EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000006114 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: POLR2E
Alias: RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5
Full Name: RNA polymerase II subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11647 bases
Position: chrQEPC01010893.1:841518-853164
Accession: 9192
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000007898	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	1.7e-33	1	1
ENSSPUP00000007898	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	6.5e-35	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000008418	POLR2E-201	1038	-	ENSSPUP00000007898	210 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSPUG00000006114's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPUG00000006114's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	ENSG00000099817	POLR2E	100	97.619	Homo_sapiens
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSAPOG00000002935	polr2eb	100	96.190	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSAMEG00000003159	POLR2E	100	98.095	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	82.857	ENSACIG00000024371	polr2eb	100	82.857	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSAOCG00000018166	polr2eb	100	96.190	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSAPEG00000009000	polr2eb	100	96.190	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSATEG00000023760	polr2eb	100	96.190	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSANAG00000038488	POLR2E	100	98.095	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSACLG00000005254	polr2eb	100	95.714	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.667	ENSAMXG00000018915	POLR2E	100	96.667	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSBTAG00000020776	POLR2E	100	98.095	Bos_taurus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	99	76.923	WBGene00019246	rpb-5	99	76.923	Caenorhabditis_elegans
ENSSPUG00000006114	POLR2E	67	94.286	ENSCJAG00000007666	-	77	94.286	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	94.762	ENSCAFG00000019546	POLR2E	100	94.762	Canis_familiaris
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSCAFG00020017111	POLR2E	100	98.095	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSCHIG00000014151	POLR2E	100	98.095	Capra_hircus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	79.535	ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	79.535	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000006114	POLR2E	91	97.917	ENSCAPG00000010843	POLR2E	93	97.917	Cavia_aperea
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSCPOG00000001542	POLR2E	100	98.095	Cavia_porcellus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSCCAG00000025658	POLR2E	100	98.095	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSCATG00000008926	POLR2E	100	98.095	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000006114	POLR2E	98	74.634	ENSCLAG00000009238	-	100	74.634	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	ENSCLAG00000014874	-	100	97.619	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSCSAG00000012336	POLR2E	100	98.095	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.571	ENSCPBG00000009702	POLR2E	100	98.571	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	85.238	ENSCING00000024933	-	99	85.238	Ciona_intestinalis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSCANG00000025560	POLR2E	100	98.095	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	ENSCGRG00001022927	Polr2e	100	97.143	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	90.698	ENSCGRG00000016441	Polr2e	100	90.698	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	94.286	ENSCSEG00000007107	polr2eb	92	94.286	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSCVAG00000019940	polr2eb	100	96.190	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.238	ENSDARG00000026183	polr2eb	100	95.238	Danio_rerio
ENSSPUG00000006114	POLR2E	90	97.895	ENSDNOG00000044994	POLR2E	84	97.895	Dasypus_novemcinctus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSDORG00000001154	Polr2e	100	98.095	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000006114	POLR2E	99	84.689	FBgn0033571	Rpb5	99	84.689	Drosophila_melanogaster
ENSSPUG00000006114	POLR2E	75	91.083	ENSEBUG00000010159	-	76	91.083	Eptatretus_burgeri
ENSSPUG00000006114	POLR2E	69	92.414	ENSEASG00005021615	POLR2E	67	86.420	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	91	96.859	ENSECAG00000011124	POLR2E	100	85.238	Equus_caballus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	94.762	ENSELUG00000005815	POLR2E	100	94.762	Esox_lucius
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	93.810	ENSELUG00000020646	polr2e	100	93.810	Esox_lucius
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	ENSFCAG00000007318	POLR2E	100	97.619	Felis_catus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	91	98.438	ENSFALG00000013986	POLR2E	99	98.438	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSFDAG00000014539	POLR2E	100	98.095	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSFHEG00000022398	polr2eb	100	96.190	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	94.762	ENSGMOG00000007615	polr2eb	100	94.762	Gadus_morhua
