EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000009799 (Gene tree)
Gene ID: 101964328
Gene Symbol: MSI1
Alias: -
Full Name: musashi RNA binding protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23244 bases
Position: chrJH393478.1:573453-596696
Accession: 7330
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000008784	RRM_1	PF00076.22	1.3e-21	1	1
ENSSTOP00000028280	RRM_1	PF00076.22	1.3e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000042705	MSI1-202	2918	XM_013363557	ENSSTOP00000028280	311 (aa)	-	I3ME87
ENSSTOT00000009796	MSI1-201	3768	-	ENSSTOP00000008784	311 (aa)	-	I3ME87

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSTOG00000009799	MSI1	51	42.308	ENSSTOG00000006401	DAZAP1	53	42.308
ENSSTOG00000009799	MSI1	97	68.874	ENSSTOG00000007884	MSI2	94	70.530

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSG00000135097	MSI1	94	100.000	Homo_sapiens
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.852	ENSAPOG00000003191	MSI1	94	85.852	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	86.174	ENSAPOG00000023458	-	94	86.174	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	80.441	ENSAMEG00000013302	MSI1	100	80.441	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000009799	MSI1	96	82.215	ENSACIG00000017754	-	78	82.215	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.852	ENSAOCG00000003804	MSI1	94	85.852	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	76.849	ENSAOCG00000009031	-	95	77.170	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.852	ENSAPEG00000003245	MSI1	94	85.852	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	86.174	ENSAPEG00000006857	-	79	86.174	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.852	ENSATEG00000017059	MSI1	95	85.852	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	82.692	ENSATEG00000023779	-	93	82.692	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	96.785	ENSACAG00000002762	MSI1	94	96.785	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSANAG00000027151	MSI1	94	100.000	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000009799	MSI1	79	96.356	ENSANAG00000027901	-	86	96.356	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSACLG00000000117	-	100	85.531	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.209	ENSACLG00000011230	MSI1	94	85.209	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	84.887	ENSAMXG00000038960	msi1	76	84.887	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	100.000	Bos_taurus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSCJAG00000008578	MSI1	94	100.000	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.678	ENSCAFG00000010283	MSI1	94	99.678	Canis_familiaris
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	93.711	ENSCHIG00000024304	MSI1	98	93.711	Capra_hircus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	100.000	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000009799	MSI1	96	89.776	ENSCAPG00000003919	MSI1	89	89.776	Cavia_aperea
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSCCAG00000035567	MSI1	94	100.000	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSCATG00000030019	MSI1	94	100.000	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000009799	MSI1	71	95.575	ENSCSAG00000002265	MSI1	89	95.575	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	96.141	ENSCPBG00000011349	MSI1	94	96.141	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSCANG00000040651	MSI1	99	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSCGRG00001018883	Msi1	94	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSCGRG00000002191	Msi1	73	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSCSEG00000005834	-	94	85.531	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	77.814	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	77.814	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	84.566	ENSCSEG00000008352	-	94	84.566	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000009799	MSI1	74	68.398	ENSCVAG00000017463	-	89	68.398	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	86.174	ENSCVAG00000009100	MSI1	94	86.174	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000009799	MSI1	74	82.096	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	89	82.096	Danio_rerio
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	82.315	ENSDARG00000010710	msi1	100	85.022	Danio_rerio
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	89.389	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	89.389	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSDORG00000005610	Msi1	93	100.000	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	95.498	ENSETEG00000004756	MSI1	99	95.498	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSEASG00005004736	MSI1	94	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSECAG00000017526	MSI1	94	100.000	Equus_caballus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	80.060	ENSELUG00000023219	MSI1	92	80.060	Esox_lucius
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	80.707	ENSELUG00000023280	-	100	80.386	Esox_lucius
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSFCAG00000011007	MSI1	94	100.000	Felis_catus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	95.820	ENSFALG00000007574	MSI1	100	95.820	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.678	ENSFDAG00000019586	MSI1	99	99.678	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSFHEG00000003560	-	94	85.531	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	86.495	ENSFHEG00000022446	MSI1	94	86.495	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	83.601	ENSGMOG00000001006	MSI1	94	83.280	Gadus_morhua
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	76.849	ENSGMOG00000017838	-	85	76.849	Gadus_morhua
