EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000027110 (Gene tree)
Gene ID: 100626611
Gene Symbol: RPP38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP subunit p38
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5655 bases
Position: chr10:46720137-46725791
Accession: 100626611
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000021772	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	3.7e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000024077	RPP38-201	2190	XM_005668110	ENSSSCP00000021772	285 (aa)	XP_005668167	I3LCJ7

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
ssc03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	72.028	ENSG00000152464	RPP38	100	72.028	Homo_sapiens
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	43.262	ENSAPOG00000001240	rpp38	99	43.390	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	75.789	ENSAMEG00000018832	RPP38	100	75.789	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	41.825	ENSACIG00000011592	rpp38	92	44.118	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000027110	RPP38	92	41.319	ENSAOCG00000017293	rpp38	99	40.984	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	42.349	ENSAPEG00000002315	rpp38	99	42.517	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000027110	RPP38	99	43.434	ENSATEG00000000731	rpp38	99	43.434	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000027110	RPP38	92	50.000	ENSAPLG00000002054	RPP38	97	51.071	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000027110	RPP38	72	44.907	ENSACLG00000016958	rpp38	99	40.550	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000027110	RPP38	72	44.444	ENSACLG00000016962	rpp38	99	40.206	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000027110	RPP38	89	39.313	ENSAMXG00000025023	rpp38	98	40.070	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	78.246	ENSBTAG00000007702	RPP38	100	78.246	Bos_taurus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	73.333	ENSCAFG00000024373	RPP38	100	73.333	Canis_familiaris
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	73.333	ENSCAFG00020008008	RPP38	100	73.333	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	78.246	ENSCHIG00000012484	RPP38	100	78.246	Capra_hircus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	69.686	ENSCPOG00000003981	RPP38	100	69.686	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	71.080	ENSCLAG00000010194	RPP38	100	71.080	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	72.388	ENSCSAG00000019055	RPP38	100	72.727	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	71.777	ENSCHOG00000004335	RPP38	100	71.777	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	66.667	ENSCGRG00001001395	Rpp38	100	67.708	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	66.667	ENSCGRG00000017441	Rpp38	100	67.708	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	43.396	ENSCSEG00000001721	rpp38	94	43.841	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000027110	RPP38	87	40.152	ENSCVAG00000001676	rpp38	90	41.877	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	90	42.857	ENSDARG00000040350	rpp38	96	41.993	Danio_rerio
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	69.204	ENSDNOG00000040314	RPP38	100	69.204	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	63.415	ENSDORG00000009783	Rpp38	100	63.415	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	65.854	ENSETEG00000002839	RPP38	100	65.854	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000027110	RPP38	99	72.954	ENSEASG00005019783	RPP38	98	72.954	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	72.632	ENSEEUG00000014677	RPP38	100	72.632	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	41.727	ENSELUG00000010160	rpp38	95	42.361	Esox_lucius
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	70.526	ENSFCAG00000022449	RPP38	100	70.526	Felis_catus
ENSSSCG00000027110	RPP38	92	49.813	ENSFALG00000014804	RPP38	95	50.890	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	69.338	ENSFDAG00000018669	RPP38	100	69.338	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000027110	RPP38	87	41.667	ENSFHEG00000013741	rpp38	91	43.796	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000027110	RPP38	92	49.438	ENSGALG00000008794	RPP38	93	50.179	Gallus_gallus
ENSSSCG00000027110	RPP38	52	50.327	ENSGACG00000009258	rpp38	88	50.327	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	72	44.444	ENSHBUG00000010937	rpp38	99	40.550	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000027110	RPP38	99	68.198	ENSHGLG00000012144	RPP38	99	68.198	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	39.216	ENSIPUG00000022879	rpp38	95	39.927	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	68.881	ENSSTOG00000025699	RPP38	98	68.881	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	69.204	ENSJJAG00000007523	Rpp38	100	69.204	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	41.221	ENSKMAG00000003986	rpp38	89	43.273	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000027110	RPP38	90	41.887	ENSLBEG00000006853	rpp38	92	42.857	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000027110	RPP38	95	48.252	ENSLACG00000006502	RPP38	100	48.667	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	45.985	ENSLOCG00000018347	rpp38	94	47.842	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	71.777	ENSLAFG00000000509	RPP38	100	71.777	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	72.015	ENSMMUG00000007679	RPP38	100	72.378	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000027110	RPP38	96	42.606	ENSMAMG00000012774	rpp38	96	41.577	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	72	44.907	ENSMZEG00005003189	rpp38	99	40.893	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000027110	RPP38	72	44.907	ENSMZEG00005003200	rpp38	99	40.550	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000027110	RPP38	92	49.438	ENSMGAG00000008217	RPP38	93	50.179	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	67.361	ENSMAUG00000003644	Rpp38	100	68.056	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	68.403	ENSMOCG00000007020	Rpp38	100	68.403	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000027110	RPP38	93	40.293	ENSMMOG00000003446	rpp38	94	42.125	Mola_mola
