EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000016884 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PELO
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1449 bases
Position: chr16:32142034-32143482
Accession: 100511788
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000017892	eRF1_2	PF03464.15	1.2e-31	1	1
ENSSSCP00000017892	eRF1_3	PF03465.15	4e-27	1	1
ENSSSCP00000017892	eRF1_1	PF03463.15	2.6e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000018388	PELO-201	1143	XM_013984761	ENSSSCP00000017892	380 (aa)	XP_013840215	F2Z5N9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.623	ENSG00000152684	PELO	100	96.623	Homo_sapiens
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.442	ENSAPOG00000023072	pelo	100	78.442	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000016884	PELO	64	78.138	ENSAPOG00000023700	-	90	78.138	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000016884	PELO	64	78.138	ENSAPOG00000000616	pelo	90	78.138	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.364	ENSAMEG00000007734	PELO	100	96.364	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000016884	PELO	97	75.335	ENSACIG00000014386	pelo	97	80.473	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	ENSAOCG00000023717	pelo	100	78.701	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	ENSAPEG00000011235	pelo	100	78.701	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.260	ENSATEG00000019550	pelo	100	80.260	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000016884	PELO	77	82.215	ENSAPLG00000013265	PELO	100	82.215	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000016884	PELO	98	88.830	ENSACAG00000004352	PELO	100	88.571	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSANAG00000014096	PELO	100	97.143	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	ENSACLG00000010305	pelo	100	78.701	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000016884	PELO	97	80.161	ENSAMXG00000020299	pelo	100	79.534	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.922	ENSBTAG00000003268	PELO	99	97.922	Bos_taurus
ENSSSCG00000016884	PELO	99	56.955	WBGene00011280	pelo-1	100	56.955	Caenorhabditis_elegans
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.403	ENSCJAG00000035190	PELO	100	97.403	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.623	ENSCAFG00020023234	PELO	100	96.623	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.662	ENSCHIG00000016410	PELO	99	97.662	Capra_hircus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.403	ENSTSYG00000005203	PELO	100	97.403	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.403	ENSCPOG00000027406	PELO	100	97.403	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.403	ENSCCAG00000035600	PELO	100	97.403	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSCATG00000011829	PELO	100	97.143	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.883	ENSCLAG00000005043	PELO	100	96.883	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSCSAG00000016692	PELO	100	97.143	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.623	ENSCHOG00000000523	PELO	100	96.623	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000016884	PELO	98	91.755	ENSCPBG00000007544	PELO	100	91.429	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000016884	PELO	97	67.024	ENSCING00000001979	-	100	67.532	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000016884	PELO	100	68.571	ENSCSAVG00000006158	-	100	68.571	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSCANG00000023382	PELO	100	97.143	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000016884	PELO	97	94.370	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	94.286	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000016884	PELO	100	95.325	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	95.325	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.442	ENSCSEG00000008807	pelo	100	78.442	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.000	ENSCVAG00000016082	pelo	100	80.000	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.519	ENSDARG00000055477	pelo	100	80.519	Danio_rerio
ENSSSCG00000016884	PELO	100	93.782	ENSDNOG00000036721	PELO	100	93.782	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.104	ENSDORG00000016689	Pelo	100	96.104	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000016884	PELO	96	66.846	FBgn0011207	pelo	96	66.755	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000016884	PELO	71	78.363	ENSEBUG00000004955	pelo	99	78.363	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.883	ENSEASG00005013348	PELO	100	96.883	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.961	ENSELUG00000023229	pelo	100	78.961	Esox_lucius
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSFCAG00000032341	PELO	100	97.143	Felis_catus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	92.727	ENSFALG00000004559	PELO	100	92.727	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000016884	PELO	73	96.127	ENSFDAG00000002076	PELO	88	96.127	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.442	ENSFHEG00000009769	pelo	100	78.442	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000016884	PELO	98	78.780	ENSGMOG00000005849	pelo	100	78.701	Gadus_morhua
