EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000011639 (Gene tree)
Gene ID: 100523141
Gene Symbol: SRPRB
Alias: APMCF1|SR-beta
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 34189 bases
Position: chr13:74976025-75010213
Accession: 100523141
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000012405	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000012739	SRPRB-201	2616	XM_021069470	ENSSSCP00000012405	271 (aa)	XP_020925129	F1SLA7

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000011639's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000011639's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSSCG00000011639	SRPRB	50	31.618	ENSSSCG00000011734	ARL14	68	31.618

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSG00000144867	SRPRB	99	93.711	Homo_sapiens
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	89.668	ENSANAG00000028236	SRPRB	100	89.668	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	95.203	ENSBTAG00000044075	SRPRB	92	95.203	Bos_taurus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	89.668	ENSCJAG00000002845	SRPRB	100	89.668	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	92.251	ENSCAFG00020027568	SRPRB	100	92.251	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	94.096	ENSCHIG00000019717	SRPRB	100	94.096	Capra_hircus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	87.454	ENSTSYG00000031948	SRPRB	100	87.454	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	81.919	ENSCPOG00000030107	SRPRB	100	81.919	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	87.823	ENSCCAG00000033027	SRPRB	100	87.823	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSCATG00000033438	SRPRB	100	91.144	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	89.299	ENSCLAG00000002810	SRPRB	100	89.299	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSCSAG00000010699	SRPRB	100	91.144	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	84.502	ENSCHOG00000011792	SRPRB	100	84.502	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	74.539	ENSCANG00000043327	SRPRB	100	74.539	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	87.454	ENSCGRG00001018121	Srprb	100	87.454	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000011639	SRPRB	94	88.672	ENSCGRG00000014367	Srprb	98	88.672	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	89.299	ENSDNOG00000032146	SRPRB	100	89.299	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	85	86.522	ENSDORG00000000764	Srprb	85	88.128	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	92.989	ENSEASG00005003967	SRPRB	100	92.989	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	92.989	ENSECAG00000036666	SRPRB	100	92.989	Equus_caballus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	93.727	ENSFCAG00000037571	SRPRB	92	93.727	Felis_catus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	88.192	ENSFDAG00000017529	SRPRB	100	88.192	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.513	ENSGGOG00000027849	SRPRB	100	91.513	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	88.561	ENSHGLG00000016818	SRPRB	100	88.561	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	88.561	ENSHGLG00100018893	SRPRB	100	88.561	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	84.133	ENSSTOG00000022718	SRPRB	100	84.133	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSMFAG00000039758	SRPRB	100	91.144	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSMMUG00000008918	SRPRB	100	91.144	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSMNEG00000032832	SRPRB	100	91.144	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSMLEG00000035589	SRPRB	100	91.144	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	87.823	ENSMAUG00000021695	Srprb	100	87.823	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	90.406	ENSMICG00000048959	SRPRB	100	90.406	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	81.919	ENSMODG00000018493	SRPRB	100	81.919	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	88.192	MGP_CAROLIEiJ_G0032586	Srprb	100	88.192	Mus_caroli
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	87.823	ENSMUSG00000032553	Srprb	100	87.823	Mus_musculus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	88.930	MGP_PahariEiJ_G0015454	Srprb	100	88.930	Mus_pahari
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	87.823	MGP_SPRETEiJ_G0033731	Srprb	100	87.823	Mus_spretus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.513	ENSMPUG00000009687	SRPRB	100	91.513	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	88.930	ENSNGAG00000024311	-	100	88.930	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	90.406	ENSNLEG00000003655	SRPRB	100	90.406	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	88.930	ENSODEG00000018092	SRPRB	100	88.930	Octodon_degus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	90.406	ENSOCUG00000007623	SRPRB	100	90.406	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	89.668	ENSOGAG00000005243	SRPRB	100	89.668	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000011639	SRPRB	85	92.174	ENSOARG00000008412	SRPRB	92	94.977	Ovis_aries
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSPPAG00000023940	SRPRB	100	91.144	Pan_paniscus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	93.727	ENSPPRG00000023305	SRPRB	100	93.727	Panthera_pardus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	92.989	ENSPTIG00000007351	SRPRB	100	92.989	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSPTRG00000015413	SRPRB	100	91.144	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	90.775	ENSPANG00000023015	SRPRB	100	90.775	Papio_anubis
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	88.192	ENSPEMG00000017954	Srprb	100	88.192	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.144	ENSPPYG00000014115	SRPRB	100	91.144	Pongo_abelii
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	80.074	ENSPCAG00000013823	SRPRB	100	80.074	Procavia_capensis
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.882	ENSPVAG00000011319	SRPRB	100	91.882	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	90.775	ENSRBIG00000027819	SRPRB	100	90.775	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	90.775	ENSRROG00000030536	SRPRB	100	90.775	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000011639	SRPRB	74	88.060	ENSSBOG00000015129	SRPRB	100	88.060	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	90.775	ENSSARG00000012943	SRPRB	100	90.775	Sorex_araneus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	99	86.989	ENSTBEG00000006116	SRPRB	99	87.732	Tupaia_belangeri
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	87.823	ENSTTRG00000007802	SRPRB	100	87.823	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	92.251	ENSUAMG00000018135	SRPRB	100	92.251	Ursus_americanus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	91.882	ENSUMAG00000015817	SRPRB	100	91.882	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000011639	SRPRB	100	92.251	ENSVVUG00000005707	SRPRB	100	92.251	Vulpes_vulpes