EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000015056 (Gene tree)
Gene ID: 100522629
Gene Symbol: REXO2
Alias: CGI-114|DKFZP566E144|SFN
Full Name: RNA exonuclease 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10727 bases
Position: chr9:41977971-41988697
Accession: 100522629
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000015981	RNase_T	PF00929.24	5.6e-33	1	1
ENSSSCP00000031527	RNase_T	PF00929.24	9.9e-28	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000016422	REXO2-201	1189	XM_003129878	ENSSSCP00000015981	237 (aa)	XP_003129926	F1SJV8
ENSSSCT00000040955	REXO2-202	1175	-	ENSSSCP00000031527	210 (aa)	-	A0A286ZIZ9

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000015056's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000015056's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSG00000076043	REXO2	100	98.404	Homo_sapiens
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.890	ENSAMEG00000013263	REXO2	100	97.890	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000015056	REXO2	76	80.663	ENSACIG00000023553	smfn	97	80.663	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000015056	REXO2	54	75.194	ENSAOCG00000011565	smfn	79	75.194	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000015056	REXO2	81	80.311	ENSAPEG00000012435	smfn	71	80.311	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000015056	REXO2	96	72.247	ENSATEG00000015385	smfn	81	72.247	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000015056	REXO2	86	84.390	ENSAPLG00000005045	REXO2	100	84.390	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000015056	REXO2	93	67.005	ENSACAG00000011631	REXO2	92	69.903	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.468	ENSANAG00000020834	REXO2	100	97.468	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000015056	REXO2	61	72.917	ENSANAG00000027457	-	99	69.444	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000015056	REXO2	95	72.124	ENSACLG00000024566	smfn	98	78.723	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	98.734	ENSBTAG00000005843	REXO2	100	98.734	Bos_taurus
ENSSSCG00000015056	REXO2	77	46.448	WBGene00007429	C08B6.8	88	56.522	Caenorhabditis_elegans
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.203	ENSCJAG00000012434	REXO2	100	96.203	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.046	ENSCAFG00000013511	REXO2	100	97.046	Canis_familiaris
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.890	ENSCAFG00020002513	REXO2	100	97.890	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	99.156	ENSCHIG00000009264	REXO2	100	99.156	Capra_hircus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSTSYG00000002237	REXO2	100	96.624	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000015056	REXO2	82	85.641	ENSTSYG00000027948	-	100	85.641	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000015056	REXO2	79	98.936	ENSCAPG00000006093	REXO2	100	98.936	Cavia_aperea
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.468	ENSCPOG00000010548	REXO2	100	97.468	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSCCAG00000034979	REXO2	100	96.624	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSCATG00000015278	REXO2	100	96.624	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.468	ENSCLAG00000011195	REXO2	100	97.468	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.203	ENSCSAG00000002754	REXO2	100	96.203	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	94.937	ENSCHOG00000000642	-	100	94.937	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000015056	REXO2	67	95.714	ENSCHOG00000013497	REXO2	100	95.714	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000015056	REXO2	61	88.966	ENSCPBG00000009359	REXO2	100	88.966	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000015056	REXO2	82	55.747	ENSCING00000009858	-	87	58.564	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSCANG00000034756	REXO2	100	96.624	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	86	96.585	ENSCGRG00001010922	-	100	96.585	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000015056	REXO2	86	97.073	ENSCGRG00001013673	-	100	97.073	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.203	ENSCGRG00001019814	-	100	96.203	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.203	ENSCGRG00000006235	Rexo2	100	96.203	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000015056	REXO2	81	82.292	ENSCSEG00000007214	smfn	71	80.808	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000015056	REXO2	77	79.235	ENSCVAG00000012008	smfn	99	79.235	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	93	72.523	ENSDARG00000009806	smfn	85	71.622	Danio_rerio
ENSSSCG00000015056	REXO2	88	96.651	ENSDNOG00000046533	REXO2	100	96.651	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.468	ENSDORG00000011255	Rexo2	100	97.468	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000015056	REXO2	97	70.742	ENSDORG00000025142	-	97	72.489	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000015056	REXO2	93	46.193	FBgn0039115	CG10214	98	48.544	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000015056	REXO2	85	73.889	ENSEBUG00000013964	REXO2	65	76.720	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.468	ENSEASG00005006674	REXO2	100	97.468	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.468	ENSECAG00000005988	REXO2	100	97.468	Equus_caballus
ENSSSCG00000015056	REXO2	84	79.293	ENSELUG00000020072	smfn	69	79.293	Esox_lucius
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	98.734	ENSFCAG00000018632	REXO2	100	98.734	Felis_catus
