EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000005251 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7392 bases
Position: chrQEPC01002647.1:1556158-1563549
Accession: 19824
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000006805	SYF2	PF08231.12	4e-55	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000007239	SYF2-201	959	-	ENSSPUP00000006805	253 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSPUG00000005251's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPUG00000005251's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.889	ENSG00000117614	SYF2	95	86.580	Homo_sapiens
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	84.685	ENSAPOG00000001174	syf2	99	80.579	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000005251	SYF2	95	82.231	ENSAMEG00000010115	-	99	82.231	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000005251	SYF2	77	86.667	ENSAMEG00000010134	-	100	86.667	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	81.982	ENSACIG00000023688	syf2	89	81.982	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000005251	SYF2	93	80.833	ENSAOCG00000022046	syf2	98	83.478	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	80.455	ENSAOCG00000010912	syf2	68	79.111	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000005251	SYF2	93	80.833	ENSAPEG00000018858	syf2	93	80.833	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000005251	SYF2	86	84.793	ENSATEG00000007745	syf2	99	79.752	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000005251	SYF2	79	89.447	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	89.447	Anas_platyrhynchos
ENSSPUG00000005251	SYF2	66	77.246	ENSACAG00000026777	-	94	76.433	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000005251	SYF2	81	90.686	ENSACAG00000013653	-	100	90.686	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.889	ENSANAG00000032473	SYF2	95	86.147	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	81.982	ENSACLG00000019916	syf2	99	79.661	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000005251	SYF2	95	78.008	ENSAMXG00000004051	syf2	99	78.008	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	84.914	ENSBTAG00000001651	SYF2	98	84.914	Bos_taurus
ENSSPUG00000005251	SYF2	82	52.381	WBGene00019402	syf-2	99	48.498	Caenorhabditis_elegans
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.889	ENSCJAG00000046570	SYF2	95	86.580	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	85.043	ENSCAFG00000012895	-	95	85.043	Canis_familiaris
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	81.019	ENSCAFG00000030331	-	92	81.019	Canis_familiaris
ENSSPUG00000005251	SYF2	72	79.121	ENSCAFG00020021094	-	83	86.538	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	85.043	ENSCAFG00020021091	-	95	85.043	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000005251	SYF2	94	83.966	ENSCHIG00000020874	SYF2	98	83.966	Capra_hircus
ENSSPUG00000005251	SYF2	94	83.966	ENSTSYG00000005114	SYF2	97	83.966	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000005251	SYF2	78	87.879	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	87.879	Cavia_aperea
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.463	ENSCPOG00000005326	SYF2	94	86.463	Cavia_porcellus
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.889	ENSCCAG00000022459	SYF2	95	86.580	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	85.714	ENSCATG00000026917	SYF2	95	85.714	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	87.773	ENSCLAG00000008474	SYF2	94	87.773	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	85.714	ENSCSAG00000000948	SYF2	95	85.714	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000005251	SYF2	70	69.492	ENSCHOG00000005273	-	98	69.492	Choloepus_hoffmanni
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	92.857	ENSCPBG00000025073	SYF2	98	88.618	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000005251	SYF2	84	54.206	ENSCING00000003017	-	89	53.738	Ciona_intestinalis
ENSSPUG00000005251	SYF2	84	50.935	ENSCSAVG00000006627	-	98	50.935	Ciona_savignyi
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	74.892	ENSCANG00000037322	SYF2	94	74.892	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	87.054	ENSCGRG00001020733	Syf2	93	87.054	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000005251	SYF2	77	87.245	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	86.935	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	74.793	ENSCSEG00000000117	syf2	99	74.793	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000005251	SYF2	87	84.163	ENSCVAG00000019543	syf2	99	79.339	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	80.169	ENSDARG00000004706	syf2	99	80.169	Danio_rerio
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	86.695	ENSDNOG00000047605	SYF2	95	86.695	Dasypus_novemcinctus
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	83.058	ENSDORG00000001274	Syf2	99	83.058	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000005251	SYF2	90	56.957	FBgn0033556	CG12343	99	56.957	Drosophila_melanogaster
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	72.685	ENSETEG00000015729	SYF2	94	73.611	Echinops_telfairi
ENSSPUG00000005251	SYF2	78	58.883	ENSEBUG00000015402	syf2	95	58.883	Eptatretus_burgeri
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	77.155	ENSEASG00005004232	-	96	77.155	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	86.207	ENSEASG00005004224	-	95	86.207	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	86.207	ENSECAG00000010440	-	97	86.207	Equus_caballus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	87.069	ENSECAG00000012023	-	95	87.069	Equus_caballus
ENSSPUG00000005251	SYF2	71	71.508	ENSEEUG00000015084	SYF2	98	71.508	Erinaceus_europaeus
