EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000003611 (Gene tree)
Gene ID: 101959663
Gene Symbol: IPO13
Alias: IMP13|KIAA0724|RANBP13
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 22015 bases
Position: chrJH393284.1:25263684-25285698
Accession: 101959663
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000003245	Xpo1	PF08389.12	6.8e-28	1	1
ENSSTOP00000025909	Xpo1	PF08389.12	2.5e-20	1	1
ENSSTOP00000003245	IBN_N	PF03810.19	4.4e-09	1	1
ENSSTOP00000025909	IBN_N	PF03810.19	4.6e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000003623	IPO13-201	4108	XM_005317931	ENSSTOP00000003245	963 (aa)	XP_005317988	I3M2M4
ENSSTOT00000039901	IPO13-202	3941	-	ENSSTOP00000025909	929 (aa)	-	A0A287CXC3

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.481	ENSG00000117408	IPO13	100	99.481	Homo_sapiens
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	66.597	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	99	66.736	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.866	ENSAPOG00000003308	ipo13	99	82.173	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.169	ENSAMEG00000001123	IPO13	100	99.169	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000003611	IPO13	97	66.878	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	66.878	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000003611	IPO13	95	78.190	ENSACIG00000008146	ipo13	100	78.190	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	65.661	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	98	65.795	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.656	ENSAOCG00000004943	ipo13	99	81.962	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	65.765	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	98	65.900	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.656	ENSAPEG00000011282	ipo13	99	81.962	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000003611	IPO13	97	65.111	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	65.111	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.447	ENSATEG00000018367	ipo13	99	81.751	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	89.004	ENSAPLG00000001349	IPO13	100	89.004	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	88.370	ENSACAG00000014300	IPO13	99	89.524	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.065	ENSANAG00000034183	IPO13	100	99.065	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	67.286	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	99	67.678	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000003611	IPO13	95	81.128	ENSACLG00000011458	ipo13	100	81.128	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	82.341	ENSAMXG00000005200	ipo13	98	82.981	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000003611	IPO13	98	60.169	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	60.169	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.650	ENSBTAG00000018887	IPO13	100	98.650	Bos_taurus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.065	ENSCJAG00000007453	IPO13	100	99.065	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.273	ENSCAFG00000004875	IPO13	100	99.273	Canis_familiaris
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.273	ENSCAFG00020017359	IPO13	100	99.273	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.754	ENSCHIG00000008341	IPO13	100	98.754	Capra_hircus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.169	ENSTSYG00000035980	IPO13	100	99.169	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000003611	IPO13	85	99.376	ENSCAPG00000001972	IPO13	98	97.200	Cavia_aperea
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	98.846	ENSCPOG00000012445	IPO13	99	98.846	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.962	ENSCCAG00000022035	IPO13	100	98.962	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.481	ENSCATG00000041276	IPO13	100	99.481	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.273	ENSCLAG00000002914	IPO13	100	99.273	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.481	ENSCSAG00000001190	IPO13	100	99.481	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000003611	IPO13	95	90.481	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	90.481	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000003611	IPO13	98	37.827	ENSCING00000001863	-	99	37.827	Ciona_intestinalis
ENSSTOG00000003611	IPO13	97	35.887	ENSCSAVG00000001368	-	99	35.887	Ciona_savignyi
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.377	ENSCANG00000009091	IPO13	100	99.377	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.235	ENSCGRG00001021177	Ipo13	100	98.235	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.235	ENSCGRG00000012411	Ipo13	100	98.235	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	79.605	ENSCSEG00000007713	ipo13	99	80.274	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	60.372	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	98	60.856	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.270	ENSCVAG00000013039	ipo13	99	81.962	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	95	63.391	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	99	63.391	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	98	82.700	ENSDARG00000060618	ipo13	99	82.770	Danio_rerio
ENSSTOG00000003611	IPO13	98	62.408	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	62.434	Danio_rerio
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.065	ENSDNOG00000016583	IPO13	100	99.065	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.169	ENSDORG00000005471	Ipo13	100	99.169	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000003611	IPO13	95	35.025	FBgn0261532	cdm	93	35.025	Drosophila_melanogaster
