EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000005545 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3146 bases
Position: chrQEPC01012145.1:49679-52824
Accession: 8829
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000007164	eRF1_2	PF03464.15	2.5e-36	1	1
ENSSPUP00000007164	eRF1_3	PF03465.15	1.8e-25	1	1
ENSSPUP00000007164	eRF1_1	PF03463.15	1.9e-51	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000007635	PELO-201	1825	-	ENSSPUP00000007164	385 (aa)	-	-

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSG00000152684	PELO	98	91.755	Homo_sapiens
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.260	ENSAPOG00000023072	pelo	97	80.800	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000005545	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000000616	pelo	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000005545	PELO	64	80.567	ENSAPOG00000023700	-	90	80.567	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSAMEG00000007734	PELO	98	92.021	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000005545	PELO	97	75.603	ENSACIG00000014386	pelo	97	79.882	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSAOCG00000023717	pelo	97	81.067	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSAPEG00000011235	pelo	97	81.067	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.818	ENSATEG00000019550	pelo	97	82.133	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000005545	PELO	77	84.899	ENSAPLG00000013265	PELO	97	84.775	Anas_platyrhynchos
ENSSPUG00000005545	PELO	98	90.957	ENSACAG00000004352	PELO	98	90.957	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000005545	PELO	100	92.208	ENSANAG00000014096	PELO	98	92.553	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSACLG00000010305	pelo	97	81.067	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000005545	PELO	97	80.965	ENSAMXG00000020299	pelo	97	80.800	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSBTAG00000003268	PELO	97	92.021	Bos_taurus
ENSSPUG00000005545	PELO	98	57.979	WBGene00011280	pelo-1	99	57.979	Caenorhabditis_elegans
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.948	ENSCJAG00000035190	PELO	98	92.287	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.948	ENSCAFG00020023234	PELO	98	92.287	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSCHIG00000016410	PELO	97	91.755	Capra_hircus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSTSYG00000005203	PELO	98	91.755	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000005545	PELO	100	92.208	ENSCPOG00000027406	PELO	98	92.553	Cavia_porcellus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.948	ENSCCAG00000035600	PELO	98	92.287	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSCATG00000011829	PELO	98	92.021	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSCLAG00000005043	PELO	98	92.021	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSCSAG00000016692	PELO	98	92.021	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.169	ENSCHOG00000000523	PELO	98	91.489	Choloepus_hoffmanni
ENSSPUG00000005545	PELO	98	94.415	ENSCPBG00000007544	PELO	98	94.415	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000005545	PELO	96	67.297	ENSCING00000001979	-	98	66.933	Ciona_intestinalis
ENSSPUG00000005545	PELO	100	67.273	ENSCSAVG00000006158	-	98	67.467	Ciona_savignyi
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSCANG00000023382	PELO	98	92.021	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000005545	PELO	97	90.617	ENSCGRG00001024665	Pelo	98	90.691	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000005545	PELO	97	91.689	ENSCGRG00000004570	Pelo	98	91.755	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSCSEG00000008807	pelo	97	80.800	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.039	ENSCVAG00000016082	pelo	97	81.600	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.299	ENSDARG00000055477	pelo	97	81.600	Danio_rerio
ENSSPUG00000005545	PELO	96	91.892	ENSDNOG00000036721	PELO	94	92.244	Dasypus_novemcinctus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSDORG00000016689	Pelo	98	91.755	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000005545	PELO	96	67.568	FBgn0011207	pelo	95	67.467	Drosophila_melanogaster
ENSSPUG00000005545	PELO	71	78.947	ENSEBUG00000004955	pelo	95	78.947	Eptatretus_burgeri
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSEASG00005013348	PELO	98	91.755	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.779	ENSELUG00000023229	pelo	98	81.972	Esox_lucius
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSFCAG00000032341	PELO	98	91.755	Felis_catus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	94.286	ENSFALG00000004559	PELO	98	94.415	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000005545	PELO	74	92.254	ENSFDAG00000002076	PELO	88	92.254	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.260	ENSFHEG00000009769	pelo	97	80.800	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000005545	PELO	98	79.841	ENSGMOG00000005849	pelo	97	80.000	Gadus_morhua
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.000	ENSGAFG00000019350	pelo	97	80.800	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.299	ENSGACG00000007245	pelo	97	84.066	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000005545	PELO	98	94.149	ENSGAGG00000004018	PELO	98	94.149	Gopherus_agassizii
