EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000010861 (Gene tree)
Gene ID: 101969176
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 37463 bases
Position: chrJH393301.1:6285206-6322668
Accession: 101969176
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000009753	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.2e-28	1	2
ENSSTOP00000009753	PAP_RNA-bind	PF04926.15	7.2e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000010871	PAPOLG-201	6470	XM_005322037	ENSSTOP00000009753	741 (aa)	XP_005322094	I3MG96

Gene Model

Click here to download ENSSTOG00000010861's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSTOG00000010861's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	61.507	ENSSTOG00000011471	PAPOLA	98	60.952

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.491	ENSG00000115421	PAPOLG	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.244	ENSAPOG00000004798	papolg	99	70.485	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	95.799	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	95.799	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.003	ENSACIG00000010546	papolg	99	69.448	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.112	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.377	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.244	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.510	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.473	ENSATEG00000009007	papolg	80	86.282	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	73.635	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	73.236	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	81	64.590	ENSACAG00000015048	-	100	64.590	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.682	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	95.682	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.340	ENSACLG00000015592	papolg	89	70.611	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.751	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.751	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.682	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	95.682	Bos_taurus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	96.086	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.277	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	88.020	Canis_familiaris
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	94.645	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	94.645	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.142	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	95.142	Capra_hircus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.626	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	96.626	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	51	91.864	ENSCAPG00000014901	-	100	91.864	Cavia_aperea
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.491	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	96.491	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.221	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	96.221	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	91	98.701	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	98.701	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	96.086	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	96.086	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	89	93.475	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.475	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	67	64.870	ENSCING00000024664	-	93	64.870	Ciona_intestinalis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	65	65.361	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.361	Ciona_savignyi
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	96.086	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	95.089	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	95.089	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	95.089	ENSCGRG00000005552	-	100	95.089	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.946	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.485	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.277	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.230	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	73.280	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.280	Danio_rerio
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	94.197	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	94.197	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	58	99.534	ENSDORG00000016228	Papolg	100	99.534	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	73.713	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	73.649	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	64	57.325	ENSEBUG00000005042	-	80	57.325	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	60	71.354	ENSEBUG00000004020	papolg	92	70.738	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.356	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	96.356	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.491	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	96.070	Equus_caballus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	84.615	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	84.615	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.340	ENSELUG00000014497	papolg	99	65.150	Esox_lucius
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.682	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	95.682	Felis_catus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	65.344	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.344	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	96.086	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	66	62.083	ENSFHEG00000019080	papolg	90	62.722	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	87	83.333	ENSGMOG00000018772	papolg	93	83.333	Gadus_morhua
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.745	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	70.479	Gallus_gallus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.799	ENSGAFG00000003263	papolg	89	69.669	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	71.693	ENSGACG00000002718	papolg	100	71.863	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.491	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	96.491	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.340	ENSHBUG00000004882	papolg	89	70.611	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	95.799	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	95.799	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.221	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	96.221	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.385	ENSHCOG00000006782	papolg	89	70.784	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	71.912	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.995	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	58	99.301	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	99.301	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.238	ENSKMAG00000016439	papolg	97	68.775	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.072	ENSLBEG00000023218	papolg	98	67.734	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	71.067	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	71.067	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.644	ENSLOCG00000016130	papolg	100	72.644	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	94.078	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.221	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	96.221	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.221	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	96.221	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	87.265	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	87.265	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.816	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	95.816	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	71.846	ENSMAMG00000010667	papolg	99	69.946	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.340	ENSMZEG00005018140	papolg	99	70.405	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	71.084	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	70.817	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	94.679	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	94.679	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.896	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	96.896	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.142	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	95.142	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	71.258	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.788	Mola_mola
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	87.668	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	87.668	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	71.713	ENSMALG00000007012	papolg	89	71.713	Monopterus_albus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.142	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	99.766	Mus_caroli
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.142	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	99.766	Mus_musculus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.277	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	95.277	Mus_pahari
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.007	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	99.766	Mus_spretus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.682	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	95.682	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	94.173	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	94.173	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	96.086	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	62.665	ENSNBRG00000011943	papolg	99	63.061	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	58	99.068	ENSNLEG00000009507	-	100	99.068	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	82	78.082	ENSMEUG00000013605	-	88	78.082	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.356	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	96.356	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	57	94.601	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.601	Octodon_degus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	65.154	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.554	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	86.461	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	86.461	Ornithorhynchus_anatinus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	97.706	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	97.706	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.053	ENSORLG00000001577	papolg	89	70.238	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.557	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.557	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.053	ENSORLG00015008836	papolg	89	70.238	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.907	ENSOMEG00000001406	papolg	89	69.801	Oryzias_melastigma
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	58	90.233	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	90.233	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.142	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	95.142	Ovis_aries
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.491	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	96.491	Pan_paniscus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.682	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	95.682	Panthera_pardus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.547	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	95.547	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.491	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	96.491	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	91.790	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	91.790	Papio_anubis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	94	69.944	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.084	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.414	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.414	Paramormyrops_kingsleyae
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	79.919	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	79.919	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	94.952	ENSPEMG00000008960	-	100	94.952	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	66	63.599	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	53.368	ENSPMAG00000002961	papolg	99	52.399	Petromyzon_marinus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	87.583	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	87.583	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.857	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.272	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.947	ENSPLAG00000018445	papolg	89	69.709	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	68.766	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.657	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	78	80.729	ENSPREG00000010358	papolg	89	68.194	Poecilia_reticulata
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.816	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	95.816	Pongo_abelii
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	82.313	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	82.313	Procavia_capensis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	85.560	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	85.560	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	89	93.972	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	93.972	Pteropus_vampyrus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.281	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.281	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	73.396	ENSPNAG00000015521	papolg	100	73.396	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	94.602	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	94.602	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	90.148	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	90.148	Rhinopithecus_bieti
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	96.086	Rhinopithecus_roxellana
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.816	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	95.816	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	94	88.369	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	88.369	Sarcophilus_harrisii
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	63.710	ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.710	Scleropages_formosus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.673	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.673	Scleropages_formosus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	75	83.036	ENSSMAG00000015598	papolg	95	68.085	Scophthalmus_maximus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	71.979	ENSSDUG00000000912	papolg	99	70.081	Seriola_dumerili
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.244	ENSSLDG00000001217	papolg	99	66.844	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	78.961	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	78.961	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	69.946	ENSSPAG00000009004	papolg	99	69.946	Stegastes_partitus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	96.086	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	96.086	Sus_scrofa
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	73	76.994	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	76.994	Taeniopygia_guttata
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	70.683	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.683	Takifugu_rubripes
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	65.969	ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.969	Tetraodon_nigroviridis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	88.980	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	88.980	Tupaia_belangeri
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	90.823	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	90.823	Tursiops_truncatus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	95.771	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	95.771	Ursus_americanus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	95.771	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	95.771	Ursus_maritimus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	99	91.837	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	91.837	Vicugna_pacos
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	95.682	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	95.682	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	74.271	ENSXETG00000002208	papolg	100	74.271	Xenopus_tropicalis
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	67	85.170	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.170	Xiphophorus_couchianus
ENSSTOG00000010861	PAPOLG	74	82.600	ENSXMAG00000007383	papolg	95	82.600	Xiphophorus_maculatus