EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSSCG00000037481 (Gene tree)
Gene ID: 100626692
Gene Symbol: SYF2
Alias: CBPIN|DKFZp564O2082|NTC31|fSAP29|p29
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Sus_scrofa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 9003 bases
Position: chr6:82834534-82843536
Accession: 100626692
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSSCP00000049277	SYF2	PF08231.12	7.7e-54	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSSCT00000056349	SYF2-201	3975	XM_021095593	ENSSSCP00000049277	245 (aa)	XP_020951252	A0A287AZF3

Gene Model

Click here to download ENSSSCG00000037481's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
ssc03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSSCG00000037481's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.358	ENSG00000117614	SYF2	99	91.358	Homo_sapiens
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	84.163	ENSAPOG00000001174	syf2	96	81.818	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSSCG00000037481	SYF2	97	94.538	ENSAMEG00000010115	-	98	94.538	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000037481	SYF2	80	97.436	ENSAMEG00000010134	-	100	97.436	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSSCG00000037481	SYF2	95	78.879	ENSACIG00000023688	syf2	92	78.879	Amphilophus_citrinellus
ENSSSCG00000037481	SYF2	87	80.841	ENSAOCG00000010912	syf2	66	80.841	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000037481	SYF2	94	82.251	ENSAOCG00000022046	syf2	97	82.251	Amphiprion_ocellaris
ENSSSCG00000037481	SYF2	94	82.251	ENSAPEG00000018858	syf2	88	82.251	Amphiprion_percula
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	82.949	ENSATEG00000007745	syf2	96	80.087	Anabas_testudineus
ENSSSCG00000037481	SYF2	81	88.945	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	88.500	Anas_platyrhynchos
ENSSSCG00000037481	SYF2	68	75.449	ENSACAG00000026777	-	94	75.796	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000037481	SYF2	83	85.294	ENSACAG00000013653	-	100	85.294	Anolis_carolinensis
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.393	ENSANAG00000032473	SYF2	98	91.393	Aotus_nancymaae
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	80.995	ENSACLG00000019916	syf2	93	80.995	Astatotilapia_calliptera
ENSSSCG00000037481	SYF2	96	78.059	ENSAMXG00000004051	syf2	99	78.059	Astyanax_mexicanus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	97.143	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	97.458	Bos_taurus
ENSSSCG00000037481	SYF2	85	50.952	WBGene00019402	syf-2	99	47.863	Caenorhabditis_elegans
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.393	ENSCJAG00000046570	SYF2	98	91.393	Callithrix_jacchus
ENSSSCG00000037481	SYF2	98	84.647	ENSCAFG00000030331	-	99	84.647	Canis_familiaris
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	94.309	ENSCAFG00000012895	-	100	94.309	Canis_familiaris
ENSSSCG00000037481	SYF2	74	89.011	ENSCAFG00020021094	-	83	97.436	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	94.309	ENSCAFG00020021091	-	100	94.309	Canis_lupus_dingo
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	96.735	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	96.735	Capra_hircus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.837	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	91.837	Carlito_syrichta
ENSSSCG00000037481	SYF2	81	97.980	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	97.980	Cavia_aperea
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.429	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	91.429	Cavia_porcellus
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.803	ENSCCAG00000022459	SYF2	98	91.803	Cebus_capucinus
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	90.535	ENSCATG00000026917	SYF2	99	90.535	Cercocebus_atys
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.061	ENSCLAG00000008474	SYF2	100	93.061	Chinchilla_lanigera
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	89.388	ENSCSAG00000000948	SYF2	99	89.388	Chlorocebus_sabaeus
ENSSSCG00000037481	SYF2	74	78.453	ENSCHOG00000005273	-	100	78.453	Choloepus_hoffmanni
ENSSSCG00000037481	SYF2	92	88.444	ENSCPBG00000025073	SYF2	97	84.232	Chrysemys_picta_bellii
ENSSSCG00000037481	SYF2	86	53.521	ENSCING00000003017	-	89	53.521	Ciona_intestinalis
ENSSSCG00000037481	SYF2	86	51.643	ENSCSAVG00000006627	-	97	51.643	Ciona_savignyi
