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Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000001629 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 240747 bases
Position: chrQEPC01009294.1:755324-996070
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000002159	ResIII	PF04851.15	3.6e-08	1	1
ENSSPUP00000002159	BRK	PF07533.16	1.2e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000002283	SMARCA2-201	4518	-	ENSSPUP00000002159	1505 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	92	70.508	ENSSPUG00000004558	SMARCA4	96	69.180

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	85.836	ENSG00000080503	SMARCA2	99	98.000	Homo_sapiens
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.800	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	95	77.852	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	82	91.719	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	91.719	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	76.847	ENSACIG00000015607	SMARCA2	95	76.559	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.617	ENSAOCG00000009647	-	95	77.326	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.785	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	95	77.559	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	78.395	ENSATEG00000006916	SMARCA2	93	78.162	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	95	84.997	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	98	82.533	Anas_platyrhynchos
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	90.033	ENSACAG00000002423	SMARCA2	98	87.768	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.642	ENSANAG00000026498	SMARCA2	98	85.245	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.940	ENSACLG00000004248	SMARCA2	95	77.660	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.933	ENSAMXG00000012404	smarca2	95	79.736	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	86.733	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	95	86.865	Bos_taurus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.292	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	95	87.558	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.401	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	95	87.426	Canis_familiaris
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	76	91.252	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	94	90.823	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.195	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	95	86.997	Capra_hircus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	84.436	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	97	85.434	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	85.387	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	94	83.311	Cavia_aperea
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.450	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	98	84.130	Cavia_porcellus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	86.294	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	95	87.558	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	86.069	ENSCATG00000031470	SMARCA2	95	87.650	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.325	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	95	86.755	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	91	86.456	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	94	88.387	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	82	82.458	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	83	82.458	Choloepus_hoffmanni
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	93.387	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	98	91.412	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	86.313	ENSCANG00000039597	SMARCA2	93	90.491	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	79.216	ENSCGRG00001002323	Smarca2	95	80.816	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	73.723	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	95	71.802	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	83	77.427	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	92	77.603	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	80.305	ENSDARG00000008904	smarca2	98	78.337	Danio_rerio
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.508	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	95	87.865	Dasypus_novemcinctus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	85.752	ENSDORG00000014832	Smarca2	95	87.667	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	79	60.784	FBgn0000212	brm	81	55.794	Drosophila_melanogaster
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	89	60.770	ENSEBUG00000002449	-	95	62.454	Eptatretus_burgeri
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	91	73.171	ENSEBUG00000011442	-	90	72.238	Eptatretus_burgeri
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	86.939	ENSEASG00005010312	SMARCA2	95	88.176	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	69	94.444	ENSEEUG00000015540	-	68	94.444	Erinaceus_europaeus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	92	79.498	ENSELUG00000010318	smarca2	92	79.707	Esox_lucius
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	86.939	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	98	84.917	Felis_catus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	91.973	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	92.324	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	85.752	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	95	85.023	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	78.047	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	95	77.916	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	74.799	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	94	75.000	Gadus_morhua
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	92.174	ENSGALG00000010164	SMARCA2	97	92.123	Gallus_gallus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	93	73.169	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	90	72.505	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	76.651	ENSGACG00000014488	SMARCA2	95	76.184	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	93.320	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	98	91.347	Gopherus_agassizii
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	82.014	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	85	90.126	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.341	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	95	77.603	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	86.228	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	96	84.460	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.092	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	98	85.243	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	78	85.178	ENSHCOG00000015348	-	87	85.094	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	78.431	ENSIPUG00000011060	smarca2	94	79.571	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	85.845	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	98	85.696	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.375	ENSJJAG00000010867	Smarca2	95	87.575	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.249	ENSKMAG00000015844	-	98	75.681	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	81.741	ENSLOCG00000011499	smarca2	95	81.479	Lepisosteus_oculatus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	85.695	ENSLAFG00000014061	SMARCA2	95	86.118	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	83	92.199	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	95	87.358	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	86.322	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	95	87.359	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	85.621	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	94	87.758	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	91	92.222	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	94	88.502	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.821	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	95	79.164	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.690	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	95	77.953	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	75	76.923	ENSMGAG00000005160	-	94	77.056	Meleagris_gallopavo
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	86.465	ENSMICG00000005162	SMARCA2	95	86.728	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.250	ENSMOCG00000001611	Smarca2	95	87.116	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	75.388	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	94	75.269	Mola_mola
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	90.854	ENSMODG00000003578	SMARCA2	98	88.694	Monodelphis_domestica
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	76.959	ENSMALG00000009611	SMARCA2	94	75.816	Monopterus_albus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	87	89.363	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	96	85.434	Mus_caroli
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	86	90.426	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	98.000	Mus_musculus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	86	90.653	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	95	86.578	Mus_pahari
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	86	90.502	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	97	100.000	Mus_spretus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	82	91.582	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	91.582	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	82.612	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	94	82.956	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	85.593	ENSNGAG00000000108	Smarca2	94	86.193	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	66.888	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	82.587	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	84.186	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	95	85.829	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	80.698	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	98	79.499	Notamacropus_eugenii
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	85	84.874	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	98	80.284	Ochotona_princeps
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	84.190	ENSODEG00000005452	SMARCA2	96	83.152	Octodon_degus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	77.243	ENSONIG00000014163	SMARCA2	94	77.441	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	52	91.026	ENSOANG00000008299	-	95	93.943	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	85.836	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	95	87.375	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	76.974	ENSORLG00000020820	SMARCA2	95	76.883	Oryzias_latipes
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	77.024	ENSORLG00015006289	SMARCA2	95	76.933	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	77.502	ENSOMEG00000009736	-	95	76.893	Oryzias_melastigma
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	85.263	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	94	84.848	Otolemur_garnettii
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	85.818	ENSOARG00000013265	SMARCA2	95	85.865	Ovis_aries
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	90	92.154	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	95	90.774	Pan_paniscus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.005	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	98	84.981	Panthera_pardus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.808	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	93	90.023	Pan_troglodytes
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	81.189	ENSPANG00000025121	SMARCA2	95	81.467	Papio_anubis
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	81.654	ENSPKIG00000018469	-	96	80.759	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	93.067	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	95	93.067	Pelodiscus_sinensis
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	71.591	ENSPMGG00000013696	-	94	71.639	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	86.200	ENSPEMG00000019821	Smarca2	95	86.067	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	92	71.419	ENSPMAG00000005337	-	95	69.889	Petromyzon_marinus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	90.654	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	95	90.454	Phascolarctos_cinereus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	77.719	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	95	76.682	Poecilia_formosa
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	77.321	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	91	76.216	Poecilia_latipinna
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	96	77.306	ENSPMEG00000001815	-	95	76.101	Poecilia_mexicana
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	97	77.139	ENSPREG00000013800	SMARCA2	95	76.117	Poecilia_reticulata
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	87.241	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	95	86.565	Pongo_abelii
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	75	77.544	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	73	77.544	Procavia_capensis
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	84.186	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	95	84.373	Propithecus_coquereli
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	92	88.198	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	91	89.625	Pteropus_vampyrus
ENSSPUG00000001629	SMARCA2	98	75.248	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	95	75.512	Pundamilia_nyererei
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