EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000004985 (Gene tree)
Gene ID: 100525675
Gene Symbol: GEMIN2
Alias: SIP1
Full Name: gem nuclear organelle associated protein 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 25479 bases
Position: chr1:169676056-169701534
Accession: 100525675
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000020329	SIP1	PF04938.12	6.2e-80	1	1
ENSSSCP00000005361	SIP1	PF04938.12	5.9e-67	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000029560	GEMIN2-201	2538	XM_003121777	ENSSSCP00000020329	281 (aa)	XP_003121825	I3L8G9
ENSSSCT00000005498	GEMIN2-202	1264	XM_005659904	ENSSSCP00000005361	258 (aa)	XP_005659961	F1SIQ2

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000004985's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000004985's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	52	56.934	ENSSSCG00000034832	-	95	56.934

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	95.374	ENSG00000092208	GEMIN2	100	95.374	Homo_sapiens
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	94.964	ENSAMEG00000003856	GEMIN2	99	94.964	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	90	64.706	ENSACIG00000014430	gemin2	94	64.706	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	65.267	ENSAOCG00000012349	gemin2	98	66.023	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	66.031	ENSAPEG00000002529	gemin2	99	66.031	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	63.118	ENSATEG00000009574	gemin2	99	63.118	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	83	78.017	ENSAPLG00000012052	GEMIN2	100	78.017	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	79.167	ENSACAG00000015872	GEMIN2	99	79.167	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	97	75.000	ENSANAG00000026213	GEMIN2	100	72.695	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	89	61.328	ENSACLG00000024473	gemin2	98	61.328	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	92	67.424	ENSAMXG00000033969	gemin2	99	67.424	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	95.018	ENSBTAG00000020930	GEMIN2	100	95.018	Bos_taurus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	93.907	ENSCJAG00000016248	GEMIN2	99	93.907	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	96.296	ENSCAFG00000013859	GEMIN2	100	96.296	Canis_familiaris
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	96.296	ENSCAFG00020022243	GEMIN2	100	96.296	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	96.667	ENSCHIG00000009881	GEMIN2	100	96.667	Capra_hircus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	89.734	ENSTSYG00000032612	-	99	89.734	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	93.950	ENSTSYG00000003528	-	100	93.950	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	85.556	ENSCPOG00000011338	GEMIN2	100	85.556	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	68.182	ENSCCAG00000030361	-	99	67.483	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	94.982	ENSCCAG00000035944	GEMIN2	99	94.982	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	95.556	ENSCATG00000042473	GEMIN2	100	95.556	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	98	72.835	ENSCATG00000031373	-	97	72.835	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	91	93.385	ENSCLAG00000008967	GEMIN2	100	93.385	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	72.656	ENSCSAG00000016872	-	99	72.656	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	97	72.426	ENSCHOG00000011644	GEMIN2	97	72.426	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	78.409	ENSCPBG00000026207	GEMIN2	99	78.409	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	87	34.138	ENSCING00000012240	-	88	34.138	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	83	35.636	ENSCSAVG00000009875	-	84	35.636	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	95.000	ENSCANG00000035266	GEMIN2	100	95.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	73.643	ENSCANG00000033060	-	95	73.643	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	93.704	ENSCGRG00001017720	Gemin2	100	93.704	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	93.704	ENSCGRG00000007060	Gemin2	100	93.704	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	61.923	ENSCSEG00000016057	gemin2	98	61.923	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	90	61.628	ENSCVAG00000003125	gemin2	99	61.628	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	68.321	ENSDARG00000015638	gemin2	99	69.020	Danio_rerio
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	75	88.208	ENSDNOG00000018278	GEMIN2	96	88.208	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	94.444	ENSDORG00000003814	Gemin2	100	94.444	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	90.357	ENSETEG00000006463	GEMIN2	99	90.357	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	78	46.667	ENSEBUG00000002198	gemin2	77	47.768	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	97.153	ENSEASG00005007617	GEMIN2	100	97.153	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	97.398	ENSECAG00000007554	GEMIN2	90	97.398	Equus_caballus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	98	85.455	ENSEEUG00000008438	GEMIN2	99	85.455	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	65.649	ENSELUG00000005266	gemin2	99	65.649	Esox_lucius
