EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000015309 (Gene tree)
Gene ID: 100516386
Gene Symbol: MTERF1
Alias: MTERF
Full Name: mitochondrial transcription termination factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8192 bases
Position: chr9:71845662-71853853
Accession: 100516386
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000016236	mTERF	PF02536.14	3.8e-77	1	1
ENSSSCP00000032256	mTERF	PF02536.14	3.8e-77	1	1
ENSSSCP00000033268	mTERF	PF02536.14	3.8e-77	1	1
ENSSSCP00000045291	mTERF	PF02536.14	3.8e-77	1	1
ENSSSCP00000034894	mTERF	PF02536.14	4.6e-77	1	1
ENSSSCP00000040645	mTERF	PF02536.14	5.4e-77	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000049326	MTERF1-203	2782	XM_013979683	ENSSSCP00000034894	399 (aa)	XP_013835137	A0A286ZTW7
ENSSSCT00000064264	MTERF1-205	2749	XM_005667586	ENSSSCP00000033268	378 (aa)	XP_005667643	F1S318
ENSSSCT00000016682	MTERF1-206	2640	-	ENSSSCP00000016236	378 (aa)	-	F1S318
ENSSSCT00000046737	MTERF1-204	2867	XM_005667588	ENSSSCP00000032256	378 (aa)	XP_005667645	F1S318
ENSSSCT00000051628	MTERF1-202	3480	XM_005667585	ENSSSCP00000045291	378 (aa)	XP_005667642	F1S318
ENSSSCT00000039655	MTERF1-201	3453	XM_003130132	ENSSSCP00000040645	420 (aa)	XP_003130180	A0A287A9T5

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.979	ENSG00000127989	MTERF1	100	82.734	Homo_sapiens
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	53.211	ENSAPOG00000022230	MTERF1	82	53.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	89	75.298	ENSAMEG00000007917	-	100	76.081	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	52.294	ENSACIG00000017700	MTERF1	81	52.381	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	51.988	ENSAOCG00000004345	MTERF1	82	52.063	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	51.988	ENSAPEG00000005877	MTERF1	82	52.063	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	53.659	ENSATEG00000011055	MTERF1	82	53.797	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	94	47.042	ENSACAG00000015777	MTERF1	90	46.479	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.447	ENSANAG00000022640	MTERF1	99	82.031	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000015309	MTERF1	93	49.014	ENSACLG00000011571	MTERF1	81	51.429	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000015309	MTERF1	88	47.619	ENSAMXG00000017008	MTERF1	89	49.051	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.933	ENSBTAG00000045617	MTERF1	97	82.946	Bos_taurus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	81.333	ENSCJAG00000014169	MTERF1	99	80.856	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.133	ENSCAFG00000001908	MTERF1	99	81.122	Canis_familiaris
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.133	ENSCAFG00020015983	MTERF1	99	81.122	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	84.267	ENSCHIG00000013172	MTERF1	97	84.755	Capra_hircus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	96	80.769	ENSTSYG00000012629	MTERF1	99	80.407	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000015309	MTERF1	100	75.926	ENSCPOG00000003510	MTERF1	97	75.126	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.447	ENSCCAG00000026587	MTERF1	99	81.612	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.181	ENSCATG00000039620	MTERF1	99	82.116	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	81.915	ENSCSAG00000012508	MTERF1	97	81.865	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	95	54.444	ENSCPBG00000021801	MTERF1	89	54.444	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	81.383	ENSCANG00000030925	MTERF1	99	81.360	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	71.733	ENSCGRG00001009716	-	100	71.429	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	71.733	ENSCGRG00000018838	-	99	71.543	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	52.439	ENSCVAG00000007837	MTERF1	83	52.532	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	86	46.769	ENSDARG00000086107	MTERF1	86	46.965	Danio_rerio
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	63.733	ENSDNOG00000032229	MTERF1	94	63.007	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	76.862	ENSDORG00000028877	-	99	77.188	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	84.267	ENSEASG00005019646	MTERF1	99	84.021	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	85.333	ENSECAG00000018128	MTERF1	99	85.052	Equus_caballus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	85	77.329	ENSEEUG00000013448	MTERF1	80	76.677	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	90	51.734	ENSELUG00000014952	MTERF1	79	53.822	Esox_lucius
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	83.289	ENSFCAG00000044797	MTERF1	99	84.171	Felis_catus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	30.211	ENSFDAG00000004491	MTERF2	84	30.408	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000015309	MTERF1	90	52.047	ENSFHEG00000000224	MTERF1	82	52.848	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	48.949	ENSGMOG00000007262	-	94	48.910	Gadus_morhua
