EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000009057 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: XPO1
Alias: CRM1|emb
Full Name: exportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 70542 bases
Position: chrQEPC01013355.1:3265423-3335964
Accession: 12825
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000011943	CRM1_C	PF08767.11	5.2e-136	1	1
ENSSPUP00000011969	CRM1_C	PF08767.11	1.8e-135	1	1
ENSSPUP00000011943	Xpo1	PF08389.12	4.6e-41	1	1
ENSSPUP00000011969	Xpo1	PF08389.12	4.8e-41	1	1
ENSSPUP00000011943	IBN_N	PF03810.19	1.9e-12	1	1
ENSSPUP00000011969	IBN_N	PF03810.19	2.1e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000012764	XPO1-202	3216	-	ENSSPUP00000011969	1071 (aa)	-	-
ENSSPUT00000012737	XPO1-201	4042	-	ENSSPUP00000011943	1027 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.150	ENSG00000082898	XPO1	100	99.441	Homo_sapiens
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.397	ENSAPOG00000004984	-	100	96.265	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	90.319	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.319	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.222	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	99.160	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	96.489	ENSACIG00000010818	-	100	96.489	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	92.660	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.660	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.397	ENSAOCG00000010121	-	100	96.265	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	92.308	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	91.877	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000009057	XPO1	95	92.482	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.482	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.397	ENSAPEG00000007038	-	100	96.265	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	92.113	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	91.503	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.397	ENSATEG00000008816	-	100	96.265	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.533	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	99.533	Anas_platyrhynchos
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.346	ENSACAG00000002501	XPO1	100	99.346	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.150	ENSANAG00000020802	XPO1	100	98.133	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.300	ENSACLG00000015192	-	100	96.078	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	92.979	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.979	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.787	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.639	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	93.856	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	93.856	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.318	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	99.253	Bos_taurus
ENSSPUG00000009057	XPO1	99	52.879	WBGene00002078	xpo-1	99	51.797	Caenorhabditis_elegans
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.150	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	98.133	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.318	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	99.253	Canis_familiaris
ENSSPUG00000009057	XPO1	97	99.197	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	99.197	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.318	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	99.253	Capra_hircus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.318	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	99.253	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000009057	XPO1	55	95.035	ENSCAPG00000006454	-	100	95.035	Cavia_aperea
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	97.858	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	97.759	Cavia_porcellus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	79.128	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	79.314	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.462	ENSCATG00000032674	XPO1	100	97.979	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.026	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	98.973	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.150	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	98.133	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000009057	XPO1	83	99.092	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	99.092	Choloepus_hoffmanni
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.440	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	99.440	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	82.004	ENSCING00000024562	-	100	80.912	Ciona_intestinalis
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	80.173	ENSCSAVG00000005965	-	99	79.925	Ciona_savignyi
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	93.931	ENSCANG00000028883	XPO1	100	98.227	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.053	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	98.039	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.053	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	98.039	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	95.319	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.319	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.397	ENSCVAG00000016788	-	100	96.172	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	91.626	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.223	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	97.079	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	97.012	Danio_rerio
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	93.476	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	94.892	Danio_rerio
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.416	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	99.346	Dasypus_novemcinctus
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	95.633	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	95.633	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	71.304	FBgn0020497	emb	99	70.759	Drosophila_melanogaster
ENSSPUG00000009057	XPO1	94	97.791	ENSETEG00000018045	XPO1	94	97.786	Echinops_telfairi
ENSSPUG00000009057	XPO1	94	79.564	ENSEBUG00000012580	-	100	88.015	Eptatretus_burgeri
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.318	ENSEASG00005007223	XPO1	100	99.253	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.318	ENSECAG00000024920	XPO1	100	99.253	Equus_caballus
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	100.000	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	95.106	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.106	Esox_lucius
ENSSPUG00000009057	XPO1	91	92.934	ENSELUG00000014306	-	99	92.934	Esox_lucius
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.318	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	99.253	Felis_catus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.253	ENSFALG00000010989	XPO1	100	99.253	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	97.566	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	97.386	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	91.918	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.503	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	90.196	ENSGMOG00000019063	-	100	90.196	Gadus_morhua
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	93.184	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	92.717	Gadus_morhua
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.533	ENSGALG00000029476	XPO1	100	99.533	Gallus_gallus
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	92.553	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.553	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000009057	XPO1	95	96.189	ENSGAFG00000003355	-	98	96.189	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	91.821	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	91.410	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.105	ENSGACG00000002743	-	100	95.985	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.346	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	99.346	Gopherus_agassizii
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.150	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	98.133	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.397	ENSHBUG00000020037	-	100	96.172	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	92.502	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.063	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.929	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	98.880	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.929	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	98.880	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	95.319	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.319	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	94.547	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	93.931	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.787	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	96.639	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.124	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	99.066	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.124	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	99.066	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	92.113	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.503	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.008	ENSKMAG00000016218	-	100	95.705	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	90.042	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.042	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.397	ENSLBEG00000005740	-	100	96.265	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	77.839	ENSLACG00000018213	XPO1	100	77.839	Latimeria_chalumnae
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	97.079	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.919	Lepisosteus_oculatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.929	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	98.880	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.150	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	98.133	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.150	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	98.133	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.150	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	98.133	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.465	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	96.465	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	92.210	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	91.783	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.300	ENSMAMG00000010568	-	100	96.172	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	92.502	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.063	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	96.300	ENSMZEG00005018158	-	98	96.189	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000009057	XPO1	71	99.036	ENSMGAG00000001496	-	100	99.036	Meleagris_gallopavo
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.053	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	98.039	Mesocricetus_auratus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.318	ENSMICG00000027770	XPO1	100	99.253	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.345	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	98.319	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000009057	XPO1	91	96.158	ENSMMOG00000008001	-	99	96.158	Mola_mola
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	92.660	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	92.660	Mola_mola
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.247	ENSMODG00000002831	XPO1	100	98.133	Monodelphis_domestica
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	95.910	ENSMALG00000007085	-	100	95.798	Monopterus_albus
ENSSPUG00000009057	XPO1	92	91.817	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	91.817	Monopterus_albus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.442	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	98.413	Mus_caroli
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.539	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	98.506	Mus_musculus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.442	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	98.413	Mus_pahari
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	98.539	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	98.506	Mus_spretus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.318	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	99.253	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.221	ENSMLUG00000010670	XPO1	100	99.160	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	99.124	ENSNGAG00000022158	Xpo1	100	99.066	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000009057	XPO1	96	95.753	ENSNBRG00000012229	-	100	96.596	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000009057	XPO1	100	92.502	ENSNBRG00000003776	xpo1a	100	92.063	Neolamprologus_brichardi
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