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	77.778	ENSCANG00000037322	SYF2	99	77.778	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.020	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	91.020	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSSCG00000037481	SYF2	81	95.477	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	95.477	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	77.982	ENSCSEG00000000117	syf2	100	71.020	Cynoglossus_semilaevis
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	81.448	ENSCVAG00000019543	syf2	96	78.879	Cyprinodon_variegatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	95	79.237	ENSDARG00000004706	syf2	99	79.237	Danio_rerio
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.878	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	93.878	Dasypus_novemcinctus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.061	ENSDORG00000001274	Syf2	100	93.061	Dipodomys_ordii
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	56.818	FBgn0033556	CG12343	97	56.818	Drosophila_melanogaster
ENSSSCG00000037481	SYF2	91	77.477	ENSETEG00000015729	SYF2	100	76.623	Echinops_telfairi
ENSSSCG00000037481	SYF2	80	59.898	ENSEBUG00000015402	syf2	95	59.898	Eptatretus_burgeri
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	82.041	ENSEASG00005004232	-	100	82.041	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.061	ENSEASG00005004224	-	100	93.061	Equus_asinus_asinus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	94.694	ENSECAG00000012023	-	100	94.694	Equus_caballus
ENSSSCG00000037481	SYF2	96	94.894	ENSECAG00000010440	-	98	94.894	Equus_caballus
ENSSSCG00000037481	SYF2	75	82.065	ENSEEUG00000015084	SYF2	100	82.065	Erinaceus_europaeus
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	85.068	ENSELUG00000003465	syf2	93	85.068	Esox_lucius
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.276	ENSFCAG00000010324	-	85	92.276	Felis_catus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.089	ENSFCAG00000043095	-	100	93.089	Felis_catus
ENSSSCG00000037481	SYF2	83	85.294	ENSFALG00000000460	SYF2	93	82.174	Ficedula_albicollis
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.469	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	93.469	Fukomys_damarensis
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	67.117	ENSFHEG00000007238	syf2	98	67.117	Fundulus_heteroclitus
ENSSSCG00000037481	SYF2	88	84.186	ENSGMOG00000019138	syf2	96	84.186	Gadus_morhua
ENSSSCG00000037481	SYF2	92	87.556	ENSGALG00000013639	SYF2	93	85.043	Gallus_gallus
ENSSSCG00000037481	SYF2	95	76.724	ENSGAFG00000019435	syf2	96	76.724	Gambusia_affinis
ENSSSCG00000037481	SYF2	88	83.256	ENSGACG00000007305	syf2	99	77.273	Gasterosteus_aculeatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	92	88.889	ENSGAGG00000010670	SYF2	97	84.647	Gopherus_agassizii
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.770	ENSGGOG00000012796	SYF2	99	91.770	Gorilla_gorilla
ENSSSCG00000037481	SYF2	96	77.872	ENSHBUG00000020477	syf2	99	77.872	Haplochromis_burtoni
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	84.615	ENSHGLG00000004304	-	100	77.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.653	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	92.653	Heterocephalus_glaber_female
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.653	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	92.653	Heterocephalus_glaber_male
ENSSSCG00000037481	SYF2	98	76.955	ENSHCOG00000012904	syf2	79	76.955	Hippocampus_comes
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	78.512	ENSIPUG00000019859	syf2	99	78.512	Ictalurus_punctatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	60	97.260	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	97.260	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	81	97.487	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	97.487	Jaculus_jaculus
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	81.448	ENSKMAG00000013856	syf2	93	81.448	Kryptolebias_marmoratus
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	83.105	ENSLBEG00000014425	syf2	93	82.805	Labrus_bergylta
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	85.780	ENSLACG00000012064	SYF2	92	85.780	Latimeria_chalumnae
ENSSSCG00000037481	SYF2	91	83.857	ENSLOCG00000002728	syf2	89	83.857	Lepisosteus_oculatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	75	65.217	ENSLAFG00000030814	-	100	65.217	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.061	ENSLAFG00000023150	-	100	93.061	Loxodonta_africana
