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Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000004506 (Gene tree)
Gene ID: 100152137
Gene Symbol: CTIF
Alias: KIAA0427
Full Name: cap binding complex dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 322397 bases
Position: chr1:98133312-98455708
Accession: 100152137
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000055467	MIF4G	PF02854.19	1e-27	1	1
ENSSSCP00000055527	MIF4G	PF02854.19	1e-27	1	1
ENSSSCP00000059437	MIF4G	PF02854.19	1e-27	1	1
ENSSSCP00000051968	MIF4G	PF02854.19	1.1e-27	1	1
ENSSSCP00000004861	MIF4G	PF02854.19	1.5e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000050085	CTIF-203	6387	XM_021092858	ENSSSCP00000055527	592 (aa)	XP_020948517	A0A287BG20
ENSSSCT00000004978	CTIF-202	5661	XM_021092876	ENSSSCP00000004861	540 (aa)	XP_020948535	F1RPR2
ENSSSCT00000052813	CTIF-204	6293	-	ENSSSCP00000055467	592 (aa)	-	A0A287BG20
ENSSSCT00000048558	CTIF-205	6059	XM_013992847	ENSSSCP00000051968	608 (aa)	XP_013848301	A0A287B685
ENSSSCT00000064712	CTIF-201	6305	XM_013992849	ENSSSCP00000059437	592 (aa)	XP_013848303	A0A287BG20

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.983	ENSG00000134030	CTIF	100	97.115	Homo_sapiens
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	57.980	ENSAPOG00000020192	ctif	99	57.492	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000004506	CTIF	87	94.434	ENSAMEG00000006759	CTIF	82	94.434	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	51.989	ENSACIG00000017099	ctif	99	53.143	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	53.801	ENSAOCG00000014275	ctif	99	53.947	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000004506	CTIF	91	63.130	ENSAPEG00000016975	ctif	99	56.012	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	55.081	ENSATEG00000016752	ctif	99	55.473	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	75.117	ENSACAG00000018006	CTIF	100	75.272	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	93.990	ENSANAG00000024925	CTIF	100	93.990	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	55.178	ENSACLG00000005956	ctif	99	55.605	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000004506	CTIF	94	60.440	ENSAMXG00000015964	ctif	100	52.205	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	93.478	ENSBTAG00000018901	CTIF	100	93.478	Bos_taurus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	93.511	ENSCJAG00000004729	CTIF	100	93.511	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000004506	CTIF	97	94.349	ENSCAFG00000019076	CTIF	100	94.333	Canis_familiaris
ENSSSCG00000004506	CTIF	97	94.521	ENSCAFG00020026482	CTIF	100	94.500	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	92.679	ENSCHIG00000014455	CTIF	100	92.679	Capra_hircus
ENSSSCG00000004506	CTIF	90	83.148	ENSTSYG00000030461	CTIF	99	83.148	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	85.382	ENSCAPG00000011865	CTIF	100	85.880	Cavia_aperea
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	90.033	ENSCPOG00000001049	CTIF	100	90.033	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	93.677	ENSCCAG00000022758	CTIF	100	93.677	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	95.151	ENSCATG00000038134	CTIF	100	95.151	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	93.823	ENSCLAG00000008174	CTIF	100	93.823	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	95.114	ENSCSAG00000018021	CTIF	100	95.114	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000004506	CTIF	53	89.394	ENSCHOG00000009041	-	71	89.231	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	81.924	ENSCPBG00000025654	CTIF	100	81.924	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.949	ENSCANG00000030916	CTIF	100	94.949	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	90.803	ENSCGRG00001020158	Ctif	100	90.803	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	84.032	ENSCGRG00000000052	Ctif	100	84.032	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000004506	CTIF	91	61.789	ENSCSEG00000019857	ctif	99	53.228	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	52.709	ENSCVAG00000017158	ctif	99	54.692	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	53.846	ENSDARG00000090617	ctif	100	55.824	Danio_rerio
ENSSSCG00000004506	CTIF	73	92.558	ENSDNOG00000037310	CTIF	99	92.558	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	90.833	ENSDORG00000003221	Ctif	100	90.833	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.816	ENSEASG00005016094	CTIF	100	94.816	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.983	ENSECAG00000020473	CTIF	100	94.983	Equus_caballus
ENSSSCG00000004506	CTIF	90	83.889	ENSEEUG00000012451	CTIF	100	83.889	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	61.415	ENSELUG00000008733	ctif	99	61.836	Esox_lucius
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.983	ENSFCAG00000000664	CTIF	100	94.983	Felis_catus
ENSSSCG00000004506	CTIF	97	82.586	ENSFALG00000008943	CTIF	97	82.586	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	91.967	ENSFDAG00000017379	CTIF	100	91.967	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	55.354	ENSFHEG00000004334	ctif	99	55.155	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	80.099	ENSGALG00000035912	-	100	80.099	Gallus_gallus
