EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000001424 (Gene tree)
Gene ID: 100124376
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 13482 bases
Position: chr7:24046965-24060446
Accession: 100124376
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000036802	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3e-40	1	1
ENSSSCP00000032051	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.1e-40	1	1
ENSSSCP00000001524	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.3e-40	1	1
ENSSSCP00000050273	rRNA_proc-arch	PF13234.6	3.6e-40	1	1
ENSSSCP00000036802	DEAD	PF00270.29	3.2e-16	1	1
ENSSSCP00000032051	DEAD	PF00270.29	3.3e-16	1	1
ENSSSCP00000001524	DEAD	PF00270.29	3.5e-16	1	1
ENSSSCP00000050273	DEAD	PF00270.29	3.8e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000001566	SKIV2L-201	3934	-	ENSSSCP00000001524	1246 (aa)	-	F1RQW4
ENSSSCT00000052515	SKIV2L-204	7061	-	ENSSSCP00000036802	1170 (aa)	-	A0A286ZZA5
ENSSSCT00000057580	SKIV2L-202	7196	-	ENSSSCP00000050273	1308 (aa)	-	A0A287B2E6
ENSSSCT00000057882	SKIV2L-203	7068	-	ENSSSCP00000032051	1197 (aa)	-	A0A286ZKF2

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000001424's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000001424's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	80	36.556	ENSSSCG00000016911	MTREX	89	36.529

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.783	ENSG00000204351	SKIV2L	100	94.783	Homo_sapiens
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.825	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.569	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.586	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	95.586	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.128	ENSACIG00000016719	skiv2l	100	59.856	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.270	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	61.270	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.111	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	61.223	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.085	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	60.921	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	65.672	ENSACAG00000011746	SKIV2L	100	66.327	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.586	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	95.586	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	60.779	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.429	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	98	59.585	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.543	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	96.067	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	96.067	Bos_taurus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	96	39.984	WBGene00008502	skih-2	99	39.765	Caenorhabditis_elegans
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.944	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	94.944	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.425	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	95.425	Canis_familiaris
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.345	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	95.345	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.746	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	95.746	Capra_hircus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.462	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	94.462	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	92.857	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	92.857	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.425	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	95.425	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.944	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	94.944	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.141	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	94.141	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.783	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	94.783	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	87	64.327	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	97	64.661	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	50.125	ENSCING00000005576	-	99	51.057	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	95.181	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	95.181	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.787	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	94.787	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.275	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	61.182	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	60.629	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	61.373	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.551	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.236	Danio_rerio
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	94	95.000	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	89.271	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	42.600	FBgn0039117	tst	97	44.054	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	72	93.702	ENSETEG00000009522	SKIV2L	72	94.444	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	88	58.428	ENSEBUG00000013680	-	99	56.113	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	93.818	ENSEASG00005015534	SKIV2L	100	96.644	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	96	95.882	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	95.882	Equus_caballus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	56	97.628	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	60	97.628	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.364	ENSELUG00000000181	skiv2l	95	66.598	Esox_lucius
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.907	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	95.907	Felis_catus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	90.457	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	90.377	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.392	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.313	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	59.904	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	59.904	Gadus_morhua
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	81	61.247	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	61.737	Gallus_gallus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.441	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.203	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.524	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	60.541	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	51	74.415	ENSGAGG00000015556	SKIV2L	81	73.856	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.623	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	94.623	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	60.611	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.429	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	91.827	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	92.228	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	89.183	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	89.583	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	98	59.723	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.561	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	59.716	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	59.743	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.944	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.944	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	71	60.671	ENSLACG00000002986	-	75	60.432	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.382	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.382	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.265	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	95.265	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.185	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	95.185	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.185	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	95.185	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.944	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	94.944	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.538	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.142	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	60.528	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.349	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	74	50.823	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	50.840	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	93.750	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	94.071	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.944	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	94.944	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	92.863	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	93.103	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.254	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	61.093	Mola_mola
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	88.551	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.551	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.064	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	60.064	Monopterus_albus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	93.986	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	93.986	Mus_caroli
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.066	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	94.066	Mus_musculus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	93.585	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	93.585	Mus_pahari
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	93.665	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	93.665	Mus_spretus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.185	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	95.185	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.141	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	94.141	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.133	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	61.164	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	98	91.769	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	91.761	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	78	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.543	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	94.543	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	92.456	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	92.456	Octodon_degus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	61.366	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	62.380	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.265	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	95.265	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	61.074	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	60.703	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	60.992	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.490	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	60.762	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	61.331	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	60.996	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	61.398	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.944	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	94.944	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	90.290	ENSOARG00000002411	-	100	90.290	Ovis_aries
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	98	94.003	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	93.976	Pan_paniscus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.987	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	95.987	Panthera_pardus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.506	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	95.506	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.783	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	94.783	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	91.896	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	93.810	Papio_anubis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.331	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.489	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.338	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	60.579	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.627	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	94.627	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	88.428	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	88.560	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.313	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.076	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.441	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.203	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.520	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.283	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	58.981	ENSPREG00000002277	skiv2l	97	66.701	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.141	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	94.141	Pongo_abelii
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	77	94.344	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	94.344	Procavia_capensis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.827	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	95.827	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.061	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	94.061	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.080	ENSPNYG00000017853	skiv2l	98	67.254	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.017	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	60.873	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.707	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	94.707	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	98	92.632	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	92.548	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.944	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	94.944	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	37.846	YLR398C	-	93	38.306	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.345	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	95.345	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	87.990	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.950	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.605	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.290	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.133	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	61.053	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.490	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.094	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.418	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	60.016	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	62.879	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	62.802	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	93	62.795	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	61.204	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	89	55.801	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.668	Takifugu_rubripes
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	59.761	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	59.745	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	94	93.865	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	93.865	Tupaia_belangeri
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	91.172	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	91.172	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	95.987	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	95.987	Ursus_americanus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	93.317	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	100	96.127	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	98	95.599	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	95.484	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	58.195	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.465	Xenopus_tropicalis
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.680	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	61.458	Xiphophorus_couchianus
ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	61.203	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.966	Xiphophorus_maculatus