EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000004725 (Gene tree)
Gene ID: 101975168
Gene Symbol: AGO4
Alias: EIF2C4|FLJ20033|KIAA1567|hAGO4
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 34547 bases
Position: chrJH393284.1:18335531-18370077
Accession: 18424
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000004264	PAZ	PF02170.22	6.4e-28	1	1
ENSSTOP00000004264	Piwi	PF02171.17	2.9e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000004749	AGO4-201	2583	XM_013362687	ENSSTOP00000004264	860 (aa)	-	I3M4T7

Gene Model

Click here to download ENSSTOG00000004725's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSTOG00000004725's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	79.034	ENSSTOG00000008113	AGO2	99	78.397
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	83.489	ENSSTOG00000010857	AGO1	98	83.489
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	77.765	ENSSTOG00000025904	AGO3	99	77.765

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSG00000134698	AGO4	99	99.884	Homo_sapiens
ENSSTOG00000004725	AGO4	96	96.296	ENSAPOG00000023867	ago4	99	96.296	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.418	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	99.418	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	97.733	ENSACIG00000014548	ago4	100	97.733	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	93.073	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.073	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.398	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000004725	AGO4	98	99.528	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	99.528	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	98.596	ENSACAG00000017275	AGO4	99	98.596	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.767	ENSANAG00000031428	AGO4	99	99.767	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSACLG00000005181	ago4	99	96.220	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.449	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.474	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	98.718	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	98.718	Bos_taurus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSCJAG00000001610	AGO4	99	99.884	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	100.000	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	100.000	Canis_familiaris
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.767	ENSCHIG00000026564	AGO4	99	99.767	Capra_hircus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	100.000	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000004725	AGO4	94	95.973	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	95.973	Cavia_aperea
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	97.445	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	97.445	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSCCAG00000001397	AGO4	99	99.884	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSCATG00000043421	AGO4	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.766	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	99.766	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSCSAG00000001090	AGO4	99	99.884	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000004725	AGO4	80	100.000	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.415	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	99.415	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.883	ENSCANG00000016914	AGO4	100	99.883	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.419	ENSCGRG00001002701	Ago4	99	99.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.415	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	99.415	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	91.709	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.709	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	97.680	ENSDARG00000100854	ago4	99	97.680	Danio_rerio
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSDNOG00000015674	AGO4	99	99.884	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	100.000	ENSDORG00000008933	Ago4	99	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000004725	AGO4	60	100.000	ENSETEG00000018390	AGO4	83	100.000	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSEASG00005012079	AGO4	99	99.884	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSECAG00000024686	AGO4	99	99.884	Equus_caballus
ENSSTOG00000004725	AGO4	79	97.518	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	97.518	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	95.667	ENSELUG00000023873	ago4	99	95.667	Esox_lucius
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSFCAG00000006218	AGO4	99	99.884	Felis_catus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	100.000	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000004725	AGO4	97	88.756	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.756	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	97.322	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.322	Gadus_morhua
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.419	ENSGALG00000039713	AGO4	100	99.496	Gallus_gallus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSGAFG00000017239	ago4	99	96.220	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	97.442	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.442	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	99.496	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	99.496	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	95.814	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	96.592	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSHBUG00000001525	ago4	99	96.220	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	100.000	ENSHGLG00000010241	AGO4	99	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	100.000	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.105	ENSHCOG00000003725	ago4	99	96.105	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSIPUG00000015600	ago4	99	96.220	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSKMAG00000018602	ago4	99	96.334	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	95.677	ENSLBEG00000010670	ago4	99	95.677	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	98.488	ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.488	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.445	ENSLOCG00000000584	ago4	99	96.445	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000004725	AGO4	93	99.251	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	99.251	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSMFAG00000035543	AGO4	99	99.884	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.650	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.883	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	99.883	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.221	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSMZEG00005026346	ago4	99	96.220	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.064	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	99.064	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000004725	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	97	98.723	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.649	ENSMICG00000033507	AGO4	100	99.649	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.419	ENSMOCG00000005772	Ago4	99	99.419	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	96.725	ENSMMOG00000013473	ago4	100	96.725	Mola_mola
