSPTRG00000047731	-	100	84.669	Pan_troglodytes
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	96.629	Pan_troglodytes
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.629	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	96.629	Papio_anubis
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	90.000	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	98.427	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	98.427	Pelodiscus_sinensis
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	90.236	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.236	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	96	96.608	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	96.608	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	97.528	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	97.528	Phascolarctos_cinereus
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.281	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.281	Poecilia_formosa
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.281	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	93.281	Poecilia_latipinna
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.483	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	93.483	Poecilia_mexicana
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	93.386	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	93.386	Poecilia_reticulata
ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	96.517	Pongo_abelii
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ENSSPUG00000000149	TNPO1	100	96.517	ENSPVAG00000013051	TNPO1	99	96.517	Pteropus_vampyrus
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