EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000008389 (Gene tree)
Gene ID: 100523547
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35450 bases
Position: chr3:80989887-81025336
Accession: 100523547
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000037160	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	1	2
ENSSSCP00000037160	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.2e-27	2	2
ENSSSCP00000043521	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-27	1	2
ENSSSCP00000043521	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.3e-27	2	2
ENSSSCP00000008955	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.4e-27	1	2
ENSSSCP00000008955	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.4e-27	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000009186	PAPOLG-202	2561	-	ENSSSCP00000008955	760 (aa)	-	F1SQL7
ENSSSCT00000054449	PAPOLG-201	3786	XM_003125108	ENSSSCP00000043521	741 (aa)	XP_003125156	A0A287AHP5
ENSSSCT00000065722	PAPOLG-203	2447	-	ENSSSCP00000037160	722 (aa)	-	A0A286ZZU3

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000008389's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000008389's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	98	62.325	ENSSSCG00000002505	-	98	62.378

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.412	ENSG00000115421	PAPOLG	100	99.573	Homo_sapiens
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.643	ENSAPOG00000004798	papolg	99	71.939	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	96.883	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	96.883	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.954	ENSACIG00000010546	papolg	99	71.547	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.510	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.776	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.643	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.908	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	73.138	ENSATEG00000009007	papolg	99	73.404	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	98	73.727	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.727	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	81	63.756	ENSACAG00000015048	-	100	63.756	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.547	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	95.547	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	69.470	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.116	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.884	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.884	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.976	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	97.976	Bos_taurus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.086	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	96.086	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.031	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	91.282	Canis_familiaris
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.386	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	96.386	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.706	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	97.706	Capra_hircus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.221	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	96.221	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	53	91.601	ENSCAPG00000014901	-	100	91.601	Cavia_aperea
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.412	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	95.412	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.951	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	95.951	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	91	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.682	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	95.682	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.682	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	95.682	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	89	94.234	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	94.234	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	69	64.752	ENSCING00000024664	-	94	64.752	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	67	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.816	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	95.816	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	93.315	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	93.315	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	93.315	ENSCGRG00000005552	-	100	93.315	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.013	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.549	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	68.277	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	73.677	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.677	Danio_rerio
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.197	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	94.197	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	59	99.068	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.068	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	73.848	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.784	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	64	71.094	ENSEBUG00000004020	papolg	94	71.094	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	66	56.904	ENSEBUG00000005042	-	82	56.904	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.166	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	97.166	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.166	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	96.748	Equus_caballus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	84.885	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.885	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.482	ENSELUG00000014497	papolg	99	65.030	Esox_lucius
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.031	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	97.031	Felis_catus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	65.471	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.471	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.277	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	95.277	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	66	62.261	ENSFHEG00000019080	papolg	90	63.424	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	87	83.032	ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.032	Gadus_morhua
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	71.506	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	71.506	Gallus_gallus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	68.799	ENSGAFG00000003263	papolg	99	70.000	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	71.788	ENSGACG00000002718	papolg	100	72.090	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.547	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	95.547	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	69.470	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.246	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	94.851	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.851	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.277	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	95.277	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.252	ENSHCOG00000006782	papolg	89	70.651	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	71.838	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.643	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.086	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	59	98.834	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	98.834	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	71.220	ENSKMAG00000016439	papolg	97	70.977	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	68.414	ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.670	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	71.067	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	71.067	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	73.560	ENSLOCG00000016130	papolg	100	73.560	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.213	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.951	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	95.951	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.951	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	95.951	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	87.265	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	87.265	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.816	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	95.816	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.510	ENSMAMG00000010667	papolg	99	71.566	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	69.470	ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.529	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.817	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.817	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	93.315	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	93.315	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.122	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	96.122	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	93.387	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	93.387	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	71.788	ENSMMOG00000008020	papolg	99	72.318	Mola_mola
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	87.936	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.936	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.244	ENSMALG00000007012	papolg	89	72.244	Monopterus_albus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.602	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.299	Mus_caroli
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.467	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.299	Mus_musculus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.332	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	94.332	Mus_pahari
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.332	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.299	Mus_spretus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.031	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	92	96.574	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	94.986	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	94.986	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.277	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	95.277	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	63.061	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.720	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	59	99.068	ENSNLEG00000009507	-	100	99.068	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	83	78.767	ENSMEUG00000013605	-	87	78.767	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.682	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	95.682	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	59	94.131	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.131	Octodon_degus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	65.421	ENSONIG00000002985	papolg	100	66.088	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	86.997	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	86.997	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.626	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	96.626	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.439	ENSORLG00000001577	papolg	99	70.185	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.159	ENSORLG00020002482	papolg	99	70.503	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.439	ENSORLG00015008836	papolg	99	70.185	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.267	ENSOMEG00000001406	papolg	99	70.053	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	58	89.302	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	89.538	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.706	ENSOARG00000001563	PAPOLG	93	97.365	Ovis_aries
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.412	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	95.412	Pan_paniscus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.031	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	97.031	Panthera_pardus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.896	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	96.896	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.412	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	95.412	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	91.790	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	91.790	Papio_anubis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.988	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.988	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	95	71.449	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.697	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	79.515	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.515	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	92.769	ENSPEMG00000008960	-	100	92.769	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	53.795	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.981	Petromyzon_marinus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	68	63.395	ENSPMAG00000004864	-	96	63.395	Petromyzon_marinus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	87.984	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.984	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	68.970	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.404	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	69.060	ENSPLAG00000018445	papolg	89	69.554	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	69.010	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.554	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	68.442	ENSPREG00000010358	papolg	96	68.889	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.412	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.412	Pongo_abelii
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	82.449	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.449	Procavia_capensis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	87.396	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	87.396	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	89	94.624	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	94.624	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	71.369	ENSPNYG00000006729	papolg	99	71.369	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	73.565	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.565	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.197	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	94.197	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	89.744	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	89.744	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.682	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	95.682	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	95.951	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.951	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	94	88.227	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.260	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	64.130	ENSSFOG00015011874	papolg	100	64.130	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	70.897	ENSSFOG00015002383	papolg	100	70.897	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	81.002	ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.750	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	73.214	ENSSDUG00000000912	papolg	99	73.352	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.510	ENSSLDG00000001217	papolg	99	72.643	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	78.503	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.503	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.199	ENSSPAG00000009004	papolg	99	72.199	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	75	76.937	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	100	76.937	Taeniopygia_guttata
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	71.486	ENSTRUG00000006410	papolg	99	71.486	Takifugu_rubripes
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	65.793	ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.793	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	88.027	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	88.027	Tupaia_belangeri
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	92.982	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	92.982	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	97.271	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	97.271	Ursus_americanus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	97.271	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	93	96.804	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	99	93.197	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	93.197	Vicugna_pacos
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	97.091	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	97.031	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	75.332	ENSXETG00000002208	papolg	100	75.332	Xenopus_tropicalis
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	69	85.685	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.685	Xiphophorus_couchianus
ENSSSCG00000008389	PAPOLG	81	83.099	ENSXMAG00000007383	papolg	99	83.099	Xiphophorus_maculatus