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.535	ENSMODG00000017888	AGO4	99	99.535	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	95.688	ENSMALG00000011797	ago4	100	95.688	Monopterus_albus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	98.953	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	99	98.953	Mus_caroli
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	98.721	ENSMUSG00000042500	Ago4	99	98.721	Mus_musculus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	98.372	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	99	98.372	Mus_pahari
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	98.488	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	99	98.488	Mus_spretus
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	100.000	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	98.715	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	98.715	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	100.000	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSNBRG00000013492	ago4	99	96.220	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.883	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	99.883	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000004725	AGO4	90	98.154	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	98.154	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	92.389	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	92.389	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000004725	AGO4	93	99.875	ENSODEG00000006355	AGO4	97	99.875	Octodon_degus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSONIG00000013603	ago4	99	96.220	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	99.622	ENSOANG00000002082	AGO4	100	99.622	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSOCUG00000004076	AGO4	99	99.884	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSORLG00000009865	ago4	92	96.334	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSORLG00020016978	ago4	92	96.334	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSORLG00015008800	ago4	92	96.334	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSOMEG00000006399	ago4	99	96.334	Oryzias_melastigma
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	90.930	ENSOGAG00000027107	-	99	90.930	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000004725	AGO4	93	98.498	ENSOGAG00000004233	-	100	98.498	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	98.952	ENSOARG00000019568	AGO4	98	98.952	Ovis_aries
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.883	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	99.883	Pan_paniscus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSPPRG00000006520	AGO4	99	99.884	Panthera_pardus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.883	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	99.883	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.884	ENSPTRG00000000527	AGO4	99	99.884	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	100.000	ENSPANG00000007232	AGO4	100	100.000	Papio_anubis
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSPKIG00000022598	ago4	99	96.334	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.415	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	99.415	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	97.607	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.607	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	89.148	ENSPEMG00000022651	-	96	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.535	ENSPCIG00000000092	AGO4	99	99.535	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSPFOG00000001935	ago4	99	96.334	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	97.564	ENSPLAG00000011534	ago4	99	97.564	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSPMEG00000005049	ago4	99	96.334	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSPREG00000010315	ago4	99	96.334	Poecilia_reticulata
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.883	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	99.883	Pongo_abelii
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	99.766	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	99.766	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000004725	AGO4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSPNYG00000002089	ago4	99	96.220	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	97.100	ENSPNAG00000005191	ago4	99	97.100	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000004725	AGO4	69	98.325	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	98.325	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	98.825	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	100.000	Rhinopithecus_bieti
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	100.000	ENSRROG00000035783	AGO4	100	100.000	Rhinopithecus_roxellana
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	95.925	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	99.868	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	98.839	ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.839	Sarcophilus_harrisii
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.220	ENSSFOG00015022028	ago4	100	96.398	Scleropages_formosus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	95.968	ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.487	Scophthalmus_maximus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	95.351	ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.103	Seriola_dumerili
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	97.733	ENSSLDG00000021841	ago4	100	97.733	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSTOG00000004725	AGO4	79	100.000	ENSSARG00000011504	AGO4	79	100.000	Sorex_araneus
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	99.302	ENSSPUG00000000889	AGO4	99	99.302	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	93.647	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	92.907	Taeniopygia_guttata
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	95.991	ENSTRUG00000008052	ago4	99	95.991	Takifugu_rubripes
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	97.316	ENSTNIG00000006331	ago4	99	97.316	Tetraodon_nigroviridis
ENSSTOG00000004725	AGO4	77	100.000	ENSTBEG00000016478	AGO4	77	100.000	Tupaia_belangeri
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	96.253	ENSTTRG00000015086	AGO4	100	96.253	Tursiops_truncatus
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	100.000	ENSUAMG00000027156	-	100	100.000	Ursus_americanus
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	97.672	ENSUMAG00000006297	AGO4	99	96.499	Ursus_maritimus
ENSSTOG00000004725	AGO4	88	99.341	ENSVPAG00000006662	AGO4	100	99.341	Vicugna_pacos
ENSSTOG00000004725	AGO4	92	100.000	ENSVVUG00000000465	-	100	100.000	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000004725	AGO4	99	86.030	ENSXETG00000009664	ago4	99	86.030	Xenopus_tropicalis
ENSSTOG00000004725	AGO4	100	96.334	ENSXMAG00000016657	ago4	99	96.334	Xiphophorus_maculatus