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Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000009436 (Gene tree)
Gene ID: 100155739
Gene Symbol: MTRF1
Alias: MGC47721|MTTRF1|RF1
Full Name: mitochondrial translation release factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 38271 bases
Position: chr11:25603779-25642049
Accession: 100155739
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000010075	RF-1	PF00472.20	4.8e-39	1	1
ENSSSCP00000045464	RF-1	PF00472.20	4.8e-39	1	1
ENSSSCP00000047509	RF-1	PF00472.20	4.8e-39	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000058161	MTRF1-201	2943	XM_021065101	ENSSSCP00000045464	446 (aa)	XP_020920760	F1RJ87
ENSSSCT00000062595	MTRF1-203	5471	-	ENSSSCP00000047509	446 (aa)	-	F1RJ87
ENSSSCT00000010343	MTRF1-202	2061	XM_021065102	ENSSSCP00000010075	446 (aa)	XP_020920761	F1RJ87

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSSCG00000009436	MTRF1	76	49.415	ENSSSCG00000004076	MTRF1L	87	49.415

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	86.323	ENSG00000120662	MTRF1	100	86.323	Homo_sapiens
ENSSSCG00000009436	MTRF1	77	59.195	ENSAPOG00000010181	mtrf1	86	59.195	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	87.220	ENSAMEG00000008696	MTRF1	100	87.220	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000009436	MTRF1	54	67.364	ENSACIG00000001495	mtrf1	96	67.364	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	86	57.216	ENSAOCG00000002832	mtrf1	87	57.216	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000009436	MTRF1	86	56.959	ENSAPEG00000014844	mtrf1	87	56.959	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000009436	MTRF1	80	57.382	ENSATEG00000017403	mtrf1	86	57.382	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	99	65.227	ENSAPLG00000009317	MTRF1	99	65.227	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000009436	MTRF1	87	66.067	ENSACAG00000000897	MTRF1	88	66.067	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000009436	MTRF1	88	79.442	ENSANAG00000025310	-	97	85.124	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	78.523	ENSANAG00000023063	-	100	78.523	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000009436	MTRF1	92	54.893	ENSACLG00000023945	mtrf1	93	54.893	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000009436	MTRF1	52	67.532	ENSAMXG00000031859	mtrf1	96	67.532	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	90.157	ENSBTAG00000012260	MTRF1	100	90.157	Bos_taurus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	83.857	ENSCJAG00000017739	MTRF1	100	89.655	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.459	ENSCAFG00000004795	MTRF1	100	85.459	Canis_familiaris
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.459	ENSCAFG00020018178	MTRF1	100	85.459	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	88.789	ENSCHIG00000011810	MTRF1	100	88.789	Capra_hircus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	84.978	ENSTSYG00000006976	MTRF1	100	84.978	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000009436	MTRF1	97	84.722	ENSCAPG00000013163	MTRF1	100	84.722	Cavia_aperea
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	84.081	ENSCPOG00000005264	MTRF1	100	84.081	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	84.081	ENSCCAG00000035116	MTRF1	100	84.081	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.650	ENSCATG00000009909	MTRF1	100	85.650	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	83.632	ENSCLAG00000000582	MTRF1	100	83.632	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.650	ENSCSAG00000017835	MTRF1	100	85.650	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	92	77.262	ENSCHOG00000011915	-	100	77.262	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000009436	MTRF1	89	70.720	ENSCPBG00000007969	MTRF1	90	70.720	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.426	ENSCANG00000040353	MTRF1	100	85.426	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	80.493	ENSCGRG00001003065	Mtrf1	100	80.493	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	80.493	ENSCGRG00000002570	Mtrf1	100	80.493	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000009436	MTRF1	90	54.390	ENSCSEG00000005667	mtrf1	92	54.390	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000009436	MTRF1	88	54.271	ENSCVAG00000021729	mtrf1	92	54.271	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	52	59.829	ENSDARG00000033579	mtrf1	99	59.829	Danio_rerio
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.045	ENSDNOG00000034196	MTRF1	100	91.613	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	99	84.270	ENSDORG00000016429	Mtrf1	100	84.270	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	81.614	ENSETEG00000014811	MTRF1	100	81.614	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000009436	MTRF1	52	57.692	ENSEBUG00000000778	mtrf1	96	57.692	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	88.789	ENSEASG00005015715	MTRF1	100	88.789	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	88.789	ENSECAG00000014389	MTRF1	97	88.789	Equus_caballus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	65.625	ENSEEUG00000004450	-	100	66.071	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	85	54.856	ENSELUG00000006544	mtrf1	88	54.856	Esox_lucius
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.202	ENSFCAG00000031635	MTRF1	100	85.202	Felis_catus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	89	68.170	ENSFALG00000008036	MTRF1	99	68.170	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	82.287	ENSFDAG00000017881	MTRF1	100	82.287	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000009436	MTRF1	88	54.220	ENSFHEG00000019043	mtrf1	90	54.220	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	84	51.852	ENSGMOG00000008608	mtrf1	99	51.852	Gadus_morhua
