EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000023062 (Gene tree)
Gene ID: 100622043
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18323 bases
Position: chrX:111624227-111642549
Accession: 100622043
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000021619	RRM_1	PF00076.22	1.7e-16	1	2
ENSSSCP00000021619	RRM_1	PF00076.22	1.7e-16	2	2
ENSSSCP00000057904	RRM_1	PF00076.22	2.3e-16	1	2
ENSSSCP00000057904	RRM_1	PF00076.22	2.3e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000022638	HTATSF1-201	2579	-	ENSSSCP00000021619	684 (aa)	-	I3LC46
ENSSSCT00000066054	HTATSF1-202	2259	XM_021079891	ENSSSCP00000057904	752 (aa)	XP_020935550	A0A287BNZ8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.907	ENSG00000102241	HTATSF1	100	92.623	Homo_sapiens
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	57	62.963	ENSAPOG00000009823	htatsf1	81	64.324	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.868	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	99	72.833	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	55.487	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	55.694	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	64.304	ENSAOCG00000020994	htatsf1	80	64.171	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	64.304	ENSAPEG00000016432	htatsf1	80	64.171	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	54	63.824	ENSATEG00000008903	htatsf1	81	63.144	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	63.934	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.830	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	50	66.102	ENSACAG00000009346	HTATSF1	82	70.062	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	93	70.270	ENSANAG00000025458	-	99	69.628	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	95	62.813	ENSANAG00000027986	-	96	61.571	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	61.021	ENSACLG00000008096	htatsf1	97	59.603	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	56.701	ENSAMXG00000008387	htatsf1	79	63.757	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	78.961	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	99	78.312	Bos_taurus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	73.768	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	99	73.387	Bos_taurus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	78.961	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	99	78.312	Bos_taurus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	73.901	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	99	73.056	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	75.066	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	99	75.132	Canis_familiaris
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.290	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	99	73.385	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	80.452	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	99	79.787	Capra_hircus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	72.259	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	99	71.805	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	74.133	ENSCCAG00000022701	-	99	73.289	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	70.227	ENSCCAG00000025329	-	99	69.799	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.971	ENSCATG00000029963	HTATSF1	99	73.873	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	67.484	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	99	67.062	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.971	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	99	73.873	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	70.757	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	84	70.757	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	74.104	ENSCANG00000028495	HTATSF1	99	74.005	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	78	74.317	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	99	66.624	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	91	60.385	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	59.778	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	64.541	ENSCVAG00000014070	htatsf1	81	64.171	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	61	57.143	ENSDARG00000056649	htatsf1	80	60.598	Danio_rerio
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	70.366	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	99	70.104	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	70	47.808	ENSETEG00000006377	-	68	47.852	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	62	46.725	ENSEBUG00000001534	htatsf1	76	49.231	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	100	73.724	ENSEASG00005003440	HTATSF1	99	73.671	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	100	73.597	ENSECAG00000009156	HTATSF1	99	73.671	Equus_caballus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	63.802	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	99	64.323	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	66	56.170	ENSELUG00000005486	htatsf1	70	63.712	Esox_lucius
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	74.409	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	99	73.907	Felis_catus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	50	72.753	ENSFALG00000003728	HTATSF1	85	69.133	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	65.670	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	66.273	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	57	62.621	ENSFHEG00000020286	htatsf1	83	64.096	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	51	63.510	ENSGMOG00000016444	htatsf1	99	63.510	Gadus_morhua
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	60.421	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	60.297	Gallus_gallus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	59	61.429	ENSGAFG00000003041	htatsf1	81	64.706	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	59.112	ENSGACG00000020459	htatsf1	82	62.903	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.775	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	99	73.873	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	61.021	ENSHBUG00000004392	htatsf1	97	59.603	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	97	67.824	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	99	66.799	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	61.323	ENSHCOG00000009056	htatsf1	90	60.957	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	64.380	ENSIPUG00000017828	htatsf1	76	64.463	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	72.177	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	71.237	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	55.464	ENSKMAG00000007622	htatsf1	81	63.733	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	54	63.708	ENSLBEG00000001154	htatsf1	79	63.562	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	56	65.633	ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	66.851	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	61	40.230	ENSLOCG00000015118	htatsf1	77	41.033	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	66.667	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	89	72.581	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.838	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	99	73.740	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.838	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	99	73.740	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	72.432	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	99	72.372	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.971	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	99	73.873	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	58	61.667	ENSMAMG00000021225	htatsf1	83	63.467	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	61.021	ENSMZEG00005000485	htatsf1	97	59.603	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	62	62.500	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	82	72.805	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	67.658	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	66.230	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	72.895	ENSMICG00000009348	HTATSF1	99	72.523	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	65.430	ENSMOCG00000022370	-	80	69.118	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	66.882	ENSMOCG00000023007	-	99	66.494	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	64.377	ENSMMOG00000011013	htatsf1	82	63.733	Mola_mola
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	72.559	ENSMODG00000014087	-	83	72.559	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	57	61.071	ENSMALG00000019977	htatsf1	80	62.873	Monopterus_albus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	66.188	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	64.868	Mus_caroli
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	97	67.065	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	99	66.184	Mus_musculus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	97	67.198	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	99	66.316	Mus_spretus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	73.813	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	99	73.739	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	69.452	ENSMLUG00000028418	-	99	69.503	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	66.932	ENSMLUG00000009234	-	98	67.596	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	97	69.880	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	69.118	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	60.780	ENSNBRG00000003818	htatsf1	82	63.852	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	74.040	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	99	74.005	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	72.267	ENSMEUG00000004133	-	86	71.910	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	61.201	ENSONIG00000008638	htatsf1	82	64.211	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	61	63.529	ENSOANG00000011674	-	82	75.224	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	71.317	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	99	72.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	54	64.450	ENSORLG00000002356	htatsf1	84	64.524	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	54	64.706	ENSORLG00020017818	htatsf1	81	65.039	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	54	64.524	ENSORLG00015002268	htatsf1	84	64.524	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	57.143	ENSOMEG00000007564	htatsf1	80	63.978	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	97	69.200	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	99	69.353	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	78.571	ENSOARG00000011215	-	99	77.662	Ovis_aries
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	72.716	ENSOARG00000000481	-	99	71.300	Ovis_aries
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.907	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	99	74.005	Pan_paniscus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	99	74.803	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	99	74.305	Panthera_pardus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	92	72.984	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	72.571	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	73.907	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	99	74.005	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	62.284	ENSPANG00000010946	HTATSF1	99	61.936	Papio_anubis
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	62.619	ENSPKIG00000024852	htatsf1	79	66.852	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	55.694	ENSPMGG00000006172	htatsf1	86	62.907	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	97	66.623	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	66.798	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	57	65.500	ENSPCIG00000018896	-	86	67.188	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	60	66.271	ENSPCIG00000030173	-	83	70.166	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	56.785	ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	64.800	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	55.950	ENSPLAG00000007532	htatsf1	82	64.267	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	67	56.367	ENSPMEG00000000352	htatsf1	82	64.800	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000023062	HTATSF1	55	64.557	ENSPREG00000007811	htatsf1	82	65.067	Poecilia_reticulata
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