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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000027293 (Gene tree)
Gene ID: 100627484
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 103248 bases
Position: chr16:49048679-49151926
Accession: 100627484
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000025214	IBN_N	PF03810.19	9.3e-16	1	1
ENSSSCP00000047516	IBN_N	PF03810.19	9.3e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000052539	TNPO1-201	8787	XM_021076714	ENSSSCP00000047516	890 (aa)	XP_020932373	I3LM93
ENSSSCT00000026046	TNPO1-202	8500	XM_003359811	ENSSSCP00000025214	890 (aa)	XP_003359859	I3LM93

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	85.457	ENSSSCG00000013726	TNPO2	99	85.457

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSG00000083312	TNPO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.820	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	93.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	98.998	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	98.998	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000027293	TNPO1	87	92.894	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	92.894	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.933	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.933	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	93.933	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.483	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	93.483	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	92.672	ENSAPLG00000009619	-	97	93.678	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	96.742	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	96.742	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	64.191	ENSANAG00000027118	-	99	63.969	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	88.539	ENSANAG00000025351	-	99	88.539	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.438	ENSANAG00000022453	-	99	99.438	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	91.573	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	91.573	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	92.713	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	92.377	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	99.888	Bos_taurus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.551	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	99.551	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	96	99.650	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.650	Canis_familiaris
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	96.854	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	96.854	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.775	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	99.775	Capra_hircus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	95.819	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.363	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.438	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	99.438	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	99.888	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.438	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	99.438	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	100.000	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	94	87.128	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	87.128	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	97.753	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	97.753	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	75.421	ENSCSAVG00000010981	-	99	75.421	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	99.888	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.551	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	99.551	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000027293	TNPO1	96	99.532	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.532	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	92.247	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	92.247	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.258	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	93.258	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	92.593	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	92.256	Danio_rerio
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.729	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	93.729	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	93	99.880	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.879	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	57.788	FBgn0035693	CG8219	99	57.336	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000027293	TNPO1	86	99.625	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	99.625	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000027293	TNPO1	94	85.119	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.238	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	99.888	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.663	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	99.663	Equus_caballus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	86.601	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	86.166	Esox_lucius
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	99.888	Felis_catus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	97.416	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	97.416	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.551	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	99.551	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.603	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	93.603	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	90.034	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	90.034	Gadus_morhua
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	96.742	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	96.742	Gallus_gallus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	92.377	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	92.377	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.146	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	93.146	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	97.528	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	97.528	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	83.072	ENSGGOG00000022535	-	98	83.072	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	99.888	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.146	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	93.146	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.213	ENSHGLG00000000970	-	99	99.213	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000027293	TNPO1	96	99.065	ENSHGLG00100017090	-	99	99.065	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000027293	TNPO1	97	77.674	ENSHGLG00100000963	-	99	77.093	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.663	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	99.663	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.596	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	93.596	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	91	90.136	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	90.136	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000027293	TNPO1	96	89.186	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	95.393	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	95.393	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	97	99.076	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	99.888	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.775	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	99.775	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	99.888	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	99.888	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.483	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	93.483	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	92.921	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	92.921	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.551	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	95.730	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	95.730	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.551	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	99.551	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000027293	TNPO1	87	92.526	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	92.526	Mola_mola
ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	97.872	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	97.872	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	92.360	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	92.360	Monopterus_albus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.326	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	100.000	Mus_caroli
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.551	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	100.000	Mus_musculus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.438	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	100.000	Mus_pahari
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.326	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	100.000	Mus_spretus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.775	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	99.775	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000027293	TNPO1	96	99.185	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.185	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.551	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	99.551	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000027293	TNPO1	87	92.765	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	92.765	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	99.888	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000027293	TNPO1	90	93.930	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	93.930	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.213	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	99.213	Octodon_degus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	92.411	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	92.411	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	92	97.927	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	96	93.107	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	93.107	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	87	92.737	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	92.737	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	93.010	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	93.010	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	93.123	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	93.123	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000027293	TNPO1	99	93.010	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	93.010	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	100.000	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	100.000	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	99.888	Ovis_aries
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	99.888	Pan_paniscus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	99.888	Panthera_pardus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	99.888	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	99.888	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000027293	TNPO1	94	86.878	ENSPTRG00000047731	-	100	86.878	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	99.888	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	99.888	Papio_anubis
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	90.562	ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	97.416	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	97.416	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	90.460	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	90.572	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	96	99.532	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.532	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	98.315	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	98.315	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000027293	TNPO1	100	93.169	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	93.169	Poecilia_formosa
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