EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSPUG00000012640 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sphenodon_punctatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 54082 bases
Position: chrQEPC01002388.1:10630732-10684813
Accession: 22973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSPUP00000016428	ResIII	PF04851.15	1.3e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSPUT00000017502	SBNO1-201	4616	-	ENSSPUP00000016428	1355 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	89.088	ENSG00000139697	SBNO1	100	88.873	Homo_sapiens
ENSSPUG00000012640	SBNO1	85	81.023	ENSAPOG00000003196	sbno1	96	81.129	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.976	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	88.825	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	76.266	ENSACIG00000008088	sbno1	98	76.561	Amphilophus_citrinellus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.232	ENSAOCG00000014859	sbno1	97	75.072	Amphiprion_ocellaris
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.232	ENSAPEG00000006069	sbno1	97	75.072	Amphiprion_percula
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.865	ENSATEG00000006667	sbno1	98	75.625	Anabas_testudineus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	92.595	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	92.595	Anas_platyrhynchos
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	93.504	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	93.504	Anolis_carolinensis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	91.163	ENSANAG00000029958	-	99	93.682	Aotus_nancymaae
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	76.233	ENSACLG00000024913	sbno1	98	76.510	Astatotilapia_calliptera
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	78.199	ENSAMXG00000019473	sbno1	98	78.587	Astyanax_mexicanus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	91.016	ENSBTAG00000020505	SBNO1	98	91.517	Bos_taurus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.881	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	88.666	Callithrix_jacchus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.968	ENSCAFG00000007503	SBNO1	97	94.444	Canis_familiaris
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	90.095	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	91.171	Canis_lupus_dingo
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	89.009	ENSCHIG00000008382	SBNO1	98	94.307	Capra_hircus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	91.826	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	91.826	Carlito_syrichta
ENSSPUG00000012640	SBNO1	97	90.785	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	93.682	Cavia_aperea
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.721	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	93.682	Cavia_porcellus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	86.829	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	88.356	Cebus_capucinus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	98	90.971	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	93.874	Cercocebus_atys
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.873	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	93.863	Chinchilla_lanigera
ENSSPUG00000012640	SBNO1	85	92.752	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	92.752	Chlorocebus_sabaeus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	96	85.481	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	85.192	Choloepus_hoffmanni
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	95.133	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	94.617	Chrysemys_picta_bellii
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	84.648	ENSCANG00000042688	-	100	84.577	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.586	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	92.613	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.586	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	92.613	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	74.324	ENSCSEG00000011919	sbno1	98	75.270	Cynoglossus_semilaevis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.547	ENSCVAG00000007038	sbno1	98	75.967	Cyprinodon_variegatus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	78.208	ENSDARG00000099080	sbno1	98	78.598	Danio_rerio
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	87.072	ENSDNOG00000017147	SBNO1	96	90.285	Dasypus_novemcinctus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	79.530	ENSDORG00000015261	Sbno1	84	90.999	Dipodomys_ordii
ENSSPUG00000012640	SBNO1	93	84.326	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	84.326	Echinops_telfairi
ENSSPUG00000012640	SBNO1	74	64.093	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.476	Eptatretus_burgeri
ENSSPUG00000012640	SBNO1	50	91.988	ENSEASG00005012595	-	92	92.433	Equus_asinus_asinus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	89.383	ENSECAG00000006127	SBNO1	98	91.465	Equus_caballus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	82	89.560	ENSEEUG00000003793	SBNO1	80	89.560	Erinaceus_europaeus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	77.857	ENSELUG00000002886	sbno1	98	78.236	Esox_lucius
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	89.375	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	89.160	Felis_catus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	92.380	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	92.380	Ficedula_albicollis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	87.428	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	89.331	Fukomys_damarensis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.652	ENSFHEG00000007360	sbno1	98	76.183	Fundulus_heteroclitus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	97	78.116	ENSGMOG00000018229	sbno1	98	78.335	Gadus_morhua
ENSSPUG00000012640	SBNO1	88	92.189	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	92.189	Gallus_gallus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	77.137	ENSGAFG00000003960	sbno1	97	77.679	Gambusia_affinis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	96	78.014	ENSGACG00000015633	sbno1	98	77.966	Gasterosteus_aculeatus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	94.096	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	96.931	Gopherus_agassizii
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	91.311	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	94.043	Gorilla_gorilla
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	70.403	ENSHBUG00000011910	sbno1	98	70.759	Haplochromis_burtoni
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.801	ENSHGLG00000014165	-	100	88.881	Heterocephalus_glaber_female
ENSSPUG00000012640	SBNO1	91	84.783	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.783	Hippocampus_comes
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	78.158	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	77.614	Ictalurus_punctatus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	91.384	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	93.514	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.873	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	88.881	Jaculus_jaculus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	76.957	ENSKMAG00000009696	sbno1	98	77.083	Kryptolebias_marmoratus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.460	ENSLBEG00000007623	sbno1	98	75.484	Labrus_bergylta
