EuRBPDB

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000005935 (Gene tree)
Gene ID: 100155245
Gene Symbol: AGO2
Alias: EIF2C2
Full Name: argonaute 2%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 95741 bases
Position: chr4:2919588-3015328
Accession: 100155245
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000006345	PAZ	PF02170.22	1.5e-26	1	1
ENSSSCP00000048921	PAZ	PF02170.22	1.5e-26	1	1
ENSSSCP00000033726	PAZ	PF02170.22	1.5e-26	1	1
ENSSSCP00000051650	PAZ	PF02170.22	1.5e-26	1	1
ENSSSCP00000006345	Piwi	PF02171.17	3.7e-115	1	1
ENSSSCP00000048921	Piwi	PF02171.17	3.7e-115	1	1
ENSSSCP00000033726	Piwi	PF02171.17	3.7e-115	1	1
ENSSSCP00000051650	Piwi	PF02171.17	3.8e-115	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000064189	-	5824	-	ENSSSCP00000051650	865 (aa)	-	A0A287B5S7
ENSSSCT00000052918	-	2586	-	ENSSSCP00000033726	861 (aa)	-	A0A286ZQ43
ENSSSCT00000006516	-	2562	-	ENSSSCP00000006345	853 (aa)	-	F1RSJ1
ENSSSCT00000062448	-	5502	-	ENSSSCP00000048921	860 (aa)	-	A0A287AY99

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	90.000	ENSSSCG00000003630	AGO3	99	90.000