ENSSPUG00000005251	SYF2	87	85.068	ENSELUG00000003465	syf2	93	85.068	Esox_lucius
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	85.043	ENSFCAG00000043095	-	95	85.043	Felis_catus
ENSSPUG00000005251	SYF2	95	82.258	ENSFCAG00000010324	-	86	82.258	Felis_catus
ENSSPUG00000005251	SYF2	81	84.314	ENSFALG00000000460	SYF2	98	77.459	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.463	ENSFDAG00000008310	SYF2	94	86.463	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	68.750	ENSFHEG00000007238	syf2	99	68.750	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	83.721	ENSGMOG00000019138	syf2	96	83.721	Gadus_morhua
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	88.839	ENSGALG00000013639	SYF2	95	84.937	Gallus_gallus
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	78.512	ENSGAFG00000019435	syf2	99	78.512	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000005251	SYF2	86	83.028	ENSGACG00000007305	syf2	99	77.593	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000005251	SYF2	97	88.618	ENSGAGG00000010670	SYF2	98	89.024	Gopherus_agassizii
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.426	ENSGGOG00000012796	SYF2	95	86.147	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	79.828	ENSHBUG00000020477	syf2	100	79.828	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.900	ENSHGLG00000014393	SYF2	94	86.900	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	77.232	ENSHGLG00000004304	-	99	73.305	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.900	ENSHGLG00100014722	SYF2	94	86.900	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000005251	SYF2	100	73.438	ENSHCOG00000012904	syf2	78	77.083	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000005251	SYF2	87	83.182	ENSIPUG00000019859	syf2	92	83.182	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000005251	SYF2	58	84.932	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	84.932	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPUG00000005251	SYF2	79	87.437	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	87.437	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	79.237	ENSKMAG00000013856	syf2	99	79.237	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000005251	SYF2	87	84.932	ENSLBEG00000014425	syf2	99	80.165	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	81.897	ENSLACG00000012064	SYF2	96	81.897	Latimeria_chalumnae
ENSSPUG00000005251	SYF2	93	80.085	ENSLOCG00000002728	syf2	92	80.085	Lepisosteus_oculatus
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	83.951	ENSLAFG00000023150	-	99	83.951	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000005251	SYF2	72	59.783	ENSLAFG00000030814	-	100	59.783	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.147	ENSMFAG00000041831	SYF2	95	86.147	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	87.963	ENSMMUG00000002968	SYF2	95	85.714	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.147	ENSMNEG00000030180	SYF2	95	86.147	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	85.714	ENSMLEG00000030248	SYF2	95	85.714	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000005251	SYF2	95	76.033	ENSMAMG00000010403	syf2	99	77.273	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	78.099	ENSMZEG00005006429	syf2	99	78.099	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000005251	SYF2	79	89.447	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	89.447	Meleagris_gallopavo
ENSSPUG00000005251	SYF2	95	82.573	ENSMAUG00000018974	Syf2	93	88.393	Mesocricetus_auratus
ENSSPUG00000005251	SYF2	79	88.442	ENSMICG00000016191	SYF2	100	88.442	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	87.946	ENSMOCG00000022938	Syf2	93	87.946	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000005251	SYF2	95	76.250	ENSMMOG00000002396	syf2	99	76.250	Mola_mola
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	85.463	ENSMODG00000013951	-	99	85.463	Monodelphis_domestica
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	77.366	ENSMALG00000010706	syf2	99	77.778	Monopterus_albus
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	87.892	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	92	87.892	Mus_caroli
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	87.892	ENSMUSG00000028821	Syf2	92	87.892	Mus_musculus
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	87.892	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	92	87.892	Mus_pahari
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	87.892	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	92	87.892	Mus_spretus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	85.043	ENSMPUG00000015802	-	95	85.043	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	83.333	ENSMPUG00000015801	-	95	83.333	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000005251	SYF2	95	83.750	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	83.750	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000005251	SYF2	93	85.169	ENSNGAG00000007912	Syf2	95	85.169	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	68.145	ENSNBRG00000010720	syf2	99	68.145	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.426	ENSNLEG00000035185	SYF2	95	86.147	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	82.231	ENSOPRG00000012870	SYF2	99	82.231	Ochotona_princeps
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	85.590	ENSODEG00000017664	-	96	85.590	Octodon_degus
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	77.293	ENSODEG00000014338	-	96	77.293	Octodon_degus