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.571	ENSGALG00000002591	POLR2E	100	98.571	Gallus_gallus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSGAFG00000005087	polr2eb	100	95.714	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	94.762	ENSGACG00000013247	polr2eb	100	94.762	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.571	ENSGAGG00000008356	POLR2E	100	98.571	Gopherus_agassizii
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSGGOG00000011267	POLR2E	100	98.095	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000006114	POLR2E	68	90.141	ENSHBUG00000011099	polr2eb	100	90.141	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	ENSHGLG00000013330	POLR2E	100	97.619	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	ENSHGLG00100011014	POLR2E	100	97.619	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	94.762	ENSHCOG00000000906	polr2eb	100	94.762	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000006114	POLR2E	53	92.857	ENSHCOG00000012099	-	88	92.857	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSIPUG00000019801	polr2e	100	96.190	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSSTOG00000002853	POLR2E	100	98.095	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	77	79.503	ENSJJAG00000015812	-	100	79.503	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	78.095	ENSJJAG00000003145	-	100	78.095	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	ENSJJAG00000016595	-	100	97.143	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSKMAG00000005954	polr2eb	100	96.190	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSLBEG00000024802	polr2eb	100	96.190	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	Latimeria_chalumnae
ENSSPUG00000006114	POLR2E	77	96.296	ENSLOCG00000004599	POLR2E	100	96.296	Lepisosteus_oculatus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	78.774	ENSLAFG00000025587	POLR2E	100	78.774	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSMFAG00000002884	POLR2E	100	98.095	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSMMUG00000013927	POLR2E	100	98.095	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSMNEG00000034046	-	100	98.095	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	65.877	ENSMNEG00000033452	-	100	65.877	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000006114	POLR2E	92	80.311	ENSMLEG00000012405	POLR2E	94	80.311	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSMAMG00000018703	polr2eb	100	96.190	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	90	95.263	ENSMZEG00005010796	polr2eb	96	95.263	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.104	ENSMGAG00000003769	POLR2E	100	98.104	Meleagris_gallopavo
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	66.667	ENSMAUG00000011003	-	100	66.667	Mesocricetus_auratus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	92	96.373	ENSMAUG00000010125	-	100	96.859	Mesocricetus_auratus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSMICG00000013063	POLR2E	100	98.095	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	ENSMOCG00000013414	Polr2e	100	97.143	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000006114	POLR2E	91	86.911	ENSMMOG00000001167	polr2eb	88	86.911	Mola_mola
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	81.905	ENSMMOG00000001161	polr2eb	100	81.905	Mola_mola
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.571	ENSMODG00000005494	POLR2E	100	98.571	Monodelphis_domestica
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSMALG00000021888	polr2eb	100	95.714	Monopterus_albus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	100	97.143	Mus_caroli
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	ENSMUSG00000004667	Polr2e	100	97.143	Mus_musculus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	100	97.143	Mus_pahari
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	100	97.143	Mus_spretus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	ENSMPUG00000008953	POLR2E	100	97.143	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSMLUG00000013193	POLR2E	100	98.095	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	66	91.304	ENSMLUG00000006376	-	100	80.247	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	85	72.626	ENSNGAG00000017344	-	96	72.626	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	ENSNGAG00000001147	Polr2e	100	97.143	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	82.857	ENSNBRG00000022772	polr2eb	100	82.857	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	94.313	ENSNLEG00000001207	-	100	94.313	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	74.762	ENSNLEG00000031364	-	100	74.762	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	85.238	ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	85.238	Ochotona_princeps
ENSSPUG00000006114	POLR2E	89	86.559	ENSODEG00000007985	-	100	86.559	Octodon_degus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSODEG00000013230	-	100	98.095	Octodon_degus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	70.476	ENSODEG00000011490	-	100	70.476	Octodon_degus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.238	ENSONIG00000002519	polr2eb	100	95.238	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSORLG00000015346	polr2eb	100	95.714	Oryzias_latipes
