EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000017346 (Gene tree)
Gene ID: 100522208
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 40896 bases
Position: chr12:18474097-18514992
Accession: 100522208
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000018378	GTP_EFTU	PF00009.27	4.8e-45	1	1
ENSSSCP00000018378	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.7e-12	1	1
ENSSSCP00000018378	EFG_IV	PF03764.18	3.7e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000018882	EFTUD2-201	3605	XM_003131332	ENSSSCP00000018378	972 (aa)	XP_003131380	F1RQZ9

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000017346's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000017346's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	87	39.024	ENSSSCG00000025675	EEF2	99	39.024
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	57	34.074	ENSSSCG00000014074	GFM2	68	34.074

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.691	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.975	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.872	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.794	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	88.477	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.374	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.975	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.387	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.284	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	99	94.233	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	94.233	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.428	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.428	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.588	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.975	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.607	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.607	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	99.486	Bos_taurus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	99	70.351	WBGene00001166	eftu-2	99	70.041	Caenorhabditis_elegans
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.588	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.794	Canis_familiaris
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.794	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	99.486	Capra_hircus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.177	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.177	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.971	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.971	Cavia_aperea
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.971	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.971	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.588	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.588	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.868	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.868	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.588	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	91	86.824	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.824	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.457	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.457	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	77.641	ENSCING00000009372	-	100	77.641	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	99	77.937	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.588	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.280	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.280	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.280	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.280	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.564	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.284	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	90.947	ENSDARG00000012261	eftud2	100	91.049	Danio_rerio
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.971	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.971	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.383	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.383	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	75.179	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.794	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.691	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	99.691	Equus_caballus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.049	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	Esox_lucius
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.897	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.897	Felis_catus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.840	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.840	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.177	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.177	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.387	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.078	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.152	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.358	Gadus_morhua
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.942	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.599	Gallus_gallus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	91.872	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.667	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.358	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.588	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.872	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.971	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.971	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.971	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.971	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.152	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	91.152	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.770	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	93.519	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	96	99.466	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.466	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.667	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.358	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	95	91.694	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	94.033	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.284	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.078	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.074	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.588	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.588	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.588	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.387	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.284	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.975	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.872	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.947	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.947	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.280	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.280	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.588	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.383	ENSMOCG00000009039	-	100	99.383	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	92	81.461	ENSMOCG00000017653	-	90	81.461	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.280	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.280	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.074	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.074	Mus_caroli
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.074	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.074	Mus_musculus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.074	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.074	Mus_pahari
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.074	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.074	Mus_spretus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	97	99.576	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.576	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	99.794	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.486	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.872	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	97	97.768	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.768	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	95.576	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.576	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.255	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	91.255	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.457	ENSODEG00000018041	-	100	98.457	Octodon_degus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	93	79.741	ENSODEG00000003385	-	100	79.741	Octodon_degus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.975	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.872	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.588	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.667	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.564	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.325	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.325	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	99.486	Ovis_aries
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.691	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.691	Pan_paniscus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.794	Panthera_pardus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.794	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.691	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.691	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.588	Papio_anubis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	93	97.133	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	97.133	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	84.671	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.362	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.280	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.280	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.280	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.280	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	91.872	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	91.872	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	91.872	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.148	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	98.148	Pongo_abelii
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	95.473	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.473	Procavia_capensis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.486	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	94.856	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.856	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.872	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.770	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.387	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.074	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.074	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.486	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.486	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.486	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	97	34.190	YKL173W	SNU114	97	33.794	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.588	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.588	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	97	99.254	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.254	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.770	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.770	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.770	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.667	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.975	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.181	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	92.078	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	90.947	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.947	Sorex_araneus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	97.325	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.325	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.181	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	92.078	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	84	97.445	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	97.445	Taeniopygia_guttata
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	91.152	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	Takifugu_rubripes
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	86.680	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	86.578	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	93.930	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.930	Tupaia_belangeri
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	90.947	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.947	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	98.665	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	98.665	Ursus_americanus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.794	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.794	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.794	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	97	94.776	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	81	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	91.872	Xiphophorus_maculatus