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	90.947	ENSMFAG00000041831	SYF2	99	90.947	Macaca_fascicularis
ENSSSCG00000037481	SYF2	88	97.685	ENSMMUG00000002968	SYF2	99	90.947	Macaca_mulatta
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	90.947	ENSMNEG00000030180	SYF2	99	90.947	Macaca_nemestrina
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	90.535	ENSMLEG00000030248	SYF2	99	90.535	Mandrillus_leucophaeus
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	81.567	ENSMAMG00000010403	syf2	100	74.390	Mastacembelus_armatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	96	77.778	ENSMZEG00005006429	syf2	97	77.778	Maylandia_zebra
ENSSSCG00000037481	SYF2	81	88.945	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	88.945	Meleagris_gallopavo
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.020	ENSMAUG00000018974	Syf2	100	91.020	Mesocricetus_auratus
ENSSSCG00000037481	SYF2	81	97.487	ENSMICG00000016191	SYF2	100	97.487	Microcebus_murinus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.245	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	92.245	Microtus_ochrogaster
ENSSSCG00000037481	SYF2	96	76.170	ENSMMOG00000002396	syf2	97	76.170	Mola_mola
ENSSSCG00000037481	SYF2	93	86.900	ENSMODG00000013951	-	100	86.900	Monodelphis_domestica
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	76.543	ENSMALG00000010706	syf2	99	76.955	Monopterus_albus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.837	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	100	91.837	Mus_caroli
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.837	ENSMUSG00000028821	Syf2	100	91.837	Mus_musculus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.837	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	100	91.837	Mus_pahari
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.837	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	100	91.837	Mus_spretus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.902	ENSMPUG00000015802	-	100	93.902	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.276	ENSMPUG00000015801	-	100	92.276	Mustela_putorius_furo
ENSSSCG00000037481	SYF2	98	91.632	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	91.632	Myotis_lucifugus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.713	ENSNGAG00000007912	Syf2	100	92.713	Nannospalax_galili
ENSSSCG00000037481	SYF2	98	70.539	ENSNBRG00000010720	syf2	100	70.539	Neolamprologus_brichardi
ENSSSCG00000037481	SYF2	88	98.611	ENSNLEG00000035185	SYF2	99	91.770	Nomascus_leucogenys
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.429	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	91.429	Ochotona_princeps
ENSSSCG00000037481	SYF2	91	97.309	ENSODEG00000017664	-	94	97.309	Octodon_degus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	82.041	ENSODEG00000014338	-	99	83.051	Octodon_degus
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	80.995	ENSONIG00000008213	syf2	93	80.995	Oreochromis_niloticus
ENSSSCG00000037481	SYF2	82	90.594	ENSOANG00000009552	SYF2	100	90.594	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.469	ENSOCUG00000013050	SYF2	100	93.469	Oryctolagus_cuniculus
ENSSSCG00000037481	SYF2	95	79.310	ENSORLG00000028820	syf2	98	79.310	Oryzias_latipes
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	81.900	ENSORLG00020018333	syf2	93	81.900	Oryzias_latipes_hni
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	82.569	ENSORLG00015014665	syf2	92	82.569	Oryzias_latipes_hsok
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	77.686	ENSOMEG00000013911	syf2	99	77.686	Oryzias_melastigma
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.653	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	92.653	Otolemur_garnettii
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	96.356	ENSOARG00000006348	-	100	96.356	Ovis_aries
ENSSSCG00000037481	SYF2	80	67.179	ENSOARG00000006269	-	100	67.179	Ovis_aries
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.770	ENSPPAG00000036579	SYF2	99	91.770	Pan_paniscus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.089	ENSPPRG00000001651	-	100	93.089	Panthera_pardus
ENSSSCG00000037481	SYF2	96	94.515	ENSPPRG00000001638	-	96	94.515	Panthera_pardus
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	98.624	ENSPTIG00000005711	-	80	98.624	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.089	ENSPTIG00000007036	-	100	93.089	Panthera_tigris_altaica
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.770	ENSPTRG00000000352	SYF2	99	91.770	Pan_troglodytes
