EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000026230 (Gene tree)
Gene ID: 100517270
Gene Symbol: SRP19
Alias: -
Full Name: signal recognition particle 19
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10593 bases
Position: chr2:116890852-116901444
Accession: 100517270
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000022214	SRP19	PF01922.17	9.2e-29	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000032409	SRP19-201	4086	XM_003480888	ENSSSCP00000022214	144 (aa)	XP_003480936	F1RLG4

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000026230's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03060	Protein export	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000026230's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSG00000153037	SRP19	100	99.010	Homo_sapiens
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	68.992	ENSAPOG00000002199	srp19	90	68.992	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.917	ENSAMEG00000012623	SRP19	99	97.917	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	68.217	ENSACIG00000005082	srp19	89	68.750	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	68.217	ENSAOCG00000002718	srp19	91	68.217	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	68.217	ENSAPEG00000022170	srp19	91	68.217	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	70.543	ENSATEG00000012472	srp19	91	70.543	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000026230	SRP19	78	85.841	ENSAPLG00000002624	SRP19	93	85.217	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	80.451	ENSACAG00000007550	SRP19	92	80.597	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSANAG00000032576	-	100	98.611	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	76.923	ENSANAG00000029862	-	89	89.691	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000026230	SRP19	95	75.182	ENSANAG00000030287	-	97	75.758	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000026230	SRP19	89	67.188	ENSACLG00000006259	srp19	90	67.188	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000026230	SRP19	89	68.750	ENSAMXG00000043011	srp19	90	69.531	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	99.306	ENSBTAG00000012803	SRP19	100	99.306	Bos_taurus
ENSSSCG00000026230	SRP19	82	50.000	WBGene00018159	F37F2.2	82	50.000	Caenorhabditis_elegans
ENSSSCG00000026230	SRP19	91	74.809	ENSCJAG00000045531	-	85	74.436	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.222	ENSCJAG00000038676	-	96	92.453	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSCAFG00000031549	SRP19	100	98.611	Canis_familiaris
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	99.242	ENSCAFG00020022437	-	99	99.242	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSCAFG00020014267	-	100	98.611	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000026230	SRP19	64	94.565	ENSCAFG00020004285	-	86	94.792	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	99.306	ENSCHIG00000017551	SRP19	100	99.306	Capra_hircus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	99.306	ENSTSYG00000007875	SRP19	100	99.306	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000026230	SRP19	99	75.524	ENSCPOG00000036806	SRP19	83	88.288	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	79.699	ENSCCAG00000023426	-	87	79.699	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	75.000	ENSCCAG00000029821	-	66	75.000	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSCCAG00000035651	-	100	98.611	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	83.465	ENSCATG00000040513	-	80	83.077	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	91.111	ENSCATG00000039250	-	93	91.111	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	94.074	ENSCLAG00000004791	-	94	94.074	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	88.148	ENSCLAG00000016055	-	93	88.148	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.222	ENSCHOG00000013452	SRP19	100	97.222	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	81.395	ENSCPBG00000013903	SRP19	91	81.538	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	94.815	ENSCGRG00001020510	Srp19	94	94.815	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000026230	SRP19	67	88.119	ENSCGRG00000010716	-	89	88.119	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000026230	SRP19	83	85.000	ENSCGRG00000008542	-	92	85.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000026230	SRP19	89	68.750	ENSCSEG00000010039	srp19	89	69.291	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	70.866	ENSCVAG00000017621	srp19	89	70.866	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	70.635	ENSDARG00000035699	srp19	89	70.866	Danio_rerio
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	95.556	ENSDNOG00000013856	SRP19	94	95.556	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000026230	SRP19	77	91.379	ENSDORG00000004746	Srp19	91	91.379	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000026230	SRP19	85	51.220	FBgn0015298	Srp19	70	53.097	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	93.333	ENSETEG00000017132	SRP19	94	93.333	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000026230	SRP19	81	65.812	ENSEBUG00000006613	srp19	87	64.516	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.917	ENSEASG00005015182	SRP19	100	97.917	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSEEUG00000007298	SRP19	100	98.611	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	66.667	ENSELUG00000004594	srp19	91	66.667	Esox_lucius