ENSSSCG00000015056	REXO2	80	88.889	ENSFALG00000010044	REXO2	94	88.889	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.046	ENSFDAG00000011764	REXO2	100	97.046	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000015056	REXO2	58	47.934	ENSFHEG00000022493	-	75	54.082	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000015056	REXO2	77	81.988	ENSGMOG00000006370	smfn	94	80.663	Gadus_morhua
ENSSSCG00000015056	REXO2	83	91.878	ENSGALG00000035980	REXO2	100	83.682	Gallus_gallus
ENSSSCG00000015056	REXO2	84	78.500	ENSGAFG00000015349	smfn	71	78.500	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000015056	REXO2	80	77.778	ENSGACG00000020096	smfn	87	80.114	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	95	84.444	ENSGAGG00000021126	REXO2	97	84.444	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.046	ENSGGOG00000023267	REXO2	100	97.046	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000015056	REXO2	54	75.591	ENSHBUG00000020097	REXO2	62	75.591	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	95.359	ENSHGLG00000013556	REXO2	100	95.359	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	95.781	ENSHGLG00100005257	REXO2	100	95.781	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000015056	REXO2	76	76.667	ENSHCOG00000007122	smfn	93	79.518	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000015056	REXO2	84	81.313	ENSIPUG00000020440	rexo2	76	78.537	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	98.312	ENSSTOG00000012465	REXO2	100	98.312	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	69.620	ENSJJAG00000022605	-	100	69.620	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	98.312	ENSJJAG00000013710	-	100	98.312	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000015056	REXO2	81	80.208	ENSKMAG00000016795	smfn	72	75.743	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000015056	REXO2	79	77.778	ENSLBEG00000006021	smfn	100	77.778	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000015056	REXO2	92	69.604	ENSLACG00000018623	REXO2	93	69.163	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000015056	REXO2	87	81.553	ENSLOCG00000002389	smfn	98	81.553	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	94.515	ENSLAFG00000012451	REXO2	100	94.515	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSMFAG00000041155	REXO2	100	96.624	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSMMUG00000012269	REXO2	100	96.624	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSMNEG00000033379	REXO2	100	96.624	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSMLEG00000036571	REXO2	100	96.624	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000015056	REXO2	85	78.218	ENSMAMG00000021209	smfn	73	77.723	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	95	72.124	ENSMZEG00005020730	REXO2	86	72.124	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000015056	REXO2	95	72.124	ENSMZEG00005023224	-	86	72.124	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000015056	REXO2	68	88.957	ENSMGAG00000003026	REXO2	100	88.957	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.203	ENSMAUG00000014576	Rexo2	100	96.203	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.468	ENSMICG00000010094	REXO2	100	97.468	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	95.781	ENSMOCG00000009016	Rexo2	100	95.781	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000015056	REXO2	89	74.762	ENSMMOG00000006430	smfn	72	78.462	Mola_mola
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	90.717	ENSMODG00000013913	REXO2	100	90.717	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000015056	REXO2	85	76.119	ENSMALG00000018130	smfn	57	76.119	Monopterus_albus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	94.937	MGP_CAROLIEiJ_G0032166	Rexo2	100	94.937	Mus_caroli
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	95.359	ENSMUSG00000032026	Rexo2	100	95.359	Mus_musculus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	95.359	MGP_PahariEiJ_G0015034	Rexo2	100	95.359	Mus_pahari
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	95.359	MGP_SPRETEiJ_G0033305	Rexo2	100	95.359	Mus_spretus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.890	ENSMPUG00000003947	REXO2	100	97.890	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSMLUG00000009030	REXO2	100	96.624	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000015056	REXO2	86	99.024	ENSNGAG00000008819	Rexo2	100	99.024	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000015056	REXO2	77	79.670	ENSNBRG00000006529	smfn	96	79.670	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.046	ENSNLEG00000029745	REXO2	100	97.046	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000015056	REXO2	92	94.495	ENSMEUG00000011558	REXO2	99	94.495	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	74.262	ENSOPRG00000011076	REXO2	100	74.262	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000015056	REXO2	86	76.667	ENSODEG00000016046	-	98	77.436	Octodon_degus
ENSSSCG00000015056	REXO2	50	87.500	ENSODEG00000009698	-	81	87.500	Octodon_degus
ENSSSCG00000015056	REXO2	79	99.468	ENSODEG00000009750	-	100	99.468	Octodon_degus