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	81.532	ENSONIG00000008213	syf2	99	78.099	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000005251	SYF2	80	89.109	ENSOANG00000009552	SYF2	100	89.109	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.889	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	87.446	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	79.828	ENSORLG00000028820	syf2	100	79.828	Oryzias_latipes
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	79.574	ENSORLG00020018333	syf2	99	79.574	Oryzias_latipes_hni
ENSSPUG00000005251	SYF2	86	83.486	ENSORLG00015014665	syf2	92	83.486	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	80.687	ENSOMEG00000013911	syf2	98	80.687	Oryzias_melastigma
ENSSPUG00000005251	SYF2	97	82.927	ENSOGAG00000009962	SYF2	97	82.927	Otolemur_garnettii
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	84.615	ENSOARG00000006348	-	95	84.615	Ovis_aries
ENSSPUG00000005251	SYF2	77	63.077	ENSOARG00000006269	-	100	63.077	Ovis_aries
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.426	ENSPPAG00000036579	SYF2	95	86.147	Pan_paniscus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	86.325	ENSPPRG00000001638	-	95	86.325	Panthera_pardus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	85.043	ENSPPRG00000001651	-	95	85.043	Panthera_pardus
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	89.352	ENSPTIG00000005711	-	81	87.892	Panthera_tigris_altaica
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	85.043	ENSPTIG00000007036	-	95	85.043	Panthera_tigris_altaica
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.426	ENSPTRG00000000352	SYF2	95	86.147	Pan_troglodytes
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.147	ENSPANG00000008139	SYF2	95	86.147	Papio_anubis
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	80.342	ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.615	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPUG00000005251	SYF2	98	84.615	ENSPSIG00000011816	SYF2	96	84.615	Pelodiscus_sinensis
ENSSPUG00000005251	SYF2	95	77.178	ENSPMGG00000008755	syf2	93	77.178	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	87.500	ENSPEMG00000008283	Syf2	93	87.500	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	88.444	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	87.826	Phascolarctos_cinereus
ENSSPUG00000005251	SYF2	95	78.279	ENSPFOG00000004116	syf2	99	78.279	Poecilia_formosa
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	78.189	ENSPLAG00000006691	syf2	98	81.034	Poecilia_latipinna
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	76.033	ENSPMEG00000011684	syf2	98	78.017	Poecilia_mexicana
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	84.259	ENSPREG00000003009	syf2	99	78.512	Poecilia_reticulata
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	86.266	ENSPPYG00000001713	SYF2	95	86.266	Pongo_abelii
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	59.740	ENSPCOG00000027011	SYF2	93	59.307	Propithecus_coquereli
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	75.107	ENSPVAG00000005841	SYF2	95	75.107	Pteropus_vampyrus
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	81.982	ENSPNYG00000004979	syf2	99	79.661	Pundamilia_nyererei
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	84.234	ENSPNAG00000015570	syf2	93	84.234	Pygocentrus_nattereri
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	87.892	ENSRNOG00000060597	Syf2	92	87.892	Rattus_norvegicus
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	83.550	ENSRBIG00000042970	SYF2	95	83.550	Rhinopithecus_bieti
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	86.147	ENSRROG00000001347	SYF2	95	86.147	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	88.426	ENSSBOG00000020184	SYF2	92	87.500	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	88.000	ENSSHAG00000015630	-	92	86.957	Sarcophilus_harrisii
ENSSPUG00000005251	SYF2	81	88.350	ENSSHAG00000007152	-	100	88.350	Sarcophilus_harrisii
ENSSPUG00000005251	SYF2	89	81.778	ENSSFOG00015023647	syf2	95	81.778	Scleropages_formosus
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	76.860	ENSSMAG00000009867	syf2	99	76.860	Scophthalmus_maximus
ENSSPUG00000005251	SYF2	86	83.945	ENSSDUG00000013072	syf2	98	79.747	Seriola_dumerili
ENSSPUG00000005251	SYF2	86	83.945	ENSSLDG00000012677	syf2	98	79.747	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	64.876	ENSSARG00000012889	SYF2	99	64.876	Sorex_araneus
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	78.099	ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.099	Stegastes_partitus
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	81.405	ENSSSCG00000037481	SYF2	99	81.405	Sus_scrofa
ENSSPUG00000005251	SYF2	59	57.616	ENSTGUG00000001126	SYF2	90	56.452	Taeniopygia_guttata
ENSSPUG00000005251	SYF2	99	75.889	ENSTRUG00000001499	syf2	93	78.390	Takifugu_rubripes
ENSSPUG00000005251	SYF2	88	78.475	ENSTNIG00000016912	syf2	100	78.475	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPUG00000005251	SYF2	91	66.812	ENSTBEG00000017370	SYF2	93	66.376	Tupaia_belangeri
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	82.645	ENSTTRG00000003550	SYF2	99	82.645	Tursiops_truncatus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	83.761	ENSUAMG00000002897	SYF2	95	83.761	Ursus_americanus
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	84.188	ENSUMAG00000013108	SYF2	95	84.188	Ursus_maritimus
ENSSPUG00000005251	SYF2	96	80.992	ENSVPAG00000005705	SYF2	99	80.992	Vicugna_pacos
ENSSPUG00000005251	SYF2	81	88.293	ENSVVUG00000027181	-	92	85.526	Vulpes_vulpes
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	85.043	ENSVVUG00000027175	-	95	85.043	Vulpes_vulpes
ENSSPUG00000005251	SYF2	92	82.328	ENSXETG00000022797	syf2	93	82.328	Xenopus_tropicalis
ENSSPUG00000005251	SYF2	85	85.116	ENSXMAG00000022698	syf2	93	82.883	Xiphophorus_maculatus