EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSSTOG00000012188 (Gene tree)
Gene ID: 101954922
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Ictidomys_tridecemlineatus
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 40798 bases
Position: chrJH393351.1:1217138-1257935
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSSTOP00000010930	GTP_EFTU	PF00009.27	2.5e-45	1	1
ENSSTOP00000010930	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.1e-12	1	1
ENSSTOP00000010930	EFG_IV	PF03764.18	1.9e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSSTOT00000012191	EFTUD2-201	2751	XM_005328130	ENSSTOP00000010930	916 (aa)	-	I3MIQ5

Gene Model

Click here to download ENSSTOG00000012188's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSSTOG00000012188's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	54	32.639	ENSSTOG00000010150	GFM1	60	32.639
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	92	38.946	ENSSTOG00000005050	EEF2	99	38.946

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	98.228	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.038	ENSAPOG00000002433	eftud2	91	93.243	Acanthochromis_polyacanthus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	93.519	Ailuropoda_melanoleuca
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	87.213	ENSACIG00000009096	eftud2	91	89.302	Amphilophus_citrinellus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	93	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	ENSAPEG00000003321	eftud2	91	93.356	Amphiprion_percula
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.366	ENSATEG00000000457	eftud2	91	93.581	Anabas_testudineus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.930	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	92	94.157	Anas_platyrhynchos
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	95.628	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	92.078	Anolis_carolinensis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	94.645	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	93.519	Aotus_nancymaae
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.929	ENSACLG00000001296	eftud2	91	93.131	Astatotilapia_calliptera
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.475	ENSAMXG00000000568	eftud2	91	93.694	Astyanax_mexicanus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	93.519	Bos_taurus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	66.632	WBGene00001166	eftu-2	90	70.602	Caenorhabditis_elegans
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	94.754	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	93.519	Callithrix_jacchus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	93.519	Canis_familiaris
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	93.519	Canis_lupus_dingo
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	93.519	Capra_hircus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.210	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	93.210	Carlito_syrichta
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.107	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	93.107	Cavia_aperea
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.107	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	93.107	Cavia_porcellus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	93.519	Cebus_capucinus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	93.519	Cercocebus_atys
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.107	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	93.107	Chinchilla_lanigera
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	93.519	Chlorocebus_sabaeus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	95	85.092	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	95	86.114	Choloepus_hoffmanni
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	96.175	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	92.798	Chrysemys_picta_bellii
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	74.203	ENSCING00000009372	-	92	79.125	Ciona_intestinalis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	78.057	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	93.519	Colobus_angolensis_palliatus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	93.621	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	93.621	Cricetulus_griseus_crigri
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.492	ENSCSEG00000016775	eftud2	91	92.680	Cynoglossus_semilaevis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.257	ENSCVAG00000012537	eftud2	91	93.468	Cyprinodon_variegatus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.601	ENSDARG00000012261	eftud2	92	92.793	Danio_rerio
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	92.901	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	92.901	Dasypus_novemcinctus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.313	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	93.313	Dipodomys_ordii
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	71.897	FBgn0039566	CG4849	91	76.378	Drosophila_melanogaster
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	91	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	78	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	93.519	Equus_asinus_asinus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	93.416	Equus_caballus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	88	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.273	ENSELUG00000017169	eftud2	92	92.455	Esox_lucius
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	93.519	Felis_catus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	95.738	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	92.387	Ficedula_albicollis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.313	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	93.313	Fukomys_damarensis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.257	ENSFHEG00000013479	eftud2	91	93.468	Fundulus_heteroclitus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.492	ENSGMOG00000014277	eftud2	91	92.680	Gadus_morhua
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	95.956	ENSGALG00000000988	EFTUD2	96	98.311	Gallus_gallus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	ENSGAFG00000002263	eftud2	91	93.356	Gambusia_affinis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.492	ENSGACG00000009163	eftud2	91	92.680	Gasterosteus_aculeatus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	93.519	Gorilla_gorilla
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.929	ENSHBUG00000023546	eftud2	91	93.131	Haplochromis_burtoni
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.107	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	93.107	Heterocephalus_glaber_female
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.107	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	93.107	Heterocephalus_glaber_male
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.383	ENSHCOG00000017689	eftud2	91	92.568	Hippocampus_comes
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.038	ENSIPUG00000023182	Eftud2	91	93.243	Ictalurus_punctatus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	97.158	ENSJJAG00000018268	Eftud2	97	97.158	Jaculus_jaculus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.383	ENSKMAG00000021027	eftud2	91	92.568	Kryptolebias_marmoratus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	93	92.706	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	93.115	ENSLACG00000012918	EFTUD2	91	95.383	Latimeria_chalumnae
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.585	ENSLOCG00000011460	eftud2	92	93.806	Lepisosteus_oculatus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	93.416	Loxodonta_africana
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	93.519	Macaca_fascicularis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	93.519	Macaca_nemestrina