ENSSSCG00000009436	MTRF1	87	71.979	ENSGALG00000016951	MTRF1	85	71.979	Gallus_gallus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	85	56.316	ENSGAFG00000007093	mtrf1	86	56.316	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000009436	MTRF1	84	57.333	ENSGACG00000013728	mtrf1	98	57.333	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	69	76.699	ENSGAGG00000025696	MTRF1	98	76.699	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.874	ENSGGOG00000002529	MTRF1	100	85.874	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	84.081	ENSHGLG00000003210	MTRF1	100	84.081	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	83.857	ENSHGLG00100011843	MTRF1	100	83.857	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000009436	MTRF1	87	54.522	ENSHCOG00000009449	mtrf1	88	54.522	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	84.305	ENSSTOG00000021682	MTRF1	100	84.305	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	81.839	ENSJJAG00000017590	Mtrf1	100	81.839	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	91	53.902	ENSKMAG00000003231	mtrf1	91	53.902	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	54	65.432	ENSLBEG00000027169	-	98	65.432	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000009436	MTRF1	54	65.432	ENSLBEG00000023151	mtrf1	98	65.432	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000009436	MTRF1	96	60.046	ENSLACG00000010582	MTRF1	88	65.051	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000009436	MTRF1	92	56.796	ENSLOCG00000005937	MTRF1	91	56.796	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	99	68.100	ENSLAFG00000030499	-	99	68.100	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	83.184	ENSLAFG00000022177	-	100	83.184	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.650	ENSMFAG00000037972	MTRF1	100	85.650	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.874	ENSMNEG00000035487	MTRF1	100	85.874	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.650	ENSMLEG00000033582	MTRF1	100	85.650	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	83	59.030	ENSMAMG00000022048	mtrf1	83	59.030	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	92	54.893	ENSMZEG00005017922	mtrf1	93	54.893	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000009436	MTRF1	87	71.649	ENSMGAG00000014971	MTRF1	93	71.649	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	80.942	ENSMAUG00000011661	Mtrf1	100	80.942	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	87.220	ENSMICG00000033131	MTRF1	100	87.220	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	79.148	ENSMOCG00000011945	Mtrf1	100	79.148	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000009436	MTRF1	51	60.262	ENSMMOG00000013394	mtrf1	94	60.262	Mola_mola
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	72.036	ENSMODG00000014772	MTRF1	100	72.036	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000009436	MTRF1	85	56.021	ENSMALG00000013274	mtrf1	87	56.021	Monopterus_albus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	80.269	MGP_CAROLIEiJ_G0019539	Mtrf1	99	80.269	Mus_caroli
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	81.839	ENSMUSG00000022022	Mtrf1	100	81.839	Mus_musculus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	81.390	MGP_PahariEiJ_G0030557	Mtrf1	100	81.390	Mus_pahari
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	81.166	MGP_SPRETEiJ_G0020435	Mtrf1	100	81.166	Mus_spretus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	99	85.135	ENSMPUG00000001874	MTRF1	99	85.135	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	88.341	ENSMLUG00000017237	MTRF1	100	88.341	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	82.735	ENSNGAG00000014460	Mtrf1	100	82.735	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000009436	MTRF1	51	68.122	ENSNBRG00000004634	mtrf1	97	68.122	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.874	ENSNLEG00000001236	MTRF1	100	85.874	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	67.114	ENSMEUG00000001846	MTRF1	100	67.114	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000009436	MTRF1	74	57.879	ENSOPRG00000006450	-	100	57.879	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	81.614	ENSODEG00000005782	MTRF1	100	81.614	Octodon_degus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	87	57.326	ENSONIG00000012476	mtrf1	100	57.326	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	70	72.152	ENSOANG00000003383	-	100	72.152	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.202	ENSOCUG00000025207	MTRF1	100	85.202	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	85	56.545	ENSORLG00000003225	mtrf1	87	56.545	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000009436	MTRF1	85	56.545	ENSORLG00020021048	mtrf1	86	56.545	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000009436	MTRF1	85	56.283	ENSORLG00015020957	mtrf1	87	56.283	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000009436	MTRF1	85	57.632	ENSOMEG00000002022	mtrf1	87	57.632	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000009436	MTRF1	73	76.687	ENSOGAG00000026411	-	100	76.687	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	80.269	ENSOGAG00000009719	-	100	80.269	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	89.013	ENSOARG00000006994	MTRF1	100	89.013	Ovis_aries
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	86.323	ENSPPAG00000000050	MTRF1	100	86.323	Pan_paniscus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.650	ENSPPRG00000009511	MTRF1	100	85.650	Panthera_pardus
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.650	ENSPTIG00000006673	MTRF1	100	85.650	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	86.323	ENSPTRG00000005815	MTRF1	100	86.323	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000009436	MTRF1	100	85.874	ENSPANG00000010809	MTRF1	100	85.874	Papio_anubis
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ENSSSCG00000009436	MTRF1	89	69.900	ENSPSIG00000004773	MTRF1	89	69.900	Pelodiscus_sinensis
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