EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000015227 (Gene tree)
Gene ID: 100513370
Gene Symbol: SRPRA
Alias: SR-alpha|SRP-alpha|SRPR|Sralpha
Full Name: SRP receptor subunit alpha
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11074 bases
Position: chr9:53354747-53365820
Accession: 100513370
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000057467	SRP54	PF00448.22	2.6e-47	1	1
ENSSSCP00000016148	SRP54	PF00448.22	3.2e-47	1	1
ENSSSCP00000057467	SRP54_N	PF02881.19	2.5e-08	1	1
ENSSSCP00000016148	SRP54_N	PF02881.19	2.8e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000044666	SRPRA-201	7517	XM_003130057	ENSSSCP00000057467	638 (aa)	XP_003130105	A0A287BMR4
ENSSSCT00000016593	SRPRA-202	2174	-	ENSSSCP00000016148	668 (aa)	-	F1S754

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000015227's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000015227's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.335	ENSG00000182934	SRPRA	100	97.335	Homo_sapiens
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.328	ENSAPOG00000017588	srpra	100	68.349	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.649	ENSAMEG00000000117	SRPRA	100	97.649	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.564	ENSACIG00000021588	srpra	100	66.871	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.237	ENSAOCG00000018884	srpra	100	68.855	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.732	ENSAPEG00000022286	srpra	100	66.563	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000015227	SRPRA	83	86.984	ENSATEG00000023578	srpra	94	85.976	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	94	78.818	ENSAPLG00000016079	SRPRA	100	78.982	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	77.658	ENSACAG00000000108	SRPRA	100	78.000	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.179	ENSANAG00000020346	SRPRA	100	97.179	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.381	ENSACLG00000000518	srpra	100	67.786	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	65.839	ENSAMXG00000009975	srpra	100	65.373	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.340	ENSBTAG00000014105	SRPRA	100	97.340	Bos_taurus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	99	49.304	WBGene00009521	F38A1.8	99	48.777	Caenorhabditis_elegans
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.179	ENSCJAG00000008752	SRPRA	100	97.179	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	94.671	ENSCAFG00000010474	SRPRA	100	94.671	Canis_familiaris
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.708	ENSCAFG00020010608	SRPRA	100	96.708	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.183	ENSCHIG00000012423	SRPRA	100	97.183	Capra_hircus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	81	98.125	ENSTSYG00000005187	SRPRA	100	98.125	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000015227	SRPRA	95	88.303	ENSCAPG00000007098	SRPRA	91	97.744	Cavia_aperea
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.925	ENSCPOG00000014976	SRPRA	100	95.925	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.022	ENSCCAG00000025602	SRPRA	100	97.022	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.492	ENSCATG00000039354	SRPRA	100	97.492	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.552	ENSCLAG00000016839	SRPRA	100	96.552	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.492	ENSCSAG00000002271	SRPRA	100	97.492	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	55	98.980	ENSCHOG00000010015	-	73	98.980	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	78.341	ENSCPBG00000011128	SRPRA	100	78.802	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000015227	SRPRA	99	58.321	ENSCING00000008954	-	100	58.626	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	99	59.140	ENSCSAVG00000005602	-	100	59.513	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.395	ENSCANG00000032337	SRPRA	100	96.395	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.925	ENSCGRG00001017670	Srpr	100	95.925	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.925	ENSCGRG00000009892	Srpr	100	95.925	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.333	ENSCSEG00000002374	srpra	100	68.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.976	ENSCVAG00000019881	srpra	100	68.598	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.565	ENSDARG00000061124	srpra	100	65.961	Danio_rerio
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.194	ENSDNOG00000010821	SRPRA	100	94.419	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.395	ENSDORG00000016719	Srpr	100	96.395	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000015227	SRPRA	99	51.623	FBgn0010391	Gtp-bp	100	52.080	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	92.212	ENSETEG00000013956	SRPRA	100	92.212	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000015227	SRPRA	51	80.923	ENSEBUG00000002602	srpra	92	68.421	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.870	ENSEASG00005022980	SRPRA	100	96.870	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.027	ENSECAG00000014692	SRPRA	100	97.027	Equus_caballus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	87.539	ENSEEUG00000007920	SRPRA	100	86.760	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	69.313	ENSELUG00000017643	srpra	100	69.466	Esox_lucius