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	55.803	ENSGAFG00000011896	ctif	99	55.346	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000004506	CTIF	68	77.778	ENSGAGG00000020663	CTIF	97	77.500	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	95.118	ENSGGOG00000015204	CTIF	100	95.118	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	55.325	ENSHBUG00000018092	ctif	99	55.752	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.147	ENSHGLG00000005663	CTIF	100	94.147	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	93.980	ENSHGLG00100006976	CTIF	100	93.980	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	54.934	ENSHCOG00000011784	ctif	99	56.312	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	55.081	ENSIPUG00000014050	ctif	99	54.314	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	90.747	ENSSTOG00000001967	CTIF	100	90.747	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	88.853	ENSJJAG00000013706	Ctif	100	88.853	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	52.562	ENSKMAG00000014651	ctif	99	53.294	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	60.762	ENSLBEG00000018277	ctif	99	61.322	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	62.536	ENSLOCG00000011697	ctif	100	63.783	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	82.222	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	98.120	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	95.151	ENSMFAG00000037903	CTIF	100	95.151	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	95.151	ENSMMUG00000020898	CTIF	100	95.151	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	95.151	ENSMNEG00000039395	CTIF	100	95.151	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.833	ENSMLEG00000041132	CTIF	100	94.833	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	55.182	ENSMAMG00000014741	ctif	99	55.912	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000004506	CTIF	88	51.895	ENSMZEG00005019767	ctif	90	52.381	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000004506	CTIF	88	54.174	ENSMGAG00000001378	CTIF	100	54.174	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	90.667	ENSMAUG00000000656	Ctif	100	90.667	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	92.846	ENSMICG00000010167	CTIF	100	92.846	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	90.500	ENSMOCG00000020507	Ctif	100	90.500	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	52.654	ENSMMOG00000000831	ctif	99	54.161	Mola_mola
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	81.513	ENSMODG00000003464	CTIF	100	81.513	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000004506	CTIF	84	54.086	ENSMALG00000020553	ctif	99	54.776	Monopterus_albus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	87.601	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	100	87.601	Mus_caroli
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	87.480	ENSMUSG00000052928	Ctif	100	87.480	Mus_musculus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	90.651	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	100	90.651	Mus_pahari
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	86.998	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	100	86.998	Mus_spretus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.500	ENSMPUG00000000844	CTIF	100	94.500	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	92.977	ENSMLUG00000003025	CTIF	100	92.977	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	92.667	ENSNGAG00000011452	Ctif	100	92.667	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	55.473	ENSNBRG00000008679	ctif	99	55.900	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.949	ENSNLEG00000011503	CTIF	100	94.949	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	77.371	ENSMEUG00000000218	CTIF	100	77.371	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	88.500	ENSOPRG00000003558	CTIF	100	88.500	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	89.372	ENSODEG00000018390	CTIF	100	89.372	Octodon_degus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	60.128	ENSONIG00000007750	ctif	99	61.874	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000004506	CTIF	83	76.289	ENSOANG00000001337	CTIF	78	95.238	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	90.333	ENSOCUG00000024842	CTIF	100	90.333	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	57.027	ENSORLG00000005786	ctif	99	57.674	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	57.395	ENSORLG00020005385	ctif	99	58.039	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	56.200	ENSORLG00015011872	ctif	99	56.844	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	53.869	ENSOMEG00000007917	ctif	99	54.227	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	92.977	ENSOGAG00000013927	CTIF	100	92.977	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	93.500	ENSOARG00000003754	CTIF	100	93.500	Ovis_aries
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.667	ENSPPAG00000023554	CTIF	100	94.667	Pan_paniscus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.667	ENSPPRG00000002265	CTIF	100	94.667	Panthera_pardus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.167	ENSPTIG00000013761	CTIF	100	94.167	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	94.500	ENSPTRG00000010009	CTIF	100	94.500	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	95.114	ENSPANG00000017087	CTIF	100	95.114	Papio_anubis
ENSSSCG00000004506	CTIF	84	63.137	ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.405	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	79.299	ENSPSIG00000006508	CTIF	100	79.299	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	49.496	ENSPMGG00000022958	ctif	99	49.857	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	91.015	ENSPEMG00000022746	Ctif	100	91.015	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000004506	CTIF	77	85.558	ENSPCIG00000026247	CTIF	95	85.558	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	60.229	ENSPFOG00000009243	ctif	99	60.229	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	56.757	ENSPLAG00000019171	ctif	99	57.188	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000004506	CTIF	99	52.693	ENSPMEG00000020089	ctif	99	53.779	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	50.140	ENSPREG00000017326	ctif	99	50.352	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000004506	CTIF	84	94.653	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	94.653	Pongo_abelii
ENSSSCG00000004506	CTIF	100	93.066	ENSPCOG00000013391	CTIF	100	93.066	Propithecus_coquereli
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