ENSSSCG00000026230	SRP19	89	70.312	ENSELUG00000007958	srp19	91	70.543	Esox_lucius
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	99.306	ENSFCAG00000025895	SRP19	100	99.306	Felis_catus
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	94.815	ENSFDAG00000013543	SRP19	94	94.815	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	70.079	ENSFHEG00000000493	srp19	89	70.079	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000026230	SRP19	83	72.500	ENSGMOG00000003264	srp19	93	72.500	Gadus_morhua
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	84.962	ENSGALG00000000218	SRP19	93	85.075	Gallus_gallus
ENSSSCG00000026230	SRP19	87	69.600	ENSGAFG00000015815	srp19	60	69.600	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	70.866	ENSGACG00000001093	srp19	85	70.866	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	81.203	ENSGAGG00000025305	SRP19	94	80.741	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	67.692	ENSHBUG00000006131	srp19	90	67.692	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	96.528	ENSHGLG00000006075	SRP19	100	96.528	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	96.528	ENSHGLG00100015859	SRP19	100	96.528	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000026230	SRP19	89	66.406	ENSHCOG00000013231	srp19	90	66.406	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	69.048	ENSIPUG00000025084	srp19	89	69.291	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	96.528	ENSSTOG00000000348	SRP19	100	96.528	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	96.528	ENSJJAG00000017185	Srp19	100	96.528	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000026230	SRP19	91	69.466	ENSKMAG00000011155	srp19	92	69.466	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	70.079	ENSLBEG00000026727	srp19	89	70.079	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	81.746	ENSLACG00000004459	SRP19	82	81.890	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000026230	SRP19	89	74.219	ENSLOCG00000010302	srp19	91	74.419	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	96.528	ENSLAFG00000002564	SRP19	100	96.528	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	91.339	ENSMFAG00000000554	-	90	91.339	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000026230	SRP19	83	74.790	ENSMFAG00000040055	-	90	75.207	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000026230	SRP19	85	83.740	ENSMMUG00000032515	-	92	84.000	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	91.339	ENSMMUG00000049186	-	90	91.339	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000026230	SRP19	83	73.950	ENSMNEG00000040117	-	90	74.380	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.917	ENSMNEG00000038714	SRP19	100	97.917	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	69.767	ENSMAMG00000018346	srp19	90	69.767	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	67.692	ENSMZEG00005001765	srp19	90	67.692	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000026230	SRP19	83	85.833	ENSMGAG00000006762	SRP19	93	85.246	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000026230	SRP19	67	88.660	ENSMICG00000049202	-	91	89.109	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.917	ENSMICG00000000399	SRP19	100	97.917	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000026230	SRP19	67	93.814	ENSMOCG00000010532	-	89	93.814	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	95.556	ENSMOCG00000006534	Srp19	94	95.556	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	69.173	ENSMMOG00000010417	srp19	86	69.173	Mola_mola
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	94.574	ENSMODG00000013278	SRP19	91	94.615	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	72.441	ENSMALG00000003858	srp19	89	72.441	Monopterus_albus
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	94.815	MGP_CAROLIEiJ_G0022086	Srp19	98	100.000	Mus_caroli
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	94.815	ENSMUSG00000014504	Srp19	98	100.000	Mus_musculus
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	94.815	MGP_PahariEiJ_G0018820	Srp19	98	97.436	Mus_pahari
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	94.815	MGP_SPRETEiJ_G0022998	Srp19	98	100.000	Mus_spretus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSMPUG00000012695	SRP19	99	98.611	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.222	ENSMLUG00000014793	-	100	97.222	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000026230	SRP19	86	91.935	ENSMLUG00000024549	-	90	92.000	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	95.556	ENSNGAG00000003440	-	94	95.556	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	87.692	ENSNGAG00000014524	-	100	87.692	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	83.704	ENSNLEG00000035364	-	94	83.704	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	96.154	ENSMEUG00000012529	SRP19	100	96.154	Notamacropus_eugenii
ENSSSCG00000026230	SRP19	81	94.017	ENSOPRG00000010549	SRP19	93	92.562	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000026230	SRP19	67	91.753	ENSODEG00000005538	-	85	91.753	Octodon_degus
ENSSSCG00000026230	SRP19	91	77.099	ENSODEG00000013862	-	94	77.778	Octodon_degus
ENSSSCG00000026230	SRP19	91	90.076	ENSODEG00000019119	-	94	89.630	Octodon_degus