ENSSSCG00000015227	SRPRA	80	96.477	ENSFCAG00000030894	-	99	96.477	Felis_catus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.496	ENSFCAG00000011274	-	100	97.496	Felis_catus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	99	75.507	ENSFALG00000005048	SRPRA	99	75.663	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.708	ENSFDAG00000016229	SRPRA	100	96.708	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.771	ENSFHEG00000016959	srpra	100	68.437	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.634	ENSGMOG00000013244	srpra	100	69.302	Gadus_morhua
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	79.045	ENSGALG00000030759	SRPRA	100	79.199	Gallus_gallus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.134	ENSGAFG00000000453	srpra	100	68.533	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.281	ENSGACG00000006550	srpra	100	68.203	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	79.570	ENSGAGG00000021157	SRPRA	100	79.570	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.179	ENSGGOG00000012962	SRPRA	100	97.179	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.228	ENSHBUG00000000119	srpra	100	67.634	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.768	ENSHGLG00000001597	SRPR	100	95.768	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.768	ENSHGLG00100006449	SRPR	100	95.768	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.134	ENSHCOG00000010749	srpra	100	68.541	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000015227	SRPRA	94	64.459	ENSIPUG00000000867	srpra	99	64.620	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.238	ENSSTOG00000009897	SRPRA	100	96.238	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.611	ENSJJAG00000020272	Srpr	100	95.611	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.524	ENSKMAG00000002280	srpra	100	69.231	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.424	ENSLBEG00000009608	srpra	100	69.313	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	70.988	ENSLACG00000017781	SRPRA	100	70.988	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.389	ENSLOCG00000002733	srpra	100	66.815	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.462	ENSLAFG00000010252	SRPRA	100	95.462	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.649	ENSMFAG00000032606	SRPRA	100	97.649	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.649	ENSMMUG00000007938	SRPRA	100	97.649	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.492	ENSMNEG00000030709	SRPRA	100	97.492	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.492	ENSMLEG00000043404	SRPRA	100	97.492	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.171	ENSMAMG00000000473	srpra	100	67.171	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.381	ENSMZEG00005013432	srpra	100	67.786	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000015227	SRPRA	94	78.878	ENSMGAG00000000732	SRPRA	100	79.043	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.238	ENSMAUG00000015648	Srpr	100	96.238	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.082	ENSMICG00000015981	SRPRA	100	96.082	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.238	ENSMOCG00000008311	Srpr	100	96.238	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.030	ENSMMOG00000005019	srpra	100	67.807	Mola_mola
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	90.297	ENSMODG00000004576	-	100	89.812	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.722	ENSMALG00000011343	srpra	100	68.693	Monopterus_albus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.611	MGP_CAROLIEiJ_G0031951	Srpr	100	95.611	Mus_caroli
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.611	ENSMUSG00000032042	Srpr	100	95.611	Mus_musculus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.082	MGP_PahariEiJ_G0014816	Srpr	100	96.082	Mus_pahari
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	91.045	MGP_SPRETEiJ_G0033075	Srpr	100	91.045	Mus_spretus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.865	ENSMPUG00000006626	SRPRA	100	96.865	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.141	ENSMLUG00000017334	SRPRA	100	95.141	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.455	ENSNGAG00000015686	Srpr	100	95.455	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.275	ENSNBRG00000017311	srpra	100	67.835	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000015227	SRPRA	99	93.218	ENSNLEG00000007467	SRPRA	100	97.209	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000015227	SRPRA	94	90.167	ENSMEUG00000004956	SRPRA	100	89.833	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	89.045	ENSOPRG00000013160	SRPRA	100	89.045	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	95.455	ENSODEG00000004730	SRPRA	100	95.455	Octodon_degus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.530	ENSONIG00000005324	srpra	100	67.982	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.649	ENSOCUG00000017057	SRPRA	100	97.649	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	86	86.032	ENSORLG00000014676	srpra	100	68.558	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.791	ENSORLG00020009240	srpra	100	68.558	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.485	ENSORLG00015015405	srpra	100	68.405	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.203	ENSOMEG00000005872	srpra	100	68.606	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.552	ENSOGAG00000008926	SRPRA	100	96.552	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	93.292	ENSOARG00000012397	SRPRA	100	93.916	Ovis_aries
