EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000002000 (Gene tree)
Gene ID: 100157703
Gene Symbol: IPO4
Alias: FLJ23338|Imp4
Full Name: importin 4
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14240 bases
Position: chr7:75104496-75118735
Accession: 100157703
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000002186	IBN_N	PF03810.19	4.4e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000002238	IPO4-202	5999	XM_013978187	ENSSSCP00000002186	1076 (aa)	XP_013833641	F1SGN4
ENSSSCT00000058885	IPO4-201	6105	-	ENSSSCP00000044724	957 (aa)	-	A0A287ALE4

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000002000's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000002000's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.454	ENSG00000196497	IPO4	100	90.009	Homo_sapiens
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	43.889	ENSAPOG00000019018	ipo4	98	44.206	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	84.736	ENSAMEG00000016271	IPO4	85	83.996	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.322	ENSACIG00000004246	ipo4	98	44.279	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.751	ENSAOCG00000004773	ipo4	98	44.331	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.659	ENSAPEG00000002112	ipo4	98	44.238	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000002000	IPO4	92	45.319	ENSATEG00000017082	ipo4	99	45.120	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000002000	IPO4	85	53.648	ENSACAG00000003973	-	98	54.292	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	88.519	ENSANAG00000037973	IPO4	100	89.167	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.434	ENSACLG00000019742	ipo4	94	45.581	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	45.000	ENSAMXG00000037878	ipo4	98	44.766	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	91.212	ENSBTAG00000002707	IPO4	100	91.859	Bos_taurus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	88.611	ENSCJAG00000006937	IPO4	100	88.981	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	91.381	ENSCAFG00000012049	IPO4	100	91.566	Canis_familiaris
ENSSSCG00000002000	IPO4	98	90.704	ENSCAFG00020002873	IPO4	99	89.850	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	90.926	ENSCHIG00000009413	IPO4	96	91.574	Capra_hircus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.732	ENSTSYG00000002643	IPO4	100	89.824	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	87.118	ENSCPOG00000014783	IPO4	100	87.396	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.167	ENSCCAG00000037929	IPO4	100	89.815	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.547	ENSCATG00000040395	IPO4	100	90.102	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	88.323	ENSCLAG00000012817	IPO4	100	88.693	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000002000	IPO4	90	56.694	ENSCPBG00000025757	IPO4	94	56.491	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000002000	IPO4	92	37.106	ENSCING00000008639	-	98	37.078	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000002000	IPO4	94	35.169	ENSCSAVG00000011482	-	100	35.169	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.084	ENSCANG00000029513	IPO4	100	89.917	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	83.071	ENSCGRG00001001217	Ipo4	100	83.071	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	83.071	ENSCGRG00000014404	Ipo4	100	83.071	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	42.766	ENSCSEG00000009606	ipo4	99	43.389	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000002000	IPO4	98	43.692	ENSCVAG00000002281	ipo4	99	43.306	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	46.432	ENSDARG00000041493	ipo4	98	46.024	Danio_rerio
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.342	ENSDNOG00000000366	IPO4	100	89.332	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.249	ENSDORG00000009274	Ipo4	100	89.249	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	86.150	ENSETEG00000018381	IPO4	100	85.596	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000002000	IPO4	91	91.420	ENSEASG00005011954	IPO4	96	91.624	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	91.566	ENSECAG00000009909	IPO4	100	91.752	Equus_caballus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	46.642	ENSELUG00000020628	ipo4	99	46.518	Esox_lucius
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	93.234	ENSFCAG00000005587	IPO4	100	92.764	Felis_catus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	81.331	ENSFDAG00000000725	IPO4	100	81.017	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	38.879	ENSFHEG00000009351	ipo4	94	47.245	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	45.806	ENSGMOG00000001801	ipo4	99	45.395	Gadus_morhua
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	43.934	ENSGAFG00000005601	ipo4	99	43.692	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	45.069	ENSGACG00000002276	ipo4	99	44.744	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.547	ENSGGOG00000016062	IPO4	100	90.102	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	45.287	ENSHBUG00000023269	ipo4	98	44.683	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	87.674	ENSHGLG00000002923	IPO4	100	88.044	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	87.303	ENSHGLG00100003725	IPO4	100	87.674	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	42.909	ENSHCOG00000016854	ipo4	98	43.028	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	46.852	ENSIPUG00000001185	ipo4	98	46.542	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.352	ENSSTOG00000002288	IPO4	100	89.815	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	86.229	ENSJJAG00000019002	Ipo4	100	86.599	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	43.721	ENSKMAG00000004627	ipo4	99	43.773	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.199	ENSLBEG00000024952	ipo4	99	44.134	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	49.498	ENSLACG00000001428	IPO4	98	49.539	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000002000	IPO4	75	48.454	ENSLOCG00000001149	ipo4	81	48.413	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	86.820	ENSLAFG00000015852	IPO4	100	86.667	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.732	ENSMFAG00000000743	IPO4	100	90.287	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.639	ENSMMUG00000012481	IPO4	100	90.194	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.547	ENSMNEG00000043531	IPO4	100	90.102	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.547	ENSMLEG00000042067	IPO4	100	90.102	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.640	ENSMAMG00000021976	ipo4	99	44.590	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	45.111	ENSMZEG00005017273	ipo4	98	44.683	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	81.885	ENSMAUG00000017565	Ipo4	100	82.440	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	87.963	ENSMICG00000001719	IPO4	100	88.426	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	79.852	ENSMOCG00000020462	Ipo4	100	80.591	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.169	ENSMMOG00000005264	ipo4	99	43.930	Mola_mola