ENSSTOG00000003611	IPO13	98	67.155	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	66.342	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.754	ENSEASG00005001738	IPO13	100	98.754	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.754	ENSECAG00000015508	IPO13	100	98.754	Equus_caballus
ENSSTOG00000003611	IPO13	69	98.933	ENSEEUG00000011681	IPO13	83	98.933	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000003611	IPO13	98	63.627	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	98	63.589	Esox_lucius
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.027	ENSELUG00000001498	ipo13	99	81.329	Esox_lucius
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.169	ENSFCAG00000006488	IPO13	100	99.169	Felis_catus
ENSSTOG00000003611	IPO13	95	90.263	ENSFALG00000005368	IPO13	100	90.263	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.962	ENSFDAG00000015599	IPO13	100	98.962	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.211	ENSFHEG00000023271	ipo13	99	81.751	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	64.730	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	98	64.885	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	80.628	ENSGMOG00000015856	ipo13	98	81.138	Gadus_morhua
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ENSSTOG00000003611	IPO13	100	89.512	ENSGALG00000010087	IPO13	100	89.408	Gallus_gallus
ENSSTOG00000003611	IPO13	98	64.780	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	98	64.780	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.478	ENSGAFG00000006361	ipo13	99	82.068	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	64.803	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	98	65.510	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	79.895	ENSGACG00000014562	ipo13	98	79.979	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	97	91.142	ENSGAGG00000008331	IPO13	98	91.142	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.481	ENSGGOG00000016375	IPO13	100	99.481	Gorilla_gorilla
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ENSSTOG00000003611	IPO13	99	66.289	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	98	66.667	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.650	ENSHGLG00000001822	IPO13	100	98.650	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.650	ENSHGLG00100015830	IPO13	100	98.650	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	77.627	ENSHCOG00000018408	ipo13	97	80.257	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000003611	IPO13	96	62.927	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	99	62.753	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	80.838	ENSIPUG00000011283	IPO13	98	81.501	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	57.652	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	99	58.078	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.065	ENSJJAG00000018591	Ipo13	100	99.065	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	66.046	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	98	66.527	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	81.112	ENSKMAG00000007869	ipo13	98	81.702	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000003611	IPO13	98	64.346	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	99	64.346	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	80.105	ENSLBEG00000007442	ipo13	98	80.485	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000003611	IPO13	73	32.990	ENSLACG00000002351	TNPO3	76	33.594	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000003611	IPO13	97	79.852	ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	78.157	ENSLOCG00000010620	ipo13	99	78.826	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	96.998	ENSLAFG00000017144	IPO13	100	96.998	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.481	ENSMFAG00000032846	IPO13	100	99.481	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.481	ENSMMUG00000015142	IPO13	100	99.481	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.481	ENSMNEG00000041971	IPO13	100	99.481	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	99.481	ENSMLEG00000044330	IPO13	100	99.481	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	66.632	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	99	66.736	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	80.957	ENSMAMG00000017290	ipo13	99	81.540	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	80.957	ENSMZEG00005019335	ipo13	99	81.540	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000003611	IPO13	99	67.286	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	99	67.678	Maylandia_zebra
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ENSSTOG00000003611	IPO13	83	99.249	ENSMAUG00000013018	Ipo13	100	99.249	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	96.555	ENSMICG00000011003	IPO13	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000003611	IPO13	100	98.754	ENSMOCG00000008881	Ipo13	100	98.754	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000003611	IPO13	97	78.891	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	78.891	Mola_mola
ENSSTOG00000003611	IPO13	98	64.533	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	99	64.533	Mola_mola
ENSSTOG00000003611	IPO13	95	93.326	ENSMODG00000003017	IPO13	100	93.326	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000003611	IPO13	81	65.195	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	97	66.023	Monopterus_albus
ENSSTOG00000003611	IPO13	95	79.587	ENSMALG00000010805	ipo13	100	79.587	Monopterus_albus
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