EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000029430 (Gene tree)
Gene ID: 100624339
Gene Symbol: IPO13
Alias: IMP13|KIAA0724|RANBP13
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22413 bases
Position: chr6:167325282-167347694
Accession: 100624339
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000028113	Xpo1	PF08389.12	7.1e-29	1	1
ENSSSCP00000025630	Xpo1	PF08389.12	1.6e-28	1	1
ENSSSCP00000028113	IBN_N	PF03810.19	4.8e-09	1	1
ENSSSCP00000025630	IBN_N	PF03810.19	2.4e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000027908	IPO13-201	5127	XM_003356487	ENSSSCP00000025630	914 (aa)	XP_003356535	I3LNF6
ENSSSCT00000025206	IPO13-202	3810	-	ENSSSCP00000028113	792 (aa)	-	I3LVG1

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.687	ENSG00000117408	IPO13	95	98.687	Homo_sapiens
ENSSSCG00000029430	IPO13	99	66.342	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	96	66.342	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	81.352	ENSAPOG00000003308	ipo13	95	81.352	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.578	ENSAMEG00000001123	IPO13	95	98.578	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	77.814	ENSACIG00000008146	ipo13	99	77.814	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000029430	IPO13	99	66.486	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	96	66.486	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000029430	IPO13	97	67.821	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	95	65.368	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	81.134	ENSAOCG00000004943	ipo13	95	81.134	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	81.134	ENSAPEG00000011282	ipo13	95	81.134	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000029430	IPO13	97	67.949	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	95	65.476	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000029430	IPO13	98	64.654	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	97	64.712	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	80.807	ENSATEG00000018367	ipo13	95	80.807	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	90.820	ENSAPLG00000001349	IPO13	95	90.820	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	89.387	ENSACAG00000014300	IPO13	95	89.387	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.687	ENSANAG00000034183	IPO13	95	98.687	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	80.807	ENSACLG00000011458	ipo13	99	80.807	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000029430	IPO13	98	68.401	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	95	67.316	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	81.987	ENSAMXG00000005200	ipo13	95	81.987	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000029430	IPO13	99	59.255	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	95	59.255	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	99.125	ENSBTAG00000018887	IPO13	95	99.125	Bos_taurus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.687	ENSCJAG00000007453	IPO13	95	98.687	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.687	ENSCAFG00000004875	IPO13	95	98.687	Canis_familiaris
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.687	ENSCAFG00020017359	IPO13	95	98.687	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	99.234	ENSCHIG00000008341	IPO13	95	99.234	Capra_hircus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.359	ENSTSYG00000035980	IPO13	95	98.359	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000029430	IPO13	88	98.710	ENSCAPG00000001972	IPO13	93	98.710	Cavia_aperea
ENSSSCG00000029430	IPO13	99	98.721	ENSCPOG00000012445	IPO13	94	98.230	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.687	ENSCCAG00000022035	IPO13	95	98.687	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.687	ENSCATG00000041276	IPO13	95	98.687	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.578	ENSCLAG00000002914	IPO13	95	98.578	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.687	ENSCSAG00000001190	IPO13	95	98.687	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	90.700	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	90.700	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	36.746	ENSCING00000001863	-	97	36.746	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000029430	IPO13	99	35.205	ENSCSAVG00000001368	-	97	35.421	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.578	ENSCANG00000009091	IPO13	95	98.578	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	97.593	ENSCGRG00001021177	Ipo13	95	97.593	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	97.593	ENSCGRG00000012411	Ipo13	95	97.593	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	79.389	ENSCSEG00000007713	ipo13	95	79.389	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000029430	IPO13	99	60.259	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	95	60.259	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	81.352	ENSCVAG00000013039	ipo13	95	81.352	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000029430	IPO13	96	64.820	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	95	63.311	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	81.769	ENSDARG00000060618	ipo13	96	81.769	Danio_rerio
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ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.468	ENSDNOG00000016583	IPO13	95	98.468	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.796	ENSDORG00000005471	Ipo13	95	98.796	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	66.558	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.126	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.578	ENSEASG00005001738	IPO13	95	98.578	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.578	ENSECAG00000015508	IPO13	99	97.750	Equus_caballus
ENSSSCG00000029430	IPO13	83	96.528	ENSEEUG00000011681	IPO13	82	96.528	Erinaceus_europaeus
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ENSSSCG00000029430	IPO13	98	64.475	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	95	63.412	Esox_lucius
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.578	ENSFCAG00000006488	IPO13	95	98.578	Felis_catus
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	90.372	ENSFALG00000005368	IPO13	100	90.372	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.578	ENSFDAG00000015599	IPO13	95	98.578	Fukomys_damarensis
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ENSSSCG00000029430	IPO13	100	81.243	ENSFHEG00000023271	ipo13	100	76.336	Fundulus_heteroclitus
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ENSSSCG00000029430	IPO13	100	81.461	ENSGAFG00000006361	ipo13	95	81.461	Gambusia_affinis
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ENSSSCG00000029430	IPO13	100	79.194	ENSGACG00000014562	ipo13	95	79.194	Gasterosteus_aculeatus
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ENSSSCG00000029430	IPO13	100	80.916	ENSHBUG00000018605	ipo13	99	79.607	Haplochromis_burtoni
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ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.031	ENSHGLG00100015830	IPO13	95	98.031	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000029430	IPO13	99	62.651	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	97	62.473	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000029430	IPO13	98	80.513	ENSHCOG00000018408	ipo13	93	79.758	Hippocampus_comes
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ENSSSCG00000029430	IPO13	100	98.687	ENSSTOG00000003611	IPO13	95	98.687	Ictidomys_tridecemlineatus
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ENSSSCG00000029430	IPO13	98	67.132	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	95	66.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000029430	IPO13	99	64.520	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	96	64.520	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000029430	IPO13	100	79.716	ENSLBEG00000007442	ipo13	95	79.716	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000029430	IPO13	80	32.990	ENSLACG00000002351	TNPO3	77	32.903	Latimeria_chalumnae
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