EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000016938 (Gene tree)
Gene ID: 100525544
Gene Symbol: IPO11
Alias: RanBP11
Full Name: importin 11
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 401663 bases
Position: chr16:41121007-41522669
Accession: 100525544
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000051659	IBN_N	PF03810.19	3.2e-20	1	1
ENSSSCP00000041767	IBN_N	PF03810.19	3.6e-20	1	1
ENSSSCP00000042254	IBN_N	PF03810.19	3.7e-20	1	1
ENSSSCP00000037820	IBN_N	PF03810.19	4e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000018446	IPO11-206	1869	-	ENSSSCP00000017946	94 (aa)	-	F1SKV5
ENSSSCT00000053964	IPO11-202	3230	XM_021077043	ENSSSCP00000037820	975 (aa)	XP_020932702	A0A287A273
ENSSSCT00000042522	IPO11-204	2942	XM_021077045	ENSSSCP00000051659	879 (aa)	XP_020932704	A0A287B6E0
ENSSSCT00000049001	IPO11-201	3146	-	ENSSSCP00000041767	947 (aa)	-	A0A287ACP5
ENSSSCT00000040024	IPO11-203	3038	-	ENSSSCP00000042254	911 (aa)	-	A0A287AED9
ENSSSCT00000038152	IPO11-205	1916	-	ENSSSCP00000040394	94 (aa)	-	F1SKV5

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.949	ENSG00000086200	IPO11	100	98.936	Homo_sapiens
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	84.513	ENSAPOG00000009256	ipo11	100	84.513	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.544	ENSAMEG00000004080	IPO11	99	97.544	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000016938	IPO11	91	85.786	ENSACIG00000003345	ipo11	98	85.856	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	81.186	ENSAOCG00000000164	ipo11	100	81.186	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	81.084	ENSAPEG00000005496	ipo11	100	81.084	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000016938	IPO11	98	84.357	ENSATEG00000016853	ipo11	99	84.691	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	91.620	ENSAPLG00000009338	IPO11	94	91.620	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	88.821	ENSACAG00000008472	IPO11	99	88.821	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.538	ENSANAG00000027877	IPO11	99	97.538	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	86.034	ENSACLG00000014997	ipo11	94	86.034	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	77.254	ENSAMXG00000005993	ipo11	100	77.254	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000016938	IPO11	98	97.329	ENSBTAG00000018616	IPO11	99	97.329	Bos_taurus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.744	ENSCJAG00000015559	IPO11	99	97.744	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	98.256	ENSCAFG00000007240	IPO11	100	98.256	Canis_familiaris
ENSSSCG00000016938	IPO11	80	96.159	ENSCAFG00020022776	-	99	96.159	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.744	ENSCHIG00000013218	IPO11	100	97.744	Capra_hircus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	95.590	ENSCPOG00000009412	IPO11	100	95.590	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.846	ENSCCAG00000024860	IPO11	99	97.846	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.846	ENSCATG00000040159	IPO11	100	97.846	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.846	ENSCLAG00000003889	IPO11	100	97.846	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000016938	IPO11	61	97.963	ENSCSAG00000016001	IPO11	96	97.963	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000016938	IPO11	79	95.305	ENSCHOG00000002780	IPO11	77	95.585	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	92.316	ENSCPBG00000026824	IPO11	100	92.316	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000016938	IPO11	99	34.879	ENSCING00000006626	-	99	34.980	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000016938	IPO11	98	39.759	ENSCSAVG00000003664	-	99	34.721	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000016938	IPO11	98	96.628	ENSCANG00000042405	IPO11	99	96.628	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	96.615	ENSCGRG00001012206	Ipo11	100	96.615	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	96.615	ENSCGRG00000003026	-	100	96.615	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	82.872	ENSCSEG00000017257	ipo11	100	82.872	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000016938	IPO11	99	86.034	ENSCVAG00000011995	ipo11	100	83.385	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000016938	IPO11	99	84.086	ENSDARG00000054224	ipo11	99	84.086	Danio_rerio
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	93.436	ENSDORG00000002721	Ipo11	100	93.436	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000016938	IPO11	97	37.070	FBgn0284254	Impbeta11	95	35.000	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000016938	IPO11	99	60.288	ENSEBUG00000003347	ipo11	99	60.391	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000016938	IPO11	60	91.887	ENSEASG00005006951	-	98	91.887	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.538	ENSECAG00000014185	IPO11	98	97.538	Equus_caballus
ENSSSCG00000016938	IPO11	90	98.256	ENSEEUG00000000271	IPO11	92	95.955	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	82.974	ENSELUG00000002842	ipo11	100	82.974	Esox_lucius
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	98.256	ENSFCAG00000003236	IPO11	100	98.256	Felis_catus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	89.949	ENSFALG00000011086	IPO11	100	89.949	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.436	ENSFDAG00000016117	IPO11	100	97.436	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000016938	IPO11	96	87.209	ENSFHEG00000017985	ipo11	100	87.209	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	81.846	ENSGMOG00000007727	ipo11	100	81.846	Gadus_morhua
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	89.846	ENSGALG00000014740	IPO11	100	89.846	Gallus_gallus
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	83.179	ENSGAFG00000012342	ipo11	100	83.713	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	82.256	ENSGACG00000006939	ipo11	100	82.256	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000016938	IPO11	98	86.295	ENSGAGG00000008880	IPO11	99	86.733	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	98.051	ENSGGOG00000003240	IPO11	100	98.051	Gorilla_gorilla
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ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.641	ENSHGLG00100011662	IPO11	100	97.641	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	80.943	ENSHCOG00000013529	ipo11	100	80.943	Hippocampus_comes
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ENSSSCG00000016938	IPO11	100	95.531	ENSMPUG00000007026	IPO11	100	94.872	Mustela_putorius_furo
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ENSSSCG00000016938	IPO11	95	78.959	ENSNBRG00000013831	ipo11	99	78.680	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.846	ENSNLEG00000003072	IPO11	100	97.846	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000016938	IPO11	74	93.478	ENSMEUG00000003783	-	74	93.478	Notamacropus_eugenii
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ENSSSCG00000016938	IPO11	100	84.513	ENSONIG00000015147	ipo11	100	84.513	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000016938	IPO11	93	92.656	ENSOANG00000012524	IPO11	91	92.656	Ornithorhynchus_anatinus
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ENSSSCG00000016938	IPO11	100	97.744	ENSOARG00000006763	IPO11	99	97.744	Ovis_aries
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ENSSSCG00000016938	IPO11	100	96.410	ENSPEMG00000018393	Ipo11	100	96.410	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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