EuRBPDB

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RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000003630 (Gene tree)
Gene ID: 100499510
Gene Symbol: AGO3
Alias: EIF2C3|FLJ12765|hAGO3
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 244962 bases
Position: chr6:91967494-92212455
Accession: 100499510
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000055926	PAZ	PF02170.22	1.5e-28	1	1
ENSSSCP00000003935	PAZ	PF02170.22	1.5e-28	1	1
ENSSSCP00000057743	PAZ	PF02170.22	1.5e-28	1	1
ENSSSCP00000055349	PAZ	PF02170.22	1e-27	1	1
ENSSSCP00000003934	PAZ	PF02170.22	1.1e-27	1	1
ENSSSCP00000032378	PAZ	PF02170.22	1.1e-27	1	1
ENSSSCP00000052845	PAZ	PF02170.22	1.1e-27	1	1
ENSSSCP00000034205	PAZ	PF02170.22	1.3e-27	1	1
ENSSSCP00000003936	PAZ	PF02170.22	1.5e-27	1	1
ENSSSCP00000019410	PAZ	PF02170.22	1.6e-27	1	1
ENSSSCP00000032378	Piwi	PF02171.17	1.4e-113	1	1
ENSSSCP00000034205	Piwi	PF02171.17	1.5e-113	1	1
ENSSSCP00000003936	Piwi	PF02171.17	1.9e-113	1	1
ENSSSCP00000052845	Piwi	PF02171.17	2e-113	1	1
ENSSSCP00000019410	Piwi	PF02171.17	2e-113	1	1
ENSSSCP00000055926	Piwi	PF02171.17	1.2e-110	1	1
ENSSSCP00000003935	Piwi	PF02171.17	1.9e-110	1	1
ENSSSCP00000057743	Piwi	PF02171.17	1.9e-110	1	1
ENSSSCP00000055349	Piwi	PF02171.17	4.3e-105	1	1
ENSSSCP00000003934	Piwi	PF02171.17	5.2e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000004025	AGO3-202	6581	-	ENSSSCP00000003934	861 (aa)	-	F1SV64
ENSSSCT00000004027	AGO3-209	3243	-	ENSSSCP00000003936	860 (aa)	-	F1SV62
ENSSSCT00000004026	AGO3-205	3335	-	ENSSSCP00000003935	856 (aa)	-	F1SV63
ENSSSCT00000030097	AGO3-208	2706	-	ENSSSCP00000019410	901 (aa)	-	I3L5V9
ENSSSCT00000056463	AGO3-207	9086	XM_021093293	ENSSSCP00000055926	706 (aa)	XP_020948952	A0A287BIG0
ENSSSCT00000065601	AGO3-203	2604	-	ENSSSCP00000052845	867 (aa)	-	A0A287B8N3
ENSSSCT00000038526	AGO3-206	8733	XM_005665209	ENSSSCP00000057743	857 (aa)	XP_005665266	A0A287BNJ6
ENSSSCT00000064566	AGO3-210	3260	XM_021093288	ENSSSCP00000034205	791 (aa)	XP_020948947	A0A286ZRU7
ENSSSCT00000038441	AGO3-204	2604	-	ENSSSCP00000032378	867 (aa)	-	A0A286ZL92
ENSSSCT00000045582	AGO3-201	6528	XM_021093284	ENSSSCP00000055349	794 (aa)	XP_020948943	A0A287BFJ8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSSCG00000003630	AGO3	99	90.000	ENSSSCG00000005935	AGO2	99	90.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSG00000126070	AGO3	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	95.489	ENSAPOG00000014494	-	100	94.579	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.977	ENSAPOG00000024260	ago3a	100	97.209	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSAMEG00000000497	AGO3	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	95.828	ENSACIG00000019272	AGO3	100	95.828	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.851	ENSACIG00000005333	ago3a	100	97.851	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000003630	AGO3	94	94.000	ENSAOCG00000017051	-	100	94.000	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.977	ENSAOCG00000017642	ago3a	100	97.209	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000003630	AGO3	54	89.144	ENSAOCG00000022538	-	90	90.275	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.118	ENSAPEG00000004375	ago3a	100	96.424	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	95.238	ENSAPEG00000020249	-	100	94.233	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	95.113	ENSATEG00000005160	-	100	94.233	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.118	ENSATEG00000008458	ago3a	100	96.424	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.532	ENSAPLG00000009642	AGO3	99	99.533	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.532	ENSACAG00000003385	AGO3	100	99.302	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSANAG00000037735	AGO3	100	99.884	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.977	ENSACLG00000000963	ago3a	100	97.209	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.862	ENSACLG00000001965	-	100	94.118	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	95.702	ENSAMXG00000002198	ago3a	100	95.702	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.564	ENSAMXG00000009571	ago3b	100	94.564	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSBTAG00000018324	AGO3	100	100.000	Bos_taurus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSCJAG00000031580	AGO3	100	99.884	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.884	ENSCAFG00000024682	AGO3	100	99.884	Canis_familiaris
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSCAFG00020009051	AGO3	99	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSCHIG00000011536	AGO3	100	100.000	Capra_hircus
ENSSSCG00000003630	AGO3	85	100.000	ENSTSYG00000011897	AGO3	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000003630	AGO3	95	96.000	ENSCAPG00000011589	AGO3	100	96.000	Cavia_aperea
