EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000025298 (Gene tree)
Gene ID: 100517907
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 25430 bases
Position: chr9:88760398-88785827
Accession: 100517907
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000026510	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	1.8e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000030736	-	3127	-	ENSSSCP00000026510	335 (aa)	-	F1SC14

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	79.167	ENSG00000105849	TWISTNB	98	80.357	Homo_sapiens
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	93	40.000	ENSAPOG00000011796	twistnb	64	46.800	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	71.503	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	98	73.385	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	90	40.964	ENSACIG00000020400	twistnb	50	54.011	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	89	42.105	ENSAOCG00000024200	twistnb	64	47.600	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	89	42.105	ENSAPEG00000016750	twistnb	64	47.600	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	61	54.412	ENSATEG00000017956	twistnb	51	56.545	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	50	63.905	ENSACAG00000011817	TWISTNB	86	63.905	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	96	80.122	ENSANAG00000026418	TWISTNB	100	80.236	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	65	52.273	ENSACLG00000022280	twistnb	80	43.155	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	59	56.122	ENSAMXG00000035868	twistnb	70	49.200	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	81.899	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	100	82.789	Bos_taurus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	96	80.488	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	100	80.588	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	77.299	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	99	79.480	Canis_familiaris
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	79.070	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	93	80.523	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	82.006	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	100	82.596	Capra_hircus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	82.544	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	99	83.481	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	80.826	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	100	81.416	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.338	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	99	80.178	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.571	ENSCATG00000035621	TWISTNB	98	79.762	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	78.698	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	81.361	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.571	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	98	79.762	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	78	93.182	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	77	93.182	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	93	61.006	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	95	61.392	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.869	ENSCANG00000038759	TWISTNB	98	80.060	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	76.347	ENSCGRG00001000499	Twistnb	100	76.347	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	83.432	ENSDNOG00000006438	-	100	84.615	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	92	79.100	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	79.100	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	86.136	ENSEASG00005021702	TWISTNB	96	87.316	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	84.615	ENSECAG00000014563	TWISTNB	96	87.316	Equus_caballus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	88	44.590	ENSELUG00000000098	TWISTNB	82	46.465	Esox_lucius
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	82.544	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	100	85.546	Felis_catus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	84	53.055	ENSFALG00000009761	TWISTNB	98	53.074	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	98	79.217	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	100	81.711	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	71	49.160	ENSFHEG00000013318	twistnb	53	55.897	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	90	53.115	ENSGALG00000010863	TWISTNB	70	53.584	Gallus_gallus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	71	48.945	ENSGAFG00000018309	twistnb	71	46.067	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	65	48.899	ENSGACG00000006425	twistnb	86	48.018	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.869	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	98	80.060	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	65	51.818	ENSHBUG00000020155	twistnb	58	50.213	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	81.306	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	100	81.416	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	98	81.381	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	100	81.416	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	93	42.560	ENSIPUG00000004117	twistnb	91	40.179	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	79.525	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	81.416	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	73.451	ENSJJAG00000015887	Twistnb	100	74.336	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	64	49.074	ENSKMAG00000001591	twistnb	54	55.446	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	92	43.865	ENSLBEG00000024225	twistnb	83	45.625	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	92	52.564	ENSLACG00000010508	TWISTNB	91	51.875	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	62	61.244	ENSLOCG00000011399	twistnb	64	60.369	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	82.143	ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	84.866	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.571	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	98	79.762	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.571	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	97	79.762	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	77.976	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	98	79.167	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.869	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	98	80.060	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	65	52.273	ENSMZEG00005007561	twistnb	80	43.155	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	81.416	ENSMICG00000036489	TWISTNB	100	82.596	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	92	77.742	ENSMOCG00000003458	Twistnb	95	77.742	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	84	63.028	ENSMODG00000001402	-	69	60.991	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	72.485	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	100	73.731	Mus_caroli
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	73.952	ENSMUSG00000020561	Twistnb	100	74.251	Mus_musculus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	96	75.701	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	97	75.701	Mus_pahari
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	72.997	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	100	74.251	Mus_spretus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	83.186	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	94	84.366	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	93	76.038	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	100	78.981	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	59	87.940	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	87.940	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	65	52.727	ENSNBRG00000008652	twistnb	86	44.643	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	95	78.816	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	94	79.814	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	75.146	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	99	75.439	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	81.361	ENSODEG00000007222	TWISTNB	100	82.544	Octodon_degus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	53	58.989	ENSORLG00015013403	twistnb	71	49.667	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	77.811	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	98	81.250	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	82.249	ENSOARG00000009803	TWISTNB	99	82.840	Ovis_aries
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	79.701	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	98	80.000	Pan_paniscus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	83.728	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	100	84.615	Panthera_pardus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	89	83.168	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	100	84.158	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	79.464	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	98	80.655	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.571	ENSPANG00000015736	TWISTNB	98	79.762	Papio_anubis
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	58	62.176	ENSPKIG00000025635	twistnb	53	62.176	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	91	46.749	ENSPMGG00000019023	twistnb	81	47.134	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	89	59.736	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	94	58.537	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.869	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	98	80.060	Pongo_abelii
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.869	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	82.196	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	79.464	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	98	80.952	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	65	52.273	ENSPNYG00000002674	twistnb	62	50.638	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	90	41.509	ENSPNAG00000011956	twistnb	51	57.754	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	96	76.250	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	76.250	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.869	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	97	80.060	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	78.869	ENSRROG00000040155	TWISTNB	98	80.060	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	96	79.511	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	100	79.646	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	55	56.831	ENSSFOG00015012788	twistnb	57	56.831	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	40.056	ENSSMAG00000012792	twistnb	84	42.462	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	92	42.988	ENSSDUG00000007038	twistnb	83	42.633	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	94	49.848	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	96	50.311	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	95	42.643	ENSSPAG00000005871	twistnb	85	41.486	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	94	44.272	ENSTNIG00000017778	twistnb	96	43.963	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	79.701	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	98	82.090	Tupaia_belangeri
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	82.840	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	100	85.546	Ursus_americanus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	82.544	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	100	85.251	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	100	78.426	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	100	81.105	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000025298	TWISTNB	70	50.424	ENSXCOG00000020199	twistnb	53	56.701	Xiphophorus_couchianus