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.335	ENSPPAG00000030813	SRPRA	100	97.335	Pan_paniscus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.496	ENSPPRG00000001542	SRPRA	100	97.496	Panthera_pardus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.340	ENSPTIG00000006989	SRPRA	100	97.340	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.335	ENSPTRG00000028360	SRPRA	100	97.335	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.649	ENSPANG00000010858	SRPRA	100	97.649	Papio_anubis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.551	ENSPKIG00000016106	srpra	100	68.069	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000015227	SRPRA	94	77.833	ENSPSIG00000012009	SRPRA	100	77.997	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.865	ENSPMGG00000001393	srpra	100	68.865	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.082	ENSPEMG00000018279	Srpr	100	96.082	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000015227	SRPRA	99	61.300	ENSPMAG00000009559	srpra	99	60.796	Petromyzon_marinus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	89.671	ENSPCIG00000010207	SRPRA	100	89.828	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.576	ENSPFOG00000003114	srpra	100	69.592	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.629	ENSPLAG00000007323	srpra	100	69.605	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.576	ENSPMEG00000015658	srpra	100	69.592	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	69.159	ENSPREG00000004937	srpra	100	69.894	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000015227	SRPRA	89	98.684	ENSPPYG00000004045	SRPRA	100	98.684	Pongo_abelii
ENSSSCG00000015227	SRPRA	64	99.225	ENSPCAG00000003801	-	64	99.225	Procavia_capensis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.395	ENSPCOG00000025726	SRPRA	100	96.395	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.865	ENSPVAG00000000993	SRPRA	100	96.865	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.381	ENSPNYG00000012371	srpra	100	67.786	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	65.091	ENSPNAG00000013476	srpra	100	66.717	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.082	ENSRNOG00000010543	Srpra	100	96.082	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.335	ENSRBIG00000008702	SRPRA	100	97.335	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.183	ENSRROG00000029494	SRPRA	100	97.183	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000015227	SRPRA	67	37.657	YDR292C	-	76	37.657	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.179	ENSSBOG00000035892	SRPRA	100	97.179	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	94	90.199	ENSSHAG00000009168	SRPRA	100	89.867	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	64.486	ENSSFOG00015008837	srpra	100	65.835	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.822	ENSSMAG00000002783	srpra	100	66.770	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.344	ENSSDUG00000013920	srpra	100	67.344	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.717	ENSSLDG00000008601	srpra	93	68.085	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	81	100.000	ENSSARG00000012434	SRPRA	86	100.000	Sorex_araneus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	77.623	ENSSPUG00000018221	SRPRA	100	77.778	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	67.223	ENSSPAG00000005103	srpra	100	68.189	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	94	75.783	ENSTGUG00000000815	SRPRA	100	75.783	Taeniopygia_guttata
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.563	ENSTRUG00000006856	srpra	100	66.970	Takifugu_rubripes
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	66.261	ENSTNIG00000010316	srpra	100	66.009	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.714	ENSTTRG00000001558	SRPRA	100	96.714	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	97.496	ENSUAMG00000005510	SRPRA	100	97.496	Ursus_americanus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	96	88.530	ENSUMAG00000002269	SRPRA	99	88.530	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	69	99.225	ENSVPAG00000001077	SRPRA	75	99.225	Vicugna_pacos
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	96.865	ENSVVUG00000020094	SRPRA	100	96.865	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	62.595	ENSXETG00000003920	srpra	100	62.748	Xenopus_tropicalis
ENSSSCG00000015227	SRPRA	84	87.619	ENSXCOG00000001286	srpra	100	86.186	Xiphophorus_couchianus
ENSSSCG00000015227	SRPRA	100	68.429	ENSXMAG00000028401	srpra	100	68.835	Xiphophorus_maculatus