ENSSSCG00000015309	MTERF1	86	51.534	ENSGAFG00000008852	MTERF1	82	51.592	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000015309	MTERF1	100	54.737	ENSGAGG00000025333	MTERF1	96	53.333	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	84.043	ENSGGOG00000025995	MTERF1	99	83.938	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000015309	MTERF1	93	49.296	ENSHBUG00000022218	MTERF1	81	51.746	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000015309	MTERF1	92	49.857	ENSHCOG00000016064	MTERF1	82	51.111	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000015309	MTERF1	86	52.308	ENSIPUG00000004017	mterf1	81	52.396	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	79.467	ENSSTOG00000001846	MTERF1	98	79.790	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	76.800	ENSJJAG00000011811	-	99	75.467	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	88	48.214	ENSKMAG00000009695	MTERF1	82	48.571	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	86	54.012	ENSLACG00000009880	MTERF1	79	54.808	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000015309	MTERF1	86	55.215	ENSLOCG00000018348	MTERF1	81	55.414	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	80.267	ENSLAFG00000000054	MTERF1	99	80.053	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	81.649	ENSMFAG00000038723	MTERF1	99	81.360	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.447	ENSMMUG00000015516	MTERF1	99	82.447	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.447	ENSMNEG00000041445	MTERF1	99	82.116	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	81.649	ENSMLEG00000008543	MTERF1	99	81.612	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	52.294	ENSMAMG00000015682	MTERF1	82	52.381	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	93	49.014	ENSMZEG00005026659	MTERF1	81	51.429	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	71.467	ENSMAUG00000006025	-	99	71.353	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	83.511	ENSMICG00000046314	MTERF1	99	83.715	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	62	64.407	MGP_CAROLIEiJ_G0026941	-	97	62.979	Mus_caroli
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	73.210	ENSMUSG00000040429	Mterf1a	99	72.679	Mus_musculus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	73.210	ENSMUSG00000053178	Mterf1b	99	72.751	Mus_musculus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	72.487	MGP_PahariEiJ_G0021713	-	99	72.222	Mus_pahari
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	72.487	MGP_PahariEiJ_G0021712	-	99	72.222	Mus_pahari
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	72.414	MGP_SPRETEiJ_G0027937	-	99	71.883	Mus_spretus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	72.414	MGP_SPRETEiJ_G0027936	-	99	71.883	Mus_spretus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	80.851	ENSMPUG00000008568	MTERF1	99	80.856	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.400	ENSMLUG00000011330	MTERF1	99	79.597	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	76.533	ENSNGAG00000014383	-	98	76.393	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000015309	MTERF1	50	56.477	ENSNBRG00000022238	-	50	63.399	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	84.574	ENSNLEG00000015192	MTERF1	99	84.383	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000015309	MTERF1	55	79.235	ENSOPRG00000009642	-	58	79.235	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	78.933	ENSODEG00000000904	-	95	79.265	Octodon_degus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	78.933	ENSODEG00000014952	-	95	79.265	Octodon_degus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	95	49.171	ENSONIG00000019792	MTERF1	83	52.063	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	81	52.941	ENSOANG00000004680	-	99	52.941	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	79.733	ENSOCUG00000010902	MTERF1	98	77.949	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	89	49.704	ENSORLG00000027811	MTERF1	82	50.794	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	48.930	ENSOMEG00000023485	MTERF1	82	49.524	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	81.067	ENSOGAG00000001378	MTERF1	97	81.347	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.667	ENSOARG00000016682	MTERF1	97	83.204	Ovis_aries
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	84.043	ENSPPAG00000027361	MTERF1	99	83.938	Pan_paniscus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.493	ENSPPRG00000002171	MTERF1	99	83.166	Panthera_pardus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	82.493	ENSPTIG00000016254	MTERF1	99	83.417	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	83.777	ENSPTRG00000052592	-	99	83.679	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	83.777	ENSPTRG00000019388	MTERF1	99	83.679	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	81.649	ENSPANG00000007445	MTERF1	100	82.111	Papio_anubis
ENSSSCG00000015309	MTERF1	81	30.225	ENSPKIG00000000498	mterf2	86	30.225	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000015309	MTERF1	88	51.807	ENSPKIG00000017849	MTERF1	85	52.229	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000015309	MTERF1	88	51.807	ENSPKIG00000017556	MTERF1	85	52.229	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000015309	MTERF1	100	53.421	ENSPSIG00000016905	MTERF1	98	52.308	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	76.000	ENSPEMG00000013884	-	99	75.862	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	39.697	ENSPMAG00000007898	MTERF1	93	39.550	Petromyzon_marinus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	51.829	ENSPFOG00000006919	MTERF1	82	51.899	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	51.524	ENSPLAG00000011584	MTERF1	82	51.582	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000015309	MTERF1	87	51.524	ENSPREG00000012369	MTERF1	83	51.582	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000015309	MTERF1	95	82.778	ENSPPYG00000017826	MTERF1	96	80.964	Pongo_abelii
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	83.289	ENSPCOG00000013179	MTERF1	100	83.166	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000015309	MTERF1	74	85.985	ENSPVAG00000006613	MTERF1	76	85.985	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000015309	MTERF1	93	49.014	ENSPNYG00000009120	MTERF1	81	51.429	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000015309	MTERF1	89	52.522	ENSPNAG00000022366	MTERF1	82	53.994	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000015309	MTERF1	99	72.872	ENSRNOG00000007899	Mterf1	99	72.872	Rattus_norvegicus
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