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	95.018	ENSFCAG00000029921	GEMIN2	100	95.018	Felis_catus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	98	77.091	ENSFALG00000006169	GEMIN2	98	77.091	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	92.222	ENSFDAG00000001562	GEMIN2	100	92.222	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	64.754	ENSFHEG00000020705	gemin2	99	64.754	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	80	62.174	ENSGMOG00000009379	gemin2	97	62.174	Gadus_morhua
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	79.167	ENSGALG00000010154	GEMIN2	99	79.167	Gallus_gallus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	61.255	ENSGAFG00000019641	gemin2	99	61.255	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	95	60.370	ENSGACG00000012444	gemin2	99	60.370	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	83	77.350	ENSGAGG00000003982	GEMIN2	98	77.350	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	89.147	ENSGGOG00000016691	GEMIN2	100	89.147	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	71.318	ENSGGOG00000043428	-	85	71.318	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	64.639	ENSHBUG00000016285	gemin2	99	64.639	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	93.333	ENSHGLG00000004890	GEMIN2	100	93.333	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	93.333	ENSHGLG00100009949	GEMIN2	100	93.333	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	62.308	ENSHCOG00000012786	gemin2	98	62.308	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	90	65.490	ENSIPUG00000012821	gemin2	99	65.490	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	95.556	ENSSTOG00000006357	GEMIN2	100	95.556	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	95.185	ENSJJAG00000022975	Gemin2	100	95.185	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	63.878	ENSKMAG00000007880	gemin2	98	64.615	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	88	53.785	ENSLBEG00000022377	gemin2	98	51.383	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	92	80.385	ENSLACG00000004723	GEMIN2	98	80.385	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	70.722	ENSLOCG00000009221	gemin2	99	70.722	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	94.074	ENSLAFG00000010321	GEMIN2	100	94.074	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	98	72.835	ENSMFAG00000003283	-	96	72.835	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	95.000	ENSMFAG00000014362	GEMIN2	100	95.000	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	95.926	ENSMMUG00000021028	GEMIN2	100	95.926	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	72.481	ENSMMUG00000001073	-	95	72.481	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	72.941	ENSMNEG00000033555	-	96	72.941	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	95.926	ENSMNEG00000033286	GEMIN2	100	95.926	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	70.980	ENSMLEG00000008946	-	96	70.980	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	98	96.000	ENSMLEG00000035575	GEMIN2	99	96.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	89	63.492	ENSMAMG00000012985	gemin2	98	63.492	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	63.878	ENSMZEG00005007915	gemin2	99	63.878	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	83	78.017	ENSMGAG00000012566	GEMIN2	100	78.017	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	94.815	ENSMAUG00000017447	Gemin2	100	94.815	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	93.571	ENSMICG00000004811	-	98	93.571	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	82.186	ENSMICG00000043979	-	100	82.186	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	94.444	ENSMOCG00000023031	Gemin2	100	94.444	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	88	60.729	ENSMMOG00000004604	gemin2	99	57.031	Mola_mola
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	87.500	ENSMODG00000011946	GEMIN2	99	87.500	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	63.118	ENSMALG00000021507	gemin2	99	63.118	Monopterus_albus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	93.704	MGP_CAROLIEiJ_G0017777	Gemin2	100	93.704	Mus_caroli
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	93.333	ENSMUSG00000060121	Gemin2	100	93.333	Mus_musculus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	94.074	MGP_PahariEiJ_G0029533	Gemin2	100	94.074	Mus_pahari
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	93.333	MGP_SPRETEiJ_G0018622	Gemin2	100	93.333	Mus_spretus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	96.296	ENSMPUG00000016240	GEMIN2	100	96.296	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	91	93.774	ENSMLUG00000002619	GEMIN2	97	93.774	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	93.704	ENSNGAG00000001053	Gemin2	100	93.704	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	97	95.238	ENSNLEG00000004013	GEMIN2	100	95.238	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	81.298	ENSMEUG00000011734	-	96	81.298	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	84.286	ENSOPRG00000007714	GEMIN2	99	84.286	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	94.815	ENSODEG00000000272	GEMIN2	100	94.815	Octodon_degus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	64.259	ENSONIG00000019495	gemin2	99	64.259	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	85.171	ENSOANG00000014013	-	96	85.171	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	90.780	ENSOCUG00000000673	GEMIN2	100	90.780	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	58.397	ENSORLG00000017666	gemin2	99	58.397	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	60.305	ENSORLG00020016613	gemin2	99	60.305	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	60.687	ENSORLG00015013224	gemin2	99	60.687	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	61.977	ENSOMEG00000011576	gemin2	99	61.977	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	94.306	ENSOGAG00000007906	GEMIN2	100	94.306	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	95.035	ENSOARG00000008466	GEMIN2	100	95.035	Ovis_aries