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.767	ENSG00000123908	AGO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.445	ENSAPOG00000017586	ago2	96	93.445	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.532	ENSAMEG00000005019	AGO2	100	99.534	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000005935	AGO2	81	93.669	ENSACIG00000001179	ago2	96	93.669	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.921	ENSAOCG00000015307	ago2	96	93.921	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.921	ENSAPEG00000018425	ago2	96	93.921	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	93.388	ENSATEG00000000529	ago2	96	93.921	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	98.945	ENSAPLG00000010465	AGO2	99	99.063	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	98.595	ENSACAG00000000167	AGO2	99	98.601	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.767	ENSANAG00000027399	AGO2	100	99.767	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000005935	AGO2	80	94.606	ENSACLG00000024684	ago2	98	94.606	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	93.160	ENSAMXG00000014587	ago2	98	93.564	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.884	ENSBTAG00000001579	AGO2	100	99.884	Bos_taurus
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	66.783	WBGene00000106	alg-2	96	66.901	Caenorhabditis_elegans
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	67.431	WBGene00000105	alg-1	87	67.431	Caenorhabditis_elegans
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.884	ENSCJAG00000004132	AGO2	100	99.884	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000005935	AGO2	95	99.877	ENSCAFG00000001196	AGO2	100	99.877	Canis_familiaris
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.883	ENSCAFG00020014198	AGO2	100	99.651	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.884	ENSCHIG00000010156	AGO2	100	99.884	Capra_hircus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.766	ENSTSYG00000007281	AGO2	99	99.883	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	84.460	ENSCAPG00000013707	AGO2	99	84.400	Cavia_aperea
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.883	ENSCPOG00000010428	AGO2	100	99.766	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	100.000	ENSCCAG00000035031	AGO2	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	96.516	ENSCATG00000038820	AGO2	100	96.516	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.883	ENSCLAG00000001381	AGO2	100	99.534	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	100.000	ENSCSAG00000009574	AGO2	96	99.074	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000005935	AGO2	83	84.633	ENSCHOG00000008938	-	84	84.633	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.180	ENSCPBG00000019183	AGO2	98	99.299	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	72.353	ENSCING00000007310	-	98	72.353	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	73.113	ENSCSAVG00000005282	-	99	79.104	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	96.127	ENSCANG00000030899	AGO2	99	96.127	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.186	ENSCGRG00001013557	Ago2	100	99.186	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	99.178	ENSCGRG00000002120	Ago2	100	99.178	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.445	ENSCSEG00000012273	ago2	96	93.445	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	92.968	ENSCVAG00000008763	ago2	100	92.539	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	92.614	ENSDARG00000061268	ago2	96	93.222	Danio_rerio
ENSSSCG00000005935	AGO2	92	97.595	ENSDNOG00000033433	AGO2	100	97.595	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.297	ENSDORG00000011242	Ago2	100	99.297	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	73.448	FBgn0262739	AGO1	90	74.443	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000005935	AGO2	81	86.172	ENSEBUG00000008202	-	99	86.172	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000005935	AGO2	95	86.757	ENSEBUG00000011986	-	100	86.757	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000005935	AGO2	81	86.192	ENSEBUG00000006807	-	100	86.192	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000005935	AGO2	81	88.905	ENSEBUG00000014654	ago2	100	88.905	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000005935	AGO2	93	57.263	ENSEBUG00000014681	ago2	99	57.263	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000005935	AGO2	95	100.000	ENSEASG00005021922	AGO2	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.884	ENSECAG00000006078	AGO2	100	99.884	Equus_caballus
ENSSSCG00000005935	AGO2	74	99.301	ENSEEUG00000008564	-	74	99.301	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	92.857	ENSELUG00000019378	ago2	96	92.857	Esox_lucius
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.884	ENSFCAG00000002782	AGO2	100	99.884	Felis_catus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	98.829	ENSFALG00000002838	AGO2	99	98.947	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	100.000	ENSFDAG00000004759	AGO2	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000005935	AGO2	95	93.432	ENSFHEG00000016080	ago2	96	93.432	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	92.729	ENSGMOG00000013651	ago2	98	92.518	Gadus_morhua
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	98.712	ENSGALG00000040957	AGO2	100	98.380	Gallus_gallus
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	93.262	ENSGAFG00000018026	ago2	97	93.683	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	92.497	ENSGACG00000006796	ago2	98	93.564	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.180	ENSGAGG00000003914	AGO2	100	99.489	Gopherus_agassizii
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ENSSSCG00000005935	AGO2	100	92.558	ENSHBUG00000018515	ago2	98	94.606	Haplochromis_burtoni
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ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.648	ENSHGLG00100015994	-	99	99.766	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.921	ENSHCOG00000006200	ago2	98	93.921	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	91.860	ENSIPUG00000001018	ago2	98	93.103	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.531	ENSSTOG00000008113	AGO2	100	99.648	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.648	ENSJJAG00000018712	Ago2	100	99.074	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	91.977	ENSKMAG00000019999	ago2	98	93.445	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.445	ENSLBEG00000005112	ago2	96	93.445	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	88.249	ENSLACG00000001277	-	98	88.507	Latimeria_chalumnae
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ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.531	ENSLAFG00000012905	AGO2	100	99.648	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	100.000	ENSMFAG00000015384	AGO2	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	100.000	ENSMMUG00000008045	AGO2	99	99.766	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	100.000	ENSMNEG00000019904	AGO2	99	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	100.000	ENSMLEG00000038874	AGO2	99	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	93.270	ENSMAMG00000008662	ago2	99	91.548	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.921	ENSMZEG00005008998	ago2	98	94.606	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	98.828	ENSMGAG00000012942	AGO2	100	98.715	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	90.973	ENSMAUG00000007785	Ago2	99	91.090	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.884	ENSMICG00000004427	AGO2	100	99.884	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.414	ENSMOCG00000000300	Ago2	100	99.531	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	90.822	ENSMMOG00000020165	ago2	100	90.822	Mola_mola
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	98.478	ENSMODG00000000748	AGO2	100	98.376	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.683	ENSMALG00000020610	ago2	98	93.683	Monopterus_albus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.302	MGP_CAROLIEiJ_G0019861	Ago2	100	99.302	Mus_caroli
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.302	ENSMUSG00000036698	Ago2	100	99.302	Mus_musculus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.070	MGP_PahariEiJ_G0019867	Ago2	100	99.070	Mus_pahari
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	99.295	MGP_SPRETEiJ_G0020759	Ago2	100	99.295	Mus_spretus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.766	ENSMPUG00000001930	AGO2	100	99.766	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000005935	AGO2	66	87.456	ENSMLUG00000004552	-	100	87.346	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	99.412	ENSNGAG00000014556	Ago2	99	99.412	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.921	ENSNBRG00000006100	ago2	96	93.921	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	94.836	ENSNLEG00000001461	AGO2	98	94.626	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000005935	AGO2	88	86.154	ENSMEUG00000001395	AGO2	86	98.039	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	87.089	ENSOPRG00000008795	-	100	87.089	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.883	ENSODEG00000014145	AGO2	100	100.000	Octodon_degus
ENSSSCG00000005935	AGO2	98	93.921	ENSONIG00000010747	ago2	96	93.921	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.414	ENSOANG00000007125	AGO2	99	99.414	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	97.655	ENSOCUG00000006066	AGO2	100	97.775	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	92.798	ENSORLG00000004615	ago2	98	93.325	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	92.798	ENSORLG00020003449	ago2	98	93.325	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	92.798	ENSORLG00015015319	ago2	98	93.325	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	92.916	ENSOMEG00000017751	ago2	98	93.445	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000005935	AGO2	100	99.766	ENSOGAG00000007933	AGO2	100	99.883	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000005935	AGO2	99	98.359	ENSOARG00000003763	AGO2	100	98.246	Ovis_aries
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