EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000000836 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 27801 bases
Position: chrQEPC01003729.1:259760-287560
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000001111	PAZ	PF02170.22	1.8e-28	1	1
ENSSPUP00000001111	Piwi	PF02171.17	4.7e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000001172	AGO1-201	2544	-	ENSSPUP00000001111	847 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	84.570	ENSSPUG00000000753	AGO3	99	84.570
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	83.255	ENSSPUG00000000889	AGO4	99	83.255
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	83.532	ENSSPUG00000006608	AGO2	98	83.195

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSG00000092847	AGO1	100	99.744	Homo_sapiens
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSAPOG00000024299	ago1	99	96.340	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSAMEG00000000504	AGO1	99	99.646	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000000836	AGO1	83	91.880	ENSACIG00000005298	ago1	98	91.880	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSAOCG00000017727	ago1	99	96.340	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.340	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSATEG00000008523	ago1	99	96.340	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	93.662	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.662	Anas_platyrhynchos
ENSSPUG00000000836	AGO1	92	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSANAG00000037711	AGO1	99	99.646	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.104	ENSACLG00000000890	ago1	99	96.104	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000000836	AGO1	81	98.397	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.397	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.528	ENSBTAG00000012253	AGO1	99	99.528	Bos_taurus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCJAG00000032023	AGO1	99	99.646	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCAFG00000003443	AGO1	99	99.646	Canis_familiaris
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	99.524	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.365	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.175	ENSCHIG00000011848	-	99	98.710	Capra_hircus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	79.475	ENSTSYG00000032426	-	99	79.542	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSTSYG00000009767	-	99	99.646	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000000836	AGO1	90	93.776	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	92.902	Cavia_aperea
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCPOG00000011568	AGO1	99	99.646	Cavia_porcellus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCCAG00000011823	AGO1	99	99.646	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCATG00000031521	AGO1	100	99.744	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCLAG00000011507	AGO1	99	99.646	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCSAG00000001091	AGO1	99	99.646	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000000836	AGO1	86	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.882	ENSCPBG00000018594	AGO1	99	99.882	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCANG00000039798	AGO1	99	99.646	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCGRG00001022708	Ago1	99	99.646	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	99.646	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	94.548	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.548	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.340	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.576	ENSDARG00000092644	ago1	99	96.576	Danio_rerio
ENSSPUG00000000836	AGO1	92	99.744	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	99.744	Dasypus_novemcinctus
ENSSPUG00000000836	AGO1	93	98.806	ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000000836	AGO1	84	92.697	ENSETEG00000007626	AGO1	99	92.697	Echinops_telfairi
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSEASG00005012086	AGO1	99	99.646	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSECAG00000024353	AGO1	99	99.646	Equus_caballus
ENSSPUG00000000836	AGO1	93	91.360	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.360	Erinaceus_europaeus
ENSSPUG00000000836	AGO1	92	96.803	ENSELUG00000016803	ago1	100	96.803	Esox_lucius
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSFCAG00000000746	AGO1	99	99.646	Felis_catus
ENSSPUG00000000836	AGO1	92	92.092	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.092	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSFDAG00000017210	AGO1	99	99.646	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	92.444	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.444	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000000836	AGO1	88	84.379	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.379	Gadus_morhua
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.764	ENSGALG00000002249	AGO1	99	99.764	Gallus_gallus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.340	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000000836	AGO1	88	96.937	ENSGACG00000012443	ago1	100	96.937	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000000836	AGO1	92	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSGGOG00000003316	AGO1	99	99.646	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.104	ENSHBUG00000010459	ago1	99	96.104	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSHGLG00000011540	AGO1	99	99.646	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSHGLG00100005568	AGO1	99	99.646	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.340	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.340	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSSTOG00000010857	AGO1	99	99.646	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.764	ENSJJAG00000019449	Ago1	99	99.764	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSKMAG00000019464	ago1	99	96.340	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSLBEG00000007694	ago1	99	96.340	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	93.655	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.655	Latimeria_chalumnae
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	94.104	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.104	Lepisosteus_oculatus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.646	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSMFAG00000002846	AGO1	99	99.646	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	95.047	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.018	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	96.226	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	99.744	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSMLEG00000038388	AGO1	99	99.646	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSMAMG00000008381	ago1	99	96.340	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.104	ENSMZEG00005007996	ago1	99	96.104	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	94.386	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.386	Meleagris_gallopavo
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSMAUG00000015189	Ago1	99	99.646	Mesocricetus_auratus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSMICG00000016147	AGO1	99	99.646	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.528	ENSMOCG00000000537	Ago1	99	99.528	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000000836	AGO1	79	98.507	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.507	Mola_mola
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.764	ENSMODG00000023335	AGO1	99	99.764	Monodelphis_domestica
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.301	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.301	Monopterus_albus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.277	Mus_caroli
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.277	Mus_musculus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.277	Mus_pahari
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.277	Mus_spretus
ENSSPUG00000000836	AGO1	85	99.861	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	99.861	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000000836	AGO1	62	99.232	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.232	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.764	ENSNGAG00000017448	Ago1	99	99.764	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000000836	AGO1	92	96.803	ENSNBRG00000010867	ago1	100	96.803	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSNLEG00000011181	AGO1	99	99.646	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000000836	AGO1	85	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSSPUG00000000836	AGO1	93	99.696	ENSOPRG00000012325	AGO1	92	99.696	Ochotona_princeps
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSODEG00000005321	AGO1	99	99.646	Octodon_degus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.104	ENSONIG00000016345	ago1	99	96.104	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	91.026	ENSOANG00000002080	AGO1	99	92.009	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.528	ENSOCUG00000023116	AGO1	99	99.528	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSORLG00000014965	ago1	99	96.340	Oryzias_latipes
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSORLG00020018253	ago1	99	96.340	Oryzias_latipes_hni
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSORLG00015003287	ago1	99	96.340	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSOMEG00000020528	ago1	99	96.340	Oryzias_melastigma
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	99.646	Otolemur_garnettii
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.528	ENSOARG00000019591	AGO1	99	99.528	Ovis_aries
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSPPAG00000034838	AGO1	99	99.646	Pan_paniscus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSPPRG00000006475	AGO1	99	99.646	Panthera_pardus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.410	ENSPTIG00000020991	AGO1	99	99.410	Panthera_tigris_altaica
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSPTRG00000000528	AGO1	99	99.646	Pan_troglodytes
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSPANG00000009060	AGO1	99	99.646	Papio_anubis
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	99.050	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
ENSSPUG00000000836	AGO1	81	97.238	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.238	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSPEMG00000023313	Ago1	99	99.646	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.764	ENSPCIG00000000172	AGO1	99	99.764	Phascolarctos_cinereus
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSPFOG00000005867	ago1	99	96.340	Poecilia_formosa
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSPLAG00000002824	ago1	99	97.974	Poecilia_latipinna
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSPMEG00000001787	ago1	99	97.974	Poecilia_mexicana
ENSSPUG00000000836	AGO1	99	96.340	ENSPREG00000006534	ago1	99	96.340	Poecilia_reticulata
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSPPYG00000001551	AGO1	99	99.646	Pongo_abelii
ENSSPUG00000000836	AGO1	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	Procavia_capensis
ENSSPUG00000000836	AGO1	100	99.646	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	99.744	Propithecus_coquereli
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