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	87.542	ENSPPAG00000043467	GEMIN2	100	87.542	Pan_paniscus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	72.481	ENSPPAG00000033797	-	91	75.556	Pan_paniscus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	95.018	ENSPPRG00000009485	GEMIN2	100	95.018	Panthera_pardus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	95.926	ENSPTIG00000018115	GEMIN2	100	95.926	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	95.374	ENSPTRG00000006291	GEMIN2	100	95.374	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	72.481	ENSPTRG00000045455	-	85	72.481	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	98	76.000	ENSPANG00000011343	-	100	76.000	Papio_anubis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	71.765	ENSPANG00000034146	-	96	71.765	Papio_anubis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	92	70.155	ENSPKIG00000010339	gemin2	98	70.155	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	75.986	ENSPSIG00000013560	GEMIN2	88	79.167	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	92	61.538	ENSPMGG00000008763	gemin2	99	61.538	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	94.444	ENSPEMG00000008079	Gemin2	100	94.444	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	82	52.590	ENSPMAG00000009804	gemin2	94	52.590	Petromyzon_marinus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	89.015	ENSPCIG00000025754	GEMIN2	79	89.015	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	62.264	ENSPFOG00000014660	gemin2	99	62.264	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	62.500	ENSPLAG00000020265	gemin2	99	62.500	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	62.121	ENSPMEG00000011134	gemin2	99	62.121	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	58.712	ENSPREG00000007692	gemin2	99	58.712	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	95.341	ENSPPYG00000005764	GEMIN2	99	95.341	Pongo_abelii
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	80.357	ENSPCAG00000005387	GEMIN2	99	80.357	Procavia_capensis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	87.900	ENSPCOG00000016964	GEMIN2	100	87.900	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	93.182	ENSPVAG00000002586	GEMIN2	99	93.182	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	64.259	ENSPNYG00000022626	gemin2	99	64.259	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	66.038	ENSPNAG00000017346	gemin2	98	66.038	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	93.704	ENSRNOG00000004360	Gemin2	100	93.704	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	67.054	ENSRBIG00000038026	-	84	80.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	95.926	ENSRBIG00000034601	GEMIN2	100	95.926	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	95.000	ENSRROG00000042627	GEMIN2	100	95.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	52	80.000	ENSRROG00000042909	-	84	80.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	92	95.367	ENSSBOG00000022280	GEMIN2	99	95.367	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	56	83.974	ENSSHAG00000000156	-	95	83.974	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	69.084	ENSSFOG00015012315	gemin2	99	69.084	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	61.217	ENSSMAG00000011151	gemin2	99	61.217	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	65.000	ENSSDUG00000017275	gemin2	98	65.000	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	89	64.542	ENSSLDG00000023429	gemin2	97	64.542	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	95	91.418	ENSSARG00000010294	GEMIN2	100	91.418	Sorex_araneus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	80.083	ENSSPUG00000017222	GEMIN2	99	80.083	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	64.504	ENSSPAG00000001354	gemin2	98	65.251	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	79.167	ENSTGUG00000012039	GEMIN2	99	79.167	Taeniopygia_guttata
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	60.837	ENSTRUG00000021760	gemin2	97	60.837	Takifugu_rubripes
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	60.456	ENSTNIG00000016875	gemin2	99	60.456	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	98	94.526	ENSTBEG00000002654	GEMIN2	98	94.526	Tupaia_belangeri
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	84.342	ENSTTRG00000017126	GEMIN2	100	84.342	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	94.815	ENSUAMG00000021811	GEMIN2	100	94.815	Ursus_americanus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	96	95.185	ENSUMAG00000008366	GEMIN2	100	95.185	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	99	96.786	ENSVPAG00000006856	GEMIN2	99	96.786	Vicugna_pacos
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	100	95.374	ENSVVUG00000020954	GEMIN2	100	95.374	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	93	77.778	ENSXETG00000000298	gemin2	96	77.778	Xenopus_tropicalis
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	58.868	ENSXCOG00000014021	gemin2	99	58.868	Xiphophorus_couchianus
ENSSSCG00000004985	GEMIN2	94	58.333	ENSXMAG00000009532	gemin2	99	58.333	Xiphophorus_maculatus