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSGGOG00000012635	PELO	98	92.021	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSHBUG00000005866	pelo	97	81.067	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSHGLG00000005932	PELO	98	91.755	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000005545	PELO	100	89.091	ENSHGLG00100017627	PELO	98	89.362	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000005545	PELO	100	78.442	ENSHCOG00000016782	pelo	97	78.933	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000005545	PELO	100	79.221	ENSIPUG00000020627	pelo	97	79.467	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.948	ENSSTOG00000027378	PELO	98	92.287	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	90.130	ENSJJAG00000015032	Pelo	98	90.426	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSKMAG00000021305	pelo	97	81.067	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000005545	PELO	99	80.729	ENSLBEG00000022399	pelo	98	81.600	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.169	ENSLAFG00000020551	PELO	98	91.489	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSMFAG00000000651	PELO	98	92.021	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSMMUG00000039101	PELO	98	92.021	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSMNEG00000035538	PELO	98	92.021	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSMLEG00000039113	PELO	98	92.021	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000005545	PELO	97	82.842	ENSMAMG00000013260	pelo	97	82.667	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSMZEG00005014258	pelo	97	81.067	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.169	ENSMAUG00000009770	Pelo	98	91.489	Mesocricetus_auratus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSMICG00000044040	PELO	98	91.755	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSMOCG00000017554	Pelo	98	92.021	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000005545	PELO	100	79.221	ENSMMOG00000001324	pelo	97	80.267	Mola_mola
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.260	ENSMALG00000008194	pelo	97	81.067	Monopterus_albus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	98	92.021	Mus_caroli
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSMUSG00000042275	Pelo	98	92.021	Mus_musculus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.948	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	98	92.287	Mus_pahari
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	98	92.021	Mus_spretus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	90.909	ENSMLUG00000024132	PELO	98	91.223	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	92.208	ENSNGAG00000019331	Pelo	98	92.287	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSNBRG00000011799	pelo	97	81.067	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSNLEG00000035970	PELO	98	92.021	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.169	ENSMEUG00000005468	PELO	98	91.489	Notamacropus_eugenii
ENSSPUG00000005545	PELO	98	90.501	ENSOPRG00000018793	PELO	99	90.957	Ochotona_princeps
ENSSPUG00000005545	PELO	100	92.468	ENSODEG00000017579	PELO	98	92.819	Octodon_degus
ENSSPUG00000005545	PELO	96	80.863	ENSONIG00000011511	pelo	97	80.800	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSOCUG00000023902	PELO	98	92.021	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.779	ENSORLG00000005827	pelo	97	81.333	Oryzias_latipes
ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.039	ENSORLG00020016456	pelo	97	81.600	Oryzias_latipes_hni
ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.299	ENSORLG00015014447	pelo	97	81.867	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPUG00000005545	PELO	100	83.117	ENSOMEG00000021567	pelo	97	83.467	Oryzias_melastigma
ENSSPUG00000005545	PELO	100	92.208	ENSOGAG00000027940	PELO	98	92.553	Otolemur_garnettii
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSOARG00000008324	PELO	97	92.021	Ovis_aries
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSPPAG00000038951	PELO	98	92.021	Pan_paniscus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSPPRG00000018800	PELO	98	91.755	Panthera_pardus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSPTIG00000019988	PELO	98	91.755	Panthera_tigris_altaica
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSPTRG00000034409	PELO	98	92.021	Pan_troglodytes
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSPANG00000010902	PELO	98	92.021	Papio_anubis
ENSSPUG00000005545	PELO	100	81.558	ENSPKIG00000015190	pelo	97	82.400	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPUG00000005545	PELO	98	94.681	ENSPSIG00000004971	PELO	98	94.681	Pelodiscus_sinensis
ENSSPUG00000005545	PELO	67	77.907	ENSPMGG00000014561	pelo	95	77.907	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSPEMG00000015584	Pelo	98	92.021	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSPCIG00000004880	PELO	98	92.021	Phascolarctos_cinereus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSPFOG00000007277	pelo	97	81.067	Poecilia_formosa
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSPLAG00000020787	pelo	97	81.067	Poecilia_latipinna
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSPMEG00000016964	pelo	97	81.067	Poecilia_mexicana
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSPREG00000023071	pelo	97	81.067	Poecilia_reticulata
ENSSPUG00000005545	PELO	97	91.689	ENSPPYG00000015451	PELO	94	91.755	Pongo_abelii
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSPCOG00000021178	PELO	98	91.755	Propithecus_coquereli
ENSSPUG00000005545	PELO	100	80.519	ENSPNYG00000017325	pelo	97	81.067	Pundamilia_nyererei
ENSSPUG00000005545	PELO	97	80.697	ENSPNAG00000012458	pelo	97	80.533	Pygocentrus_nattereri
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.429	ENSRNOG00000061128	Pelo	98	91.755	Rattus_norvegicus
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSRBIG00000007299	PELO	98	92.021	Rhinopithecus_bieti
ENSSPUG00000005545	PELO	100	91.688	ENSRROG00000035507	PELO	98	92.021	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPUG00000005545	PELO	98	34.115	YNL001W	-	97	34.211	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSPUG00000005545	PELO	100	92.208	ENSSBOG00000036140	PELO	98	92.553	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPUG00000005545	PELO	63	92.213	ENSSHAG00000010770	PELO	96	92.766	Sarcophilus_harrisii
ENSSPUG00000005545	PELO	98	81.963	ENSSFOG00015013399	pelo	97	82.133	Scleropages_formosus
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