ENSSSCG00000016884	PELO	100	79.221	ENSGAFG00000019350	pelo	100	79.221	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	ENSGACG00000007245	pelo	100	78.701	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000016884	PELO	98	92.021	ENSGAGG00000004018	PELO	100	91.688	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSGGOG00000012635	PELO	100	97.143	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	ENSHBUG00000005866	pelo	100	78.701	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.883	ENSHGLG00000005932	PELO	100	96.883	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000016884	PELO	100	95.526	ENSHGLG00100017627	PELO	100	95.526	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000016884	PELO	100	76.364	ENSHCOG00000016782	pelo	100	76.364	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	ENSIPUG00000020627	pelo	100	78.701	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.403	ENSSTOG00000027378	PELO	100	97.403	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	92.727	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	92.727	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.000	ENSKMAG00000021305	pelo	100	80.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000016884	PELO	99	79.167	ENSLBEG00000022399	pelo	100	79.167	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSLAFG00000020551	PELO	100	97.143	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSMFAG00000000651	PELO	100	97.143	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSMMUG00000039101	PELO	100	97.143	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSMNEG00000035538	PELO	100	97.143	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSMLEG00000039113	PELO	100	97.143	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000016884	PELO	97	81.501	ENSMAMG00000013260	pelo	100	81.299	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	ENSMZEG00005014258	pelo	100	78.701	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000016884	PELO	100	95.584	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	95.584	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.403	ENSMICG00000044040	PELO	100	97.403	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	95.844	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	95.844	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.182	ENSMMOG00000001324	pelo	100	78.182	Mola_mola
ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.519	ENSMALG00000008194	pelo	100	80.519	Monopterus_albus
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ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.104	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	96.104	Mus_musculus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.364	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	96.364	Mus_pahari
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.104	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	96.104	Mus_spretus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	94.026	ENSMLUG00000024132	PELO	100	94.026	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.104	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	96.104	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	ENSNBRG00000011799	pelo	100	78.701	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSNLEG00000035970	PELO	100	97.143	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000016884	PELO	100	92.987	ENSMEUG00000005468	PELO	100	92.987	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000016884	PELO	98	95.778	ENSOPRG00000018793	PELO	100	95.778	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.104	ENSODEG00000017579	PELO	100	96.104	Octodon_degus
ENSSSCG00000016884	PELO	96	78.919	ENSONIG00000011511	pelo	100	78.701	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.883	ENSOCUG00000023902	PELO	100	96.883	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	79.481	ENSORLG00000005827	pelo	100	79.481	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000016884	PELO	100	79.740	ENSORLG00020016456	pelo	100	79.740	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.000	ENSORLG00015014447	pelo	100	80.000	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.260	ENSOMEG00000021567	pelo	100	80.260	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.104	ENSOGAG00000027940	PELO	100	96.104	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.922	ENSOARG00000008324	PELO	99	97.922	Ovis_aries
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSPPAG00000038951	PELO	100	97.143	Pan_paniscus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSPPRG00000018800	PELO	100	97.143	Panthera_pardus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSPTIG00000019988	PELO	100	97.143	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.883	ENSPTRG00000034409	PELO	100	96.883	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSPANG00000010902	PELO	100	97.143	Papio_anubis
ENSSSCG00000016884	PELO	100	81.818	ENSPKIG00000015190	pelo	100	81.818	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000016884	PELO	98	91.489	ENSPSIG00000004971	PELO	100	91.169	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000016884	PELO	67	76.357	ENSPMGG00000014561	pelo	95	76.357	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.104	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	96.104	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000016884	PELO	100	95.325	ENSPCIG00000004880	PELO	100	95.325	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.000	ENSPFOG00000007277	pelo	100	80.000	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.260	ENSPLAG00000020787	pelo	100	80.260	Poecilia_latipinna
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ENSSSCG00000016884	PELO	100	80.260	ENSPREG00000023071	pelo	100	80.260	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000016884	PELO	100	96.883	ENSPPYG00000015451	PELO	96	96.883	Pongo_abelii
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.403	ENSPCOG00000021178	PELO	100	97.403	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000016884	PELO	100	78.701	ENSPNYG00000017325	pelo	100	78.701	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000016884	PELO	97	80.697	ENSPNAG00000012458	pelo	99	79.481	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000016884	PELO	100	95.844	ENSRNOG00000061128	Pelo	100	95.844	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSRBIG00000007299	PELO	100	97.143	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000016884	PELO	100	97.143	ENSRROG00000035507	PELO	100	97.143	Rhinopithecus_roxellana
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