ENSSSCG00000027110	RPP38	95	60.219	ENSMODG00000024091	RPP38	100	60.069	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000027110	RPP38	89	39.474	ENSMALG00000002356	rpp38	91	39.474	Monopterus_albus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	68.403	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	100	68.403	Mus_caroli
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	67.361	ENSMUSG00000049950	Rpp38	100	67.361	Mus_musculus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	68.403	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	100	68.403	Mus_pahari
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	67.708	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	100	67.708	Mus_spretus
ENSSSCG00000027110	RPP38	99	73.145	ENSMPUG00000018523	RPP38	99	73.145	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	71.536	ENSMLUG00000002153	RPP38	100	72.281	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	67.708	ENSNGAG00000011066	Rpp38	100	67.708	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000027110	RPP38	93	38.909	ENSNBRG00000006994	rpp38	97	41.637	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000027110	RPP38	95	40.714	ENSONIG00000020467	rpp38	97	42.308	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	68.773	ENSOCUG00000024367	-	100	69.338	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	68.773	ENSOCUG00000022768	-	100	69.338	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	40.892	ENSORLG00000009219	rpp38	93	41.516	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	41.729	ENSORLG00020011503	rpp38	89	40.357	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	40.230	ENSORLG00015017702	rpp38	89	40.794	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	42.205	ENSOMEG00000005414	rpp38	92	42.491	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	70.280	ENSOGAG00000008059	RPP38	100	70.280	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	78.246	ENSOARG00000004534	RPP38	100	78.246	Ovis_aries
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	72.028	ENSPPAG00000041577	RPP38	91	72.028	Pan_paniscus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	72.281	ENSPPRG00000015329	RPP38	100	72.281	Panthera_pardus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	71.579	ENSPTIG00000007188	RPP38	100	71.579	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	72.028	ENSPTRG00000002318	RPP38	91	72.028	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000027110	RPP38	93	44.444	ENSPKIG00000025652	rpp38	94	44.322	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000027110	RPP38	97	53.004	ENSPSIG00000001527	RPP38	98	53.004	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	69.097	ENSPEMG00000008375	Rpp38	100	70.139	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	61.458	ENSPCIG00000009096	RPP38	94	61.458	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000027110	RPP38	61	44.944	ENSPFOG00000016823	rpp38	82	44.944	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000027110	RPP38	89	39.259	ENSPLAG00000007626	rpp38	91	38.768	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000027110	RPP38	87	37.066	ENSPMEG00000020392	rpp38	93	36.594	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000027110	RPP38	89	38.768	ENSPREG00000017744	rpp38	93	38.768	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	72.727	ENSPPYG00000002113	RPP38	100	72.727	Pongo_abelii
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	73.034	ENSPVAG00000007155	RPP38	100	74.035	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000027110	RPP38	72	44.907	ENSPNYG00000004293	rpp38	99	40.893	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000027110	RPP38	88	41.016	ENSPNAG00000010633	rpp38	99	41.489	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000027110	RPP38	98	66.312	ENSRNOG00000038025	Rpp38	99	66.312	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	61.806	ENSSHAG00000015529	RPP38	100	61.986	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	42.908	ENSSMAG00000018276	rpp38	95	42.908	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	41.489	ENSSDUG00000001651	rpp38	98	42.254	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	41.489	ENSSLDG00000014355	rpp38	98	42.509	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	57.895	ENSSARG00000012099	RPP38	100	57.895	Sorex_araneus
ENSSSCG00000027110	RPP38	96	50.896	ENSSPUG00000008560	-	97	50.896	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	99	53.979	ENSSPUG00000018363	-	99	53.979	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	54.296	ENSSPUG00000005237	-	100	54.296	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	40.780	ENSSPAG00000020387	rpp38	96	41.115	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000027110	RPP38	92	47.744	ENSTGUG00000001366	RPP38	98	48.929	Taeniopygia_guttata
ENSSSCG00000027110	RPP38	94	41.993	ENSTNIG00000001334	rpp38	96	41.993	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	78.947	ENSTTRG00000004420	RPP38	100	78.947	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	75.789	ENSUAMG00000002618	RPP38	100	75.789	Ursus_americanus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	74.825	ENSUMAG00000012382	RPP38	100	75.175	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000027110	RPP38	100	72.982	ENSVVUG00000005272	RPP38	100	72.982	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000027110	RPP38	92	47.426	ENSXETG00000003419	rpp38	97	48.043	Xenopus_tropicalis