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	80.601	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	82.711	Latimeria_chalumnae
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	80.742	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	80.884	Lepisosteus_oculatus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.227	ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	88.164	Loxodonta_africana
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	90.103	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	89.883	Macaca_fascicularis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	90.103	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	89.883	Macaca_mulatta
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	90.059	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	93.874	Mandrillus_leucophaeus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.496	ENSMAMG00000005473	sbno1	98	75.902	Mastacembelus_armatus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	92.667	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	92.667	Meleagris_gallopavo
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	90.353	ENSMICG00000006573	-	100	90.133	Microcebus_murinus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	86.351	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	93.502	Microtus_ochrogaster
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	74.090	ENSMMOG00000008691	sbno1	97	73.711	Mola_mola
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	90.144	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	90.144	Monodelphis_domestica
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.383	ENSMALG00000001056	sbno1	98	75.111	Monopterus_albus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	88.713	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	96.491	Mus_caroli
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	88.641	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	91.704	Mus_musculus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	88.993	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	96.491	Mus_pahari
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	88.569	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	100	91.704	Mus_spretus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	89.455	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	89.240	Mustela_putorius_furo
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.953	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	88.737	Myotis_lucifugus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	89.383	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	94.303	Nannospalax_galili
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	76.397	ENSNBRG00000019189	sbno1	98	76.431	Neolamprologus_brichardi
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	87.629	ENSNLEG00000001502	SBNO1	98	88.982	Nomascus_leucogenys
ENSSPUG00000012640	SBNO1	61	82.051	ENSMEUG00000008768	-	93	82.051	Notamacropus_eugenii
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	87.088	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	87.088	Ochotona_princeps
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	89.447	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	93.502	Octodon_degus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.318	ENSONIG00000015348	sbno1	98	75.664	Oreochromis_niloticus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	98	87.965	ENSOCUG00000002441	SBNO1	93	89.013	Oryctolagus_cuniculus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	74.522	ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.307	Oryzias_latipes
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	74.433	ENSORLG00020015216	sbno1	98	74.442	Oryzias_latipes_hni
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	74.646	ENSORLG00015002726	sbno1	98	74.586	Oryzias_latipes_hsok
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.125	ENSOMEG00000019313	sbno1	98	75.127	Oryzias_melastigma
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	88.809	ENSOARG00000004404	SBNO1	98	89.035	Ovis_aries
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	91.384	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	94.224	Pan_paniscus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	89.375	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	89.160	Panthera_pardus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	89.504	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	89.216	Panthera_tigris_altaica
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	91.311	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	94.043	Pan_troglodytes
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	91.458	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	93.874	Papio_anubis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	79.484	ENSPKIG00000001441	sbno1	98	79.240	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	94.985	ENSPSIG00000009572	-	100	94.764	Pelodiscus_sinensis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	92	88.327	ENSPSIG00000009256	-	100	88.171	Pelodiscus_sinensis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.442	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	92.780	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	91.888	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	92.330	Phascolarctos_cinereus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.674	ENSPFOG00000005069	sbno1	98	76.173	Poecilia_formosa
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.603	ENSPLAG00000015015	sbno1	98	76.118	Poecilia_latipinna
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.762	ENSPMEG00000021212	sbno1	98	76.263	Poecilia_mexicana
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.337	ENSPREG00000017746	sbno1	98	75.830	Poecilia_reticulata
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	88.945	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	88.729	Pongo_abelii
ENSSPUG00000012640	SBNO1	88	82.305	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	82.231	Procavia_capensis
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	91.679	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	94.000	Propithecus_coquereli
ENSSPUG00000012640	SBNO1	87	94.246	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	94.246	Pteropus_vampyrus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	75.425	ENSPNYG00000004291	sbno1	98	75.701	Pundamilia_nyererei
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	78.286	ENSPNAG00000015622	sbno1	98	78.125	Pygocentrus_nattereri
ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	88.785	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	93.671	Rattus_norvegicus
ENSSPUG00000012640	SBNO1	100	91.532	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	93.874	Rhinopithecus_roxellana
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