EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000010839 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: APOBEC2
Alias: ARCD1|ARP1
Full Name: apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2402 bases
Position: chrQEPC01007384.1:2887223-2889624
Accession: 605
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000014053	APOBEC_N	PF08210.11	2.6e-49	1	1
ENSSPUP00000014053	APOBEC_C	PF05240.14	2.7e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000014992	APOBEC2-201	627	-	ENSSPUP00000014053	208 (aa)	-	-

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.956	ENSG00000124701	APOBEC2	80	74.725	Homo_sapiens
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.333	ENSAPOG00000019390	apobec2b	64	53.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	50	53.333	ENSAPOG00000010919	-	85	53.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	68.852	ENSAMEG00000004467	APOBEC2	71	67.582	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	52.486	ENSACIG00000016370	apobec2a	68	52.486	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	90	51.596	ENSACIG00000002472	APOBEC2	73	52.747	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.333	ENSAOCG00000003291	apobec2a	71	53.333	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.333	ENSAOCG00000023355	apobec2b	64	53.333	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.333	ENSAPEG00000003630	apobec2a	71	53.333	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.333	ENSAPEG00000004591	apobec2b	64	53.333	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	51.667	ENSATEG00000023043	APOBEC2	64	51.667	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	91	53.684	ENSATEG00000000956	apobec2a	98	54.144	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	82.222	ENSAPLG00000002895	APOBEC2	78	81.111	Anas_platyrhynchos
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	88	80.978	ENSACAG00000016506	APOBEC2	95	80.663	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSANAG00000026993	APOBEC2	80	74.176	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	48.889	ENSACLG00000026736	-	97	48.889	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	88	53.297	ENSACLG00000007634	APOBEC2	65	53.297	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	47.826	ENSAMXG00000042992	apobec2a	76	47.761	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	88	58.378	ENSAMXG00000015966	apobec2b	64	57.297	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	66.667	ENSBTAG00000005974	APOBEC2	64	65.217	Bos_taurus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	68.750	ENSCJAG00000004063	APOBEC2	89	67.633	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.770	ENSCAFG00000001575	APOBEC2	80	73.077	Canis_familiaris
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	74.317	ENSCAFG00020008306	APOBEC2	80	73.077	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	66.667	ENSCHIG00000026348	APOBEC2	89	65.217	Capra_hircus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.770	ENSTSYG00000008206	APOBEC2	79	72.527	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	72.678	ENSCAPG00000015084	APOBEC2	79	71.429	Cavia_aperea
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	72.678	ENSCPOG00000036103	APOBEC2	79	71.429	Cavia_porcellus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSCCAG00000033987	APOBEC2	80	74.176	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSCATG00000010691	APOBEC2	80	74.176	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	74.317	ENSCLAG00000013817	APOBEC2	79	73.077	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSCSAG00000011177	APOBEC2	80	74.176	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.626	ENSCHOG00000008930	APOBEC2	99	71.978	Choloepus_hoffmanni
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	81	80.473	ENSCPBG00000017469	APOBEC2	81	77.901	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	74.863	ENSCANG00000035072	APOBEC2	80	73.626	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	66.667	ENSCGRG00001014983	Apobec2	89	65.217	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	66.667	ENSCGRG00000007835	Apobec2	89	65.217	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.591	ENSCSEG00000000690	-	65	53.591	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	56.593	ENSCSEG00000020201	apobec2a	70	56.593	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	55.000	ENSCVAG00000012342	apobec2b	65	53.889	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	88	57.065	ENSDARG00000113992	apobec2b	65	55.978	Danio_rerio
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	54.696	ENSDARG00000018881	apobec2a	65	54.696	Danio_rerio
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	95	71.357	ENSDORG00000006447	Apobec2	84	69.500	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	66.827	ENSETEG00000000624	APOBEC2	88	64.762	Echinops_telfairi
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	70	74.324	ENSEASG00005002937	APOBEC2	77	74.324	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.770	ENSECAG00000006576	APOBEC2	80	72.527	Equus_caballus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	71.978	ENSEEUG00000006046	APOBEC2	80	70.330	Erinaceus_europaeus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	51.934	ENSELUG00000003736	apobec2a	61	51.934	Esox_lucius
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	72.678	ENSFCAG00000004108	APOBEC2	80	71.429	Felis_catus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	64.641	ENSFALG00000003910	APOBEC2	78	64.088	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSFDAG00000006015	APOBEC2	80	74.176	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	54.444	ENSFHEG00000005492	apobec2b	74	53.333	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	51.111	ENSGMOG00000006819	apobec2b	71	51.111	Gadus_morhua
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	56.906	ENSGMOG00000007028	apobec2a	100	56.906	Gadus_morhua