ENSSTOG00000009799	MSI1	99	85.882	ENSGALG00000007227	MSI1	93	85.882	Gallus_gallus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	68.269	ENSGAFG00000005860	-	89	68.269	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	84.887	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	84.887	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	81.350	ENSGACG00000008674	-	94	81.350	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	84.887	ENSGACG00000012679	MSI1	94	84.887	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	96.141	ENSGAGG00000016037	MSI1	94	96.141	Gopherus_agassizii
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSGGOG00000010328	MSI1	99	100.000	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.209	ENSHBUG00000021921	MSI1	94	85.209	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSHBUG00000011841	-	94	85.531	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.678	ENSHGLG00000012782	MSI1	94	99.678	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.678	ENSHGLG00100016848	MSI1	99	99.678	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	80.707	ENSHCOG00000012019	MSI1	100	80.707	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	84.566	ENSHCOG00000012067	-	89	84.566	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	84.244	ENSIPUG00000001976	msi1	99	80.386	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	81.994	ENSJJAG00000010643	-	94	81.672	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSJJAG00000010463	Msi1	94	100.000	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.209	ENSKMAG00000011251	MSI1	94	85.209	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	82.637	ENSKMAG00000019877	-	100	82.637	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.209	ENSLBEG00000001375	-	94	85.209	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSLBEG00000008789	MSI1	94	85.531	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	87.781	ENSLACG00000018287	MSI1	100	87.781	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	88.818	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	88.818	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	100.000	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSMNEG00000040034	MSI1	94	100.000	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSMLEG00000003921	MSI1	99	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSMAMG00000018426	-	94	85.531	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	84.887	ENSMAMG00000002279	MSI1	94	84.887	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.209	ENSMZEG00005026892	MSI1	94	85.209	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSMZEG00005000340	-	94	85.531	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000009799	MSI1	54	98.817	ENSMGAG00000016518	-	100	98.817	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000009799	MSI1	68	100.000	ENSMAUG00000016820	Msi1	100	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSMICG00000033181	MSI1	94	100.000	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.678	ENSMOCG00000002286	Msi1	94	99.678	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	82.315	ENSMMOG00000012265	-	99	82.315	Mola_mola
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	75.563	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	75.563	Mola_mola
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	65.924	ENSMODG00000003189	-	100	65.924	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSMALG00000017889	MSI1	94	85.531	Monopterus_albus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	84.887	ENSMALG00000001426	-	100	84.887	Monopterus_albus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.357	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	94	99.357	Mus_caroli
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.357	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	95.820	Mus_musculus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.035	MGP_PahariEiJ_G0024206	Msi1	98	99.035	Mus_pahari
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.357	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	94	99.357	Mus_spretus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	89.623	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	89.623	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSNGAG00000014508	Msi1	93	100.000	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000009799	MSI1	82	77.432	ENSNBRG00000018012	MSI1	99	77.432	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSNBRG00000000841	-	94	85.531	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	89.068	ENSNLEG00000015636	MSI1	94	89.068	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	76.527	ENSMEUG00000015759	MSI1	95	76.527	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000009799	MSI1	96	91.611	ENSOPRG00000016879	MSI1	99	91.611	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	100.000	ENSODEG00000006328	MSI1	99	100.000	Octodon_degus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSONIG00000011182	MSI1	94	85.531	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	ENSONIG00000019452	-	94	85.531	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	99.678	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	99.678	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.209	ENSORLG00000029593	MSI1	94	85.209	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	86.174	ENSORLG00000019978	-	94	86.174	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000009799	MSI1	100	86.174	ENSORLG00020001208	-	67	86.174	Oryzias_latipes_hni
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ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.209	ENSORLG00015003916	MSI1	99	81.994	Oryzias_latipes_hsok
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