EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000010249 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 56219 bases
Position: chrQEPC01006872.1:2983080-3039298
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000013341	GTP_EFTU	PF00009.27	4.7e-43	1	1
ENSSPUP00000013341	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1e-12	1	1
ENSSPUP00000013341	EFG_IV	PF03764.18	2.4e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000014222	EFTUD2-201	3820	-	ENSSPUP00000013341	972 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSSPUG00000010249's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSPUG00000010249's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	87	38.603	ENSSPUG00000011003	EEF2	99	38.488
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	87	38.558	ENSSPUG00000014537	-	99	38.444
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	83	30.769	ENSSPUG00000000941	EFL1	71	30.769

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.872	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	97.531	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	88.477	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.272	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	87	87.647	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	87.647	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.770	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	92.284	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.078	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	99	94.130	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.130	Anas_platyrhynchos
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	98.148	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	98.148	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	97.634	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.872	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.667	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.788	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	90.788	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	97.325	Bos_taurus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	99	69.835	WBGene00001166	eftu-2	99	69.525	Caenorhabditis_elegans
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	97.634	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	97.531	Canis_familiaris
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	97.531	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	97.325	Capra_hircus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	97.325	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.914	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	96.914	Cavia_aperea
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.914	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	96.914	Cavia_porcellus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	97.634	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	97.634	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.914	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	96.914	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	97.634	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	91	84.910	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	84.910	Choloepus_hoffmanni
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.942	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	97.942	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	77.128	ENSCING00000009372	-	100	77.026	Ciona_intestinalis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	99	78.004	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.481	Ciona_savignyi
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	97.634	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	97.222	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	97.222	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.461	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.255	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	92.078	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.872	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.339	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	Danio_rerio
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	97.222	Dasypus_novemcinctus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	97.325	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	74.769	FBgn0039566	CG4849	100	74.667	Drosophila_melanogaster
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	92	98.913	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	98.913	Echinops_telfairi
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	74	94.030	ENSEBUG00000004047	-	96	87.065	Eptatretus_burgeri
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	97.531	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.428	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	97.428	Equus_caballus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.432	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.741	Esox_lucius
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.428	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	97.428	Felis_catus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.840	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.119	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	97.119	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	91.770	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.844	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.255	Gadus_morhua
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.840	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.384	Gallus_gallus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.872	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.358	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.152	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	97.634	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.770	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.564	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.016	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	97.016	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.016	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	97.016	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.638	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.638	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.638	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.049	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.872	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	95.191	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	96	97.436	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	97.436	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.461	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.255	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	95	91.370	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.118	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	94.033	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	Latimeria_chalumnae
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.667	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	91.872	Lepisosteus_oculatus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.222	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	97.634	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	97.634	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	97.634	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	92.181	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	91.975	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.872	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.667	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.844	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.844	Meleagris_gallopavo
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	97.222	Mesocricetus_auratus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	97.634	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	ENSMOCG00000009039	-	100	97.325	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	92	80.112	ENSMOCG00000017653	-	90	80.112	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	87	93.294	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.294	Mola_mola
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.840	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	97.840	Monodelphis_domestica
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	87	91.647	ENSMALG00000014501	eftud2	100	91.647	Monopterus_albus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.016	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	97.016	Mus_caroli
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.016	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	97.016	Mus_musculus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.016	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	97.016	Mus_pahari
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.016	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	97.016	Mus_spretus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	97	97.246	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	97.246	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	97.531	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	97.222	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.770	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.564	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	97	95.749	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	95.749	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	94.033	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	94.033	Notamacropus_eugenii
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	89.095	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	89.095	Ochotona_princeps
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.605	ENSODEG00000018041	-	100	96.605	Octodon_degus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	94	78.305	ENSODEG00000003385	-	100	78.305	Octodon_degus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.872	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.667	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	97.531	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.461	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.461	Oryzias_latipes
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.358	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.358	Oryzias_latipes_hni
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.358	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.028	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	95.473	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	95.473	Otolemur_garnettii
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	97.325	Ovis_aries
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	97.634	Pan_paniscus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	97.531	Panthera_pardus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	97.531	Panthera_tigris_altaica
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	97.634	Pan_troglodytes
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	97.634	Papio_anubis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	93	96.362	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.362	Pelodiscus_sinensis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	84.362	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	83.951	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	97.222	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.737	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	97.737	Phascolarctos_cinereus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.872	Poecilia_formosa
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.872	Poecilia_latipinna
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.872	Poecilia_mexicana
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.193	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	96.193	Pongo_abelii
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	93.519	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	93.519	Procavia_capensis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	97.634	Propithecus_coquereli
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	93.004	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	93.004	Pteropus_vampyrus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.770	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.564	Pundamilia_nyererei
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.255	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	91.461	Pygocentrus_nattereri
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.119	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	97.119	Rattus_norvegicus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	97.531	Rhinopithecus_bieti
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	97.531	Rhinopithecus_roxellana
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	97	33.696	YKL173W	SNU114	97	33.465	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.634	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	97.634	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	96	97.863	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	99	97.863	Sarcophilus_harrisii
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	90.947	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.255	Scleropages_formosus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.667	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.461	Scophthalmus_maximus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.770	Seriola_dumerili
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	92.078	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.872	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	88.992	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	88.992	Sorex_araneus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	92.078	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.872	Stegastes_partitus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.325	Sus_scrofa
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	84	97.317	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	99	97.317	Taeniopygia_guttata
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.049	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	90.844	Takifugu_rubripes
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	86.680	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.373	Tetraodon_nigroviridis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	92.078	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	92.078	Tupaia_belangeri
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	88.889	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	88.889	Tursiops_truncatus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	96.407	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	96.407	Ursus_americanus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	97.531	Ursus_maritimus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.531	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	97.531	Vulpes_vulpes
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	97	94.989	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.974	Xenopus_tropicalis
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	81	93.240	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.240	Xiphophorus_couchianus
ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.975	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	Xiphophorus_maculatus