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	66.667	ENSONIG00000000542	srp19	91	66.667	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	84.127	ENSOANG00000011139	SRP19	73	84.252	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	92.647	ENSOCUG00000015639	SRP19	94	92.647	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	68.217	ENSORLG00000028267	srp19	91	68.217	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	68.217	ENSORLG00020015201	srp19	91	68.217	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	68.217	ENSORLG00015007525	srp19	91	68.217	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	69.767	ENSOMEG00000009178	srp19	91	69.767	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.222	ENSOGAG00000008579	SRP19	100	97.222	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSOARG00000016066	SRP19	100	98.611	Ovis_aries
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSPPAG00000037062	SRP19	100	98.611	Pan_paniscus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	99.306	ENSPPRG00000015591	SRP19	100	99.306	Panthera_pardus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	99.306	ENSPTIG00000021474	SRP19	100	99.306	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSPTRG00000017136	SRP19	100	98.611	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.917	ENSPANG00000004370	-	100	97.917	Papio_anubis
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	90.370	ENSPANG00000034740	-	93	90.370	Papio_anubis
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	69.767	ENSPKIG00000018671	srp19	91	69.767	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000026230	SRP19	83	83.333	ENSPSIG00000013811	SRP19	93	82.787	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	68.992	ENSPMGG00000015313	srp19	91	68.992	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	91.111	ENSPEMG00000004412	-	93	91.111	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	63.077	ENSPMAG00000002685	srp19	91	63.566	Petromyzon_marinus
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	95.349	ENSPCIG00000010250	SRP19	90	95.385	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	70.079	ENSPFOG00000015887	srp19	89	70.079	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	70.079	ENSPLAG00000007784	srp19	89	70.079	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	69.291	ENSPMEG00000003056	srp19	89	69.291	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	70.079	ENSPREG00000017307	srp19	89	70.079	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSPPYG00000029584	SRP19	99	98.611	Pongo_abelii
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	75.556	ENSPCAG00000000228	SRP19	94	75.556	Procavia_capensis
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSPCOG00000023239	SRP19	100	98.611	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.917	ENSPVAG00000004895	SRP19	100	97.917	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	67.460	ENSPNAG00000009392	srp19	88	69.167	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	94.815	ENSRNOG00000020204	Srp19	94	94.815	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000026230	SRP19	52	90.667	ENSRBIG00000031651	-	83	90.667	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.917	ENSRBIG00000015627	-	100	97.917	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	87.970	ENSRBIG00000040440	-	93	88.060	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000026230	SRP19	86	78.226	ENSRROG00000037316	-	92	78.862	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	87.970	ENSRROG00000037054	-	93	88.060	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSSBOG00000028071	-	100	98.611	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	71.852	ENSSBOG00000032685	-	89	79.798	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	72.093	ENSSFOG00015022139	srp19	91	72.093	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	65.891	ENSSMAG00000016803	srp19	90	65.891	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	62.143	ENSSDUG00000012930	srp19	91	62.143	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000026230	SRP19	61	53.409	ENSSLDG00000021916	-	57	53.409	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000026230	SRP19	94	95.556	ENSSARG00000000615	SRP19	94	95.556	Sorex_araneus
ENSSSCG00000026230	SRP19	85	86.992	ENSSPUG00000015769	SRP19	90	87.023	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000026230	SRP19	85	85.366	ENSTGUG00000001019	SRP19	91	84.211	Taeniopygia_guttata
ENSSSCG00000026230	SRP19	88	71.538	ENSTRUG00000023119	srp19	90	71.538	Takifugu_rubripes
ENSSSCG00000026230	SRP19	90	69.767	ENSTNIG00000018880	srp19	91	69.767	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSTTRG00000001690	SRP19	100	98.611	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	97.917	ENSUAMG00000000111	SRP19	100	97.917	Ursus_americanus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	98.611	ENSUMAG00000016997	SRP19	100	98.611	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000026230	SRP19	100	99.306	ENSVPAG00000006001	SRP19	100	99.306	Vicugna_pacos
ENSSSCG00000026230	SRP19	74	98.113	ENSVVUG00000012423	SRP19	100	98.718	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000026230	SRP19	84	72.727	ENSXETG00000011993	srp19	85	72.727	Xenopus_tropicalis
ENSSSCG00000026230	SRP19	69	65.000	ENSXCOG00000012530	srp19	68	67.368	Xiphophorus_couchianus
ENSSSCG00000026230	SRP19	92	68.939	ENSXMAG00000029788	srp19	89	70.866	Xiphophorus_maculatus