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	90.947	ENSPANG00000008139	SYF2	99	90.947	Papio_anubis
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	77.551	ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.551	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSSCG00000037481	SYF2	94	85.714	ENSPSIG00000011816	SYF2	90	85.345	Pelodiscus_sinensis
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	81.900	ENSPMGG00000008755	syf2	86	81.900	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	92.245	ENSPEMG00000008283	Syf2	100	92.245	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSSCG00000037481	SYF2	91	93.274	ENSPCIG00000014235	SYF2	92	91.739	Phascolarctos_cinereus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	73.984	ENSPFOG00000004116	syf2	95	77.155	Poecilia_formosa
ENSSSCG00000037481	SYF2	95	77.155	ENSPLAG00000006691	syf2	98	77.155	Poecilia_latipinna
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	71.901	ENSPMEG00000011684	syf2	98	74.569	Poecilia_mexicana
ENSSSCG00000037481	SYF2	88	81.019	ENSPREG00000003009	syf2	100	74.286	Poecilia_reticulata
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.770	ENSPPYG00000001713	SYF2	99	91.770	Pongo_abelii
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	62.041	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	61.633	Propithecus_coquereli
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	81.224	ENSPVAG00000005841	SYF2	100	81.224	Pteropus_vampyrus
ENSSSCG00000037481	SYF2	90	80.995	ENSPNYG00000004979	syf2	93	80.995	Pundamilia_nyererei
ENSSSCG00000037481	SYF2	96	80.169	ENSPNAG00000015570	syf2	99	80.169	Pygocentrus_nattereri
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.837	ENSRNOG00000060597	Syf2	100	91.837	Rattus_norvegicus
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	88.889	ENSRBIG00000042970	SYF2	99	88.889	Rhinopithecus_bieti
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	90.947	ENSRROG00000001347	SYF2	99	90.947	Rhinopithecus_roxellana
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	91.358	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	91.358	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSSCG00000037481	SYF2	84	93.204	ENSSHAG00000007152	-	100	93.204	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000037481	SYF2	93	91.189	ENSSHAG00000015630	-	92	90.435	Sarcophilus_harrisii
ENSSSCG00000037481	SYF2	91	83.408	ENSSFOG00015023647	syf2	94	83.408	Scleropages_formosus
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	82.569	ENSSMAG00000009867	syf2	92	82.569	Scophthalmus_maximus
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	83.028	ENSSDUG00000013072	syf2	92	83.028	Seriola_dumerili
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	83.028	ENSSLDG00000012677	syf2	92	83.028	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	74.694	ENSSARG00000012889	SYF2	100	74.694	Sorex_araneus
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	81.405	ENSSPUG00000005251	SYF2	96	81.405	Sphenodon_punctatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	99	77.686	ENSSPAG00000009626	syf2	99	78.481	Stegastes_partitus
ENSSSCG00000037481	SYF2	61	59.603	ENSTGUG00000001126	SYF2	84	60.355	Taeniopygia_guttata
ENSSSCG00000037481	SYF2	91	80.717	ENSTRUG00000001499	syf2	90	80.717	Takifugu_rubripes
ENSSSCG00000037481	SYF2	89	80.275	ENSTNIG00000016912	syf2	98	80.275	Tetraodon_nigroviridis
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	70.204	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	69.796	Tupaia_belangeri
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	95.918	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	95.918	Tursiops_truncatus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.496	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	93.496	Ursus_americanus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	93.902	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	93.902	Ursus_maritimus
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	94.694	ENSVPAG00000005705	SYF2	100	94.694	Vicugna_pacos
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	94.309	ENSVVUG00000027175	-	100	94.309	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000037481	SYF2	100	91.532	ENSVVUG00000027181	-	100	91.532	Vulpes_vulpes
ENSSSCG00000037481	SYF2	96	81.780	ENSXETG00000022797	syf2	95	81.780	Xenopus_tropicalis
ENSSSCG00000037481	SYF2	88	80.930	ENSXMAG00000022698	syf2	93	79.186	Xiphophorus_maculatus