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSORLG00020020700	polr2e	100	95.714	Oryzias_latipes_hni
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSORLG00015016842	polr2e	100	95.714	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSOMEG00000002709	polr2eb	100	96.190	Oryzias_melastigma
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSOGAG00000012311	POLR2E	100	98.095	Otolemur_garnettii
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSOARG00000010994	POLR2E	100	98.095	Ovis_aries
ENSSPUG00000006114	POLR2E	91	97.906	ENSPPAG00000003145	POLR2E	100	97.906	Pan_paniscus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	ENSPPRG00000000777	POLR2E	100	97.619	Panthera_pardus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	91	75.521	ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	91.447	Panthera_tigris_altaica
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSPTRG00000010183	POLR2E	100	98.095	Pan_troglodytes
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSPANG00000018011	POLR2E	100	98.095	Papio_anubis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.238	ENSPKIG00000009607	POLR2E	100	95.238	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSPKIG00000024123	POLR2E	100	95.714	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPUG00000006114	POLR2E	98	94.634	ENSPSIG00000002870	POLR2E	99	94.634	Pelodiscus_sinensis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	83.333	ENSPMGG00000014354	polr2eb	100	83.333	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	ENSPEMG00000023261	Polr2e	100	97.143	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPUG00000006114	POLR2E	90	98.413	ENSPCIG00000007312	POLR2E	75	98.413	Phascolarctos_cinereus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSPFOG00000005734	polr2eb	100	95.714	Poecilia_formosa
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSPLAG00000014496	polr2eb	100	95.714	Poecilia_latipinna
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSPMEG00000008053	polr2eb	100	95.714	Poecilia_mexicana
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSPREG00000006489	polr2eb	100	95.714	Poecilia_reticulata
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	90.521	ENSPPYG00000009305	POLR2E	100	90.521	Pongo_abelii
ENSSPUG00000006114	POLR2E	53	98.198	ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	98.198	Procavia_capensis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSPCOG00000014491	POLR2E	100	98.095	Propithecus_coquereli
ENSSPUG00000006114	POLR2E	65	100.000	ENSPVAG00000007718	-	65	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	90	95.263	ENSPNYG00000019797	polr2eb	96	95.263	Pundamilia_nyererei
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSPNAG00000026263	POLR2E	100	96.190	Pygocentrus_nattereri
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.143	ENSRNOG00000013545	Polr2e	100	97.143	Rattus_norvegicus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	72.512	ENSRBIG00000027259	-	100	72.512	Rhinopithecus_bieti
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSRBIG00000028726	-	100	98.095	Rhinopithecus_bieti
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSRROG00000043763	POLR2E	100	98.095	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPUG00000006114	POLR2E	99	42.202	YBR154C	RPB5	98	42.202	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSSBOG00000027241	POLR2E	100	98.095	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.571	ENSSHAG00000010690	POLR2E	100	98.571	Sarcophilus_harrisii
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSSFOG00015006073	polr2e	100	96.190	Scleropages_formosus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSSMAG00000012782	polr2eb	100	96.190	Scophthalmus_maximus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSSDUG00000003352	polr2eb	100	96.190	Seriola_dumerili
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSSLDG00000004965	polr2eb	100	96.190	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSSPAG00000017556	polr2eb	100	96.190	Stegastes_partitus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSSSCG00000021472	POLR2E	100	98.095	Sus_scrofa
ENSSPUG00000006114	POLR2E	66	88.571	ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	88.571	Taeniopygia_guttata
ENSSPUG00000006114	POLR2E	96	91.542	ENSTRUG00000018238	polr2eb	100	83.333	Takifugu_rubripes
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	96.190	ENSTNIG00000013187	polr2eb	100	96.190	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	97.619	Tursiops_truncatus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	92	94.845	ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	84.762	Ursus_americanus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	98.095	ENSVVUG00000022818	POLR2E	54	98.095	Vulpes_vulpes
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	97.619	ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.619	Xenopus_tropicalis
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	82.857	ENSXCOG00000009197	polr2eb	100	82.857	Xiphophorus_couchianus
ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	ENSXMAG00000026495	polr2eb	100	95.714	Xiphophorus_maculatus