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	82.320	ENSGALG00000003226	APOBEC2	81	81.215	Gallus_gallus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	55.000	ENSGAFG00000007634	apobec2b	56	53.889	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	51.111	ENSGACG00000009663	apobec2b	77	51.111	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	54.144	ENSGACG00000011671	apobec2a	93	54.144	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	81	79.290	ENSGAGG00000010347	APOBEC2	81	76.796	Gopherus_agassizii
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.956	ENSGGOG00000001099	APOBEC2	78	74.725	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.333	ENSHBUG00000015890	apobec2a	70	53.333	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.889	ENSHBUG00000005993	apobec2b	64	53.889	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.626	ENSHGLG00000017169	APOBEC2	79	72.527	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.626	ENSHGLG00100019442	APOBEC2	79	72.527	Heterocephalus_glaber_male
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	50.276	ENSHCOG00000020319	apobec2a	71	51.099	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.333	ENSHCOG00000002712	APOBEC2	65	53.333	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	54.098	ENSIPUG00000017355	apobec2a	50	53.552	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	88	56.216	ENSIPUG00000013784	Apobec2	67	56.216	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.770	ENSSTOG00000023643	APOBEC2	80	72.527	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	65.700	ENSJJAG00000009733	Apobec2	89	64.251	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	51.381	ENSKMAG00000020631	apobec2b	66	51.381	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.039	ENSLBEG00000025214	apobec2a	73	53.039	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.333	ENSLBEG00000009422	-	61	53.333	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	69.444	ENSLACG00000015985	APOBEC2	76	67.222	Latimeria_chalumnae
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	60.221	ENSLOCG00000012415	apobec2b	63	60.221	Lepisosteus_oculatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	68.750	ENSLAFG00000016563	APOBEC2	89	67.633	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSMFAG00000044645	APOBEC2	80	74.176	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSMMUG00000021171	APOBEC2	80	74.176	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSMNEG00000045497	APOBEC2	80	74.176	Macaca_nemestrina
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSMLEG00000028328	APOBEC2	80	74.176	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	88	54.098	ENSMAMG00000023685	apobec2a	70	54.098	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	52.778	ENSMAMG00000007926	APOBEC2	63	52.778	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	52.778	ENSMZEG00005005240	-	91	54.601	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.889	ENSMZEG00005027159	APOBEC2	64	53.889	Maylandia_zebra
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	91	79.894	ENSMGAG00000010173	APOBEC2	98	78.836	Meleagris_gallopavo
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	67.150	ENSMAUG00000011016	Apobec2	89	65.700	Mesocricetus_auratus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.626	ENSMICG00000043339	APOBEC2	80	71.978	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	67.633	ENSMOCG00000001904	Apobec2	89	66.184	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	88	50.549	ENSMMOG00000008681	apobec2b	66	50.000	Mola_mola
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	55	44.737	ENSMMOG00000009531	-	64	44.737	Mola_mola
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.956	ENSMODG00000013090	APOBEC2	81	74.317	Monodelphis_domestica
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	51.667	ENSMALG00000013779	APOBEC2	67	51.667	Monopterus_albus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.591	ENSMALG00000020523	apobec2a	71	53.591	Monopterus_albus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	67.150	MGP_CAROLIEiJ_G0021727	Apobec2	89	65.700	Mus_caroli
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	67.150	ENSMUSG00000040694	Apobec2	89	65.700	Mus_musculus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	66.667	MGP_PahariEiJ_G0020716	Apobec2	89	65.217	Mus_pahari
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	72.527	ENSMPUG00000013691	APOBEC2	77	70.879	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.077	ENSMLUG00000011327	APOBEC2	78	71.429	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	99	67.150	ENSNGAG00000013717	Apobec2	89	65.700	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	53.889	ENSNBRG00000021776	apobec2a	70	53.889	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	54.444	ENSNBRG00000018806	apobec2b	57	54.444	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.956	ENSNLEG00000005057	APOBEC2	80	74.725	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSMEUG00000011623	APOBEC2	81	73.770	Notamacropus_eugenii
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	74.863	ENSOPRG00000014808	APOBEC2	79	73.626	Ochotona_princeps
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	73.224	ENSODEG00000016183	APOBEC2	78	71.978	Octodon_degus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	54.444	ENSONIG00000012289	apobec2b	64	54.444	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	55.556	ENSONIG00000004644	-	70	55.556	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	82	77.778	ENSOANG00000000824	APOBEC2	94	76.023	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	75.410	ENSOCUG00000028008	APOBEC2	79	74.176	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	86	53.371	ENSORLG00000022372	APOBEC2	64	53.371	Oryzias_latipes
ENSSPUG00000010839	APOBEC2	87	51.934	ENSORLG00000010752	apobec2a	74	51.934	Oryzias_latipes
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ENSSPUG00000010839	APOBEC2	86	53.933	ENSORLG00020006164	APOBEC2	64	53.933	Oryzias_latipes_hni
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