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	72.263	ENSMODG00000003337	IPO4	97	72.263	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	42.962	ENSMALG00000001587	ipo4	99	42.326	Monopterus_albus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	80.481	MGP_CAROLIEiJ_G0019305	Ipo4	99	81.684	Mus_caroli
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	80.037	ENSMUSG00000002319	Ipo4	100	81.238	Mus_musculus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	80.296	MGP_PahariEiJ_G0030322	Ipo4	100	81.499	Mus_pahari
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	80.776	MGP_SPRETEiJ_G0020194	Ipo4	100	81.054	Mus_spretus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	91.103	ENSMPUG00000005916	IPO4	100	91.474	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	87.106	ENSMLUG00000025277	IPO4	86	87.477	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	87.130	ENSNGAG00000019340	Ipo4	100	87.778	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	45.933	ENSNBRG00000005870	ipo4	98	45.607	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	86.691	ENSOPRG00000016615	IPO4	100	86.599	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	87.396	ENSODEG00000002609	IPO4	100	87.674	Octodon_degus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	45.471	ENSONIG00000014574	ipo4	98	45.149	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	87.350	ENSOCUG00000002881	IPO4	100	87.627	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	43.871	ENSORLG00000006457	ipo4	99	44.225	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.506	ENSORLG00020004286	ipo4	99	44.082	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.691	ENSORLG00015021856	ipo4	99	44.319	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000002000	IPO4	98	43.855	ENSOMEG00000016203	ipo4	99	44.041	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	88.971	ENSOGAG00000010642	IPO4	100	88.961	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.094	ENSOARG00000019188	IPO4	100	89.741	Ovis_aries
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.157	ENSPPAG00000035476	IPO4	100	89.342	Pan_paniscus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	93.142	ENSPPRG00000023607	IPO4	100	92.672	Panthera_pardus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	93.234	ENSPTIG00000008720	IPO4	100	92.764	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.362	ENSPTRG00000006200	IPO4	100	89.917	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.547	ENSPANG00000026278	IPO4	100	90.102	Papio_anubis
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	47.650	ENSPKIG00000007830	ipo4	98	47.907	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	46.154	ENSPKIG00000007683	-	98	46.255	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	43.186	ENSPMGG00000020871	ipo4	99	43.494	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	82.778	ENSPEMG00000016160	Ipo4	100	83.148	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000002000	IPO4	94	75.713	ENSPCIG00000010718	IPO4	97	75.615	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.669	ENSPFOG00000009255	ipo4	98	44.052	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.761	ENSPLAG00000020556	ipo4	98	44.145	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.485	ENSPMEG00000013102	ipo4	98	44.052	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.485	ENSPREG00000017605	ipo4	98	44.052	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.722	ENSPPYG00000005688	IPO4	100	90.370	Pongo_abelii
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	87.338	ENSPCAG00000015669	IPO4	100	87.708	Procavia_capensis
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	88.519	ENSPCOG00000015319	IPO4	100	89.167	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	90.093	ENSPVAG00000010755	IPO4	100	90.463	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	45.111	ENSPNYG00000021414	ipo4	98	44.683	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	46.994	ENSPNAG00000027964	ipo4	99	47.152	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	82.701	ENSRNOG00000019553	Ipo4	100	82.979	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.269	ENSRBIG00000027704	IPO4	100	89.824	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	89.084	ENSRROG00000011492	IPO4	100	89.639	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	87.222	ENSSBOG00000020162	IPO4	100	87.870	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	73.315	ENSSHAG00000002619	IPO4	97	73.130	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	46.568	ENSSFOG00015014437	IPO4	98	46.629	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	48.482	ENSSFOG00015012267	ipo4	98	48.189	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.107	ENSSMAG00000019912	ipo4	99	43.866	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	42.226	ENSSDUG00000017513	ipo4	98	42.458	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.015	ENSSLDG00000003869	ipo4	99	43.896	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000002000	IPO4	80	83.607	ENSSARG00000010701	IPO4	81	82.668	Sorex_araneus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.229	ENSSPAG00000008486	ipo4	98	44.362	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	44.332	ENSTRUG00000012832	ipo4	98	44.000	Takifugu_rubripes
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	43.386	ENSTNIG00000005191	ipo4	99	42.951	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	85.291	ENSTBEG00000009781	IPO4	97	91.829	Tupaia_belangeri
ENSSSCG00000002000	IPO4	100	90.445	ENSTTRG00000008626	IPO4	100	90.631	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	89.074	ENSUAMG00000024037	IPO4	99	89.074	Ursus_americanus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	46.598	ENSXETG00000014621	ipo4	98	46.660	Xenopus_tropicalis
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	42.634	ENSXCOG00000005208	ipo4	98	42.790	Xiphophorus_couchianus
ENSSSCG00000002000	IPO4	99	43.750	ENSXMAG00000006041	ipo4	98	43.401	Xiphophorus_maculatus