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	96.370	ENSCPOG00000030524	AGO3	100	96.374	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSCCAG00000034189	AGO3	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSCATG00000029748	AGO3	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSCLAG00000013184	AGO3	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSCSAG00000001092	AGO3	100	99.884	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000003630	AGO3	93	100.000	ENSCHOG00000011621	AGO3	92	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.651	ENSCPBG00000018583	AGO3	100	99.651	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSCANG00000033258	AGO3	100	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.747	ENSCGRG00001024614	Ago3	100	99.535	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.747	ENSCGRG00000010670	Ago3	100	99.535	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.345	ENSCSEG00000001040	ago3a	100	97.345	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	90.387	ENSCSEG00000009788	-	100	92.000	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.724	ENSCVAG00000018224	ago3a	100	96.860	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	52	87.061	ENSCVAG00000011229	-	98	87.061	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.118	ENSDARG00000059888	ago3a	100	96.309	Danio_rerio
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	96.207	ENSDARG00000063079	ago3b	100	95.233	Danio_rerio
ENSSSCG00000003630	AGO3	89	100.000	ENSDNOG00000008106	AGO3	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.651	ENSDORG00000009414	Ago3	100	99.651	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000003630	AGO3	86	98.592	ENSETEG00000007639	AGO3	89	98.592	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSEASG00005012089	AGO3	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSECAG00000023972	AGO3	100	100.000	Equus_caballus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSEEUG00000007058	AGO3	99	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.561	ENSELUG00000001774	-	100	94.000	Esox_lucius
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.817	ENSELUG00000016755	ago3a	100	96.000	Esox_lucius
ENSSSCG00000003630	AGO3	79	100.000	ENSFCAG00000000747	-	100	100.000	Felis_catus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.495	ENSFALG00000000802	AGO3	99	99.416	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSFDAG00000012874	AGO3	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.110	ENSFHEG00000016205	-	100	93.080	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000003630	AGO3	84	97.872	ENSGMOG00000019418	-	89	97.872	Gadus_morhua
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	96.966	ENSGMOG00000013069	-	100	96.886	Gadus_morhua
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.649	ENSGALG00000043711	AGO3	100	99.645	Gallus_gallus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.977	ENSGAFG00000009808	ago3a	100	97.093	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.236	ENSGAFG00000015911	-	100	94.000	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.229	ENSGACG00000012453	ago3a	100	97.240	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	95.449	ENSGACG00000002455	AGO3	100	95.569	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.621	ENSGAGG00000012887	AGO3	100	99.535	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSGGOG00000036711	AGO3	100	99.884	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.862	ENSHBUG00000017794	-	100	94.118	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000003630	AGO3	93	93.225	ENSHBUG00000010542	ago3a	97	95.607	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSHGLG00000012538	AGO3	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.494	ENSHGLG00100006043	AGO3	100	99.529	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000003630	AGO3	53	91.777	ENSHCOG00000005654	ago3a	100	97.878	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000003630	AGO3	88	96.107	ENSHCOG00000005674	ago3a	97	96.107	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.110	ENSHCOG00000011851	AGO3	100	94.000	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	95.865	ENSIPUG00000008548	ago3b	100	94.925	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	99	100.000	ENSIPUG00000023241	ago3a	99	100.000	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	96.000	ENSSTOG00000025904	AGO3	100	95.233	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.884	ENSJJAG00000017436	Ago3	100	99.884	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.118	ENSKMAG00000019534	ago3a	100	96.424	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.851	ENSLBEG00000007592	ago3a	100	97.851	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.314	ENSLBEG00000016073	-	100	93.736	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSLAFG00000002744	AGO3	100	100.000	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSMFAG00000035610	AGO3	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSMMUG00000006252	AGO3	100	99.884	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSMNEG00000039518	AGO3	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	100.000	ENSMLEG00000027912	AGO3	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.737	ENSMAMG00000005697	-	100	94.002	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.092	ENSMAMG00000008440	ago3a	100	97.092	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	94.987	ENSMZEG00005026243	-	100	94.233	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	97.977	ENSMZEG00005007949	ago3a	100	97.209	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000003630	AGO3	100	99.532	ENSMGAG00000003773	AGO3	99	99.532	Meleagris_gallopavo
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