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	93.519	Mandrillus_leucophaeus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.366	ENSMAMG00000022190	eftud2	91	93.581	Mastacembelus_armatus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.929	ENSMZEG00005022885	eftud2	91	93.131	Maylandia_zebra
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	95.856	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	92.402	Meleagris_gallopavo
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	93.519	Mesocricetus_auratus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	93.519	Microcebus_murinus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSMOCG00000009039	-	100	93.621	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	88	80.149	ENSMOCG00000017653	-	90	75.393	Microtus_ochrogaster
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	93	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.313	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	93.313	Monodelphis_domestica
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	93	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	93.519	Mus_caroli
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.512	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	93.519	Mus_musculus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	93.519	Mus_pahari
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	93.519	Mus_spretus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	97	93.220	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	93.114	Mustela_putorius_furo
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	93.519	Myotis_lucifugus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	93.416	Nannospalax_galili
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.820	ENSNBRG00000020081	eftud2	91	93.018	Neolamprologus_brichardi
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	97	94.855	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	94.652	Nomascus_leucogenys
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	94.020	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	89.918	Notamacropus_eugenii
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	88.306	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	85.597	Ochotona_princeps
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	92	79.741	ENSODEG00000003385	-	90	79.741	Octodon_degus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.004	ENSODEG00000018041	-	100	93.004	Octodon_degus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.929	ENSONIG00000000912	eftud2	91	93.131	Oreochromis_niloticus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	93.519	Oryctolagus_cuniculus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.710	ENSORLG00000003109	eftud2	91	92.905	Oryzias_latipes
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.710	ENSORLG00020009865	eftud2	91	92.905	Oryzias_latipes_hni
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.710	ENSORLG00015002611	eftud2	97	92.905	Oryzias_latipes_hsok
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	91.864	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	91.864	Otolemur_garnettii
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	93.519	Ovis_aries
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	93.519	Pan_paniscus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	93.519	Panthera_pardus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	93.519	Panthera_tigris_altaica
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	93.519	Pan_troglodytes
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	93.519	Papio_anubis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	93	90.628	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	90.628	Pelodiscus_sinensis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	96	85.471	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	80.475	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	93.621	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.313	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	93.313	Phascolarctos_cinereus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	ENSPFOG00000008515	eftud2	91	93.356	Poecilia_formosa
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	ENSPLAG00000010393	eftud2	91	93.356	Poecilia_latipinna
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	ENSPMEG00000005087	eftud2	91	93.356	Poecilia_mexicana
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	92.078	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	92.078	Pongo_abelii
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	93.909	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	89.815	Procavia_capensis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	93.416	Propithecus_coquereli
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	90.432	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	90.432	Pteropus_vampyrus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.820	ENSPNYG00000012448	eftud2	91	93.018	Pundamilia_nyererei
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.257	ENSPNAG00000012490	eftud2	91	93.468	Pygocentrus_nattereri
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.512	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	93.512	Rattus_norvegicus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	93.519	Rhinopithecus_bieti
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	93.519	Rhinopithecus_roxellana
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	97	33.069	YKL173W	SNU114	89	34.301	Saccharomyces_cerevisiae
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	93.519	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	98.007	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	96	98.007	Sarcophilus_harrisii
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	ENSSFOG00015023272	eftud2	92	93.356	Scleropages_formosus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.492	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	90.353	Scophthalmus_maximus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.038	ENSSDUG00000022675	eftud2	91	93.243	Seriola_dumerili
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	ENSSLDG00000001595	eftud2	91	93.356	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	85.185	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	85.185	Sorex_araneus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	95.191	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	91.872	Sphenodon_punctatus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.038	ENSSPAG00000016235	eftud2	91	93.243	Stegastes_partitus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	93.519	Sus_scrofa
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	87	94.869	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	94	97.539	Taeniopygia_guttata
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	90.055	ENSTRUG00000016422	eftud2	91	92.230	Takifugu_rubripes
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	96	87.896	ENSTNIG00000005346	eftud2	90	87.896	Tetraodon_nigroviridis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	87.860	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	87.860	Tupaia_belangeri
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	100.000	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	94	100.000	Tursiops_truncatus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	92.482	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	92.482	Ursus_americanus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	93.519	Ursus_maritimus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	86	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.519	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	93.519	Vulpes_vulpes
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	93.115	ENSXETG00000003394	eftud2	95	95.383	Xenopus_tropicalis
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	86	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	91.148	ENSXMAG00000008494	eftud2	91	93.356	Xiphophorus_maculatus