ENSSSCG00000015056	REXO2	85	79.602	ENSONIG00000001954	smfn	85	79.602	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000015056	REXO2	88	94.231	ENSOANG00000001754	REXO2	100	87.967	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.046	ENSOCUG00000004274	REXO2	95	97.046	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000015056	REXO2	87	80.583	ENSORLG00000005119	smfn	67	80.583	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000015056	REXO2	87	80.583	ENSORLG00020010121	smfn	67	80.583	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000015056	REXO2	87	80.097	ENSORLG00015015699	smfn	66	80.097	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000015056	REXO2	87	76.699	ENSOMEG00000016878	REXO2	76	76.699	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000015056	REXO2	60	75.352	ENSOMEG00000008940	-	99	75.352	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.890	ENSOGAG00000016860	REXO2	100	97.890	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000015056	REXO2	88	98.086	ENSOARG00000001040	REXO2	98	98.086	Ovis_aries
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSPPAG00000039849	REXO2	100	96.624	Pan_paniscus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	98.734	ENSPPRG00000007255	REXO2	100	98.734	Panthera_pardus
ENSSSCG00000015056	REXO2	79	100.000	ENSPTIG00000015578	REXO2	100	100.000	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSPTRG00000004306	REXO2	100	96.624	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSPANG00000010675	REXO2	100	96.624	Papio_anubis
ENSSSCG00000015056	REXO2	88	78.846	ENSPKIG00000000911	smfn	77	84.459	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000015056	REXO2	84	92.000	ENSPSIG00000005151	REXO2	81	86.266	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000015056	REXO2	79	80.851	ENSPMGG00000007442	smfn	100	80.851	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	81.013	ENSPEMG00000001421	Rexo2	100	81.013	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000015056	REXO2	50	74.038	ENSPMAG00000001022	REXO2	97	79.646	Petromyzon_marinus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	90.295	ENSPCIG00000011227	REXO2	63	90.295	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000015056	REXO2	85	79.602	ENSPFOG00000017861	smfn	97	81.218	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000015056	REXO2	81	78.947	ENSPLAG00000007327	REXO2	68	76.966	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000015056	REXO2	85	79.602	ENSPMEG00000017343	smfn	72	79.602	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000015056	REXO2	85	78.607	ENSPREG00000016438	smfn	72	78.607	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.046	ENSPPYG00000003895	REXO2	100	97.046	Pongo_abelii
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	94.937	ENSPCAG00000005237	REXO2	100	94.937	Procavia_capensis
ENSSSCG00000015056	REXO2	93	95.897	ENSPCOG00000027639	REXO2	100	95.897	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	87.029	ENSPVAG00000005295	REXO2	100	87.029	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000015056	REXO2	95	71.681	ENSPNYG00000018401	smfn	92	64.979	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000015056	REXO2	82	83.077	ENSPNAG00000005290	smfn	76	80.193	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	95.781	ENSRNOG00000018939	Rexo2	100	95.781	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSRBIG00000037809	REXO2	100	96.624	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	96.624	ENSRROG00000038928	REXO2	100	96.624	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000015056	REXO2	73	43.956	YLR059C	REX2	67	44.134	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.046	ENSSBOG00000028651	REXO2	100	97.046	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000015056	REXO2	99	90.213	ENSSHAG00000008008	REXO2	100	90.213	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000015056	REXO2	79	81.283	ENSSFOG00015022414	smfn	99	81.283	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000015056	REXO2	98	68.670	ENSSMAG00000003168	smfn	85	68.670	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000015056	REXO2	85	79.104	ENSSDUG00000015624	smfn	71	79.104	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000015056	REXO2	86	79.803	ENSSLDG00000014005	smfn	71	79.803	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000015056	REXO2	60	100.000	ENSSARG00000014530	REXO2	100	100.000	Sorex_araneus
ENSSSCG00000015056	REXO2	67	88.679	ENSSPUG00000006005	REXO2	85	88.679	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	76	82.320	ENSSPAG00000001530	smfn	97	82.320	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000015056	REXO2	84	88.442	ENSTGUG00000000121	REXO2	99	80.335	Taeniopygia_guttata
ENSSSCG00000015056	REXO2	82	77.320	ENSTRUG00000021529	smfn	82	69.196	Takifugu_rubripes
ENSSSCG00000015056	REXO2	80	81.579	ENSTNIG00000008588	smfn	89	78.109	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.468	ENSTBEG00000017040	REXO2	100	97.468	Tupaia_belangeri
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.046	ENSTTRG00000014928	REXO2	100	97.046	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000015056	REXO2	93	97.949	ENSUAMG00000019096	REXO2	100	97.949	Ursus_americanus
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	98.312	ENSUMAG00000003770	REXO2	100	98.312	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000015056	REXO2	79	79.255	ENSVPAG00000006301	REXO2	100	79.255	Vicugna_pacos
ENSSSCG00000015056	REXO2	100	97.468	ENSVVUG00000025223	REXO2	100	97.468	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000015056	REXO2	84	86.935	ENSXETG00000012648	rexo2	98	75.720	Xenopus_tropicalis
ENSSSCG00000015056	REXO2	94	68.000	ENSXCOG00000018838	smfn	95	78.495	Xiphophorus_couchianus
ENSSSCG00000015056	REXO2	85	77.114	ENSXMAG00000021125	smfn	64	77.114	Xiphophorus_maculatus